Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6031
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6031, 316 aa
1>>>pF1KE6031 316 - 316 aa - 316 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7186+/-0.00124; mu= 13.2940+/- 0.071
mean_var=151.6454+/-50.212, 0's: 0 Z-trim(102.8): 370 B-trim: 875 in 2/47
Lambda= 0.104150
statistics sampled from 6608 (7102) to 6608 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.566), E-opt: 0.2 (0.218), width: 16
Scan time: 2.360
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 ( 316) 2085 326.0 2.4e-89
CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 ( 307) 1779 280.0 1.6e-75
CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 ( 308) 1746 275.0 5.1e-74
CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 1284 205.6 4.1e-53
CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 ( 313) 1243 199.5 2.9e-51
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 1160 187.0 1.7e-47
CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 1143 184.4 9.8e-47
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 1102 178.3 6.9e-45
CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 ( 310) 1094 177.1 1.6e-44
CCDS31563.1 OR4D11 gene_id:219986|Hs108|chr11 ( 311) 1085 175.7 4.1e-44
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 1083 175.4 5e-44
CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 ( 314) 1083 175.4 5e-44
CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 ( 307) 1081 175.1 6.1e-44
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 1080 175.0 6.9e-44
CCDS53636.1 OR4D10 gene_id:390197|Hs108|chr11 ( 311) 1070 173.5 1.9e-43
CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 ( 314) 1055 171.2 9.3e-43
CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 ( 343) 1055 171.3 9.8e-43
CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11 ( 329) 1049 170.3 1.8e-42
CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 ( 344) 1043 169.5 3.4e-42
CCDS32343.1 OR4F4 gene_id:26682|Hs108|chr15 ( 305) 1041 169.1 3.9e-42
CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 ( 304) 1040 168.9 4.4e-42
CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 ( 348) 1039 168.9 5.2e-42
CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 ( 370) 1039 168.9 5.4e-42
CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 ( 305) 1031 167.6 1.1e-41
CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 ( 309) 1031 167.6 1.1e-41
CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 ( 309) 1029 167.3 1.4e-41
CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 1028 167.1 1.5e-41
CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 ( 309) 1024 166.5 2.3e-41
CCDS30547.1 OR4F5 gene_id:79501|Hs108|chr1 ( 305) 1021 166.1 3.2e-41
CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 ( 310) 1018 165.6 4.4e-41
CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11 ( 314) 1016 165.4 5.4e-41
CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 ( 309) 1005 163.7 1.7e-40
CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 ( 323) 1005 163.7 1.7e-40
CCDS32029.1 OR4L1 gene_id:122742|Hs108|chr14 ( 312) 1004 163.5 1.9e-40
CCDS31487.1 OR4X1 gene_id:390113|Hs108|chr11 ( 305) 995 162.2 4.7e-40
CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15 ( 312) 991 161.6 7.3e-40
CCDS32342.1 OR4F15 gene_id:390649|Hs108|chr15 ( 312) 980 159.9 2.3e-39
CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11 ( 315) 972 158.7 5.3e-39
CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11 ( 309) 970 158.4 6.5e-39
CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 ( 309) 969 158.3 7.2e-39
CCDS31504.1 OR4P4 gene_id:81300|Hs108|chr11 ( 312) 965 157.7 1.1e-38
CCDS41221.1 OR4F16 gene_id:81399|Hs108|chr1 ( 312) 964 157.5 1.2e-38
CCDS72675.1 OR4F29 gene_id:729759|Hs108|chr1 ( 312) 964 157.5 1.2e-38
CCDS43415.1 OR4F3 gene_id:26683|Hs108|chr5 ( 312) 964 157.5 1.2e-38
CCDS34792.1 OR4F21 gene_id:441308|Hs108|chr8 ( 312) 961 157.1 1.7e-38
CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11 ( 309) 954 156.0 3.4e-38
CCDS32047.1 OR10G2 gene_id:26534|Hs108|chr14 ( 310) 895 147.2 1.6e-35
CCDS31499.1 OR4A16 gene_id:81327|Hs108|chr11 ( 328) 893 146.9 2e-35
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 875 144.2 1.3e-34
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 872 143.7 1.8e-34
>>CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 (316 aa)
initn: 2085 init1: 2085 opt: 2085 Z-score: 1717.5 bits: 326.0 E(32554): 2.4e-89
Smith-Waterman score: 2085; 100.0% identity (100.0% similar) in 316 aa overlap (1-316:1-316)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKIANNTVVTEFILLGLTQSQDIQLLVFVLILIFYLIILPGNFLIIFTIRSDPGLTAPLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MKIANNTVVTEFILLGLTQSQDIQLLVFVLILIFYLIILPGNFLIIFTIRSDPGLTAPLY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LFLGNLAFLDASYSFIVAPRMLVDFLSEKKVISYRGCITQLFFLHFLGGGEGLLLVVMAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LFLGNLAFLDASYSFIVAPRMLVDFLSEKKVISYRGCITQLFFLHFLGGGEGLLLVVMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYIAICRPLHCSTVMNPRACYAMMLALWLGGFVHSIIQVVLILRLPFCGPNQLDNFFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DRYIAICRPLHCSTVMNPRACYAMMLALWLGGFVHSIIQVVLILRLPFCGPNQLDNFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 VRQVIKLACTDMFVVELLMVFNSGLMTLLCFLGLLASYAVILCHVRRAASEGKNKAMSTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VRQVIKLACTDMFVVELLMVFNSGLMTLLCFLGLLASYAVILCHVRRAASEGKNKAMSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TTRVIIILLMFGPAIFIYMCPFRALPADKMVSLFHTVIFPLMNPMIYTLRNQEVKTSMKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TTRVIIILLMFGPAIFIYMCPFRALPADKMVSLFHTVIFPLMNPMIYTLRNQEVKTSMKR
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 LLSRHVVCQVDFIIRN
::::::::::::::::
CCDS32 LLSRHVVCQVDFIIRN
310
>>CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 (307 aa)
initn: 1804 init1: 1769 opt: 1779 Z-score: 1469.1 bits: 280.0 E(32554): 1.6e-75
Smith-Waterman score: 1779; 85.9% identity (95.8% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKIANNTVVTEFILLGLTQSQDIQLLVFVLILIFYLIILPGNFLIIFTIRSDPGLTAPLY
:. : ::. ::::::::::::::::::::.::::.:::::::::::::.::::::::::
CCDS32 MESENRTVIREFILLGLTQSQDIQLLVFVLVLIFYFIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAPLY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LFLGNLAFLDASYSFIVAPRMLVDFLSEKKVISYRGCITQLFFLHFLGGGEGLLLVVMAF
.:::::::::::::::::::::::::: ::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FFLGNLAFLDASYSFIVAPRMLVDFLSAKKIISYRGCITQLFFLHFLGGGEGLLLVVMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYIAICRPLHCSTVMNPRACYAMMLALWLGGFVHSIIQVVLILRLPFCGPNQLDNFFCD
::::::::::: ::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DRYIAICRPLHYPTVMNPRTCYAMMLALWLGGFVHSIIQVVLILRLPFCGPNQLDNFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 VRQVIKLACTDMFVVELLMVFNSGLMTLLCFLGLLASYAVILCHVRRAASEGKNKAMSTC
: ::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::..: ..::.::::::::
CCDS32 VPQVIKLACTDTFVVELLMVFNSGLMTLLCFLGLLASYAVILCRIRGSSSEAKNKAMSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TTRVIIILLMFGPAIFIYMCPFRALPADKMVSLFHTVIFPLMNPMIYTLRNQEVKTSMKR
:..:.:..::::.:::: ::::.::::.:::::::::::.::.::::::::::.:::.
CCDS32 ITHIIVIFFMFGPGIFIYTRPFRAFPADKVVSLFHTVIFPLLNPVIYTLRNQEVKASMKK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 LLSRHVVCQVDFIIRN
....:.
CCDS32 VFNKHIA
>>CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 (308 aa)
initn: 1779 init1: 1737 opt: 1746 Z-score: 1442.3 bits: 275.0 E(32554): 5.1e-74
Smith-Waterman score: 1746; 83.8% identity (95.8% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKIANNTVVTEFILLGLTQSQDIQLLVFVLILIFYLIILPGNFLIIFTIRSDPGLTAPLY
:. : :::::::::::::::: :::::::.::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS32 METQNLTVVTEFILLGLTQSQDAQLLVFVLVLIFYLIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAPLY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LFLGNLAFLDASYSFIVAPRMLVDFLSEKKVISYRGCITQLFFLHFLGGGEGLLLVVMAF
.::::::.:::::::::.:::::::::::::::::.::::::::::::.:: .:::::::
CCDS32 FFLGNLALLDASYSFIVVPRMLVDFLSEKKVISYRSCITQLFFLHFLGAGEMFLLVVMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYIAICRPLHCSTVMNPRACYAMMLALWLGGFVHSIIQVVLILRLPFCGPNQLDNFFCD
::::::::::: ::.::::::::. :.::::::.:::.::.:::.:::::::::::::::
CCDS32 DRYIAICRPLHYSTIMNPRACYALSLVLWLGGFIHSIVQVALILHLPFCGPNQLDNFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 VRQVIKLACTDMFVVELLMVFNSGLMTLLCFLGLLASYAVILCHVRRAASEGKNKAMSTC
: ::::::::. :::::::: ::::..::::::::::::::::..:. .::::.::.:::
CCDS32 VPQVIKLACTNTFVVELLMVSNSGLLSLLCFLGLLASYAVILCRIREHSSEGKSKAISTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TTRVIIILLMFGPAIFIYMCPFRALPADKMVSLFHTVIFPLMNPMIYTLRNQEVKTSMKR
::..:::.:::::::::: :::.:.::::.::::::::::::::.::::::::::.::..
CCDS32 TTHIIIIFLMFGPAIFIYTCPFQAFPADKVVSLFHTVIFPLMNPVIYTLRNQEVKASMRK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 LLSRHVVCQVDFIIRN
:::.:. :
CCDS32 LLSQHMFC
>>CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 (313 aa)
initn: 1282 init1: 974 opt: 1284 Z-score: 1067.1 bits: 205.6 E(32554): 4.1e-53
Smith-Waterman score: 1284; 56.3% identity (86.2% similar) in 311 aa overlap (1-309:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKIANNTVVTEFILLGLTQSQDIQLLVFVLILIFYLIILPGNFLIIFTIRSDPGLTAPLY
:. :: : ::::.: ::.:....::..::..: :::.:::::.::: ::: :: ::.:.:
CCDS32 METANYTKVTEFVLTGLSQTREVQLVLFVIFLSFYLFILPGNILIICTIRLDPHLTSPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LFLGNLAFLDASYSFIVAPRMLVDFLSEKKVISYRGCITQLFFLHFLGGGEGLLLVVMAF
..:.:::.:: :: :.::.::.::. :.:.::. :::.:::::::.:..: .::.:::.
CCDS32 FLLANLALLDIWYSSITAPKMLIDFFVERKIISFGGCIAQLFFLHFVGASEMFLLTVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYIAICRPLHCSTVMNPRACYAMMLALWLGGFVHSIIQVVLILRLPFCGPNQLDNFFCD
::: ::::::: .:.:: : : .. :.:::.::::::.::.::::::::.::..:::
CCDS32 DRYAAICRPLHYATIMNRRLCCILVALSWMGGFIHSIIQVALIVRLPFCGPNELDSYFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE6 VRQVIKLACTDMFVVELLMVFNSGLMTLLCFLGLLASYAVILCHVRRAASEGKN--KAMS
. ::...::.. : ::.:. .:::....::..:: ::: .: ... .. :.: .:::
CCDS32 ITQVVRIACANTFPEELVMICSSGLISVVCFIALLMSYAFLLALLKKHSGSGENTNRAMS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 TCTTRVIIILLMFGPAIFIYMCPFRALPADKMVSLFHTVIFPLMNPMIYTLRNQEVKTSM
:: ... :..:::::.:.:: :: .. ::.::.::::::::.::.::::::.:::..:
CCDS32 TCYSHITIVVLMFGPSIYIYARPFDSFSLDKVVSVFHTVIFPLLNPIIYTLRNKEVKAAM
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 KRLLSRHVVCQVDFIIRN
.........:.
CCDS32 RKVVTKYILCEEK
310
>>CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 (313 aa)
initn: 1241 init1: 947 opt: 1243 Z-score: 1033.8 bits: 199.5 E(32554): 2.9e-51
Smith-Waterman score: 1243; 55.6% identity (83.9% similar) in 311 aa overlap (1-309:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKIANNTVVTEFILLGLTQSQDIQLLVFVLILIFYLIILPGNFLIIFTIRSDPGLTAPLY
:. :: : ::::.: ::.:. ..::..::..: :::.:::::.::: :: :: ::.:.:
CCDS32 METANYTKVTEFVLTGLSQTPEVQLVLFVIFLSFYLFILPGNILIICTISLDPHLTSPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LFLGNLAFLDASYSFIVAPRMLVDFLSEKKVISYRGCITQLFFLHFLGGGEGLLLVVMAF
..:.:::::: :: :.::.::.::. :.:.::. :::.::::::: :..: .::.::::
CCDS32 FLLANLAFLDIWYSSITAPEMLIDFFVERKIISFDGCIAQLFFLHFAGASEMFLLTVMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYIAICRPLHCSTVMNPRACYAMMLALWLGGFVHSIIQVVLILRLPFCGPNQLDNFFCD
: : ::::::: .:.:: : : .. : :::.::::::.::.::::::::.::..:::
CCDS32 DLYTAICRPLHYATIMNQRLCCILVALSWRGGFIHSIIQVALIVRLPFCGPNELDSYFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE6 VRQVIKLACTDMFVVELLMVFNSGLMTLLCFLGLLASYAVILCHVRRAASEGKN--KAMS
. ::...::.. : ::.:. .:::....:...:: ::: .: .. .. :.: .:::
CCDS32 ITQVVRIACANTFPEELVMICSSGLISVVCLIALLMSYAFLLALFKKLSGSGENTNRAMS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 TCTTRVIIILLMFGPAIFIYMCPFRALPADKMVSLFHTVIFPLMNPMIYTLRNQEVKTSM
:: ... :..:::::.:.:: :: .. ::.::.:.:.:::: ::.::::::.:::..:
CCDS32 TCYSHITIVVLMFGPSIYIYARPFDSFSLDKVVSVFNTLIFPLRNPIIYTLRNKEVKAAM
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 KRLLSRHVVCQVDFIIRN
..:......:.
CCDS32 RKLVTKYILCKEK
310
>>CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 (313 aa)
initn: 1160 init1: 988 opt: 1160 Z-score: 966.4 bits: 187.0 E(32554): 1.7e-47
Smith-Waterman score: 1160; 53.6% identity (82.8% similar) in 302 aa overlap (1-301:1-302)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MKIANNTVVTEFILLGLTQSQDIQLLVFVLILIFYLIILPGNFLIIFTIRSDPGLT-APL
:: ... ::::.::::..: ..::..:.:.:.::. :. ::.::. :... : .:.
CCDS32 MKKEQDSNVTEFVLLGLSSSWELQLFLFLLFLFFYIAIVLGNLLIVVTVQAHAHLLQSPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 YLFLGNLAFLDASYSFIVAPRMLVDFLSEKKVISYRGCITQLFFLHFLGGGEGLLLVVMA
: :::.:.:.: : ...:.:: :::.. : ::. ::..:..::::::..: .::.:::
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310
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316 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]