Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6038
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6038, 317 aa
1>>>pF1KE6038 317 - 317 aa - 317 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6898+/-0.00103; mu= 13.5041+/- 0.060
mean_var=170.5140+/-58.286, 0's: 0 Z-trim(104.8): 376 B-trim: 482 in 1/49
Lambda= 0.098219
statistics sampled from 7623 (8091) to 7623 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.61), E-opt: 0.2 (0.249), width: 16
Scan time: 1.920
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs108|chr1 ( 317) 2094 309.6 2e-84
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 1273 193.3 2.1e-49
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 1243 189.1 4.4e-48
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 1233 187.6 1.1e-47
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 1221 185.9 3.5e-47
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 1175 179.4 3.2e-45
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 1173 179.1 3.9e-45
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 1168 178.4 6.4e-45
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 1164 177.8 9.5e-45
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 1163 177.7 1.1e-44
CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16 ( 312) 1154 176.4 2.5e-44
CCDS4660.1 OR2H1 gene_id:26716|Hs108|chr6 ( 316) 1152 176.1 3.1e-44
CCDS31092.1 OR2G2 gene_id:81470|Hs108|chr1 ( 317) 1147 175.4 5.1e-44
CCDS31099.1 OR2W3 gene_id:343171|Hs108|chr1 ( 314) 1112 170.5 1.6e-42
CCDS4656.1 OR2W1 gene_id:26692|Hs108|chr6 ( 320) 1103 169.2 3.8e-42
CCDS34323.1 OR2Y1 gene_id:134083|Hs108|chr5 ( 311) 1096 168.2 7.5e-42
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 1007 155.6 4.8e-38
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 964 149.5 3.2e-36
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 964 149.5 3.3e-36
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 960 148.9 4.8e-36
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 960 148.9 4.8e-36
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 956 148.4 7.1e-36
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 950 147.5 1.3e-35
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 936 145.5 5.1e-35
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 929 144.5 9.9e-35
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 929 144.6 1e-34
CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 ( 347) 929 144.6 1.1e-34
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 928 144.4 1.1e-34
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 923 143.7 1.8e-34
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 923 143.7 1.9e-34
CCDS35091.1 OR13C5 gene_id:138799|Hs108|chr9 ( 318) 922 143.6 2e-34
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 921 143.4 2.2e-34
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 920 143.3 2.4e-34
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 919 143.1 2.7e-34
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 918 142.9 2.9e-34
CCDS31102.1 OR2AK2 gene_id:391191|Hs108|chr1 ( 335) 918 143.0 3.1e-34
CCDS31124.1 OR2T27 gene_id:403239|Hs108|chr1 ( 317) 917 142.8 3.3e-34
CCDS6596.2 OR2S2 gene_id:56656|Hs108|chr9 ( 319) 916 142.7 3.6e-34
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 915 142.5 3.9e-34
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 912 142.1 5.3e-34
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 911 142.0 5.8e-34
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 911 142.0 5.8e-34
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 907 141.4 8.7e-34
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 906 141.3 9.7e-34
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 904 141.0 1.2e-33
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 902 140.7 1.4e-33
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 901 140.6 1.6e-33
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 899 140.3 1.9e-33
CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9 ( 320) 899 140.3 1.9e-33
CCDS31115.1 OR2T1 gene_id:26696|Hs108|chr1 ( 369) 899 140.4 2.1e-33
>>CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs108|chr1 (317 aa)
initn: 2094 init1: 2094 opt: 2094 Z-score: 1629.0 bits: 309.6 E(32554): 2e-84
Smith-Waterman score: 2094; 99.4% identity (99.7% similar) in 317 aa overlap (1-317:1-317)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKSDNHSFLGDSPKAFILLGVSDRPWLELPLFVVLLLSYVLAMLGNVAIILASRVDPQLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MKSDNHSFLGDSPKAFILLGVSDRPWLELPLFVVLLLSYVLAMLGNVAIILASRVDPQLH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 SPMYIFLSHLSFLDLCYTTTTVPQMLVNMGSSQKTISYGGCTVQYAVFHWLGCTECIVLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SPMYIFLSHLSFLDLCYTTTTVPQMLVNMGSSQKTISYGGCTVQYAVFHWLGCTECIVLA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 AMALDRYVASCKPLHYAVLMHRALCQQLVALAWLSGFGNSFVQVVLTVQLPFCGRQVLNN
::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AMALDRYVAICKPLHYAVLMHRALCQQLVALAWLSGFGNSFVQVVLTVQLPFCGRQVLNN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 FFCEVPAVIKLSCADTAMNDTILAVLVAFFVLVPLALILLSYGFIARAVLRIQSSKGRHK
:::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FFCEVPAVIKLSCADTAVNDTILAVLVAFFVLVPLALILLSYGFIARAVLRIQSSKGRHK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 AFGTCSSHLMIVSLFYLPAIYMYLQPPSSYSQEQGKFISLFYSIITPTLNPFTYTLRNKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AFGTCSSHLMIVSLFYLPAIYMYLQPPSSYSQEQGKFISLFYSIITPTLNPFTYTLRNKD
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 MKGALRRLLARIWRLCG
:::::::::::::::::
CCDS31 MKGALRRLLARIWRLCG
310
>>CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 (313 aa)
initn: 1310 init1: 1271 opt: 1273 Z-score: 1000.3 bits: 193.3 E(32554): 2.1e-49
Smith-Waterman score: 1273; 59.0% identity (87.2% similar) in 305 aa overlap (12-316:8-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKSDNHSFLGDSPKAFILLGVSDRPWLELPLFVVLLLSYVLAMLGNVAIILASRVDPQLH
::: ::::: ::: ::..:::::::.::.....:::.:... .::.::
CCDS34 MNWENESSPKEFILLGFSDRAWLQMPLFVVLLISYTITIFGNVSIMMVCILDPKLH
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 SPMYIFLSHLSFLDLCYTTTTVPQMLVNMGSSQKTISYGGCTVQYAVFHWLGCTECIVLA
.:::.::..::.:::::::::::.::::.: ..:::::.::... .: :: :::..::
CCDS34 TPMYFFLTNLSILDLCYTTTTVPHMLVNIGCNKKTISYAGCVAHLIIFLALGATECLLLA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 AMALDRYVASCKPLHYAVLMHRALCQQLVALAWLSGFGNSFVQVVLTVQLPFCGRQVLNN
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CCDS34 VMSFDRYVAVCRPLHYVVIMNYWFCLRMAAFSWLIGFGNSVLQSSLTLNMPRCGHQEVDH
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 FFCEVPAVIKLSCADTAMNDTILAVLVAFFVLVPLALILLSYGFIARAVLRIQSSKGRHK
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CCDS34 FFCEVPALLKLSCADTKPIEAELFFFSVLILLIPVTLILISYGFIAQAVLKIRSAEGRQK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 AFGTCSSHLMIVSLFYLPAIYMYLQPPSSYSQEQGKFISLFYSIITPTLNPFTYTLRNKD
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CCDS34 AFGTCGSHMIVVSLFYGTAIYMYLQPPSSTSKDWGKMVSLFYGIITSMLNSLIYSLRNKD
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 MKGALRRLLARIWRLCG
:: :..::. ::. .:
CCDS34 MKEAFKRLMPRIF-FCKK
300 310
>>CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 (357 aa)
initn: 1254 init1: 1232 opt: 1243 Z-score: 976.8 bits: 189.1 E(32554): 4.4e-48
Smith-Waterman score: 1243; 58.2% identity (88.6% similar) in 299 aa overlap (13-311:9-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKSDNHSFLGDSPKAFILLGVSDRPWLELPLFVVLLLSYVLAMLGNVAIILASRVDPQLH
:. :::: ::.::::.: ::..:.::.:...::..:::.:.:: .::
CCDS46 MNWVNKSVPQEFILLVFSDQPWLEIPPFVMFLFSYILTIFGNLTIILVSHVDFKLH
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pF1KE6 SPMYIFLSHLSFLDLCYTTTTVPQMLVNMGSSQKTISYGGCTVQYAVFHWLGCTECIVLA
.:::.:::.::.:::::::.::::::::. ...:.::::::..: .: :: :::..::
CCDS46 TPMYFFLSNLSLLDLCYTTSTVPQMLVNICNTRKVISYGGCVAQLFIFLALGSTECLLLA
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130 140 150 160 170 180
pF1KE6 AMALDRYVASCKPLHYAVLMHRALCQQLVALAWLSGFGNSFVQVVLTVQLPFCGRQVLNN
.: .::.:: :.::::...::. :: ::.: .:.:::.:: .: . :...:.::.. ...
CCDS46 VMCFDRFVAICRPLHYSIIMHQRLCFQLAAASWISGFSNSVLQSTWTLKMPLCGHKEVDH
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190 200 210 220 230 240
pF1KE6 FFCEVPAVIKLSCADTAMNDTILAVLVAFFVLVPLALILLSYGFIARAVLRIQSSKGRHK
:::::::..::::.::. :.. : . ..:.:.:..:::.::.::..:::::::..:..:
CCDS46 FFCEVPALLKLSCVDTTANEAELFFISVLFLLIPVTLILISYAFIVQAVLRIQSAEGQRK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 AFGTCSSHLMIVSLFYLPAIYMYLQPPSSYSQEQGKFISLFYSIITPTLNPFTYTLRNKD
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CCDS46 AFGTCGSHLIVVSLFYGTAISMYLQPPSPSSKDRGKMVSLFCGIIAPMLNPLIYTLRNKE
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 MKGALRRLLARIWRLCG
.: :..::.:.
CCDS46 VKEAFKRLVAKSLLNQEIRNMQMISFAKDTVLTYLTNFSASCPIFVITIENYCNLPQRKF
300 310 320 330 340 350
>>CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 (313 aa)
initn: 1252 init1: 1231 opt: 1233 Z-score: 969.7 bits: 187.6 E(32554): 1.1e-47
Smith-Waterman score: 1233; 57.8% identity (87.0% similar) in 308 aa overlap (7-313:2-309)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MKSDNHSFLGDSP-KAFILLGVSDRPWLELPLFVVLLLSYVLAMLGNVAIILASRVDPQL
....:: . ::::: :::::::.::.::.:.::.....::..:::.::.: .:
CCDS46 MNWVNDSIIQEFILLGFSDRPWLEFPLLVVFLISYTVTIFGNLTIILVSRLDTKL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 HSPMYIFLSHLSFLDLCYTTTTVPQMLVNMGSSQKTISYGGCTVQYAVFHWLGCTECIVL
:.:::.::..::.::::::: ::::::::. : .:.::: ::..: .: :: :: ..:
CCDS46 HTPMYFFLTNLSLLDLCYTTCTVPQMLVNLCSIRKVISYRGCVAQLFIFLALGATEYLLL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 AAMALDRYVASCKPLHYAVLMHRALCQQLVALAWLSGFGNSFVQVVLTVQLPFCGRQVLN
:.:..::.:: :.::::.:.::. :: ::.: .:..::.:: .::.:::.: :..
CCDS46 AVMSFDRFVAICRPLHYSVIMHQRLCLQLAAASWVTGFSNSVWLSTLTLQLPLCDPYVID
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 NFFCEVPAVIKLSCADTAMNDTILAVLVAFFVLVPLALILLSYGFIARAVLRIQSSKGRH
.:.:::::..::::..:. :.. : .. .: :.::.:::.::.::.::::::::..::.
CCDS46 HFLCEVPALLKLSCVETTANEAELFLVSELFHLIPLTLILISYAFIVRAVLRIQSAEGRQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 KAFGTCSSHLMIVSLFYLPAIYMYLQPPSSYSQEQGKFISLFYSIITPTLNPFTYTLRNK
::::::.:::..::::: :. .:::::: :..:::..::::.::.: :::. ::::::
CCDS46 KAFGTCGSHLIVVSLFYSTAVSVYLQPPSPSSKDQGKMVSLFYGIIAPMLNPLIYTLRNK
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 DMKGALRRLLARIWRLCG
..: ...::.::..
CCDS46 EVKEGFKRLVARVFLIKK
300 310
>>CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 (309 aa)
initn: 1242 init1: 1219 opt: 1221 Z-score: 960.6 bits: 185.9 E(32554): 3.5e-47
Smith-Waterman score: 1221; 57.7% identity (83.9% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKSDNHSFLGDSPKAFILLGVSDRPWLELPLFVVLLLSYVLAMLGNVAIILASRVDPQLH
: :.: : : ::::: ::.: :: ::: .:. :.:...:: .::. : .:: ::
CCDS31 MGLGNESSLMD----FILLGFSDHPRLEAVLFVFVLFFYLLTLVGNFTIIIISYLDPPLH
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 SPMYIFLSHLSFLDLCYTTTTVPQMLVNMGSSQKTISYGGCTVQYAVFHWLGCTECIVLA
.:::.:::.::.::.:.::. .:: :::. .:::.::::..: . :: ::::.::
CCDS31 TPMYFFLSNLSLLDICFTTSLAPQTLVNLQRPKKTITYGGCVAQLYISLALGSTECILLA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 AMALDRYVASCKPLHYAVLMHRALCQQLVALAWLSGFGNSFVQVVLTVQLPFCGRQVLNN
::::::.: ::::::.:.:. :::::....::::...:......:.:::.:: . :..
CCDS31 DMALDRYIAVCKPLHYVVIMNPRLCQQLASISWLSGLASSLIHATFTLQLPLCGNHRLDH
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 FFCEVPAVIKLSCADTAMNDTILAVLVAFFVLVPLALILLSYGFIARAVLRIQSSKGRHK
:.:::::..::.:.::..:. .: :. ..::..: ::: .:::::..:::::.: ..:::
CCDS31 FICEVPALLKLACVDTTVNELVLFVVSVLFVVIPPALISISYGFITQAVLRIKSVEARHK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 AFGTCSSHLMIVSLFYLPAIYMYLQPPSSYSQEQGKFISLFYSIITPTLNPFTYTLRNKD
::.:::::: .: .:: ::.:::: .::.:.:::::::::...::::::. :::::::
CCDS31 AFSTCSSHLTVVIIFYGTIIYVYLQPSDSYAQDQGKFISLFYTMVTPTLNPIIYTLRNKD
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 MKGALRRLLARIWRLCG
:: :::.::.
CCDS31 MKEALRKLLSGKL
300
>>CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 (311 aa)
initn: 1212 init1: 1170 opt: 1175 Z-score: 925.3 bits: 179.4 E(32554): 3.2e-45
Smith-Waterman score: 1175; 52.7% identity (82.0% similar) in 311 aa overlap (3-313:2-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKSDNHSFLGDSPKAFILLGVSDRPWLELPLFVVLLLSYVLAMLGNVAIILASRVDPQLH
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CCDS43 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLH
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300 310
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CCDS43 VKGAAKRLLGWEWGK
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CCDS31 VKGALRTLILGSAAGQSHKD
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CCDS34 SPMYFFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLT
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CCDS34 VMAFDRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDD
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CCDS34 FVCEVPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRK
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CCDS34 VTRAFRRLLGKEMGLTQS
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CCDS16 TMSYDRYAAICRPLHYTVIMHPQLCLGLALASWLGGLTTSMVGSTLTMLLPLCGNNCIDH
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