Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6058
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6058, 320 aa
1>>>pF1KE6058 320 - 320 aa - 320 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5004+/-0.00107; mu= 14.6689+/- 0.063
mean_var=106.4994+/-31.519, 0's: 0 Z-trim(104.7): 351 B-trim: 950 in 2/49
Lambda= 0.124280
statistics sampled from 7617 (8023) to 7617 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.605), E-opt: 0.2 (0.246), width: 16
Scan time: 2.440
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 2075 383.2 1.5e-106
CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 ( 329) 1068 202.7 3.3e-52
CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 ( 318) 997 189.9 2.2e-48
CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 945 180.6 1.4e-45
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CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 ( 314) 934 178.6 5.5e-45
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CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 ( 317) 925 177.0 1.7e-44
CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 ( 321) 924 176.9 1.9e-44
CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 ( 320) 922 176.5 2.5e-44
CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 ( 311) 916 175.4 5.1e-44
CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 ( 317) 903 173.1 2.6e-43
CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 ( 325) 902 172.9 3e-43
CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 ( 312) 897 172.0 5.4e-43
CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 ( 312) 889 170.6 1.5e-42
CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 ( 324) 869 167.0 1.8e-41
CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 ( 320) 860 165.4 5.5e-41
CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 ( 323) 860 165.4 5.5e-41
CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 ( 320) 838 161.4 8.5e-40
CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 828 159.6 2.9e-39
CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 ( 318) 822 158.6 6.2e-39
CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 813 157.0 2e-38
CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 ( 350) 812 156.8 2.3e-38
CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 ( 314) 805 155.5 5e-38
CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 ( 314) 804 155.3 5.7e-38
CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 ( 342) 797 154.1 1.4e-37
CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 ( 312) 796 153.9 1.5e-37
CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 ( 312) 791 153.0 2.9e-37
CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 ( 324) 788 152.5 4.3e-37
CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 ( 324) 782 151.4 9e-37
CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 ( 326) 770 149.2 4e-36
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 761 147.6 1.2e-35
CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 ( 321) 752 146.0 3.7e-35
CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 738 143.5 2.3e-34
CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 ( 312) 734 142.8 3.4e-34
CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 ( 313) 729 141.9 6.4e-34
CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 ( 312) 718 139.9 2.5e-33
CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 ( 317) 709 138.3 7.7e-33
CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 701 136.9 2.1e-32
CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 688 134.5 1.1e-31
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 662 129.9 2.7e-30
CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 ( 310) 636 125.2 6.6e-29
CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 627 123.7 2.3e-28
CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 624 123.1 3e-28
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 614 121.3 1e-27
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 613 121.1 1.2e-27
CCDS31639.1 OR2AT4 gene_id:341152|Hs108|chr11 ( 320) 577 114.6 1e-25
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 542 108.4 8e-24
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 527 105.7 5.1e-23
>>CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 (320 aa)
initn: 2075 init1: 2075 opt: 2075 Z-score: 2026.6 bits: 383.2 E(32554): 1.5e-106
Smith-Waterman score: 2075; 99.4% identity (99.7% similar) in 320 aa overlap (1-320:1-320)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAETLQLNSTFLHPNFFILTGFPGLGSAQTWLTLVFGPIYLLALLGNGALPAVVWIDSTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MAETLQLNSTFLHPNFFILTGFPGLGSAQTWLTLVFGPIYLLALLGNGALPAVVWIDSTL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 HQPMFLLLAILAATDLGLATSIAPGLLAVLWLGPRSVPYAVCLVQMFFVHALTAMESGVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HQPMFLLLAILAATDLGLATSIAPGLLAVLWLGPRSVPYAVCLVQMFFVHALTAMESGVL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LAMACDRAAAIGRPLHYPVLVTKACVGYAALALALKAVAIVVPFPLLVAKFEHFQAKTIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LAMACDRAAAIGRPLHYPVLVTKACVGYAALALALKAVAIVVPFPLLVAKFEHFQAKTIG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 HTYCAHMAVVELVVGNTQATNLYGLALSLAISGMDILGITGSYGLIAHAVLQLPTREARA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS31 HTYCAHMAVVELVVGNTQATNLYGLALSLAISGMDILGITGSYGLIAHAVLQLPTREAHA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 KAFGTCSSHICVIQAFYIPGLFSYLTHRFGHHTVPKPVHILLSNIYLLLPPALNPLIYGA
::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KAFGTCSSHICVILAFYIPGLFSYLTHRFGHHTVPKPVHILLSNIYLLLPPALNPLIYGA
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE6 RTKQIRDRLLETFTFRKSPL
::::::::::::::::::::
CCDS31 RTKQIRDRLLETFTFRKSPL
310 320
>>CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 (329 aa)
initn: 892 init1: 892 opt: 1068 Z-score: 1050.7 bits: 202.7 E(32554): 3.3e-52
Smith-Waterman score: 1068; 50.6% identity (80.2% similar) in 308 aa overlap (8-314:20-326)
10 20 30 40
pF1KE6 MAETLQLNSTF-LHPNFFILTGFPGLGSAQTWLTLVFGPIYLLALLGN
::.. : :.:.:.::: .: :..: .: .:::::.::
CCDS44 MTLVSFFSFLSKPLIMLLSNSSWRLSQPSFLLVGIPGLEESQHWIALPLGILYLLALVGN
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 GALPAVVWIDSTLHQPMFLLLAILAATDLGLATSIAPGLLAVLWLGPRSVPYAVCLVQMF
.. ..:.: .::: :.:.:..::: :: ::.: :: :::: . . . : :::.:::
CCDS44 VTILFIIWMDPSLHQSMYLFLSMLAAIDLVLASSTAPKALAVLLVHAHEIGYIVCLIQMF
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 FVHALTAMESGVLLAMACDRAAAIGRPLHYPVLVTKACVGYAALALALKAVAIVVPFPLL
:.::...::::::.::: :: .:: .:::. ... . .: .... .... ...:::.:
CCDS44 FIHAFSSMESGVLVAMALDRYVAICHPLHHSTILHPGVIGRIGMVVLVRGLLLLIPFPIL
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 VAKFEHFQAKTIGHTYCAHMAVVELVVGNTQATNLYGLALSLAISGMDILGITGSYGLIA
.. . :: :::.:: :::::.:. ..: .. :::...: . :.:.:.: ::. :
CCDS44 LGTLIFCQATIIGHAYCEHMAVVKLACSETTVNRAYGLTMALLVIGLDVLAIGVSYAHIL
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 HAVLQLPTREARAKAFGTCSSHICVIQAFYIPGLFSYLTHRFGHHTVPKPVHILLSNIYL
.:::..: ::: :::.::.:::::: .::.::.::.:::::::: ::. ::.::.. ::
CCDS44 QAVLKVPGSEARLKAFSTCGSHICVILVFYVPGIFSFLTHRFGHH-VPHHVHVLLATRYL
250 260 270 280 290
290 300 310 320
pF1KE6 LLPPALNPLIYGARTKQIRDRLLETFTFRKSPL
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CCDS44 LMPPALNPLVYGVKTQQIRQRVLRVFTQKD
300 310 320
>>CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 (318 aa)
initn: 1000 init1: 979 opt: 997 Z-score: 982.1 bits: 189.9 E(32554): 2.2e-48
Smith-Waterman score: 997; 46.6% identity (80.1% similar) in 307 aa overlap (14-320:12-318)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAETLQLNSTFLHPNFFILTGFPGLGSAQTWLTLVFGPIYLLALLGNGALPAVVWIDSTL
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CCDS31 MSDSNLSDNHLPDTFFLTGIPGLEAAHFWIAIPFCAMYLVALVGNAALILVIAMDNAL
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pF1KE6 HQPMFLLLAILAATDLGLATSIAPGLLAVLWLGPRSVPYAVCLVQMFFVHALTAMESGVL
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CCDS31 HAPMYLFLCLLSLTDLALSSTTVPKMLAILWLHAGEISFGGCLAQMFCVHSIYALESSIL
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pF1KE6 LAMACDRAAAIGRPLHYPVLVTKACVGYAALALALKAVAIVVPFPLLVAKFEHFQAKTIG
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CCDS31 LAMAFDRYVAICNPLRYTTILNHAVIGRIGFVGLFRSVAIVSPFIFLLRRLPYCGHRVMT
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190 200 210 220 230 240
pF1KE6 HTYCAHMAVVELVVGNTQATNLYGLALSLAISGMDILGITGSYGLIAHAVLQLPTREARA
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CCDS31 HTYCEHMGIARLACANITVNIVYGLTVALLAMGLDSILIAISYGFILHAVFHLPSHDAQH
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250 260 270 280 290 300
pF1KE6 KAFGTCSSHICVIQAFYIPGLFSYLTHRFGHHTVPKPVHILLSNIYLLLPPALNPLIYGA
::..::.::: .: .::::..::.:::::::: ::: :::.:.:.:.:.::.:::..:::
CCDS31 KALSTCGSHIGIILVFYIPAFFSFLTHRFGHHEVPKHVHIFLANLYVLVPPVLNPILYGA
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 RTKQIRDRLLETFTFRKSPL
:::.::.:::. . . :. .
CCDS31 RTKEIRSRLLKLLHLGKTSI
300 310
>>CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 (316 aa)
initn: 786 init1: 469 opt: 945 Z-score: 931.7 bits: 180.6 E(32554): 1.4e-45
Smith-Waterman score: 945; 42.9% identity (78.8% similar) in 312 aa overlap (7-317:4-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAETLQLNSTFLHPNFFILTGFPGLGSAQTWLTLVFGPIYLLALLGNGALPAVVWIDSTL
.:.. . :. ::: :.::: :.: :. . :. .::....::. . ... ...:
CCDS31 MPTFNGSVFMPSAFILIGIPGLESVQCWIGIPFSAMYLIGVIGNSLILVIIKYENSL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 HQPMFLLLAILAATDLGLATSIAPGLLAVLWLGPRSVPYAVCLVQMFFVHALTAMESGVL
: ::...::.:::::..: : : : .:...:. . . .:: ::...:.. :.:::.:
CCDS31 HIPMYIFLAMLAATDIALNTCILPKMLGIFWFHLPEISFDACLFQMWLIHSFQAIESGIL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE6 LAMACDRAAAIGRPLHYPVLVTKACVGYAALALALKAVAIVVP-FPLLVAKFEHFQAKTI
:::: :: .:: ::.. .. .. . . .:...:.:. ...: . :. ..:... .:
CCDS31 LAMALDRYVAICIPLRHATIFSQQFLTHIGLGVTLRAAILIIPSLGLIKCCLKHYRTTVI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 GHTYCAHMAVVELVVGNTQATNLYGLALSLAISGMDILGITGSYGLIAHAVLQLPTREAR
.:.:: :::.:.:.. . .....::: ...:: :.::. :: :: : .:.::: .:::
CCDS31 SHSYCEHMAIVKLATEDIRVNKIYGLFVAFAILGFDIIFITLSYVQIFITVFQLPQKEAR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 AKAFGTCSSHICVIQAFYIPGLFSYLTHRFGHHTVPKPVHILLSNIYLLLPPALNPLIYG
:::.:: .::::. ::. ..::..::::: : .: .::::::.:::.:: :::..::
CCDS31 FKAFNTCIAHICVFLQFYLLAFFSFFTHRFGSH-IPPYIHILLSNLYLLVPPFLNPIVYG
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE6 ARTKQIRDRLLETFTFRKSPL
..::::::.....: :.:
CCDS31 VKTKQIRDHIVKVFFFKKVT
300 310
>>CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 917 init1: 779 opt: 941 Z-score: 927.9 bits: 179.9 E(32554): 2.3e-45
Smith-Waterman score: 941; 43.9% identity (78.4% similar) in 310 aa overlap (8-317:6-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAETLQLNSTFLHPNFFILTGFPGLGSAQTWLTLVFGPIYLLALLGNGALPAVVWIDSTL
:: ..: .::: ::::: ...::...: ::.:..:: .. .:.::.:.:
CCDS31 MGDWNNSDAVEP-IFILRGFPGLEYVHSWLSILFCLAYLVAFMGNVTILSVIWIESSL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 HQPMFLLLAILAATDLGLATSIAPGLLAVLWLGPRSVPYAVCLVQMFFVHALTAMESGVL
::::. ...:::..:::.. : : .:::::: . ..: .:.::.:..: .::.::
CCDS31 HQPMYYFISILAVNDLGMSLSTLPTMLAVLWLDAPEIQASACYAQLFFIHTFTFLESSVL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LAMACDRAAAIGRPLHYPVLVTKACVGYAALALALKAVAIVVPFPLLVAKFEHFQAKTIG
:::: :: .:: .:::::...:.. .: .:: :.....:.: :::. .... ......
CCDS31 LAMAFDRFVAICHPLHYPTILTNSVIGKIGLACLLRSLGVVLPTPLLLRHYHYCHGNALS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 HTYCAHMAVVELVVGNTQATNLYGLALSLAISGMDILGITGSYGLIAHAVLQLPTREARA
:..: :. :..: .......::: . .: :.: . : :: :: ..::.. .:: .
CCDS31 HAFCLHQDVLRLSCTDARTNSIYGLCVVIATLGVDSIFILLSYVLILNTVLDIASREEQL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 KAFGTCSSHICVIQAFYIPGLFSYLTHRFGHHTVPKPVHILLSNIYLLLPPALNPLIYGA
::..:: :::::. :..: . ..::::.: : ::::...:::::::.:::..:..
CCDS31 KALNTCVSHICVVLIFFVPVIGVSMVHRFGKHLSPI-VHILMADIYLLLPPVLNPIVYSV
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE6 RTKQIRDRLLETFTFRKSPL
:::::: .:. :..:.
CCDS31 RTKQIRLGILHKFVLRRRF
300 310
>>CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 944 init1: 776 opt: 936 Z-score: 923.1 bits: 179.0 E(32554): 4.3e-45
Smith-Waterman score: 936; 46.4% identity (76.5% similar) in 306 aa overlap (8-313:5-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAETLQLNSTFLHPNFFILTGFPGLGSAQTWLTLVFGPIYLLALLGNGALPAVVWIDSTL
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