Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6059
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6059, 320 aa
1>>>pF1KE6059 320 - 320 aa - 320 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1858+/-0.00119; mu= 15.8948+/- 0.071
mean_var=88.9925+/-25.877, 0's: 0 Z-trim(101.2): 360 B-trim: 756 in 2/49
Lambda= 0.135956
statistics sampled from 6017 (6439) to 6017 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.533), E-opt: 0.2 (0.198), width: 16
Scan time: 1.900
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 ( 320) 2127 428.0 4.7e-120
CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 ( 321) 1620 328.6 4.1e-90
CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 ( 321) 1620 328.6 4.1e-90
CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 ( 324) 1514 307.8 7.5e-84
CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 ( 318) 1123 231.1 9e-61
CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 ( 312) 1100 226.6 2e-59
CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 ( 325) 1097 226.0 3.1e-59
CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 ( 317) 1092 225.0 6.1e-59
CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 ( 311) 1088 224.2 1e-58
CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 1087 224.0 1.2e-58
CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 ( 323) 1080 222.7 3.1e-58
CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 ( 314) 1078 222.3 4e-58
CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 ( 320) 1071 220.9 1.1e-57
CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 ( 314) 1067 220.1 1.8e-57
CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 ( 329) 1064 219.5 2.8e-57
CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 ( 342) 1059 218.6 5.7e-57
CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 1049 216.6 2.1e-56
CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 ( 312) 1043 215.4 4.7e-56
CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 1036 214.1 1.3e-55
CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 ( 318) 1021 211.1 9.5e-55
CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 ( 314) 994 205.8 3.7e-53
CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 ( 314) 989 204.8 7.3e-53
CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 ( 317) 985 204.0 1.3e-52
CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 ( 312) 974 201.9 5.6e-52
CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 ( 315) 970 201.1 9.7e-52
CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 ( 320) 964 199.9 2.2e-51
CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 ( 324) 955 198.2 7.6e-51
CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 ( 326) 943 195.8 3.9e-50
CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 ( 317) 938 194.8 7.5e-50
CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 ( 312) 935 194.2 1.1e-49
CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 ( 313) 918 190.9 1.1e-48
CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 918 190.9 1.1e-48
CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 917 190.7 1.3e-48
CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 ( 321) 870 181.5 7.8e-46
CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 ( 350) 866 180.7 1.4e-45
CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 ( 312) 856 178.7 5.2e-45
CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 855 178.6 6.5e-45
CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 ( 312) 850 177.5 1.2e-44
CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 ( 324) 844 176.4 2.7e-44
CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 788 165.4 5.4e-41
CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 762 160.3 2e-39
CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 ( 310) 753 158.5 6.2e-39
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 751 158.1 8.2e-39
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 742 156.4 2.8e-38
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 729 153.8 1.7e-37
CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 729 153.8 1.7e-37
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 704 148.9 4.9e-36
CCDS31639.1 OR2AT4 gene_id:341152|Hs108|chr11 ( 320) 603 129.1 4.6e-30
CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1 ( 308) 577 124.0 1.5e-28
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 575 123.6 2e-28
>>CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 (320 aa)
initn: 2127 init1: 2127 opt: 2127 Z-score: 2268.8 bits: 428.0 E(32554): 4.7e-120
Smith-Waterman score: 2127; 99.4% identity (99.7% similar) in 320 aa overlap (1-320:1-320)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSFLNGTSLTPASFILNGIPGLEDVHLWISFPLCTMYSIAITGNFGLMYLIYCDEALHRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MSFLNGTSLTPASFILNGIPGLEDVHLWISFPLCTMYSIAITGNFGLMYLIYCDEALHRP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 MYVFLALLSFTDVLMCTSTLPNTLFILWFNLKEIDFKACLAQMFFVHTFTGMESGVLMLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MYVFLALLSFTDVLMCTSTLPNTLFILWFNLKEIDFKACLAQMFFVHTFTGMESGVLMLM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ALDHCVAICFPLRYATILTNSVIAKAGFLTFLRGVMLVIPSTFLTKCLPYCKGNVIPHTY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::
CCDS31 ALDHCVAICFPLRYATILTNSVIAKAGFLTFLRGVMLVIPSTFLTKRLPYCKGNVIPHTY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 CDHMSVAKISCGNVRVNAIYGLIVALLIGGFDILCITISYTMILQAVVSLSSADARQKAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CDHMSVAKISCGNVRVNAIYGLIVALLIGGFDILCITISYTMILQAVVSLSSADARQKAF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 STCTAHICAIVLTYVPAFFTFFTHHFGGHTIPLHIHIIMANLYLLMPPTMNPIVYGVKTR
::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 STCTAHFCAIVLTYVPAFFTFFTHHFGGHTIPLHIHIIMANLYLLMPPTMNPIVYGVKTR
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 QVRESVIRFFLKGKDNSHNF
::::::::::::::::::::
CCDS31 QVRESVIRFFLKGKDNSHNF
310 320
>>CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 (321 aa)
initn: 1618 init1: 1618 opt: 1620 Z-score: 1731.3 bits: 328.6 E(32554): 4.1e-90
Smith-Waterman score: 1620; 73.7% identity (91.1% similar) in 315 aa overlap (1-315:1-315)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSFLNGTSLTPASFILNGIPGLEDVHLWISFPLCTMYSIAITGNFGLMYLIYCDEALHRP
: :: :.: ::::::::.:::::..::::::.:.:: .:..:: ::.:::. ..:::.:
CCDS44 MLTLNKTDLIPASFILNGVPGLEDTQLWISFPFCSMYVVAMVGNCGLLYLIHYEDALHKP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 MYVFLALLSFTDVLMCTSTLPNTLFILWFNLKEIDFKACLAQMFFVHTFTGMESGVLMLM
:: :::.:::::..::.::.:..: :.::.::.: : ::.::::.::::::::::::::
CCDS44 MYYFLAMLSFTDLVMCSSTIPKALCIFWFHLKDIGFDECLVQMFFTHTFTGMESGVLMLM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ALDHCVAICFPLRYATILTNSVIAKAGFLTFLRGVMLVIPSTFLTKCLPYCKGNVIPHTY
:::. ::::.::::.::::: ::::.: ::::::.:.:: ::::: ::::.::..::::
CCDS44 ALDRYVAICYPLRYSTILTNPVIAKVGTATFLRGVLLIIPFTFLTKLLPYCRGNILPHTY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 CDHMSVAKISCGNVRVNAIYGLIVALLIGGFDILCITISYTMILQAVVSLSSADARQKAF
::::::::.:::::.:::::::.::::: :::::::: ::::::.:::::::::::::::
CCDS44 CDHMSVAKLSCGNVKVNAIYGLMVALLIWGFDILCITNSYTMILRAVVSLSSADARQKAF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 STCTAHICAIVLTYVPAFFTFFTHHFGGHTIPLHIHIIMANLYLLMPPTMNPIVYGVKTR
.::::::::::..:.::::.::.:.:: : :: :::.::.:::.:::::::::::::.
CCDS44 NTCTAHICAIVFSYTPAFFSFFSHRFGEHIIPPSCHIIVANIYLLLPPTMNPIVYGVKTK
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 QVRESVIRFFLKGKDNSHNF
:.:. :::.. .::
CCDS44 QIRDCVIRILSGSKDTKSYSM
310 320
>>CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 (321 aa)
initn: 1620 init1: 1620 opt: 1620 Z-score: 1731.3 bits: 328.6 E(32554): 4.1e-90
Smith-Waterman score: 1620; 75.8% identity (90.4% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSFLNGTSLTPASFILNGIPGLEDVHLWISFPLCTMYSIAITGNFGLMYLIYCDEALHRP
:: :..::::. :::::.:::: .:.:::.:.: :: ::..:: ::. :: .::::::
CCDS31 MSGDNSSSLTPGFFILNGVPGLEATHIWISLPFCFMYIIAVVGNCGLICLISHEEALHRP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 MYVFLALLSFTDVLMCTSTLPNTLFILWFNLKEIDFKACLAQMFFVHTFTGMESGVLMLM
:: :::::::::: .::. .:: : :.:::::::::.:::::::::: .:::::::::::
CCDS31 MYYFLALLSFTDVTLCTTMVPNMLCIFWFNLKEIDFNACLAQMFFVHMLTGMESGVLMLM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 ALDHCVAICFPLRYATILTNSVIAKAGFLTFLRGVMLVIPSTFLTKCLPYCKGNVIPHTY
:::. ::::.:::::::::: ::::::. ::::.:::.:: :.::: ::::.:: :::::
CCDS31 ALDRYVAICYPLRYATILTNPVIAKAGLATFLRNVMLIIPFTLLTKRLPYCRGNFIPHTY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 CDHMSVAKISCGNVRVNAIYGLIVALLIGGFDILCITISYTMILQAVVSLSSADARQKAF
::::::::.:::: .:::::::.:::::: ::: ::..:::::::::.::::::::.:::
CCDS31 CDHMSVAKVSCGNFKVNAIYGLMVALLIGVFDICCISVSYTMILQAVMSLSSADARHKAF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 STCTAHICAIVLTYVPAFFTFFTHHFGGHTIPLHIHIIMANLYLLMPPTMNPIVYGVKTR
::::.:.:.::.::: ::::::::.: ::.:: :::::.::::::.:::::::::::::.
CCDS31 STCTSHMCSIVITYVAAFFTFFTHRFVGHNIPNHIHIIVANLYLLLPPTMNPIVYGVKTK
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 QVRESVIRFFLKGKDNSHNF
:..:.::.:.: :
CCDS31 QIQEGVIKFLLGDKVSFTYDK
310 320
>>CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 (324 aa)
initn: 1512 init1: 1241 opt: 1514 Z-score: 1618.9 bits: 307.8 E(32554): 7.5e-84
Smith-Waterman score: 1514; 71.3% identity (90.6% similar) in 307 aa overlap (9-314:15-321)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MSFLNGTSLTPASFILNGIPGLEDVHLWISFPLCTMYSIAITGNFGLMYLIYCD
.:: ::::::::::: ::.:::.:::::: : ..::.::.:::: .
CCDS31 MPLFNSLCWFPTIHVTPPSFILNGIPGLERVHVWISLPLCTMYIIFLVGNLGLVYLIYYE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 EALHRPMYVFLA-LLSFTDVLMCTSTLPNTLFILWFNLKEIDFKACLAQMFFVHTFTGME
:.::.::: :.. ::. :.: ::.::::.: :.::.::::.:.:::::::::: :::.:
CCDS31 ESLHHPMYFFFGHALSLIDLLTCTTTLPNALCIFWFSLKEINFNACLAQMFFVHGFTGVE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 SGVLMLMALDHCVAICFPLRYATILTNSVIAKAGFLTFLRGVMLVIPSTFLTKCLPYCKG
::::::::::. ::::.:::::: ::: .:::: . ::::::.:.:: ::.: ::.:..
CCDS31 SGVLMLMALDRYVAICYPLRYATTLTNPIIAKAELATFLRGVLLMIPFPFLVKRLPFCQS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 NVIPHTYCDHMSVAKISCGNVRVNAIYGLIVALLIGGFDILCITISYTMILQAVVSLSSA
:.: :::::::::.:.::....::.::::.:::::: ::: ::..:::.::.:..::::.
CCDS31 NIISHTYCDHMSVVKLSCASIKVNVIYGLMVALLIGVFDICCISLSYTLILKAAISLSSS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 DARQKAFSTCTAHICAIVLTYVPAFFTFFTHHFGGHTIPLHIHIIMANLYLLMPPTMNPI
:::::::::::::: ::..::::::::::.:.::::::: .:::.::::::.:::.:::
CCDS31 DARQKAFSTCTAHISAIIITYVPAFFTFFAHRFGGHTIPPSLHIIVANLYLLLPPTLNPI
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE6 VYGVKTRQVRESVIRFFLKGKDNSHNF
::::::.:.:.:::.:: :
CCDS31 VYGVKTKQIRKSVIKFFQGDKGAG
310 320
>>CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 (318 aa)
initn: 1123 init1: 1123 opt: 1123 Z-score: 1204.5 bits: 231.1 E(32554): 9e-61
Smith-Waterman score: 1123; 51.0% identity (81.6% similar) in 304 aa overlap (11-314:12-315)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MSFLNGTSLTPASFILNGIPGLEDVHLWISFPLCTMYSIAITGNFGLMYLIYCDEALHR
: .:.:.:::::: .:.::..:.:.:: .:..:: .:. .: :.:::
CCDS31 MSDSNLSDNHLPDTFFLTGIPGLEAAHFWIAIPFCAMYLVALVGNAALILVIAMDNALHA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 PMYVFLALLSFTDVLMCTSTLPNTLFILWFNLKEIDFKACLAQMFFVHTFTGMESGVLML
:::.:: :::.::. . ..:.:. : :::.. ::.: .:::::: ::.. ..::..:.
CCDS31 PMYLFLCLLSLTDLALSSTTVPKMLAILWLHAGEISFGGCLAQMFCVHSIYALESSILLA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 MALDHCVAICFPLRYATILTNSVIAKAGFLTFLRGVMLVIPSTFLTKCLPYCKGNVIPHT
::.:. :::: ::::.:::...::.. ::. ..:.: .: : :: . :::: :. ::
CCDS31 MAFDRYVAICNPLRYTTILNHAVIGRIGFVGLFRSVAIVSPFIFLLRRLPYCGHRVMTHT
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 YCDHMSVAKISCGNVRVNAIYGLIVALLIGGFDILCITISYTMILQAVVSLSSADARQKA
::.::..:...:.:. :: .::: :::: :.: . :.::: .::.:: : : ::..::
CCDS31 YCEHMGIARLACANITVNIVYGLTVALLAMGLDSILIAISYGFILHAVFHLPSHDAQHKA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 FSTCTAHICAIVLTYVPAFFTFFTHHFGGHTIPLHIHIIMANLYLLMPPTMNPIVYGVKT
.::: .:: :.. :.::::.:.::.:: : .: :.::..::::.:.::..:::.::..:
CCDS31 LSTCGSHIGIILVFYIPAFFSFLTHRFGHHEVPKHVHIFLANLYVLVPPVLNPILYGART
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE6 RQVRESVIRFFLKGKDNSHNF
...: ..... ::
CCDS31 KEIRSRLLKLLHLGKTSI
310
>>CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1100 init1: 722 opt: 1100 Z-score: 1180.3 bits: 226.6 E(32554): 2e-59
Smith-Waterman score: 1100; 48.4% identity (80.1% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-310)
10 20 30 40 50 60
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CCDS31 MPSINDTHFYPPFFLLLGIPGLDTLHIWISFPFCIVYLIAIVGNMTILFVIKTEHSLHQP
10 20 30 40 50 60
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CCDS31 MFYFLAMLSMIDLGLSTSTIPKMLGIFWFNLQEISFGGCLLQMFFIHMFTGMETVLLVVM
70 80 90 100 110 120
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pF1KE6 ALDHCVAICFPLRYATILTNSVIAKAGFLTFLRGVMLVIPSTFLTKCLPYCKGNVIPHTY
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CCDS31 AYDRFVAICNPLQYTMILTNKTISILASVVVGRNLVLVTPFVFLILRLPFCGHNIVPHTY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 CDHMSVAKISCGNVRVNAIYGLIVALLIGGFDILCITISYTMILQAVVSLSSADARQKAF
:.: ..: ..:. ...: ::::.: : :.. :. ::..::.:: : : :.: :::
CCDS31 CEHRGLAGLACAPIKINIIYGLMVISYII-VDVILIASSYVLILRAVFRLPSQDVRLKAF
190 200 210 220 230
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CCDS31 NTCGSHVCVMLCFYTPAFFSFMTHRFG-QNIPHYIHILLANLYVVVPPALNPVIYGVRTK
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 QVRESVIRFFLKGKDNSHNF
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CCDS31 QIREQIVKIFVQKE
300 310
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10 20 30 40 50
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CCDS31 MFLPNDTQFHPSSFLLLGIPGLETLHIWIGFPFCAVYMIALIGNFTILLVIKTDSSLHQ
10 20 30 40 50
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CCDS31 PMFYFLAMLATTDVGLSTATIPKMLGIFWINLRGIIFEACLTQMFFIHNFTLMESAVLVA
60 70 80 90 100 110
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pF1KE6 MALDHCVAICFPLRYATILTNSVIAKAGFLTFLRGVMLVIPSTFLTKCLPYCKGNVIPHT
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CCDS31 MAYDSYVAICNPLQYSAILTNKVVSVIGLGVFVRALIFVIPSILLILRLPFCGNHVIPHT
120 130 140 150 160 170
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pF1KE6 YCDHMSVAKISCGNVRVNAIYGLIVALLIGGFDILCITISYTMILQAVVSLSSADARQKA
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CCDS31 YCEHMGLAHLSCASIKINIIYGL-CAICNLVFDITVIALSYVHILCAVFRLPTHEARLKS
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240 250 260 270 280 290
pF1KE6 FSTCTAHICAIVLTYVPAFFTFFTHHFGGHTIPLHIHIIMANLYLLMPPTMNPIVYGVKT
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CCDS31 LSTCGSHVCVILAFYTPALFSFMTHRFG-RNVPRYIHILLANLYVVVPPMLNPVIYGVRT
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE6 RQVRESVIRFFLKGKDNSHNF
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CCDS31 KQIYKCVKKILLQEQGMEKEEYLIHTRF
300 310 320
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10 20 30 40 50
pF1KE6 MSFLNGTSLTPASFILNGIPGLEDVHLWISFPLCTMYSIAITGNFGLMYLIYCDEA
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CCDS31 MAGRMSTSNHTQFHPSSFLLLGIPGLEDVHIWIGVPFFFVYLVALLGNTALLFVIQTEQS
10 20 30 40 50 60
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pF1KE6 LHRPMYVFLALLSFTDVLMCTSTLPNTLFILWFNLKEIDFKACLAQMFFVHTFTGMESGV
::.::: :::.:. :. . :.:.:. : :.::: :::.: .::..:::.: ::.::: :
CCDS31 LHEPMYYFLAMLDSIDLGLSTATIPKMLGIFWFNTKEISFGGCLSHMFFIHFFTAMESIV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 LMLMALDHCVAICFPLRYATILTNSVIAKAGFLTFLRGVMLVIPSTFLTKCLPYCKGNVI
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CCDS31 LVAMAFDRYIAICKPLRYTMILTSKIISLIAGIAVLRSLYMVVPLVFLLLRLPFCGHRII
130 140 150 160 170 180
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pF1KE6 PHTYCDHMSVAKISCGNVRVNAIYGL-IVALLIGGFDILCITISYTMILQAVVSLSSADA
:::::.::..:...:....:: .:: ..::. .:.. : .::. :: :: : : .:
CCDS31 PHTYCEHMGIARLACASIKVNIRFGLGNISLLL--LDVILIILSYVRILYAVFCLPSWEA
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pF1KE6 RQKAFSTCTAHICAIVLTYVPAFFTFFTHHFGGHTIPLHIHIIMANLYLLMPPTMNPIVY
: ::..:: .:: .:. ..::::.:.::.:: :.:: .::::.::::...::..::..:
CCDS31 RLKALNTCGSHIGVILAFFTPAFFSFLTHRFG-HNIPQYIHIILANLYVVVPPALNPVIY
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE6 GVKTRQVRESVIRFFLKGKDNSHNF
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CCDS31 GVRTKQIRERVLRIFLKTNH
300 310
>>CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 (311 aa)
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CCDS31 MFYHNKSIFHPVTFFLIGIPGLEDFHMWISGPFCSVYLVALLGNATILLVIKVEQTLREP
10 20 30 40 50 60
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:. :::.:: :. . :...: : :.::. .::.. ::.::::..:.:::::. ::. :
CCDS31 MFYFLAILSTIDLALSTTSVPRMLGIFWFDAHEINYGACVAQMFLIHAFTGMEAEVLLAM
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CCDS31 AFDRYVAVCAPLHYATILTSQVLVGISMCIVIRPVLLTLPMVYLIYRLPFCQAHIIAHSY
130 140 150 160 170 180
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CCDS31 CEHMGIAKLSCGNIRINGIYGLFVVSFFV--LNLVLIGISYVYILRAVFRLPSHDAQLKA
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CCDS31 LSTCGAHVGVICVFYIPSVFSFLTHRFG-HQIPGYIHILVANLYLIIPPSLNPIIYGVRT
240 250 260 270 280 290
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CCDS31 KQIRERVLYVFTKK
300 310
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CCDS31 MPTFNGSVFMPSAFILIGIPGLESVQCWIGIPFSAMYLIGVIGNSLILVIIKYENSLHIP
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CCDS31 MYIFLAMLAATDIALNTCILPKMLGIFWFHLPEISFDACLFQMWLIHSFQAIESGILLAM
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CCDS31 ALDRYVAICIPLRHATIFSQQFLTHIGLGVTLRAAILIIPSLGLIKCCLKHYRTTVISHS
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CCDS31 YCEHMAIVKLATEDIRVNKIYGLFVAFAILGFDIIFITLSYVQIFITVFQLPQKEARFKA
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]