Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6036
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6036, 317 aa
1>>>pF1KE6036 317 - 317 aa - 317 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3364+/-0.00119; mu= 15.7411+/- 0.070
mean_var=118.9995+/-36.310, 0's: 0 Z-trim(103.0): 368 B-trim: 836 in 2/47
Lambda= 0.117571
statistics sampled from 6719 (7188) to 6719 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.555), E-opt: 0.2 (0.221), width: 16
Scan time: 2.340
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 ( 317) 2102 368.3 4.5e-102
CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 ( 314) 1158 208.2 7e-54
CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 ( 315) 1114 200.7 1.2e-51
CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 ( 313) 1098 198.0 8.1e-51
CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 ( 312) 1086 195.9 3.3e-50
CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 ( 321) 1086 196.0 3.4e-50
CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 ( 312) 1079 194.8 7.6e-50
CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 1073 193.7 1.5e-49
CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 ( 342) 1044 188.9 4.9e-48
CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 ( 314) 1029 186.3 2.7e-47
CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 ( 326) 1018 184.4 1e-46
CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 ( 314) 987 179.2 3.8e-45
CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 ( 312) 985 178.8 4.8e-45
CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 ( 314) 984 178.6 5.4e-45
CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 ( 312) 981 178.1 7.7e-45
CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 ( 320) 962 174.9 7.3e-44
CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 ( 318) 952 173.2 2.3e-43
CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 ( 323) 951 173.1 2.7e-43
CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 ( 320) 944 171.9 6e-43
CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 ( 321) 943 171.7 6.8e-43
CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 941 171.4 9.1e-43
CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 ( 325) 932 169.8 2.5e-42
CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 ( 317) 919 167.6 1.1e-41
CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 ( 324) 918 167.5 1.3e-41
CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 ( 318) 910 166.1 3.3e-41
CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 ( 312) 893 163.2 2.4e-40
CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 ( 321) 890 162.7 3.5e-40
CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 ( 317) 884 161.7 6.9e-40
CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 ( 311) 879 160.8 1.2e-39
CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 ( 324) 872 159.7 2.9e-39
CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 ( 329) 867 158.8 5.2e-39
CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 ( 320) 866 158.6 5.8e-39
CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 ( 310) 846 155.2 6e-38
CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 835 153.4 2.3e-37
CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 814 149.8 2.6e-36
CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 797 146.9 1.9e-35
CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 ( 312) 777 143.5 2e-34
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 771 142.5 4.1e-34
CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 709 132.0 6e-31
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 703 131.0 1.2e-30
CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 ( 350) 694 129.5 3.7e-30
CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 690 128.9 6.1e-30
CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 ( 324) 671 125.6 5.3e-29
CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 657 123.2 2.7e-28
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 646 121.3 9.8e-28
CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 640 120.3 2e-27
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 603 114.0 1.6e-25
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 529 101.5 9.3e-22
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 520 99.9 2.7e-21
CCDS35132.1 OR1K1 gene_id:392392|Hs108|chr9 ( 316) 511 98.4 7.7e-21
>>CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 (317 aa)
initn: 2102 init1: 2102 opt: 2102 Z-score: 1946.1 bits: 368.3 E(32554): 4.5e-102
Smith-Waterman score: 2102; 100.0% identity (100.0% similar) in 317 aa overlap (1-317:1-317)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSQVTNTTQEGIYFILTDIPGFEASHIWISIPVCCLYTISIMGNTTILTVIRTEPSVHQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MSQVTNTTQEGIYFILTDIPGFEASHIWISIPVCCLYTISIMGNTTILTVIRTEPSVHQR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 MYLFLSMLALTDLGLTLTTLPTVMQLLWFNVRRISSEACFAQFFFLHGFSFMESSVLLAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MYLFLSMLALTDLGLTLTTLPTVMQLLWFNVRRISSEACFAQFFFLHGFSFMESSVLLAM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SVDCYVAICCPLHYASILTNEVIGRTGLAIICCCVLAVLPSLFLLKRLPFCHSHLLSRSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SVDCYVAICCPLHYASILTNEVIGRTGLAIICCCVLAVLPSLFLLKRLPFCHSHLLSRSY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 CLHQDMIRLVCADIRLNSWYGFALALLIIIVDPLLIVISYTLILKNILGTATWAERLRAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CLHQDMIRLVCADIRLNSWYGFALALLIIIVDPLLIVISYTLILKNILGTATWAERLRAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 NNCLSHILAVLVLYIPMVGVSMTHRFAKHASPLVHVIMANIYLLAPPVMNPIIYSVKNKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NNCLSHILAVLVLYIPMVGVSMTHRFAKHASPLVHVIMANIYLLAPPVMNPIIYSVKNKQ
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 IQWGMLNFLSLKNMHSR
:::::::::::::::::
CCDS31 IQWGMLNFLSLKNMHSR
310
>>CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1142 init1: 1142 opt: 1158 Z-score: 1080.8 bits: 208.2 E(32554): 7e-54
Smith-Waterman score: 1158; 58.5% identity (83.4% similar) in 289 aa overlap (14-302:17-305)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MSQVTNTTQEGIYFILTDIPGFEASHIWISIPVCCLYTISIMGNTTILTVIRTEPSV
:.:. :::.: :::::::.: .: .:: :: ::: .:.:: :.
CCDS31 MTLGSLGNSSSSVSATFLLSGIPGLERMHIWISIPLCFMYLVSIPGNCTILFIIKTERSL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 HQRMYLFLSMLALTDLGLTLTTLPTVMQLLWFNVRRISSEACFAQFFFLHGFSFMESSVL
:. :::::::::: ::::.: :::::. ..: ..:.:: .:::::.::.: :::.:::::
CCDS31 HEPMYLFLSMLALIDLGLSLCTLPTVLGIFWVGAREISHDACFAQLFFIHCFSFLESSVL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 LAMSVDCYVAICCPLHYASILTNEVIGRTGLAIICCCVLAVLPSLFLLKRLPFCHSHLLS
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CCDS31 LSMAFDRFVAICHPLHYVSILTNTVIGRIGLVSLGRSVALIFPLPFMLKRFPYCGSPVLS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 RSYCLHQDMIRLVCADIRLNSWYGFALALLIIIVDPLLIVISYTLILKNILGTATWAERL
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CCDS31 HSYCLHQEVMKLACADMKANSIYGMFVIVSTVGIDSLLILFSYALILRTVLSIASRAERF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 RALNNCLSHILAVLVLYIPMVGVSMTHRFAKHASPLVHVIMANIYLLAPPVMNPIIYSVK
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CCDS31 KALNTCVSHICAVLLFYTPMIGLSVIHRFGKQAPHLVQVVMGFMYLLFPPVMNPIVYSVK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 NKQIQWGMLNFLSLKNMHSR
.:::.
CCDS31 TKQIRDRVTHAFCY
310
>>CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 1132 init1: 1110 opt: 1114 Z-score: 1040.4 bits: 200.7 E(32554): 1.2e-51
Smith-Waterman score: 1114; 50.6% identity (80.8% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSQVTNTTQEGIYFILTDIPGFEASHIWISIPVCCLYTISIMGNTTILTVIRTEPSVHQR
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CCDS31 MGDWNNSDAVEPIFILRGFPGLEYVHSWLSILFCLAYLVAFMGNVTILSVIWIESSLHQP
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pF1KE6 MYLFLSMLALTDLGLTLTTLPTVMQLLWFNVRRISSEACFAQFFFLHGFSFMESSVLLAM
:: :.:.::..:::..:.::::.. .::... .:.. ::.::.::.: :.:.::::::::
CCDS31 MYYFISILAVNDLGMSLSTLPTMLAVLWLDAPEIQASACYAQLFFIHTFTFLESSVLLAM
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pF1KE6 SVDCYVAICCPLHYASILTNEVIGRTGLAIICCCVLAVLPSLFLLKRLPFCHSHLLSRSY
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CCDS31 AFDRFVAICHPLHYPTILTNSVIGKIGLACLLRSLGVVLPTPLLLRHYHYCHGNALSHAF
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190 200 210 220 230 240
pF1KE6 CLHQDMIRLVCADIRLNSWYGFALALLIIIVDPLLIVISYTLILKNILGTATWAERLRAL
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CCDS31 CLHQDVLRLSCTDARTNSIYGLCVVIATLGVDSIFILLSYVLILNTVLDIASREEQLKAL
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pF1KE6 NNCLSHILAVLVLYIPMVGVSMTHRFAKHASPLVHVIMANIYLLAPPVMNPIIYSVKNKQ
:.:.::: .::....:..::::.:::.:: ::.::..::.:::: :::.:::.:::..::
CCDS31 NTCVSHICVVLIFFVPVIGVSMVHRFGKHLSPIVHILMADIYLLLPPVLNPIVYSVRTKQ
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 IQWGMLNFLSLKNMHSR
:. :.:. . :.
CCDS31 IRLGILHKFVLRRRF
310
>>CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 (313 aa)
initn: 1099 init1: 730 opt: 1098 Z-score: 1025.8 bits: 198.0 E(32554): 8.1e-51
Smith-Waterman score: 1098; 52.6% identity (83.1% similar) in 302 aa overlap (1-302:1-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSQVTNTTQEGIYFILTDIPGFEASHIWISIPVCCLYTISIMGNTTILTVIRTEPSVHQR
:: .... : :.:. .::.: .:::::::.: .: :.:.:: ::: .:.::::.:.
CCDS31 MSIINTSYVEITTFFLVGMPGLEYAHIWISIPICSMYLIAILGNGTILFIIKTEPSLHEP
10 20 30 40 50 60
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pF1KE6 MYLFLSMLALTDLGLTLTTLPTVMQLLWFNVRRISSEACFAQFFFLHGFSFMESSVLLAM
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CCDS31 MYYFLSMLAMSDLGLSLSSLPTVLSIFLFNAPEISSNACFAQEFFIHGFSVLESSVLLIM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SVDCYVAICCPLHYASILTNEVIGRTGLAIICCCVLAVLPSLFLLKRLPFCHSHLLSRSY
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CCDS31 SFDRFLAIHNPLRYTSILTTVRVAQIGIVFSFKSMLLVLPFPFTLRNLRYCKKNQLSHSY
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190 200 210 220 230 240
pF1KE6 CLHQDMIRLVCADIRLNSWYGFALALLIIIVDPLLIVISYTLILKNILGTATWAERLRAL
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CCDS31 CLHQDVMKLACSDNRIDVIYGF-FGALCLMVDFILIAVSYTLILKTVLGIASKKEQLKAL
190 200 210 220 230
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pF1KE6 NNCLSHILAVLVLYIPMVGVSMTHRFAKHASPLVHVIMANIYLLAPPVMNPIIYSVKNKQ
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CCDS31 NTCVSHICAVIIFYLPIINLAVVHRFARHVSPLINVLMANVLLLVPPLTNPIVYCVKTKQ
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 IQWGMLNFLSLKNMHSR
:.
CCDS31 IRVRVVAKLCQRKI
300 310
>>CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1063 init1: 718 opt: 1086 Z-score: 1014.8 bits: 195.9 E(32554): 3.3e-50
Smith-Waterman score: 1086; 52.8% identity (80.9% similar) in 303 aa overlap (1-303:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSQVTNTTQEGIYFILTDIPGFEASHIWISIPVCCLYTISIMGNTTILTVIRTEPSVHQR
:: ..:. : :.: :::.: .:::.:::.: .: ..:::: ::: .:.::::.:.
CCDS31 MSVLNNS--EVKLFLLIGIPGLEHAHIWFSIPICLMYLLAIMGNCTILFIIKTEPSLHEP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 MYLFLSMLALTDLGLTLTTLPTVMQLLWFNVRRISSEACFAQFFFLHGFSFMESSVLLAM
:: ::.:::..:.::.:..:::..... ::. :: .::::: ::.:::. ::::::: :
CCDS31 MYYFLAMLAVSDMGLSLSSLPTMLRVFLFNAMGISPNACFAQEFFIHGFTVMESSVLLIM
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SVDCYVAICCPLHYASILTNEVIGRTGLAIICCCVLAVLPSLFLLKRLPFCHSHLLSRSY
:.: ..:: ::.:.::::.. ... :: . .: :.: : :.:: .:...:::.::
CCDS31 SLDRFLAIHNPLRYSSILTSNRVAKMGLILAIRSILLVIPFPFTLRRLKYCQKNLLSHSY
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 CLHQDMIRLVCADIRLNSWYGFALALLIIIVDPLLIVISYTLILKNILGTATWAERLRAL
::::: ..:.:.: . : ::: .:: .. : :::.::.::::.::. :. ::::.::
CCDS31 CLHQDTMKLACSDNKTNVIYGFFIALCTML-DLALIVLSYVLILKTILSIASLAERLKAL
180 190 200 210 220 230
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pF1KE6 NNCLSHILAVLVLYIPMVGVSMTHRFAKHASPLVHVIMANIYLLAPPVMNPIIYSVKNKQ
:.:.::: :::..:.:.. .. :.:::: :::: ...:...::.::.::::.: ::..:
CCDS31 NTCVSHICAVLTFYVPIITLAAMHHFAKHKSPLVVILIADMFLLVPPLMNPIVYCVKTRQ
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 IQWGMLNFLSLKNMHSR
: :
CCDS31 I-WEKILGKLLNVCGR
300 310
>>CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 (321 aa)
initn: 1076 init1: 1076 opt: 1086 Z-score: 1014.7 bits: 196.0 E(32554): 3.4e-50
Smith-Waterman score: 1086; 50.6% identity (81.4% similar) in 312 aa overlap (1-312:8-319)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MSQVTNTTQEGIYFILTDIPGFEASHIWISIPVCCLYTISIMGNTTILTVIRT
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CCDS31 MFLSSRMITSVSPSTSTNSSFLLTGFSGMEQQYPWLSIPFSSIYAMVLLGNCMVLHVIWT
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CCDS31 SSVLLTMAFDRYIAICNPLRYSSILTNSRIIKIGLTIIGRSFFFITPPIICLKFFNYCHF
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CCDS31 HILSHSFCLHQDLLRLACSDIRFNSYYALMLVICILLLDAILILFSYILILKSVLAVASQ
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CCDS31 IRRAIFRMFHHIKI
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CCDS31 MYYFLSMLAMSDLGLSLSSLPTVLSIFLFNAPETSSSACFAQEFFIHGFSVLESSVLLIM
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CCDS31 SFDRFLAIHNPLRYTSILTTVRVAQIGIVFSFKSMLLVLPFPFTLRSLRYCKKNQLSHSY
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:.
CCDS31 IRVRVVAKLCQWKI
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]