Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6030
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6030, 316 aa
1>>>pF1KE6030 316 - 316 aa - 316 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4998+/-0.00119; mu= 14.8960+/- 0.070
mean_var=185.7378+/-65.263, 0's: 0 Z-trim(102.9): 436 B-trim: 403 in 1/50
Lambda= 0.094107
statistics sampled from 6626 (7172) to 6626 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.551), E-opt: 0.2 (0.22), width: 16
Scan time: 1.660
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32941.1 OR10H4 gene_id:126541|Hs108|chr19 ( 316) 2108 299.5 2.3e-81
CCDS12334.1 OR10H3 gene_id:26532|Hs108|chr19 ( 316) 1887 269.5 2.4e-72
CCDS12333.1 OR10H2 gene_id:26538|Hs108|chr19 ( 315) 1514 218.9 4.3e-57
CCDS12335.1 OR10H1 gene_id:26539|Hs108|chr19 ( 318) 1510 218.3 6.2e-57
CCDS32940.1 OR10H5 gene_id:284433|Hs108|chr19 ( 315) 1484 214.8 7.2e-56
CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 ( 313) 1000 149.1 4.3e-36
CCDS30896.1 OR10K2 gene_id:391107|Hs108|chr1 ( 312) 976 145.8 4.1e-35
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 935 140.2 2e-33
CCDS30910.1 OR10J5 gene_id:127385|Hs108|chr1 ( 309) 932 139.8 2.6e-33
CCDS30909.1 OR10J3 gene_id:441911|Hs108|chr1 ( 329) 918 138.0 9.9e-33
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 912 137.2 1.8e-32
CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 ( 320) 907 136.5 2.8e-32
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 902 135.8 4.4e-32
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 881 132.9 3.2e-31
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 881 133.0 3.3e-31
CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 ( 314) 865 130.7 1.4e-30
CCDS42837.1 OR6B3 gene_id:150681|Hs108|chr2 ( 331) 865 130.8 1.5e-30
CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 ( 303) 852 128.9 4.7e-30
CCDS46559.1 OR6B2 gene_id:389090|Hs108|chr2 ( 312) 850 128.7 5.8e-30
CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9 ( 320) 846 128.2 8.6e-30
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 845 128.0 9.3e-30
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 845 128.0 9.3e-30
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 844 127.9 1e-29
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 842 127.6 1.2e-29
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 841 127.5 1.4e-29
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 834 126.5 2.6e-29
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 833 126.4 2.9e-29
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 832 126.3 3.2e-29
CCDS6596.2 OR2S2 gene_id:56656|Hs108|chr9 ( 319) 832 126.3 3.2e-29
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 832 126.3 3.2e-29
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 831 126.1 3.5e-29
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 828 125.7 4.6e-29
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 828 125.7 4.6e-29
CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 ( 311) 825 125.3 6.1e-29
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 823 125.0 7.4e-29
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 819 124.5 1.1e-28
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 817 124.2 1.3e-28
CCDS31695.1 OR6X1 gene_id:390260|Hs108|chr11 ( 312) 817 124.2 1.3e-28
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 816 124.1 1.4e-28
CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1 ( 317) 816 124.1 1.4e-28
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 816 124.1 1.5e-28
CCDS31565.1 OR10V1 gene_id:390201|Hs108|chr11 ( 309) 814 123.8 1.7e-28
CCDS31705.1 OR10G7 gene_id:390265|Hs108|chr11 ( 311) 814 123.8 1.7e-28
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 812 123.5 2.1e-28
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 809 123.2 2.8e-28
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 808 123.0 3.1e-28
CCDS32046.1 OR10G3 gene_id:26533|Hs108|chr14 ( 313) 807 122.9 3.3e-28
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 806 122.7 3.7e-28
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 805 122.6 4e-28
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 805 122.6 4e-28
>>CCDS32941.1 OR10H4 gene_id:126541|Hs108|chr19 (316 aa)
initn: 2108 init1: 2108 opt: 2108 Z-score: 1574.4 bits: 299.5 E(32554): 2.3e-81
Smith-Waterman score: 2108; 100.0% identity (100.0% similar) in 316 aa overlap (1-316:1-316)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MPSQNYSIISEFNLFGFSAFPQHLLPILFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATIWIEHRLHTPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MPSQNYSIISEFNLFGFSAFPQHLLPILFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATIWIEHRLHTPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YLFLCTLSVSEILFTVAITPRMLADLLSTHHSITFVACANQMFFSFMFGFTHSFLLLVMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YLFLCTLSVSEILFTVAITPRMLADLLSTHHSITFVACANQMFFSFMFGFTHSFLLLVMG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YDRYVAICHPLRYNVLMSPRDCAHLVACTWAGGSVMGMMVTTIVFHLTFCGSNVIHHFFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YDRYVAICHPLRYNVLMSPRDCAHLVACTWAGGSVMGMMVTTIVFHLTFCGSNVIHHFFC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 HVLSLLKLACENKTSSVIMGVMLVCVTALIGCLFLIILSYVFIVAAILRIPSAEGRHKTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HVLSLLKLACENKTSSVIMGVMLVCVTALIGCLFLIILSYVFIVAAILRIPSAEGRHKTF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 STCVSHLTVVVTHYSFASFIYLKPKGLHSMYSDALMATTYTVFTPFLSPIIFSLRNKELK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 STCVSHLTVVVTHYSFASFIYLKPKGLHSMYSDALMATTYTVFTPFLSPIIFSLRNKELK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 NAINKNFYRKFCPPSS
::::::::::::::::
CCDS32 NAINKNFYRKFCPPSS
310
>>CCDS12334.1 OR10H3 gene_id:26532|Hs108|chr19 (316 aa)
initn: 1887 init1: 1887 opt: 1887 Z-score: 1412.2 bits: 269.5 E(32554): 2.4e-72
Smith-Waterman score: 1887; 89.9% identity (95.9% similar) in 316 aa overlap (1-316:1-316)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MPSQNYSIISEFNLFGFSAFPQHLLPILFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATIWIEHRLHTPM
::.::: :::: : :::::::.:::.::::::::::::::::::::::.:::.::::::
CCDS12 MPGQNYRTISEFILSGFSAFPQQLLPVLFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATVWIERRLHTPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YLFLCTLSVSEILFTVAITPRMLADLLSTHHSITFVACANQMFFSFMFGFTHSFLLLVMG
:::::.::.:::::::::::::::::: ::.:::::::: ::::::::::::::::.:::
CCDS12 YLFLCALSISEILFTVAITPRMLADLLFTHRSITFVACAIQMFFSFMFGFTHSFLLMVMG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YDRYVAICHPLRYNVLMSPRDCAHLVACTWAGGSVMGMMVTTIVFHLTFCGSNVIHHFFC
::.::.:::::.::.::::: :::::: ::::::::::::: .:::::::::::::::.:
CCDS12 YDHYVTICHPLHYNMLMSPRGCAHLVAWTWAGGSVMGMMVTMMVFHLTFCGSNVIHHFLC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 HVLSLLKLACENKTSSVIMGVMLVCVTALIGCLFLIILSYVFIVAAILRIPSAEGRHKTF
:::::::::: .:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS12 HVLSLLKLACGSKTSSVIMGVMLVCVTALIGCLFLIILSFVFIVAAILRIPSAEGRHKTF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 STCVSHLTVVVTHYSFASFIYLKPKGLHSMYSDALMATTYTVFTPFLSPIIFSLRNKELK
::::::::::: ::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 STCVSHLTVVVMHYSFASLIYLKPKGLHSMYSDALMATTYTVFTPFLSPIIFSLRNKELK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 NAINKNFYRKFCPPSS
::::::: :.::: ::
CCDS12 NAINKNFCRRFCPLSS
310
>>CCDS12333.1 OR10H2 gene_id:26538|Hs108|chr19 (315 aa)
initn: 1529 init1: 1451 opt: 1514 Z-score: 1138.6 bits: 218.9 E(32554): 4.3e-57
Smith-Waterman score: 1514; 73.6% identity (90.2% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MPSQNYSIISEFNLFGFSAFPQHLLPILFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATIWIEHRLHTPM
: . :.. .::: : :::::: :: .::::.:::.:::::::::::::.: :. :::::
CCDS12 MLGLNHTSMSEFILVGFSAFP-HLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHTPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YLFLCTLSVSEILFTVAITPRMLADLLSTHHSITFVACANQMFFSFMFGFTHSFLLLVMG
:::::.:::::::.:::: ::::::::::..::.:.:::.:::::: ::::::::: :::
CCDS12 YLFLCVLSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YDRYVAICHPLRYNVLMSPRDCAHLVACTWAGGSVMGMMVTTIVFHLTFCGSNVIHHFFC
:::::::::::::::::::: :: ::.:.:::::::::.::. .:.::::::. :.::.:
CCDS12 YDRYVAICHPLRYNVLMSPRGCACLVGCSWAGGSVMGMVVTSAIFQLTFCGSHEIQHFLC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 HVLSLLKLACENKTSSVIMGVMLVCVTALIGCLFLIILSYVFIVAAILRIPSAEGRHKTF
:: :::::: :.. .: .:: :::. ::.::..::.:::.:::: ::.:::::::.:.:
CCDS12 HVPPLLKLACGNNVPAVALGVGLVCIMALLGCFLLILLSYAFIVADILKIPSAEGRNKAF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 STCVSHLTVVVTHYSFASFIYLKPKGLHSMYSDALMATTYTVFTPFLSPIIFSLRNKELK
:::.::: ::..::.::: ::::::: ::. .:.::::::.:.:::::::::::::::::
CCDS12 STCASHLIVVIVHYGFASVIYLKPKGPHSQEGDTLMATTYAVLTPFLSPIIFSLRNKELK
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 NAINKNFYRKFCPPSS
:....:
CCDS12 VAMKRTFLSTLYSSGT
300 310
>>CCDS12335.1 OR10H1 gene_id:26539|Hs108|chr19 (318 aa)
initn: 1497 init1: 1449 opt: 1510 Z-score: 1135.6 bits: 218.3 E(32554): 6.2e-57
Smith-Waterman score: 1510; 72.2% identity (88.2% similar) in 313 aa overlap (1-313:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MPSQNYSIISEFNLFGFSAFPQHLLPILFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATIWIEHRLHTPM
: :.: ...: : :::.:: :: .::::.:::.:::::::::::::.: :. :::::
CCDS12 MQRANHSTVTQFILVGFSVFP-HLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHTPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YLFLCTLSVSEILFTVAITPRMLADLLSTHHSITFVACANQMFFSFMFGFTHSFLLLVMG
:::::.:::::::.:::: ::::::::::..::.:.:::.:::::: ::::::::: :::
CCDS12 YLFLCALSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YDRYVAICHPLRYNVLMSPRDCAHLVACTWAGGSVMGMMVTTIVFHLTFCGSNVIHHFFC
:::::::::::::::::::: :: ::.:.:::: ::::.::. .:::.::: . :::: :
CCDS12 YDRYVAICHPLRYNVLMSPRGCACLVGCSWAGGLVMGMVVTSAIFHLAFCGHKEIHHFAC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 HVLSLLKLACENKTSSVIMGVMLVCVTALIGCLFLIILSYVFIVAAILRIPSAEGRHKTF
:: :::::: . . : :: :::.:::.::..::.:::.:::::::.:::::::.:.:
CCDS12 HVPPLLKLACGDDVLVVAKGVGLVCITALLGCFLLILLSYAFIVAAILKIPSAEGRNKAF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 STCVSHLTVVVTHYSFASFIYLKPKGLHSMYSDALMATTYTVFTPFLSPIIFSLRNKELK
:::.:::::::.::.::: ::::::. .:. .:.::. ::::.:::::::::::::::::
CCDS12 STCASHLTVVVVHYGFASVIYLKPKSPQSLEGDTLMGITYTVLTPFLSPIIFSLRNKELK
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 NAINKNFYRKFCPPSS
:..:.:. :. :
CCDS12 VAMKKTFFSKLYPEKNVMM
300 310
>>CCDS32940.1 OR10H5 gene_id:284433|Hs108|chr19 (315 aa)
initn: 1491 init1: 1416 opt: 1484 Z-score: 1116.5 bits: 214.8 E(32554): 7.2e-56
Smith-Waterman score: 1484; 71.2% identity (87.2% similar) in 313 aa overlap (1-313:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MPSQNYSIISEFNLFGFSAFPQHLLPILFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATIWIEHRLHTPM
: . :.. .::: : :::::: :: .::::.:::.:::::::::::::.: :. :: ::
CCDS32 MQGLNHTSVSEFILVGFSAFP-HLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHMPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 YLFLCTLSVSEILFTVAITPRMLADLLSTHHSITFVACANQMFFSFMFGFTHSFLLLVMG
:::::.::..:::.:::: ::::::::::..::.:.:::.:::::: ::::::::: :::
CCDS32 YLFLCALSITEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YDRYVAICHPLRYNVLMSPRDCAHLVACTWAGGSVMGMMVTTIVFHLTFCGSNVIHHFFC
:::::::::::::::::: : :. :.:.:::: ::::.::. .:::.::: . ::::::
CCDS32 YDRYVAICHPLRYNVLMSLRGCTCRVGCSWAGGLVMGMVVTSAIFHLAFCGHKEIHHFFC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 HVLSLLKLACENKTSSVIMGVMLVCVTALIGCLFLIILSYVFIVAAILRIPSAEGRHKTF
:: :::::: . . : :: :::.:::.::..::.:::.:::::::.:::::::.:.:
CCDS32 HVPPLLKLACGDDVLVVAKGVGLVCITALLGCFLLILLSYAFIVAAILKIPSAEGRNKAF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 STCVSHLTVVVTHYSFASFIYLKPKGLHSMYSDALMATTYTVFTPFLSPIIFSLRNKELK
:::.:::::::.::.::: ::::::: .: .:.::. ::::.:::::::::::::::::
CCDS32 STCASHLTVVVVHYGFASVIYLKPKGPQSPEGDTLMGITYTVLTPFLSPIIFSLRNKELK
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 NAINKNFYRKFCPPSS
:..:. . :. :
CCDS32 VAMKKTCFTKLFPQNC
300 310
>>CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 (313 aa)
initn: 956 init1: 586 opt: 1000 Z-score: 761.4 bits: 149.1 E(32554): 4.3e-36
Smith-Waterman score: 1000; 48.6% identity (80.3% similar) in 315 aa overlap (1-315:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MPSQNYSIISEFNLFGFSAFPQHLLPILFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATIWIEHRLHTPM
: . : ... :: ..:::.. . : .::...::..:::: : .:..:: ... :::::
CCDS30 MEQVNKTVVREFVVLGFSSLAR-LQQLLFVIFLLLYLFTLGTNAIIISTIVLDRALHTPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
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300
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