Result of FASTA (omim) for
pFN21AE6040
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6040, 317 aa
1>>>pF1KE6040 317 - 317 aa - 317 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2431+/-0.00045; mu= 16.1240+/- 0.028
mean_var=97.1623+/-24.868, 0's: 0 Z-trim(110.3): 240 B-trim: 1077 in 1/50
Lambda= 0.130114
statistics sampled from 18283 (18638) to 18283 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.565), E-opt: 0.2 (0.219), width: 16
Scan time: 7.440
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 1247 245.0 1.5e-64
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 942 187.8 2.6e-47
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 930 185.5 1.2e-46
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 903 180.5 4.1e-45
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 857 171.8 1.6e-42
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 856 171.6 1.8e-42
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 856 171.6 1.8e-42
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 848 170.1 5.2e-42
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 841 168.8 1.3e-41
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 812 163.4 5.6e-40
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 807 162.4 1.1e-39
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 807 162.4 1.1e-39
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 807 162.4 1.1e-39
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 802 161.5 2.1e-39
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 800 161.1 2.6e-39
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 781 157.5 3.1e-38
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 781 157.5 3.2e-38
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 765 154.5 2.5e-37
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 754 152.5 1e-36
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 752 152.1 1.4e-36
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 514 107.4 3.9e-23
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 485 102.0 1.7e-21
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 230 54.1 4.4e-07
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 199 48.3 2.5e-05
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 197 48.0 3.6e-05
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 197 48.0 3.6e-05
NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 192 47.0 6.3e-05
NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337) 191 46.8 7.3e-05
NP_001243495 (OMIM: 601919) proteinase-activated r ( 352) 181 45.0 0.00028
NP_004092 (OMIM: 601919) proteinase-activated rece ( 374) 181 45.0 0.00029
NP_002377 (OMIM: 155555,203200,266300,613098,61309 ( 317) 180 44.7 0.00029
NP_005288 (OMIM: 601751) melanin-concentrating hor ( 422) 180 44.9 0.00036
NP_000855 (OMIM: 182133) 5-hydroxytryptamine recep ( 377) 178 44.4 0.00043
XP_011527129 (OMIM: 162651) PREDICTED: neurotensin ( 336) 175 43.8 0.00058
NP_002522 (OMIM: 162651) neurotensin receptor type ( 418) 175 43.9 0.00068
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 173 43.6 0.00089
XP_011534091 (OMIM: 182132) PREDICTED: 5-hydroxytr ( 365) 171 43.1 0.001
NP_000856 (OMIM: 182132) 5-hydroxytryptamine recep ( 365) 171 43.1 0.001
NP_001718 (OMIM: 300107) bombesin receptor subtype ( 399) 171 43.2 0.0011
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 165 41.9 0.0021
NP_001727 (OMIM: 113995) C5a anaphylatoxin chemota ( 350) 165 42.0 0.0022
NP_001265427 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 165 42.0 0.0025
NP_001265426 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 165 42.0 0.0025
NP_001265428 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 165 42.0 0.0025
NP_001265429 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 165 42.0 0.0025
NP_000666 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a [H ( 412) 165 42.0 0.0025
NP_005289 (OMIM: 602174) probable G-protein couple ( 361) 161 41.2 0.0038
XP_016882097 (OMIM: 600551) PREDICTED: G-protein c ( 362) 157 40.5 0.0064
NP_005273 (OMIM: 600551) G-protein coupled recepto ( 362) 157 40.5 0.0064
XP_016882096 (OMIM: 600551) PREDICTED: G-protein c ( 362) 157 40.5 0.0064
>>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo (327 aa)
initn: 1231 init1: 926 opt: 1247 Z-score: 1279.8 bits: 245.0 E(85289): 1.5e-64
Smith-Waterman score: 1247; 57.4% identity (84.5% similar) in 317 aa overlap (2-314:4-319)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MRNLSGGHVEEFVLVGFPTTPPLQLLLFVLFFAIYLLTLLENALIVFTIWLAPSLHRP
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NP_003 MEWRNHSG-RVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLHKP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 MYFFLGHLSFLELWYINVTIPRLLAAFL--TQD-GR-VSYVGCMTQLYFFIALACTECVL
:::::...::::.::..::::..::.:. :: :. .:. :::::::::..:.::::::
NP_003 MYFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVL
60 70 80 90 100 110
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pF1KE6 LAVMAYDRYLAICGPLLYPSLMPSSLATRLAAASWGSGFFSSMMKLLFISQLSYCGPNII
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NP_003 LAVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPNII
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pF1KE6 NHFFCDISPLLNLTCSDKEQAELVDFLLALVMILLPLLAVVSSYTAIIAAILRIPTSRGR
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NP_003 NHFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAGR
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pF1KE6 HKAFSTCAAHLAVVVIYYSSTLFTYARPRAMYTFNHNKIISVLYTIIVPFFNPAIYCLRN
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NP_003 YKAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLRN
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 KEVKEAFRKTVMGRCHYPRDVQD
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NP_003 QEVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
300 310 320
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 923 init1: 904 opt: 942 Z-score: 970.5 bits: 187.8 E(85289): 2.6e-47
Smith-Waterman score: 942; 45.1% identity (76.1% similar) in 297 aa overlap (9-304:9-305)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MRNLSGGHVEEFVLVGFPTTPP-LQLLLFVLFFAIYLLTLLENALIVFTIWLAPSLHRPM
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NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
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pF1KE6 YDRYLAICGPLLYPSLMPSSLATRLAAASWGSGFFSSMMKLLFISQLSYCGPNIINHFFC
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NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
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pF1KE6 DISPLLNLTCSDKEQAELVDFLLALVMILLPLLAVVSSYTAIIAAILRIPTSRGRHKAFS
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NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
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240 250 260 270 280 290
pF1KE6 TCAAHLAVVVIYYSSTLFTYARPRAMYTFNHNKIISVLYTIIVPFFNPAIYCLRNKEVKE
::..:: :: ..: :. .:: :.. . . .:..:. ::...:..:: :: :::.:::.
NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
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300 310
pF1KE6 AFRKTVMGRCHYPRDVQD
:. .:
NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP
310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 971 init1: 930 opt: 930 Z-score: 958.4 bits: 185.5 E(85289): 1.2e-46
Smith-Waterman score: 930; 43.4% identity (79.0% similar) in 295 aa overlap (11-305:11-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MRNLSGGHVEEFVLVGFPTTPPLQLLLFVLFFAIYLLTLLENALIVFTIWLAPSLHRPMY
::::.:. : ::..::..:..:: ::.: : ... : . .:: :::
NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
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pF1KE6 FFLGHLSFLELWYINVTIPRLLAAFLTQDGRVSYVGCMTQLYFFIALACTECVLLAVMAY
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pF1KE6 DRYLAICGPLLYPSLMPSSLATRLAAASWGSGFFSSMMKLLFISQLSYCGPNIINHFFCD
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NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
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pF1KE6 ISPLLNLTCSDKEQAELVDFLLALVMILLPLLAVVSSYTAIIAAILRIPTSRGRHKAFST
::..:.::: : .. .:: : :. ::...:::. .. .:. . ...:::.::::
NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
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pF1KE6 CAAHLAVVVIYYSSTLFTYARPRAMYTFNHNKIISVLYTIIVPFFNPAIYCLRNKEVKEA
::.::......:.. ..:: :: . :..:..:. ::.::...:..:: :: ::.::::.:
NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
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310
pF1KE6 FRKTVMGRCHYPRDVQD
. ...
NP_003 LANVISRKRTSSFL
310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 926 init1: 899 opt: 903 Z-score: 931.0 bits: 180.5 E(85289): 4.1e-45
Smith-Waterman score: 903; 44.3% identity (74.0% similar) in 300 aa overlap (9-308:11-310)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MRNLSGGHVEEFVLVGFPTTPPLQLLLFVLFFAIYLLTLLENALIVFTIWLAPSLHRP
: ::.:.:::: : ::..::..:...: . :. : ... : . : :. :
NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
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pF1KE6 MYFFLGHLSFLELWYINVTIPRLLAAFLTQDGRVSYVGCMTQLYFFIALACTECVLLAVM
:::::..:::..: :.. .:..:. ::... .:: :: :.::: ..: :: .::.:
NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
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pF1KE6 AYDRYLAICGPLLYPSLMPSSLATRLAAASWGSGFFSSMMKLLFISQLSYCGPNIINHFF
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NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
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::. :::.:.:.: : . . . .. .. .. :: :. ..:.: . ::.:.:
NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
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pF1KE6 STCAAHLAVVVIYYSSTLFTYARPRAMYTFNHNKIISVLYTIIVPFFNPAIYCLRNKEVK
::::.::. :.:: .. :: :.:: .:. : .:::::.:::..: .:: :: ::::.::
NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
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300 310
pF1KE6 EAFRKTVMGRCHYPRDVQD
.: .:.. ..
NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 892 init1: 845 opt: 857 Z-score: 884.2 bits: 171.8 E(85289): 1.6e-42
Smith-Waterman score: 857; 39.7% identity (73.9% similar) in 310 aa overlap (2-308:9-317)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MRNLSGGH---VEEFVLVGFPTTPPLQLLLFVLFFAIYLLTLLENALIVFTIW
: .:: . : ::.:.:. : : ::::.:...:: :.: : ::....
XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
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60 70 80 90 100 110
pF1KE6 LAPSLHRPMYFFLGHLSFLELWYINVTIPRLLAAFLTQDGRVSYVGCMTQLYFFIALACT
. :: ::::::..:::... . .:.:..:: . . .:. ::.::.:: . ..
XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
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pF1KE6 ECVLLAVMAYDRYLAICGPLLYPSLMPSSLATRLAAASWGSGFFSSMMKLLFISQLSYCG
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XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
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pF1KE6 PNIINHFFCDISPLLNLTCSDKEQAELVDFLLALVMILLPLLAVVSSYTAIIAAILRIPT
: :.:::::..:::.:.::: . :.. . . .... :.: ...:: : ..:..:.
XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
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pF1KE6 SRGRHKAFSTCAAHLAVVVIYYSSTLFTYARPRAMYTFNHNKIISVLYTIIVPFFNPAIY
..:: ::::::..:::::...::. . .: : . .. ... . .::::...:..:: ::
XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
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300 310
pF1KE6 CLRNKEVKEAFRKTVMGRCHYPRDVQD
:::. .: :..: :.::
XP_011 SLRNRYLKGALKK-VVGRVVFSV
310 320
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 892 init1: 845 opt: 856 Z-score: 883.4 bits: 171.6 E(85289): 1.8e-42
Smith-Waterman score: 856; 39.3% identity (74.0% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MRNLSGGHVEEFVLVGFPTTPPLQLLLFVLFFAIYLLTLLENALIVFTIWLAPSLHRPMY
: . . . : ::.:.:. : : ::::.:...:: :.: : ::.... . :: :::
NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE6 FFLGHLSFLELWYINVTIPRLLAAFLTQDGRVSYVGCMTQLYFFIALACTECVLLAVMAY
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NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYLAICGPLLYPSLMPSSLATRLAAASWGSGFFSSMMKLLFISQLSYCGPNIINHFFCD
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NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 ISPLLNLTCSDKEQAELVDFLLALVMILLPLLAVVSSYTAIIAAILRIPTSRGRHKAFST
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NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CAAHLAVVVIYYSSTLFTYARPRAMYTFNHNKIISVLYTIIVPFFNPAIYCLRNKEVKEA
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NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 FRKTVMGRCHYPRDVQD
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NP_036 LKK-VVGRVVFSV
310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 892 init1: 845 opt: 856 Z-score: 883.4 bits: 171.6 E(85289): 1.8e-42
Smith-Waterman score: 856; 39.3% identity (74.0% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MRNLSGGHVEEFVLVGFPTTPPLQLLLFVLFFAIYLLTLLENALIVFTIWLAPSLHRPMY
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XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLGHLSFLELWYINVTIPRLLAAFLTQDGRVSYVGCMTQLYFFIALACTECVLLAVMAY
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XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYLAICGPLLYPSLMPSSLATRLAAASWGSGFFSSMMKLLFISQLSYCGPNIINHFFCD
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XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 ISPLLNLTCSDKEQAELVDFLLALVMILLPLLAVVSSYTAIIAAILRIPTSRGRHKAFST
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XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CAAHLAVVVIYYSSTLFTYARPRAMYTFNHNKIISVLYTIIVPFFNPAIYCLRNKEVKEA
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XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 FRKTVMGRCHYPRDVQD
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XP_011 LKK-VVGRVVFSV
310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 859 init1: 832 opt: 848 Z-score: 875.3 bits: 170.1 E(85289): 5.2e-42
Smith-Waterman score: 848; 42.6% identity (72.0% similar) in 296 aa overlap (12-307:15-309)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MRNLSGGHVEEFVLVGFPTTPPLQLLLFVLFFAIYLLTLLENALIVFTIWLAPSLHR
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 PMYFFLGHLSFLELWYINVTIPRLLAAFLTQDGRVSYVGCMTQLYFFIALACTECVLLAV
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 MAYDRYLAICGPLLYPSLMPSSLATRLAAASWGSGFFSSMMKLLFISQLSYCGPNIINHF
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NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 FCDISPLLNLTCSDKEQAELVDFLLALVMILLPLLAVVSSYTAIIAAILRIPTSRGRHKA
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NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 FSTCAAHLAVVVIYYSSTLFTYARPRAMYTFNHNKIISVLYTIIVPFFNPAIYCLRNKEV
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NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 KEAFRKTVMGRCHYPRDVQD
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NP_001 RGAVKR-LMGWE
310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 887 init1: 727 opt: 841 Z-score: 868.2 bits: 168.8 E(85289): 1.3e-41
Smith-Waterman score: 841; 40.3% identity (75.9% similar) in 303 aa overlap (1-303:1-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MRNLSGGHVEEFVLVGFPTTPPLQLLLFVLFFAIYLLTLLENALIVFTIWLAPSLHRPMY
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NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLGHLSFLELWYINVTIPRLLAAFLTQDGRVSYVGCMTQLYFFIALACTECVLLAVMAY
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NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYLAICGPLLYPSLMPSSLATRLAAASWGSGFFSSMMKLLFISQLSYCGPNIINHFFCD
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NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
130 140 150 160 170 180
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pF1KE6 ISPLLNLTCSDKEQAELVDFLLALVMILLPLLAVVSSYTAIIAAILRIPTSRGRHKAFST
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NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CAAHLAVVVIYYSSTLFTYARPRAMYTFNHNKIISVLYTIIVPFFNPAIYCLRNKEVKEA
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NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKS--SKQQEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA
250 260 270 280 290
310
pF1KE6 FRKTVMGRCHYPRDVQD
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NP_003 LRKVATRNFP
300
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 802 init1: 777 opt: 812 Z-score: 838.7 bits: 163.4 E(85289): 5.6e-40
Smith-Waterman score: 812; 36.8% identity (72.0% similar) in 307 aa overlap (6-309:4-310)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MRNLSGGHVEE---FVLVGFPTTPPLQLLLFVLFFAIYLLTLLENALIVFTIWLAPSLHR
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NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHT
10 20 30 40 50
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pF1KE6 PMYFFLGHLSFLELWYINVTIPRLLAAFLTQDGRVSYVGCMTQLYFFIALACTECVLLAV
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NP_001 PMYFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTA
60 70 80 90 100 110
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pF1KE6 MAYDRYLAICGPLLYPSLMPSSLATRLAAASWGSGFFSSMMKLLFISQLSYCGPNIINHF
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NP_001 MAYDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHF
120 130 140 150 160 170
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pF1KE6 FCDISPLLNLTCSDKEQAELVDFLLALVMILLPLLAVVSSYTAIIAAILRIPTSRGRHKA
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NP_001 FCDMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKA
180 190 200 210 220 230
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pF1KE6 FSTCAAHLAVVVIYYSSTLFTYARPRAMYTFNHNKIISVLYTIIVPFFNPAIYCLRNKEV
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240 250 260 270 280 290
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:.:... .:
NP_001 KDALKRLQKRKCC
300 310
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Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]