Result of FASTA (omim) for
pFN21AE6030
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6030, 316 aa
1>>>pF1KE6030 316 - 316 aa - 316 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.6290+/-0.000477; mu= 19.8889+/- 0.030
mean_var=103.8511+/-29.593, 0's: 0 Z-trim(108.5): 400 B-trim: 924 in 1/48
Lambda= 0.125854
statistics sampled from 15981 (16561) to 15981 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.517), E-opt: 0.2 (0.194), width: 16
Scan time: 5.030
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 902 175.1 1.6e-43
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 828 161.7 1.8e-39
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 819 160.1 5.5e-39
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 819 160.1 5.5e-39
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 819 160.1 5.6e-39
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 815 159.3 9.3e-39
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 815 159.3 9.3e-39
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 815 159.3 9.3e-39
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 803 157.2 4.3e-38
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 799 156.4 6.9e-38
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 790 154.8 2.1e-37
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 787 154.2 3.1e-37
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 777 152.4 1.1e-36
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 771 151.3 2.3e-36
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 752 147.9 2.5e-35
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 735 144.8 2.2e-34
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 730 143.9 4e-34
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 729 143.7 4.6e-34
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 727 143.3 5.8e-34
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 693 137.2 4.2e-32
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 574 115.6 1.4e-25
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 560 113.0 8.1e-25
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 234 54.0 5.9e-07
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 234 54.0 5.9e-07
NP_001138757 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 389) 233 53.8 6.7e-07
NP_001008504 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 392) 233 53.8 6.8e-07
NP_001138755 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 397) 233 53.8 6.8e-07
NP_000905 (OMIM: 600018) mu-type opioid receptor i ( 400) 233 53.8 6.9e-07
NP_001138756 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 403) 233 53.8 6.9e-07
NP_001138754 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 406) 233 53.8 6.9e-07
NP_001272452 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 414) 233 53.8 7e-07
NP_001008503 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 418) 233 53.8 7e-07
NP_001138758 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 420) 233 53.8 7.1e-07
NP_001008505 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 446) 233 53.9 7.3e-07
NP_001272453 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 493) 233 53.9 7.7e-07
NP_001138751 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 493) 233 53.9 7.7e-07
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 222 51.7 2.4e-06
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 220 51.4 3.4e-06
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 220 51.5 3.6e-06
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 216 50.6 5.3e-06
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 213 50.0 7.5e-06
NP_872588 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 212 49.9 9.2e-06
XP_016883343 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 370) 212 49.9 9.2e-06
NP_001186948 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 370) 212 49.9 9.2e-06
NP_000904 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 212 49.9 9.2e-06
XP_011527130 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 212 50.0 9.5e-06
XP_016883341 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 212 50.0 9.5e-06
XP_016883342 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 212 50.0 9.5e-06
NP_001305782 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 399) 212 50.0 9.6e-06
NP_001305783 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 365) 206 48.8 1.9e-05
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 896 init1: 585 opt: 902 Z-score: 902.2 bits: 175.1 E(85289): 1.6e-43
Smith-Waterman score: 902; 45.3% identity (73.6% similar) in 318 aa overlap (1-314:1-317)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MPSQNYSIISEFNLFGFSAFPQHLLPILFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATIWIEHRLHTPM
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NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
10 20 30 40 50 60
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pF1KE6 YLFLCTLSVSEILFTVAITPRMLADLLSTHHSITFVACANQMFFSFMFGFTHSFLLLVMG
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NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
70 80 90 100 110 120
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pF1KE6 YDRYVAICHPLRYNVLMSPRDCAHLVACTWAGGSVMGMMVTTIVFHLTFCGSNVIHHFFC
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NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
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190 200 210 220 230 240
pF1KE6 HVLSLLKLACENKTSSVIMGVMLVCVTALIGCLFLIILSYVFIVAAILRIPSAEGRHKTF
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NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCL-LILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAF
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pF1KE6 STCVSHLTVVVTHYSFASFIYLKPKGLHSMYSDALMATTYTVFTPFLSPIIFSLRNKELK
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NP_835 STCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVK
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310
pF1KE6 NAINKNFYR----KFCPPSS
::....:.. . : :
NP_835 NALSRTFHKVLALRNCIP
300 310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 820 init1: 492 opt: 828 Z-score: 829.6 bits: 161.7 E(85289): 1.8e-39
Smith-Waterman score: 828; 41.7% identity (73.9% similar) in 307 aa overlap (4-310:6-310)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MPSQNYSIISEFNLFGFSAFPQHLLPILFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATIWIEHRLHT
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pF1KE6 PMYLFLCTLSVSEILFTVAITPRMLADLLSTHHSITFVACANQMFFSFMFGFTHSFLLLV
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pF1KE6 MGYDRYVAICHPLRYNVLMSPRDCAHLVACTWAGGSVMGMMVTTIVFHLTFCGSNVIHHF
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pF1KE6 FCHVLSLLKLACENKTSSVIMGVMLVCVTALIGCLFLIILSYVFIVAAILRIPSAEGRHK
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NP_006 FCDLPPLLKLSCTDTTINEWL-LSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKK
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pF1KE6 TFSTCVSHLTVVVTHYSFASFIYLKPKGLHSMYSDALMATTYTVFTPFLSPIIFSLRNKE
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NP_006 TFSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKD
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300 310
pF1KE6 LKNAINKNFYRKFCPPSS
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NP_006 VKDAAEKVLRSKVDSS
300 310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 823 init1: 508 opt: 819 Z-score: 820.8 bits: 160.1 E(85289): 5.5e-39
Smith-Waterman score: 819; 42.3% identity (72.8% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MPSQNYSIISEFNLFGFSAFPQHLLPILFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATIWIEHRLHTPM
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pF1KE6 HVLSLLKLACENKTSSVIMGVMLVCVTALIGCLFLIILSYVFIVAAILRIPSAEGRHKTF
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NP_036 DVTPLLKLSCSDTHLNEVI-ILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAF
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pF1KE6 STCVSHLTVVVTHYSFASFIYLKPKGLHSMYSDALMATTYTVFTPFLSPIIFSLRNKELK
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NP_036 STCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLK
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310
pF1KE6 NAINKNFYRKFCPPSS
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NP_036 GALKKVVGRVVFSV
300 310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 823 init1: 508 opt: 819 Z-score: 820.8 bits: 160.1 E(85289): 5.5e-39
Smith-Waterman score: 819; 42.3% identity (72.8% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MPSQNYSIISEFNLFGFSAFPQHLLPILFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATIWIEHRLHTPM
: . : : .::: :.:.: ::. .::...: :.: :.::::::. .. :. :::::
XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQ-HLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPM
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pF1KE6 YLFLCTLSVSEILFTVAITPRMLADLLSTHHSITFVACANQMFFSFMFGFTHSFLLLVMG
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XP_011 YFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMA
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pF1KE6 YDRYVAICHPLRYNVLMSPRDCAHLVACTWAGGSVMGMMVTTIVFHLTFCGSNVIHHFFC
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XP_011 YDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFC
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pF1KE6 HVLSLLKLACENKTSSVIMGVMLVCVTALIGCLFLIILSYVFIVAAILRIPSAEGRHKTF
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XP_011 DVTPLLKLSCSDTHLNEVI-ILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAF
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pF1KE6 STCVSHLTVVVTHYSFASFIYLKPKGLHSMYSDALMATTYTVFTPFLSPIIFSLRNKELK
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XP_011 STCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLK
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pF1KE6 NAINKNFYRKFCPPSS
.:..:
XP_011 GALKKVVGRVVFSV
300 310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 823 init1: 508 opt: 819 Z-score: 820.7 bits: 160.1 E(85289): 5.6e-39
Smith-Waterman score: 819; 42.3% identity (72.8% similar) in 305 aa overlap (1-305:11-313)
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pF1KE6 MPSQNYSIISEFNLFGFSAFPQHLLPILFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATI
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pF1KE6 WIEHRLHTPMYLFLCTLSVSEILFTVAITPRMLADLLSTHHSITFVACANQMFFSFMFGF
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XP_011 MDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFC
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pF1KE6 GSNVIHHFFCHVLSLLKLACENKTSSVIMGVMLVCVTALIGCLFLIILSYVFIVAAILRI
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XP_011 ADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVI-ILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKV
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pF1KE6 PSAEGRHKTFSTCVSHLTVVVTHYSFASFIYLKPKGLHSMYSDALMATTYTVFTPFLSPI
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XP_011 PSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPF
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300 310
pF1KE6 IFSLRNKELKNAINKNFYRKFCPPSS
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XP_011 IYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
300 310 320
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 793 init1: 496 opt: 815 Z-score: 816.8 bits: 159.3 E(85289): 9.3e-39
Smith-Waterman score: 815; 40.8% identity (75.4% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-307)
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pF1KE6 MPSQNYSIISEFNLFGFSAFPQHLLPILFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATIWIEHRLHTPM
: ..: . .::: :.:.:. ::.:.:.:.. :.::: ::. : .. ::::::
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pF1KE6 YLFLCTLSVSEILFTVAITPRMLADLLSTHHSITFVACANQMFFSFMFGFTHSFLLLVMG
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pF1KE6 YDRYVAICHPLRYNVLMSPRDCAHLVACTWAGGSVMGMMVTTIVFHLTFCGSNVIHHFFC
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pF1KE6 HVLSLLKLACENKTSSVIMGVMLVCVTALIGCLFLIILSYVFIVAAILRIPSAEGRHKTF
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NP_036 ELLAVVRLACVD-TSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAF
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NP_036 HTCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVK
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310
pF1KE6 NAINKNFYRKFCPPSS
.: .: ...
NP_036 GAWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
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XP_011 HTCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVK
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310
pF1KE6 NAINKNFYRKFCPPSS
.: .: ...
XP_011 GAWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 793 init1: 496 opt: 815 Z-score: 816.8 bits: 159.3 E(85289): 9.3e-39
Smith-Waterman score: 815; 40.8% identity (75.4% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MPSQNYSIISEFNLFGFSAFPQHLLPILFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATIWIEHRLHTPM
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSS-DWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPM
10 20 30 40 50
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pF1KE6 YLFLCTLSVSEILFTVAITPRMLADLLSTHHSITFVACANQMFFSFMFGFTHSFLLLVMG
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XP_011 YFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YDRYVAICHPLRYNVLMSPRDCAHLVACTWAGGSVMGMMVTTIVFHLTFCGSNVIHHFFC
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XP_011 YDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 HVLSLLKLACENKTSSVIMGVMLVCVTALIGCLFLIILSYVFIVAAILRIPSAEGRHKTF
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XP_011 ELLAVVRLACVD-TSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAF
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pF1KE6 STCVSHLTVVVTHYSFASFIYLKPKGLHSMYSDALMATTYTVFTPFLSPIIFSLRNKELK
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XP_011 HTCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVK
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310
pF1KE6 NAINKNFYRKFCPPSS
.: .: ...
XP_011 GAWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo (327 aa)
initn: 737 init1: 293 opt: 803 Z-score: 804.9 bits: 157.2 E(85289): 4.3e-38
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pF1KE6 MPSQNYSI-ISEFNLFGFSAFPQHLLPILFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATIWIEHRLHTP
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pF1KE6 MYLFLCTLSVSEILFTVAITPRMLADLLSTHHS----ITFVACANQMFFSFMFGFTHSFL
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NP_003 MYFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVL
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pF1KE6 LLVMGYDRYVAICHPLRYNVLMSPRDCAHLVACTWAGGSVMGMMVTTIVFHLTFCGSNVI
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NP_003 LAVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPNII
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NP_003 NHFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILA-IFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAG
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pF1KE6 RHKTFSTCVSHLTVVVTHYSFASFIYLKPKGLHSMYSDALMATTYTVFTPFLSPIIFSLR
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NP_003 RYKAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLR
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pF1KE6 NKELKNAINKNFYRKFCPPSS
:.:.: :.
NP_003 NQEVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
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>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 818 init1: 482 opt: 799 Z-score: 801.2 bits: 156.4 E(85289): 6.9e-38
Smith-Waterman score: 799; 41.0% identity (74.5% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-308)
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pF1KE6 MPSQNYSIISEFNLFGFSAFPQHLLPILFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATIWIEHRLHTPM
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NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGL-ADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPM
10 20 30 40 50
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pF1KE6 YLFLCTLSVSEILFTVAITPRMLADLLSTHHSITFVACANQMFFSFMFGFTHSFLLLVMG
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NP_003 YFFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMA
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pF1KE6 YDRYVAICHPLRYNVLMSPRDCAHLVACTWAGGSVMGMMVTTIVFHLTFCGSNVIHHFFC
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NP_003 YDRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFC
120 130 140 150 160 170
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pF1KE6 HVLSLLKLACENKTSSVIMGVMLVCVTALIGCLFLIILSYVFIVAAILRIPSAEGRHKTF
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NP_003 DSPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVN-IVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAF
180 190 200 210 220 230
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NP_003 KALANVISRKRTSSFL
300 310
316 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 08:52:29 2016 done: Tue Nov 8 08:52:30 2016
Total Scan time: 5.030 Total Display time: 0.010
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]