Result of FASTA (omim) for
pFN21AE6031
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6031, 316 aa
1>>>pF1KE6031 316 - 316 aa - 316 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.5873+/-0.000506; mu= 19.8848+/- 0.031
mean_var=98.2763+/-26.797, 0's: 0 Z-trim(108.2): 327 B-trim: 2044 in 2/51
Lambda= 0.129375
statistics sampled from 15797 (16325) to 15797 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.536), E-opt: 0.2 (0.191), width: 16
Scan time: 5.910
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 1031 203.6 4.3e-52
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 809 162.2 1.3e-39
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 793 159.2 1e-38
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 791 158.8 1.3e-38
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XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 781 157.0 4.9e-38
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 767 154.3 2.9e-37
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 757 152.5 1.1e-36
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 755 152.1 1.4e-36
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 752 151.5 2e-36
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 750 151.2 2.6e-36
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 748 150.8 3.4e-36
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 744 150.0 5.7e-36
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 741 149.5 8.4e-36
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 730 147.4 3.4e-35
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 526 109.4 1e-23
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 478 100.4 5.1e-21
NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 206 49.9 1.2e-05
XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 206 49.9 1.3e-05
NP_001025186 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 2 [ ( 489) 189 46.7 0.00011
XP_016872444 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 539) 189 46.8 0.00012
NP_005949 (OMIM: 600665) melatonin receptor type 1 ( 350) 182 45.2 0.00023
NP_001471 (OMIM: 600377) galanin receptor type 1 [ ( 349) 180 44.8 0.0003
NP_000697 (OMIM: 600821) vasopressin V1a receptor ( 418) 179 44.8 0.00038
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 178 44.5 0.00039
XP_016872446 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 405) 177 44.4 0.00048
NP_006574 (OMIM: 605224) visual pigment-like recep ( 337) 174 43.7 0.00064
NP_005279 (OMIM: 600752) G-protein coupled recepto ( 334) 171 43.1 0.00093
NP_003848 (OMIM: 603691) galanin receptor type 2 [ ( 387) 170 43.0 0.0012
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 168 42.7 0.0015
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 168 42.7 0.0015
NP_061822 (OMIM: 600896) urotensin-2 receptor [Hom ( 389) 167 42.5 0.0017
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 166 42.2 0.0018
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 162 41.5 0.003
NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337) 162 41.5 0.003
NP_005275 (OMIM: 600553) G-protein coupled recepto ( 362) 162 41.5 0.0031
NP_001273028 (OMIM: 600553) G-protein coupled rece ( 377) 162 41.5 0.0032
XP_011527129 (OMIM: 162651) PREDICTED: neurotensin ( 336) 160 41.1 0.0039
NP_002522 (OMIM: 162651) neurotensin receptor type ( 418) 160 41.2 0.0044
NP_001699 (OMIM: 190900,613522) short-wave-sensiti ( 348) 159 40.9 0.0045
NP_001043 (OMIM: 182454) somatostatin receptor typ ( 388) 159 41.0 0.0048
NP_000698 (OMIM: 600264) vasopressin V1b receptor ( 424) 159 41.0 0.0051
XP_011532064 (OMIM: 167055) PREDICTED: oxytocin re ( 389) 158 40.8 0.0055
NP_000907 (OMIM: 167055) oxytocin receptor [Homo s ( 389) 158 40.8 0.0055
NP_795344 (OMIM: 118445) gastrin/cholecystokinin t ( 447) 157 40.7 0.0068
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
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310
pF1KE6 LLSRHVVCQVDFIIRN
: ::
NP_001 LCSRKDISGDK
300
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
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pF1KE6 MAFDRYIAICRPLHCSTVMNPRACYAMMLALWLGGFVHSIIQVVLILRLPFCGPNQLDNF
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pF1KE6 FCDVRQVIKLACTDMFVVELLMVFNSGLMTLLCFLGLLASY-AVILCHVRRAASEGKNKA
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pF1KE6 MSTCTTRVIIILLMFGPAIFIYMCPFRALPAD--KMVSLFHTVIFPLMNPMIYTLRNQEV
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300 310
pF1KE6 KTSMKRLLSRHVVCQVDFIIRN
. ..:::.
NP_001 RGAVKRLMGWE
310
>>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo (327 aa)
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pF1KE6 MKIANNTVVTEFILLGLTQSQDIQLLVFVLILIFYLIILPGNFLIIFTIRSDPGLTAPL
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pF1KE6 NFFCDVRQVIKLACTDMFVVELLMVFNSGLMTLLCFLGLL-ASYAVI---LCHVRRAASE
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NP_003 HFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTD-FILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAA--
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pF1KE6 GKNKAMSTCTTRVIIILLMFGPAIFIYMCP--FRALPADKMVSLFHTVIFPLMNPMIYTL
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NP_003 GRYKAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCL
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:::::: ..
NP_003 RNQEVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
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>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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pF1KE6 LYLFLGNLAFLDASYSFIVAPRMLVDFLSEKKVISYRGCITQLFFLHFLGGGEGLLLVVM
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NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
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pF1KE6 TSMKRLLSRHVVCQVDFIIRN
. ...: .:
NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
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pF1KE6 MKIANNTVVTEFILLGLTQSQDIQLLVFVLILIFYLIILPGNFLIIFTIRSDPGLTAPLY
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NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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pF1KE6 VRQVIKLACTDMFVVELLMVFNSGLMTLLCFLGLLASYAVILCHVRRAAS-EGKNKAMST
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NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSS-PSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
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pF1KE6 SMKRLLSRHVVCQVDFIIRN
. ..::
NP_036 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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Smith-Waterman score: 786; 38.9% identity (72.9% similar) in 306 aa overlap (1-302:1-305)
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pF1KE6 MKIANNTVVTEFILLGLTQSQDIQLLVFVLILIFYLIILPGNFLIIFTIRSDPGLTAPLY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KE6 LFLGNLAFLDASYSFIVAPRMLVDFLSEKKVISYRGCITQLFFLHFLGGGEGLLLVVMAF
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYIAICRPLHCSTVMNPRACYAMMLALWLGGFVHSIIQVVLILRLPFCGPNQLDNFFCD
:::.:.: :. :..:. : . .. :..::. : .:... ..::.: . .:.. :.
XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE6 VRQVIKLACTDMFVVELLMVFNSGLMTLLCFLGLLASYAVILCHVRRAAS-EGKNKAMST
. :..:::.: :. .. .: .. . : .: :: :. . . : ::..::. :
XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 CTTRVIIILLMFGPAIFIYMCPFRALPA---DKMVSLFHTVIFPLMNPMIYTLRNQEVKT
:.... .. : .: ::: :. : . :. .:. :.:.... :..:::::.:::.:::
XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSS-PSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 SMKRLLSRHVVCQVDFIIRN
. ..::
XP_011 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 795 init1: 579 opt: 786 Z-score: 809.0 bits: 157.9 E(85289): 2.5e-38
Smith-Waterman score: 786; 38.9% identity (72.9% similar) in 306 aa overlap (1-302:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKIANNTVVTEFILLGLTQSQDIQLLVFVLILIFYLIILPGNFLIIFTIRSDPGLTAPLY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LFLGNLAFLDASYSFIVAPRMLVDFLSEKKVISYRGCITQLFFLHFLGGGEGLLLVVMAF
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE6 DRYIAICRPLHCSTVMNPRACYAMMLALWLGGFVHSIIQVVLILRLPFCGPNQLDNFFCD
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE6 VRQVIKLACTDMFVVELLMVFNSGLMTLLCFLGLLASYAVILCHVRRAAS-EGKNKAMST
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 CTTRVIIILLMFGPAIFIYMCPFRALPA---DKMVSLFHTVIFPLMNPMIYTLRNQEVKT
:.... .. : .: ::: :. : . :. .:. :.:.... :..:::::.:::.:::
XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSS-PSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 SMKRLLSRHVVCQVDFIIRN
. ..::
XP_011 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 750 init1: 567 opt: 782 Z-score: 805.0 bits: 157.1 E(85289): 4.2e-38
Smith-Waterman score: 782; 38.0% identity (73.1% similar) in 308 aa overlap (1-304:1-308)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MKIANNTVVTEFILLGLTQ-SQDIQLLVFVLILIFYLIILPGNFLIIFTIRSDPGLTAPL
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NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
10 20 30 40 50 60
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pF1KE6 YLFLGNLAFLDASYSFIVAPRMLVDFLSEKKVISYRGCITQLFFLHFLGGGEGLLLVVMA
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NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
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pF1KE6 FDRYIAICRPLHCSTVMNPRACYAMMLALWLGGFVHSIIQVVLILRLPFCGPNQLDNFFC
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NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
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pF1KE6 DVRQVIKLACTDMFVVELLMVFNSGLMTLLCFLGLLASYAVILCHVRRAAS-EGKNKAMS
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NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
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240 250 260 270 280 290
pF1KE6 TCTTRVIIILLMFGPAIFIYMCP-FRALP-ADKMVSLFHTVIFPLMNPMIYTLRNQEVKT
::....... :.. . . :. : : . :..:: .::. :..::.::.:::.:::.
NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
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300 310
pF1KE6 SMKRLLSRHVVCQVDFIIRN
...: . .
NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP
310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 739 init1: 575 opt: 781 Z-score: 804.1 bits: 157.0 E(85289): 4.8e-38
Smith-Waterman score: 781; 36.6% identity (76.1% similar) in 309 aa overlap (1-306:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKIANNTVVTEFILLGLTQSQDIQLLVFVLILIFYLIILPGNFLIIFTIRSDPGLTAPLY
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XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LFLGNLAFLDASYSFIVAPRMLVDFLSEKKVISYRGCITQLFFLHFLGGGEGLLLVVMAF
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XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYIAICRPLHCSTVMNPRACYAMMLALWLGGFVHSIIQVVLILRLPFCGPNQLDNFFCD
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XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE6 VRQVIKLACTDMFVVELLMVFNSGLMTLLCFLGLLASYAVILCHVRRAAS-EGKNKAMST
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XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 CTTRVIIILLMFGPAIFIYMCPFRALPADK--MVSLFHTVIFPLMNPMIYTLRNQEVKTS
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XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 MKRLLSRHVVCQVDFIIRN
.:....: :
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 739 init1: 575 opt: 781 Z-score: 804.1 bits: 157.0 E(85289): 4.8e-38
Smith-Waterman score: 781; 36.6% identity (76.1% similar) in 309 aa overlap (1-306:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKIANNTVVTEFILLGLTQSQDIQLLVFVLILIFYLIILPGNFLIIFTIRSDPGLTAPLY
:. .:.. :.::.::::... . : :.::..: .:: . ::.:::... : : .:.:
NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LFLGNLAFLDASYSFIVAPRMLVDFLSEKKVISYRGCITQLFFLHFLGGGEGLLLVVMAF
.::.::.:.: .:: ..:.::.. . : ..::. ::.::..:. .. ...::.:::.
NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYIAICRPLHCSTVMNPRACYAMMLALWLGGFVHSIIQVVLILRLPFCGPNQLDNFFCD
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NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE6 VRQVIKLACTDMFVVELLMVFNSGLMTLLCFLGLLASYAVILCHVRRAAS-EGKNKAMST
: ..::.:.: . :.... ...:. . :: .:::: : : : .. : .:. ::.::
NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 CTTRVIIILLMFGPAIFIYMCPFRALPADK--MVSLFHTVIFPLMNPMIYTLRNQEVKTS
: ... ..::... : .:. :. . :.: :.....::. :..::.::.:::. .: .
NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
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pF1KE6 MKRLLSRHVVCQVDFIIRN
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NP_036 LKKVVGRVVFSV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]