Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6063
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6063, 320 aa
1>>>pF1KE6063 320 - 320 aa - 320 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3051+/-0.00127; mu= 10.3612+/- 0.074
mean_var=183.3227+/-60.107, 0's: 0 Z-trim(103.2): 394 B-trim: 434 in 1/47
Lambda= 0.094725
statistics sampled from 6825 (7303) to 6825 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.566), E-opt: 0.2 (0.224), width: 16
Scan time: 2.460
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 2096 299.7 2e-81
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 1291 189.7 2.6e-48
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 1261 185.6 4.5e-47
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 1260 185.4 4.9e-47
CCDS31092.1 OR2G2 gene_id:81470|Hs108|chr1 ( 317) 1259 185.3 5.5e-47
CCDS4656.1 OR2W1 gene_id:26692|Hs108|chr6 ( 320) 1254 184.6 8.9e-47
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 1244 183.2 2.2e-46
CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16 ( 312) 1218 179.7 2.6e-45
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 1189 175.8 4.5e-44
CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs108|chr1 ( 317) 1174 173.7 1.7e-43
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 1166 172.6 3.6e-43
CCDS34323.1 OR2Y1 gene_id:134083|Hs108|chr5 ( 311) 1165 172.4 4e-43
CCDS31099.1 OR2W3 gene_id:343171|Hs108|chr1 ( 314) 1162 172.0 5.3e-43
CCDS4660.1 OR2H1 gene_id:26716|Hs108|chr6 ( 316) 1153 170.8 1.3e-42
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 1152 170.7 1.4e-42
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 1120 166.3 2.8e-41
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 1029 153.9 1.6e-37
CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9 ( 320) 1002 150.2 2.1e-36
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 1001 150.0 2.3e-36
CCDS6596.2 OR2S2 gene_id:56656|Hs108|chr9 ( 319) 988 148.3 7.8e-36
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 988 148.3 7.9e-36
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 985 147.9 1e-35
CCDS31109.1 OR2T33 gene_id:391195|Hs108|chr1 ( 320) 981 147.3 1.5e-35
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 980 147.2 1.6e-35
CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 ( 347) 979 147.1 1.9e-35
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 978 146.9 2.1e-35
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 977 146.8 2.2e-35
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 974 146.3 2.9e-35
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 974 146.3 2.9e-35
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 974 146.3 2.9e-35
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 972 146.1 3.5e-35
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 968 145.5 5.2e-35
CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 ( 303) 966 145.2 6e-35
CCDS43666.1 OR2F2 gene_id:135948|Hs108|chr7 ( 317) 964 145.0 7.5e-35
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 962 144.7 9e-35
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 960 144.4 1.1e-34
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 957 144.0 1.4e-34
CCDS31110.1 OR2T12 gene_id:127064|Hs108|chr1 ( 320) 957 144.0 1.5e-34
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 955 143.7 1.7e-34
CCDS31100.1 OR2T8 gene_id:343172|Hs108|chr1 ( 312) 955 143.7 1.7e-34
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 953 143.5 2.1e-34
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 953 143.5 2.1e-34
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 949 142.9 3.1e-34
CCDS31816.1 OR6C74 gene_id:254783|Hs108|chr12 ( 312) 939 141.6 7.9e-34
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 936 141.1 1.1e-33
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 934 140.9 1.3e-33
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 932 140.6 1.5e-33
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 930 140.3 1.8e-33
CCDS32900.1 OR7D2 gene_id:162998|Hs108|chr19 ( 312) 926 139.8 2.7e-33
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 922 139.3 4.1e-33
>>CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 (320 aa)
initn: 2096 init1: 2096 opt: 2096 Z-score: 1575.2 bits: 299.7 E(32554): 2e-81
Smith-Waterman score: 2096; 99.4% identity (99.7% similar) in 320 aa overlap (1-320:1-320)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MMEIANVSSPEVFVLLGFSARPSLETVLFIVVLSFYMVSILGNGIIILVSHTDVHLHTPM
:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 MMEIANVSSPEVFVLLGFSTRPSLETVLFIVVLSFYMVSILGNGIIILVSHTDVHLHTPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YFFLANLSFLDMSFTTSIVPQLLANLWGPQKTISYGGCVVQFYISHWLGATECVLLATMS
::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 YFFLANLPFLDMSFTTSIVPQLLANLWGPQKTISYGGCVVQFYISHWLGATECVLLATMS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YDRYAAICRPLHYTVIMHPQLCLGLALASWLGGLTTSMVGSTLTMLLPLCGNNCIDHFFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 YDRYAAICRPLHYTVIMHPQLCLGLALASWLGGLTTSMVGSTLTMLLPLCGNNCIDHFFC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 EMPLIMQLACVDTSLNEMEMYLASFVFVVLPLGLILVSYGHIARAVLKIRSAEGRRKAFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 EMPLIMQLACVDTSLNEMEMYLASFVFVVLPLGLILVSYGHIARAVLKIRSAEGRRKAFN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TCSSHVAVVSLFYGSIIFMYLQPAKSTSHEQGKFIALFYTVVTPALNPLIYTLRNTEVKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 TCSSHVAVVSLFYGSIIFMYLQPAKSTSHEQGKFIALFYTVVTPALNPLIYTLRNTEVKS
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 ALRHMVLENCCGSAGKLAQI
::::::::::::::::::::
CCDS16 ALRHMVLENCCGSAGKLAQI
310 320
>>CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 (316 aa)
initn: 1339 init1: 1291 opt: 1291 Z-score: 980.7 bits: 189.7 E(32554): 2.6e-48
Smith-Waterman score: 1291; 58.4% identity (85.4% similar) in 315 aa overlap (2-316:1-315)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MMEIANVSSPEVFVLLGFSARPSLETVLFIVVLSFYMVSILGNGIIILVSHTDVHLHTPM
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CCDS31 MEETNNSSEKGFLLLGFSDQPQLERFLFAIILYFYVLSLLGNTALILVCCLDSRLHTPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YFFLANLSFLDMSFTTSIVPQLLANLWGPQKTISYGGCVVQFYISHWLGATECVLLATMS
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CCDS31 YFFLSNLSCVDICFTTSVAPQLLVTMNKKDKTMSYGGCVAQLYVAMGLGSSECILLAVMA
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130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YDRYAAICRPLHYTVIMHPQLCLGLALASWLGGLTTSMVGSTLTMLLPLCGNNCIDHFFC
::::::.::::.: .::::..: .:: ..::.:: ::.. .::. :::::. .::.::
CCDS31 YDRYAAVCRPLRYIAIMHPRFCASLAGGAWLSGLITSLIQCSLTVQLPLCGHRTLDHIFC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 EMPLIMQLACVDTSLNEMEMYLASFVFVVLPLGLILVSYGHIARAVLKIRSAEGRRKAFN
:.:....::::::..:: :...:: ::...:. ::::::: :..:::.:.:: ::.:::.
CCDS31 EVPVLIKLACVDTTFNEAELFVASVVFLIVPVLLILVSYGFITQAVLRIKSAAGRQKAFG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TCSSHVAVVSLFYGSIIFMYLQPAKSTSHEQGKFIALFYTVVTPALNPLIYTLRNTEVKS
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CCDS31 TCSSHLVVVIIFYGTIIFMYLQPANRRSKNQGKFVSLFYTIVTPLLNPIIYTLRNKDVKG
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 ALRHMVLENCCGSAGKLAQI
::: ..: . :.. :
CCDS31 ALRTLILGSAAGQSHKD
300 310
>>CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 (309 aa)
initn: 1270 init1: 1251 opt: 1261 Z-score: 958.6 bits: 185.6 E(32554): 4.5e-47
Smith-Waterman score: 1261; 58.7% identity (86.6% similar) in 305 aa overlap (2-306:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MMEIANVSSPEVFVLLGFSARPSLETVLFIVVLSFYMVSILGNGIIILVSHTDVHLHTPM
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CCDS31 MGLGNESSLMDFILLGFSDHPRLEAVLFVFVLFFYLLTLVGNFTIIIISYLDPPLHTPM
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70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YFFLANLSFLDMSFTTSIVPQLLANLWGPQKTISYGGCVVQFYISHWLGATECVLLATMS
::::.:::.::. ::::..:: :.:: :.:::.:::::.:.::: ::.:::.::: :.
CCDS31 YFFLSNLSLLDICFTTSLAPQTLVNLQRPKKTITYGGCVAQLYISLALGSTECILLADMA
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130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YDRYAAICRPLHYTVIMHPQLCLGLALASWLGGLTTSMVGSTLTMLLPLCGNNCIDHFFC
::: :.:.::::.:::.:.:: :: :::.::..:.. .:.:. ::::::. .:::.:
CCDS31 LDRYIAVCKPLHYVVIMNPRLCQQLASISWLSGLASSLIHATFTLQLPLCGNHRLDHFIC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 EMPLIMQLACVDTSLNEMEMYLASFVFVVLPLGLILVSYGHIARAVLKIRSAEGRRKAFN
:.: ...::::::..::. ....: .:::.: .:: .::: :..:::.:.:.:.:.:::.
CCDS31 EVPALLKLACVDTTVNELVLFVVSVLFVVIPPALISISYGFITQAVLRIKSVEARHKAFS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TCSSHVAVVSLFYGSIIFMYLQPAKSTSHEQGKFIALFYTVVTPALNPLIYTLRNTEVKS
:::::..:: .:::.::..::::. : ...:::::.::::.:::.:::.:::::: ..:
CCDS31 TCSSHLTVVIIFYGTIIYVYLQPSDSYAQDQGKFISLFYTMVTPTLNPIIYTLRNKDMKE
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 ALRHMVLENCCGSAGKLAQI
:::...
CCDS31 ALRKLLSGKL
300
>>CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 (311 aa)
initn: 1279 init1: 1253 opt: 1260 Z-score: 957.9 bits: 185.4 E(32554): 4.9e-47
Smith-Waterman score: 1260; 58.1% identity (87.4% similar) in 301 aa overlap (6-306:8-308)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MMEIANVSSPEVFVLLGFSARPSLETVLFIVVLSFYMVSILGNGIIILVSHTDVHLHT
:.:: :.:.::: : ::.:.:.::: ::.....:: .::..:. : ::::
CCDS43 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 PMYFFLANLSFLDMSFTTSIVPQLLANLWGPQKTISYGGCVVQFYISHWLGATECVLLAT
::::::.::::::. .::: .::::.:::::.:::::.::..:.:. ::.::::::..
CCDS43 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
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120 130 140 150 160 170
pF1KE6 MSYDRYAAICRPLHYTVIMHPQLCLGLALASWLGGLTTSMVGSTLTMLLPLCGNNCIDHF
::::::::.::::::::.:::..: ::.:::..:.:.: . :..:. .::::. .:::
CCDS43 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 FCEMPLIMQLACVDTSLNEMEMYLASFVFVVLPLGLILVSYGHIARAVLKIRSAEGRRKA
:::.: ...:.:::: .::. ....: .::..:: :::.::: :.::.:...:. : .:.
CCDS43 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 FNTCSSHVAVVSLFYGSIIFMYLQPAKSTSHEQGKFIALFYTVVTPALNPLIYTLRNTEV
:.::..:. .::::. . ::::: ...:..::::::::::::::.:::::::::: :
CCDS43 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE6 KSALRHMVLENCCGSAGKLAQI
..:.....
CCDS43 RGAVKRLMGWE
310
>>CCDS31092.1 OR2G2 gene_id:81470|Hs108|chr1 (317 aa)
initn: 1284 init1: 1242 opt: 1259 Z-score: 957.0 bits: 185.3 E(32554): 5.5e-47
Smith-Waterman score: 1259; 59.2% identity (86.9% similar) in 306 aa overlap (1-306:3-308)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MMEIANVSSPEVFVLLGFSARPSLETVLFIVVLSFYMVSILGNGIIILVSHTDVHLHT
:.. .: :. :.::::: :.:. :::...: .:...:::: :::::. . .::
CCDS31 MGMVRHTNESNLAGFILLGFSDYPQLQKVLFVLILILYLLTILGNTTIILVSRLEPKLHM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 PMYFFLANLSFLDMSFTTSIVPQLLANLWGPQKTISYGGCVVQFYISHWLGATECVLLAT
::::::..:::: ::.:..::::.::: :.:::.::::.:..: :: ::.::::: :.
CCDS31 PMYFFLSHLSFLYRCFTSSVIPQLLVNLWEPMKTIAYGGCLVHLYNSHALGSTECVLPAV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 MSYDRYAAICRPLHYTVIMHPQLCLGLALASWLGGLTTSMVGSTLTMLLPLCGNNCIDHF
:: :::.:.::::::::.:: .::..:: .::.:..:..: ::::. ::.::. .:::
CCDS31 MSCDRYVAVCRPLHYTVLMHIHLCMALASMAWLSGIATTLVQSTLTLQLPFCGHRQVDHF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 FCEMPLIMQLACVDTSLNEMEMYLASFVFVVLPLGLILVSYGHIARAVLKIRSAEGRRKA
.::.:....:::: :..:: :...::..:...:...:::: :.::.:::.:.:: :.::
CCDS31 ICEVPVLIKLACVGTTFNEAELFVASILFLIVPVSFILVSSGYIAHAVLRIKSATRRQKA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 FNTCSSHVAVVSLFYGSIIFMYLQPAKSTSHEQGKFIALFYTVVTPALNPLIYTLRNTEV
:.:: ::..::..:::.::::::::::: :..::::..::::::: ::::::::: ::
CCDS31 FGTCFSHLTVVTIFYGTIIFMYLQPAKSRSRDQGKFVSLFYTVVTRMLNPLIYTLRIKEV
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE6 KSALRHMVLENCCGSAGKLAQI
:.::....
CCDS31 KGALKKVLAKALGVNIL
310
>>CCDS4656.1 OR2W1 gene_id:26692|Hs108|chr6 (320 aa)
initn: 1241 init1: 1241 opt: 1254 Z-score: 953.3 bits: 184.6 E(32554): 8.9e-47
Smith-Waterman score: 1254; 57.0% identity (85.2% similar) in 305 aa overlap (2-306:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MMEIANVSSPEVFVLLGFSARPSLETVLFIVVLSFYMVSILGNGIIILVSHTDVHLHTPM
:. .: :: . :.::::: .:..: .: :: ::.....:: :::.: : .:::::
CCDS46 MDQSNYSSLHGFILLGFSNHPKMEMILSGVVAIFYLITLVGNTAIILASLLDSQLHTPM
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CCDS10 YFFLSNLSSLDLAFATSSVPQMLINLWGPGKTISYGGCITQLYVFLWLGATECILLVVMA
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CCDS10 ALRRLLGKGREVG
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CCDS46 MNWVNKSVPQEFILLVFSDQPWLEIPPFVMFLFSYILTIFGNLTIILVSHVDFKLHTPM
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CCDS46 YFFLSNLSLLDLCYTTSTVPQMLVNICNTRKVISYGGCVAQLFIFLALGSTECLLLAVMC
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CCDS46 FDRFVAICRPLHYSIIMHQRLCFQLAAASWISGFSNSVLQSTWTLKMPLCGHKEVDHFFC
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]