Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6034
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6034, 316 aa
1>>>pF1KE6034 316 - 316 aa - 316 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8072+/-0.00127; mu= 12.9560+/- 0.074
mean_var=179.5864+/-64.225, 0's: 0 Z-trim(101.6): 382 B-trim: 397 in 1/44
Lambda= 0.095706
statistics sampled from 6137 (6594) to 6137 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.536), E-opt: 0.2 (0.203), width: 16
Scan time: 2.380
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33804.1 OR5K2 gene_id:402135|Hs108|chr3 ( 316) 2081 300.7 1e-81
CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 ( 308) 1936 280.6 1.1e-75
CCDS33803.1 OR5K3 gene_id:403277|Hs108|chr3 ( 321) 1535 225.3 5e-59
CCDS33802.1 OR5K4 gene_id:403278|Hs108|chr3 ( 321) 1497 220.0 1.9e-57
CCDS33796.1 OR5AC2 gene_id:81050|Hs108|chr3 ( 309) 1091 164.0 1.4e-40
CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 1084 163.0 2.7e-40
CCDS33797.1 OR5H1 gene_id:26341|Hs108|chr3 ( 313) 1077 162.0 5.4e-40
CCDS33799.1 OR5H15 gene_id:403274|Hs108|chr3 ( 313) 1075 161.8 6.5e-40
CCDS33800.1 OR5H6 gene_id:79295|Hs108|chr3 ( 325) 1075 161.8 6.6e-40
CCDS33798.1 OR5H14 gene_id:403273|Hs108|chr3 ( 310) 1049 158.2 7.8e-39
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1036 156.4 2.7e-38
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 1026 155.0 7.2e-38
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 1019 154.0 1.4e-37
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 996 150.9 1.3e-36
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 993 150.5 1.7e-36
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 987 149.6 3e-36
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 982 148.9 4.9e-36
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 978 148.4 6.9e-36
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 966 146.7 2.2e-35
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 965 146.6 2.4e-35
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 965 146.6 2.4e-35
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 965 146.6 2.6e-35
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 963 146.3 2.9e-35
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 958 145.6 4.8e-35
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 957 145.5 5.3e-35
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 956 145.3 5.7e-35
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 955 145.3 6.8e-35
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 948 144.2 1.2e-34
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 948 144.2 1.2e-34
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 940 143.2 2.8e-34
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 939 143.0 2.9e-34
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 935 142.5 4.6e-34
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 933 142.2 5.2e-34
CCDS31544.1 OR9Q2 gene_id:219957|Hs108|chr11 ( 314) 932 142.0 5.7e-34
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 931 141.9 6.2e-34
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 927 141.3 9.2e-34
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 927 141.4 9.4e-34
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 925 141.0 1.1e-33
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 917 139.9 2.4e-33
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 910 139.0 4.7e-33
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 909 138.8 5.2e-33
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 909 138.8 5.2e-33
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 908 138.7 5.6e-33
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 906 138.4 6.8e-33
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 905 138.3 7.4e-33
CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 ( 309) 904 138.1 8.3e-33
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 904 138.1 8.3e-33
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 903 138.0 9.1e-33
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 903 138.0 9.2e-33
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 896 137.1 1.8e-32
>>CCDS33804.1 OR5K2 gene_id:402135|Hs108|chr3 (316 aa)
initn: 2081 init1: 2081 opt: 2081 Z-score: 1580.7 bits: 300.7 E(32554): 1e-81
Smith-Waterman score: 2081; 100.0% identity (100.0% similar) in 316 aa overlap (1-316:1-316)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MVEENHTMKNEFILTGFTDHPELKTLLFVVFFAIYLITVVGNISLVALIFTHCRLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MVEENHTMKNEFILTGFTDHPELKTLLFVVFFAIYLITVVGNISLVALIFTHCRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 IFLGNLALVDSCCACAITPKMLENFFSEGKRISLYECAVQFYFLCTVETADCFLLAAVAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 IFLGNLALVDSCCACAITPKMLENFFSEGKRISLYECAVQFYFLCTVETADCFLLAAVAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAICNPLQYHIMMSKKLCIQMTTGAFIAGNLHSMIHVGLVFRLVFCGLNHINHFYCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DRYVAICNPLQYHIMMSKKLCIQMTTGAFIAGNLHSMIHVGLVFRLVFCGLNHINHFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 TLPLYRLSCVDPFINELVLFIFSGSVQVFTIGSVLISYLYILLTIFRMKSKEGRAKAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TLPLYRLSCVDPFINELVLFIFSGSVQVFTIGSVLISYLYILLTIFRMKSKEGRAKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CASHFSSVSLFYGSIFFLYIRPNLLEEGGNDIPAAILFTIVVPLLNPFIYSLRNKEVISV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CASHFSSVSLFYGSIFFLYIRPNLLEEGGNDIPAAILFTIVVPLLNPFIYSLRNKEVISV
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 LRKILLKIKSQGSVNK
::::::::::::::::
CCDS33 LRKILLKIKSQGSVNK
310
>>CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 (308 aa)
initn: 1951 init1: 1929 opt: 1936 Z-score: 1472.6 bits: 280.6 E(32554): 1.1e-75
Smith-Waterman score: 1936; 94.8% identity (98.4% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MVEENHTMKNEFILTGFTDHPELKTLLFVVFFAIYLITVVGNISLVALIFTHCRLHTPMY
:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::
CCDS43 MAEENHTMKNEFILTGFTDHPELKTLLFVVFFAIYLITVVGNISLVALIFTHRRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 IFLGNLALVDSCCACAITPKMLENFFSEGKRISLYECAVQFYFLCTVETADCFLLAAVAY
::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS43 IFLGNLALVDSCCACAITPKMLENFFSENKRISLYECAVQFYFLCTVETADCFLLAAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAICNPLQYHIMMSKKLCIQMTTGAFIAGNLHSMIHVGLVFRLVFCGLNHINHFYCD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::
CCDS43 DRYVAICNPLQYHIMMSKKLCIQMTTGAFIAGNLHSMIHVGLVFRLVFCGSNHINHFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 TLPLYRLSCVDPFINELVLFIFSGSVQVFTIGSVLISYLYILLTIFRMKSKEGRAKAFST
:::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS43 ILPLYRLSCVDPYINELVLFIFSGSVQVFTIGSVLISYLYILLTIFKMKSKEGRAKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CASHFSSVSLFYGSIFFLYIRPNLLEEGGNDIPAAILFTIVVPLLNPFIYSLRNKEVISV
::::: ::::::::.::.:.:::::::: .::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS43 CASHFLSVSLFYGSLFFMYVRPNLLEEGDKDIPAAILFTIVVPLLNPFIYSLRNREVISV
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 LRKILLKIKSQGSVNK
:::::.:
CCDS43 LRKILMKK
>>CCDS33803.1 OR5K3 gene_id:403277|Hs108|chr3 (321 aa)
initn: 1535 init1: 1116 opt: 1535 Z-score: 1173.2 bits: 225.3 E(32554): 5e-59
Smith-Waterman score: 1535; 72.2% identity (91.3% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MVEENHTMKNEFILTGFTDHPELKTLLFVVFFAIYLITVVGNISLVALIFTHCRLHTPMY
: .:::.. :::::::: ::.:::.::::::::::::.::::.:::::. . :::::::
CCDS33 MNKENHSLIAEFILTGFTYHPKLKTVLFVVFFAIYLITMVGNIGLVALIYIEQRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 IFLGNLALVDSCCACAITPKMLENFFSEGKRISLYECAVQFYFLCTVETADCFLLAAVAY
::::::.:.::::. ::::::::::::: :::.:::: .:::::: .::.:::::::.::
CCDS33 IFLGNLVLMDSCCSSAITPKMLENFFSEDKRITLYECMAQFYFLCLAETTDCFLLAAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAICNPLQYHIMMSKKLCIQMTTGAFIAGNLHSMIHVGLVFRLVFCGLNHINHFYCD
: ::::::::::: :::: ::::::.::..::::: ::.: ...::.::: ..::::.::
CCDS33 DCYVAICNPLQYHTMMSKTLCIQMTAGAYLAGNLHPMIEVEFLLRLTFCGSHQINHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 TLPLYRLSCVDPFINELVLFIFSGSVQVFTIGSVLISYLYILLTIFRMKSKEGRAKAFST
.::::::::..:.::::::::..::.:.::: ::.::.:::.::: :::::::.::.::
CCDS33 VLPLYRLSCINPYINELVLFILAGSIQIFTI--VLVSYFYILFTIFTMKSKEGRGKALST
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CASHFSSVSLFYGSIFFLYIRPNLLEEGGNDIPAAILFTIVVPLLNPFIYSLRNKEVISV
::::: :::.: :..:.: ::. ..:: .:::.::..:.:.::::::::::::::::..
CCDS33 CASHFLSVSIFCDSLLFMYARPGAVNEGDKDIPVAIFYTLVIPLLNPFIYSLRNKEVINI
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 LRKILLKIKSQGSVNK
..::. : :
CCDS33 MKKIMKKRKFCHILKQMSSPLAT
300 310 320
>>CCDS33802.1 OR5K4 gene_id:403278|Hs108|chr3 (321 aa)
initn: 1487 init1: 1304 opt: 1497 Z-score: 1144.9 bits: 220.0 E(32554): 1.9e-57
Smith-Waterman score: 1497; 72.5% identity (90.5% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MVEENHTMKNEFILTGFTDHPELKTLLFVVFFAIYLITVVGNISLVALIFTHCRLHTPMY
:..:::.. :::: :::..::::::::::: ::::.:.:::..:::::... :: ::::
CCDS33 MARENHSLAAEFILIGFTNYPELKTLLFVVFSAIYLVTMVGNLGLVALIYVERRLLTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 IFLGNLALVDSCCACAITPKMLENFFSEGKRISLYECAVQFYFLCTVETADCFLLAAVAY
::::::::.::::.::.::::::::::: . :::::: .:::::: .::.::::::..::
CCDS33 IFLGNLALMDSCCSCAVTPKMLENFFSEDRIISLYECMAQFYFLCLAETTDCFLLATMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAICNPLQYHIMMSKKLCIQMTTGAFIAGNLHSMIHVGLVFRLVFCGLNHINHFYCD
:::::::.::::: :::: :::.:::::: ::::::::::::..::.:: :.:.::.::
CCDS33 DRYVAICHPLQYHTMMSKTLCIRMTTGAFKAGNLHSMIHVGLLLRLTFCRSNKIHHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 TLPLYRLSCVDPFINELVLFIFSGSVQVFTIGSVLISYLYILLTIFRMKSKEGRAKAFST
::::::::.:: ::::...::: .:.:::..:::::: ::::.:.:::::::.:::::
CCDS33 ILPLYRLSCTDPSINELMIYIFSIPIQIFTIATVLISYLCILLTVFKMKSKEGRGKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CASHFSSVSLFYGSIFFLYIRPNLLEEGGNDIPAAILFTIVVPLLNPFIYSLRNKEVISV
::::: :::.:: .. .:: :. ::: .: :.::...::.::::::::::::::::.:
CCDS33 CASHFLSVSIFYICLL-MYIGPS--EEGDKDTPVAIFYAIVIPLLNPFIYSLRNKEVINV
250 260 270 280 290
310
pF1KE6 LRKILLKIKSQGSVNK
:.::.
CCDS33 LKKIMRNYNILKQTCSIANLFLIY
300 310 320
>>CCDS33796.1 OR5AC2 gene_id:81050|Hs108|chr3 (309 aa)
initn: 1076 init1: 1076 opt: 1091 Z-score: 842.1 bits: 164.0 E(32554): 1.4e-40
Smith-Waterman score: 1091; 50.2% identity (81.6% similar) in 305 aa overlap (3-307:5-309)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MVEENHTMKNEFILTGFTDHPELKTLLFVVFFAIYLITVVGNISLVALIFTHCRLHTP
: :.:. .::.:::.::.: :..:.::::...::::.:::..:..::.. .:: :
CCDS33 MDISEGNKTLVTEFVLTGLTDRPWLHVLFFVVFLVVYLITMVGNLGLIVLIWNDPHLHMP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 MYIFLGNLALVDSCCACAITPKMLENFFSEGKRISLYECAVQFYFLCTVETADCFLLAAV
::.:::.::. :.: . .:::.:: ::... ::: :: .::::. . :..::::. .
CCDS33 MYLFLGGLAFSDACTSTSITPRMLVNFLDKTAMISLAECITQFYFFASSATTECFLLVMM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 AYDRYVAICNPLQYHIMMSKKLCIQMTTGAFIAGNLHSMIHVGLVFRLVFCGLNHINHFY
:::::::::::: : .:::.:: :. . ... : :: ..::.:..::.:: .: :..::
CCDS33 AYDRYVAICNPLLYPVMMSNKLSAQLLSISYVIGFLHPLVHVSLLLRLTFCRFNIIHYFY
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 CDTLPLYRLSCVDPFINELVLFIFSGSVQVFTIGSVLISYLYILLTIFRMKSKEGRAKAF
:. : :...:: : :: :..:::.. .:. :. ...::: .:. :.. ::..::.:::
CCDS33 CEILQLFKISCNGPSINALMIFIFGAFIQIPTLMTIIISYTRVLFDILKKKSEKGRSKAF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 STCASHFSSVSLFYGSIFFLYIRPNLLEEGGNDIPAAILFTIVVPLLNPFIYSLRNKEVI
:::..:. ::::.::...:.:.:: .: ....::..:::::::::::::.:.
CCDS33 STCGAHLLSVSLYYGTLIFMYVRPASGLAEDQDKVYSLFYTIIIPLLNPFIYSLRNKKVM
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 SVLRKILLKIKSQGSVNK
.::... :
CCDS33 HALRRVIRK
>>CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 (314 aa)
initn: 1091 init1: 1066 opt: 1084 Z-score: 836.8 bits: 163.0 E(32554): 2.7e-40
Smith-Waterman score: 1084; 51.8% identity (81.6% similar) in 305 aa overlap (1-305:6-310)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MVEENHTMKNEFILTGFTDHPELKTLLFVVFFAIYLITVVGNISLVALIFTHCRL
: ..: :. .::.:::.: .:: : ::.::..:::::.: :..:.:::.. .:
CCDS33 MSNEDMEQDNTTLLTEFVLTGLTYQPEWKMPLFLVFLVIYLITIVWNLGLIALIWNDPQL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 HTPMYIFLGNLALVDSCCACAITPKMLENFFSEGKRISLYECAVQFYFLCTVETADCFLL
: :::.:::.::.::. . ..::::: ::..... ::: :: .::. . :..::::
CCDS33 HIPMYFFLGSLAFVDAWISSTVTPKMLVNFLAKNRMISLSECMIQFFSFAFGGTTECFLL
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310
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310
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]