FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6040, 317 aa
1>>>pF1KE6040 317 - 317 aa - 317 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3334+/-0.00106; mu= 15.5240+/- 0.062
mean_var=144.8418+/-48.660, 0's: 0 Z-trim(104.8): 371 B-trim: 440 in 1/49
Lambda= 0.106568
statistics sampled from 7617 (8071) to 7617 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.597), E-opt: 0.2 (0.248), width: 16
Scan time: 2.260
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS43667.1 OR6B1 gene_id:135946|Hs108|chr7 ( 311) 1198 196.5 2.2e-50
CCDS42837.1 OR6B3 gene_id:150681|Hs108|chr2 ( 331) 1177 193.3 2.2e-49
CCDS46559.1 OR6B2 gene_id:389090|Hs108|chr2 ( 312) 1164 191.3 8.3e-49
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CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 954 159.0 4.4e-39
CCDS32034.1 OR11H4 gene_id:390442|Hs108|chr14 ( 324) 954 159.0 4.5e-39
CCDS32017.1 OR11H12 gene_id:440153|Hs108|chr14 ( 326) 954 159.0 4.5e-39
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 952 158.7 5.4e-39
CCDS74807.1 OR11H1 gene_id:81061|Hs108|chr22 ( 326) 952 158.7 5.5e-39
CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1 ( 308) 949 158.2 7.4e-39
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 942 157.2 1.6e-38
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 942 157.2 1.6e-38
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 935 156.1 3.3e-38
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 934 155.9 3.7e-38
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CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 930 155.3 5.6e-38
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 920 153.8 1.6e-37
CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 ( 303) 919 153.6 1.8e-37
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CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 904 151.4 9.3e-37
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 903 151.2 1e-36
CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 ( 313) 900 150.7 1.4e-36
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 900 150.8 1.4e-36
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CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 896 150.1 2.1e-36
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CCDS31536.1 OR9G1 gene_id:390174|Hs108|chr11 ( 305) 891 149.3 3.5e-36
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 890 149.2 4e-36
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 890 149.2 4e-36
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 884 148.2 7.4e-36
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 881 147.8 1e-35
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 881 147.8 1e-35
CCDS31827.1 OR6C4 gene_id:341418|Hs108|chr12 ( 309) 880 147.6 1.2e-35
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 880 147.7 1.2e-35
CCDS31819.1 OR6C3 gene_id:254786|Hs108|chr12 ( 311) 879 147.5 1.3e-35
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 878 147.4 1.5e-35
>>CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1 (317 aa)
initn: 2098 init1: 2098 opt: 2098 Z-score: 1765.7 bits: 334.9 E(32554): 5e-92
Smith-Waterman score: 2098; 100.0% identity (100.0% similar) in 317 aa overlap (1-317:1-317)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MRNLSGGHVEEFVLVGFPTTPPLQLLLFVLFFAIYLLTLLENALIVFTIWLAPSLHRPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MRNLSGGHVEEFVLVGFPTTPPLQLLLFVLFFAIYLLTLLENALIVFTIWLAPSLHRPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLGHLSFLELWYINVTIPRLLAAFLTQDGRVSYVGCMTQLYFFIALACTECVLLAVMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 FFLGHLSFLELWYINVTIPRLLAAFLTQDGRVSYVGCMTQLYFFIALACTECVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYLAICGPLLYPSLMPSSLATRLAAASWGSGFFSSMMKLLFISQLSYCGPNIINHFFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DRYLAICGPLLYPSLMPSSLATRLAAASWGSGFFSSMMKLLFISQLSYCGPNIINHFFCD
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190 200 210 220 230 240
pF1KE6 ISPLLNLTCSDKEQAELVDFLLALVMILLPLLAVVSSYTAIIAAILRIPTSRGRHKAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ISPLLNLTCSDKEQAELVDFLLALVMILLPLLAVVSSYTAIIAAILRIPTSRGRHKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CAAHLAVVVIYYSSTLFTYARPRAMYTFNHNKIISVLYTIIVPFFNPAIYCLRNKEVKEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 CAAHLAVVVIYYSSTLFTYARPRAMYTFNHNKIISVLYTIIVPFFNPAIYCLRNKEVKEA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 FRKTVMGRCHYPRDVQD
:::::::::::::::::
CCDS53 FRKTVMGRCHYPRDVQD
310
>>CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 (325 aa)
initn: 1319 init1: 1272 opt: 1294 Z-score: 1097.5 bits: 211.3 E(32554): 8.2e-55
Smith-Waterman score: 1294; 59.6% identity (85.4% similar) in 302 aa overlap (12-313:17-318)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MRNLSGGHVEEFVLVGFPTTPPLQLLLFVLFFAIYLLTLLENALIVFTIWLAPSL
:.:.:::: : .:::.: .:.: :::::::: ::...: .:
CCDS30 MTTIILEVDNHTVTTRFILLGFPTRPAFQLLFFSIFLATYLLTLLENLLIILAIHSDGQL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 HRPMYFFLGHLSFLELWYINVTIPRLLAAFLTQDGRVSYVGCMTQLYFFIALACTECVLL
:.::::::.::::::.::..: :..:. ::..: .:. :::::::::....::: .::
CCDS30 HKPMYFFLSHLSFLEMWYVTVISPKMLVDFLSHDKSISFNGCMTQLYFFVTFVCTEYILL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 AVMAYDRYLAICGPLLYPSLMPSSLATRLAAASWGSGFFSSMMKLLFISQLSYCGPNIIN
:.::.:::.:::.:: :: .: ..: ::.. : :....:.:..::.:: ::: ::
CCDS30 AIMAFDRYVAICNPLRYPVIMTNQLCGTLAGGCWFCGLMTAMIKMVFIAQLHYCGMPQIN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 HFFCDISPLLNLTCSDKEQAELVDFLLALVMILLPLLAVVSSYTAIIAAILRIPTSRGRH
:.:::::::::..: : :::.:::.:::..: .:: .::.::.::.:.:::::...::.
CCDS30 HYFCDISPLLNVSCEDASQAEMVDFFLALMVIAIPLCVVVASYAAILATILRIPSAQGRQ
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 KAFSTCAAHLAVVVIYYSSTLFTYARPRAMYTFNHNKIISVLYTIIVPFFNPAIYCLRNK
:::::::.::.::...:: ::::::::. ::..: ::..:::::.:::..:: ::::::.
CCDS30 KAFSTCASHLTVVILFYSMTLFTYARPKLMYAYNSNKVVSVLYTVIVPLLNPIIYCLRNH
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 EVKEAFRKTVMGRCHYPRDVQD
::: :.:::. : :.
CCDS30 EVKAALRKTIHCRGSGPQGNGAFSS
310 320
>>CCDS7772.1 OR6A2 gene_id:8590|Hs108|chr11 (327 aa)
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Smith-Waterman score: 1247; 57.4% identity (84.5% similar) in 317 aa overlap (2-314:4-319)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MRNLSGGHVEEFVLVGFPTTPPLQLLLFVLFFAIYLLTLLENALIVFTIWLAPSLHRP
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CCDS77 MEWRNHSG-RVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLHKP
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pF1KE6 MYFFLGHLSFLELWYINVTIPRLLAAFL--TQD-GR-VSYVGCMTQLYFFIALACTECVL
:::::...::::.::..::::..::.:. :: :. .:. :::::::::..:.::::::
CCDS77 MYFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVL
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pF1KE6 LAVMAYDRYLAICGPLLYPSLMPSSLATRLAAASWGSGFFSSMMKLLFISQLSYCGPNII
:::::::::.::: :: :: .. . : ...::.::..:: ::.:...:: :::::::::
CCDS77 LAVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPNII
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pF1KE6 NHFFCDISPLLNLTCSDKEQAELVDFLLALVMILLPLLAVVSSYTAIIAAILRIPTSRGR
::::::.::::::.:.: :::.::.::. ..: :: .. .::.:: .:...::.. ::
CCDS77 NHFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAGR
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pF1KE6 HKAFSTCAAHLAVVVIYYSSTLFTYARPRAMYTFNHNKIISVLYTIIVPFFNPAIYCLRN
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CCDS77 YKAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLRN
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 KEVKEAFRKTVMGRCHYPRDVQD
.:::.:. :. : :
CCDS77 QEVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
300 310 320
>>CCDS43667.1 OR6B1 gene_id:135946|Hs108|chr7 (311 aa)
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Smith-Waterman score: 1198; 56.4% identity (82.0% similar) in 305 aa overlap (9-313:9-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MRNLSGGHVEEFVLVGFPTTPPLQLLLFVLFFAIYLLTLLENALIVFTIWLAPSLHRPMY
: .:.::::: . .. .:..:.. :.::. ::..:.. . ::.:::
CCDS43 MELENQTRVTKFILVGFPGSLSMRAAMFLIFLVAYILTVAENVIIILLVLQNRPLHKPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE6 FFLGHLSFLELWYINVTIPRLLAAFLTQDGRVSYVGCMTQLYFFIALACTECVLLAVMAY
:::..::::: :::.::.:.:: .: . .. .:.. :: :::::::: ::::::::.:::
CCDS43 FFLANLSFLETWYISVTVPKLLFSFWSVNNSISFTLCMIQLYFFIALMCTECVLLAAMAY
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pF1KE6 DRYLAICGPLLYPSLMPSSLATRLAAASWGSGFFSSMMKLLFISQLSYCGPNIINHFFCD
:::.::: :: ::..: .: ::: .::. :: :. :. ::: ::.::::.:::::::
CCDS43 DRYVAICRPLHYPTIMSHGLCFRLALGSWAIGFGISLAKIYFISCLSFCGPNVINHFFCD
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190 200 210 220 230 240
pF1KE6 ISPLLNLTCSDKEQAELVDFLLALVMILLPLLAVVSSYTAIIAAILRIPTSRGRHKAFST
:::.:::.:.: .:::::.::::..:.::. .: :: :.:.:: .:: :..:::::
CCDS43 ISPVLNLSCTDMSITELVDFILALVIFLFPLFITVLSYGCILATILCMPT--GKQKAFST
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CAAHLAVVVIYYSSTLFTYARPRAMYTFNHNKIISVLYTIIVPFFNPAIYCLRNKEVKEA
::.::.::.:.::. .: :::::....:: :::::..:.:..: .:: ::::::.:::::
CCDS43 CASHLVVVTIFYSAIIFMYARPRVIHAFNMNKIISIFYAIVTPSLNPFIYCLRNREVKEA
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 FRKTVMGRCHYPRDVQD
..: .. :. :
CCDS43 LKK--LAYCQASRSD
300 310
>>CCDS42837.1 OR6B3 gene_id:150681|Hs108|chr2 (331 aa)
initn: 1163 init1: 1163 opt: 1177 Z-score: 1000.2 bits: 193.3 E(32554): 2.2e-49
Smith-Waterman score: 1177; 55.4% identity (82.2% similar) in 303 aa overlap (4-303:1-303)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MRNLSGGHVEE---FVLVGFPTTPPLQLLLFVLFFAIYLLTLLENALIVFTIWLAPSLHR
.:: .: . :.::::::.: :: :::.::. ::..:.:: :..:.: . ::::
CCDS42 MSGENVTRVGTFILVGFPTAPGLQYLLFLLFLLTYLFVLVENLAIILTVWSSTSLHR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 PMYFFLGHLSFLELWYINVTIPRLLAAFLTQDGRVSYVGCMTQLYFFIALACTECVLLAV
:::.::. .::::.::.. :..: .:: :. :.:.:::::::::: .:.::::::::
CCDS42 PMYYFLSSMSFLEIWYVSDITPKMLEGFLLQQKRISFVGCMTQLYFFSSLVCTECVLLAS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 MAYDRYLAICGPLLYPSLMPSSLATRLAAASWGSGFFSSMMKLLFISQLSYCGPNIINHF
::::::.::: :: : :. .: .:.. :. ::: ::.:. :::....:: :..:::
CCDS42 MAYDRYVAICHPLRYHVLVTPGLCLQLVGFSFVSGFTISMIKVCFISSVTFCGSNVLNHF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 FCDISPLLNLTCSDKEQAELVDFLLALVMILLPLLAVVSSYTAIIAAILRIPTSRGRHKA
::::::.:.:.:.: ::::::.::......::::.. ::. : :.::::.. : .:
CCDS42 FCDISPILKLACTDFSTAELVDFILAFIILVFPLLATMLSYAHITLAVLRIPSATGCWRA
180 190 200 210 220 230
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pF1KE6 FSTCAAHLAVVVIYYSSTLFTYARPRAMYTFNHNKIISVLYTIIVPFFNPAIYCLRNKEV
: :::.::.::...:.. :: :.::.:. . . ::.::::::.:.:..:: ::::::::
CCDS42 FFTCASHLTVVTVFYTALLFMYVRPQAIDSRSSNKLISVLYTVITPILNPLIYCLRNKEF
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 KEAFRKTVMGRCHYPRDVQD
:.:..:
CCDS42 KNALKKAFGLTSCAVEGRLSSLLELHLQIHSQPL
300 310 320 330
>>CCDS46559.1 OR6B2 gene_id:389090|Hs108|chr2 (312 aa)
initn: 1177 init1: 1149 opt: 1164 Z-score: 989.7 bits: 191.3 E(32554): 8.3e-49
Smith-Waterman score: 1164; 54.5% identity (82.5% similar) in 297 aa overlap (9-305:9-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MRNLSGGHVEEFVLVGFPTTPPLQLLLFVLFFAIYLLTLLENALIVFTIWLAPSLHRPMY
: :.:::.::.: :: :::.::. ::..:.:: :.. .: . :::::::
CCDS46 MSGENVTKVSTFILVGLPTAPGLQYLLFLLFLLTYLFVLVENLAIILIVWSSTSLHRPMY
10 20 30 40 50 60
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CCDS46 LKKALGLGQTSH
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CCDS31 MYFFLTHLSCLEIWYTSVTVPKMLAGFIGVDGGKNISYADCLSQLFIFTFLGATECFLLA
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CCDS31 AFSTCAAHLTVVSLFYGTLFFMYVQTKVTSSINFNKVVSVFYSVVTPMLNPLIYSLRNKE
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CCDS31 VKGALGRVFSLNFWKGQ
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CCDS31 CGSHLAVVTLYYGTMISMYVCPSPHLLPEINKIISVFYTVVTPLLNPVIYSLRNKDFKEA
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CCDS31 TCASHLTAVTLFYGSGFFMYMRPSSSYSLNRDKVVSIFYALVIPVVNPIIYSFRNKEIKN
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