Result of FASTA (omim) for
pFN21AE6023
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6023, 315 aa
1>>>pF1KE6023 315 - 315 aa - 315 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8159+/-0.000563; mu= 19.1780+/- 0.035
mean_var=108.5135+/-27.751, 0's: 0 Z-trim(107.2): 268 B-trim: 875 in 1/49
Lambda= 0.123121
statistics sampled from 14911 (15241) to 14911 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.517), E-opt: 0.2 (0.179), width: 16
Scan time: 5.670
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 840 160.8 3.4e-39
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 809 155.3 1.5e-37
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 802 154.0 3.6e-37
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 794 152.6 9.6e-37
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 791 152.1 1.4e-36
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 786 151.2 2.6e-36
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 779 150.0 6.1e-36
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 779 150.0 6.1e-36
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 779 150.0 6.2e-36
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 735 142.1 1.4e-33
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 735 142.1 1.4e-33
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 735 142.1 1.4e-33
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 721 139.6 7.6e-33
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 713 138.2 2e-32
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 710 137.7 3e-32
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 708 137.3 3.8e-32
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 707 137.2 4.3e-32
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 692 134.5 2.7e-31
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 690 134.1 3.4e-31
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 685 133.3 6.4e-31
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 634 124.2 3.5e-28
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 602 118.5 1.8e-26
XP_016869882 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 203 47.7 4.2e-05
XP_016869886 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 203 47.7 4.2e-05
XP_016869876 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 203 47.7 4.2e-05
XP_016869885 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 203 47.7 4.2e-05
XP_016869884 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 203 47.7 4.2e-05
XP_016869880 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 203 47.7 4.2e-05
XP_016869888 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 203 47.7 4.2e-05
XP_016869881 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 203 47.7 4.2e-05
XP_016869875 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 203 47.7 4.2e-05
XP_016869892 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 203 47.7 4.2e-05
XP_016869872 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 203 47.7 4.2e-05
XP_016869878 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 203 47.7 4.2e-05
XP_005251839 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 203 47.7 4.2e-05
XP_016869891 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 203 47.7 4.2e-05
XP_016869879 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 203 47.7 4.2e-05
XP_016869873 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 203 47.7 4.2e-05
XP_016869896 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 203 47.7 4.2e-05
XP_016869895 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 203 47.7 4.2e-05
XP_016869887 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 203 47.7 4.2e-05
XP_016869893 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 203 47.7 4.2e-05
XP_016869889 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 203 47.7 4.2e-05
NP_476500 (OMIM: 602282) lysophosphatidic acid rec ( 364) 203 47.7 4.2e-05
XP_016869890 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 203 47.7 4.2e-05
XP_016869877 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 203 47.7 4.2e-05
NP_001392 (OMIM: 602282) lysophosphatidic acid rec ( 364) 203 47.7 4.2e-05
XP_016869894 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 203 47.7 4.2e-05
XP_016869883 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 203 47.7 4.2e-05
XP_016869874 (OMIM: 602282) PREDICTED: lysophospha ( 364) 203 47.7 4.2e-05
>>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo (327 aa)
initn: 817 init1: 369 opt: 840 Z-score: 824.6 bits: 160.8 E(85289): 3.4e-39
Smith-Waterman score: 840; 43.1% identity (72.5% similar) in 306 aa overlap (1-300:1-306)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MESGNQS-TVTEFIFTGFPQLQDGSLLYFFPLLFIYTFIIIDNLLIFSAVRLDTHLHNPM
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NP_003 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLHKPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 YNFISIFSFLEIWYTTATIPKMLSNLISEKKA----ISMTGCILQMYFFHSLENSEGILL
: :.. .:::::::.:.::::::..... :. ::. ::. :.::: .: .: .::
NP_003 YFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVLL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 TTMAIDRYVAICNPLRYQMIMTPRLCAQLSAGSCLFGFLILLPEIVMISTLPFCGPNQIH
..:: :::.::: ::.: .:.. :::.:..::: :: : . .. .:: : .:::: :.
NP_003 AVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPNIIN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 QIFCDLVPVLSLACTDTSMILIEDVIHAVTIIITFL-IIALSYVRIVTVILRIPSSEGRQ
..:::. :.:.:.::: : . : : :. :.. : . . ::: :. ....:::. ::
NP_003 HFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAGRY
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 KAFSTCAGHLMVFPIFFGSVSLMYLRFSDTYPPVLDTAIALMFTVLAPFFNPIIYSLRNK
:::::::.:: : ::... ..: : . . ......:..:..::::: :::.
NP_003 KAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLRNQ
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 DMNNAIKKLFCLQKVLNKPGG
... :.
NP_003 EVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
310 320
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 803 init1: 482 opt: 809 Z-score: 795.0 bits: 155.3 E(85289): 1.5e-37
Smith-Waterman score: 809; 41.7% identity (72.8% similar) in 312 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MESGNQSTVTEFIFTGFPQLQ-DGSLLYFFPLLFIYTFIIIDNLLIFSAVRLDTHLHNPM
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NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
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pF1KE6 YNFISIFSFLEIWYTTATIPKMLSNLISEKKAISMTGCILQMYFFHSLENSEGILLTTMA
: :. .::::: .. . .::::..:... .::. :: ::::: . .: .::.:::
NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
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pF1KE6 IDRYVAICNPLRYQMIMTPRLCAQLSAGSCLFGFLILLPEIVMISTLPFCGPNQIHQIFC
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NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
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pF1KE6 DLVPVLSLACTDTSMILIEDVIHAVTII-ITFLIIALSYVRIVTVILRIPSSEGRQKAFS
: :::.:.:.::... : .. .. .. : :.: ::.::...::.:::..:..::::
NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
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240 250 260 270 280 290
pF1KE6 TCAGHLMVFPIFFGSVSLMYLRFSDTYPPVLDTAIALMFTVLAPFFNPIIYSLRNKDMNN
::..::.: .:. : :: :. ... : ..: .::..:..:::::::::....:
NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 AIKKLFCLQKVLNKPGG
:... : .:::
NP_835 ALSRTF--HKVLALRNCIP
310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 813 init1: 541 opt: 802 Z-score: 788.3 bits: 154.0 E(85289): 3.6e-37
Smith-Waterman score: 802; 41.5% identity (71.4% similar) in 301 aa overlap (5-304:7-307)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MESGNQSTVTEFIFTGFPQLQDGSLLYFFPLLFIYTFIIIDNLLIFSAVRLDTHLHNP
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NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
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pF1KE6 MYNFISIFSFLEIWYTTATIPKMLSNLISEKKAISMTGCILQMYFFHSLENSEGILLTTM
:: :.: .::... : . .:::: :..::.:.::. :: ::.::: .. ..:...:..:
NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
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pF1KE6 AIDRYVAICNPLRYQMIMTPRLCAQLSAGSCLFGFLILLPEIVMISTLPFCGPNQIHQIF
: :::::::::: : ..:. .: .: . : : : . : . . : .: : :...:
NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
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pF1KE6 CDLVPVLSLACTDTSMILIEDVIHAVTI-IITFLIIALSYVRIVTVILRIPSSEGRQKAF
::: :.:.:.::::.. .. .. :: :.:: .:: :. .:.: : ::.:.:
NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
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pF1KE6 STCAGHLMVFPIFFGSVSLMYLRFSDTYPPVLDTAIALMFTVLAPFFNPIIYSLRNKDMN
::::.:: :. :.. ..: : : : : : :....:.. : .::.::::::::..
NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 NAIKKLFCLQKVLNKPGG
.: .:..
NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 775 init1: 560 opt: 794 Z-score: 780.7 bits: 152.6 E(85289): 9.6e-37
Smith-Waterman score: 794; 38.8% identity (73.8% similar) in 309 aa overlap (1-308:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MESGNQSTVTEFIFTGFPQLQDGSLLYFFPLLFIYTFIIIDNLLIFSAVRLDTHLHNPMY
: : ...:::.. :. . . ... :. .: :::. .. :: .. .:.:..::.:::
NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
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pF1KE6 NFISIFSFLEIWYTTATIPKMLSNLISEKKAISMTGCILQMYFFHSLENSEGILLTTMAI
:.. .::... .:. ::::..:.::::.::..::.:::::: :: ..: ::. ::
NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
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pF1KE6 DRYVAICNPLRYQMIMTPRLCAQLSAGSCLFGFLILLPEIVMISTLPFCGPNQIHQIFCD
:::.::: :: :..::. . ...::. :.: .. . .:.: :: : ::..:::
NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
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pF1KE6 LVPVLSLACTDTSMIL-IEDVIHAVTIIITFLIIALSYVRIVTVILRIPSSEGRQKAFST
:...:.:.:: . : ... .:.:. :.:.: :: .. :. . :.:::..::::
NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
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240 250 260 270 280 290
pF1KE6 CAGHLMVFPIFFGSVSLMYLRFSDTYPPVLDTAIALMFTVLAPFFNPIIYSLRNKDMNNA
::.:: .. .:... ::: :..: : . ....::. :..::.:::::.:....:
NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 IKKLFCLQKVLNKPGG
. ... ..
NP_003 LANVISRKRTSSFL
310
>>NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [Homo (312 aa)
initn: 787 init1: 577 opt: 791 Z-score: 777.8 bits: 152.1 E(85289): 1.4e-36
Smith-Waterman score: 791; 40.3% identity (72.1% similar) in 308 aa overlap (1-304:1-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MESGNQSTVTEFIFTGFPQLQDGSLLYFFPLLFIYTFIIIDNLLIFSAVRLDTHLHNPMY
:..:::: .::.. :. . . . . :. .: .: .. :.::. :. :..::.:.:
NP_002 MDGGNQSEGSEFLLLGMSESPEQQRILFWMFLSMYLVTVVGNVLIILAISSDSRLHTPVY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE6 NFISIFSFLEIWYTTATIPKMLSNLISEKKAISMTGCILQMYFFHSLENSEGILLTTMAI
:.. .:: .....: :::::: :: :..::::..::. :.::. :: ....:..::
NP_002 FFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNLQSHNKAISYAGCLTQLYFLVSLVALDNLILAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE6 DRYVAICNPLRYQMIMTPRLCAQLSAGSCLFGFLILLPEIVMISTLPFCGPNQIHQIFCD
::::::: ::.: :.:.:: : . ... : : . .... . ::: .:: :::.
NP_002 DRYVAICCPLHYTTAMSPKLCILLLSLCWVLSVLYGLIHTLLMTRVTFCGSRKIHYIFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE6 LVPVLSLACTDTSMILIEDVIHAVTIIITFLI----IALSYVRIVTVILRIPSSEGRQKA
. .: .::.. : :. .. .: . ::: . .::: :. .:::::: . ::
NP_002 MYVLLRMACSN---IQINHTVLIATGCFIFLIPFGFVIISYVLIIRAILRIPSVSKKYKA
190 200 210 220 230
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pF1KE6 FSTCAGHLMVFPIFFGSVSLMYLRFSDTYPPVLDTAIALMFTVLAPFFNPIIYSLRNKDM
:::::.:: . .:.:.. ..::. :: : :.. ..:..:..:..::.:::::::::
NP_002 FSTCASHLGAVSLFYGTLCMVYLKPLHTYS-VKDSVATVMYAVVTPMMNPFIYSLRNKDM
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 NNAIKKLFCLQKVLNKPGG
..:. .:.
NP_002 HGALGRLLDKHFKRLT
300 310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 770 init1: 549 opt: 786 Z-score: 773.0 bits: 151.2 E(85289): 2.6e-36
Smith-Waterman score: 786; 40.5% identity (71.4% similar) in 301 aa overlap (4-303:5-305)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MESGNQSTVTEFIFTGFPQLQDGSLLYFFPLLFIYTFIIIDNLLIFSAVRLDTHLHNPM
:: . .: ::. :: .. . : .: :: . :: .. .:.:.:::.::
NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 YNFISIFSFLEIWYTTATIPKMLSNLISEKKAISMTGCILQMYFFHSLENSEGILLTTMA
: :.: .::... : ..:.:::::::..:...:...:::.:...: .. ::. :.:.::
NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 IDRYVAICNPLRYQMIMTPRLCAQLSAGSCLFGFLILLPEIVMISTLPFCGPNQIHQIFC
:::.:::::: :. ::.: ::. . :. . :. : .: . : ::: : :...::
NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 DLVPVLSLACTDTSMILIEDVIHAVTI-IITFLIIALSYVRIVTVILRIPSSEGRQKAFS
:. .: :.:::: .. . .: .. . : . :.: .:: : :..: :..::.:::.
NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 TCAGHLMVFPIFFGSVSLMYLRFSDTYPPVLDTAIALMFTVLAPFFNPIIYSLRNKDMNN
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NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD
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300 310
pF1KE6 AIKKLFCLQKVLNKPGG
:.:.:
NP_001 ALKRLQKRKCC
310
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: . :::.:.::.. :. : :. ::. : .: .: .. ::::. .: .:. ::.::
XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVF-FLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPM
10 20 30 40 50
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pF1KE6 YNFISIFSFLEIWYTTATIPKMLSNLISEKKAISMTGCILQMYFFHSLENSEGILLTTMA
: :.: .::..: .. .:.::::.: : : ..::. ::. :::: . . ...::..::
XP_011 YFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMA
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pF1KE6 IDRYVAICNPLRYQMIMTPRLCAQLSAGSCLFGFLILLPEIVMISTLPFCGPNQIHQIFC
:..::.:.::.: :: .::: : :: . . : .: . .... : ::. : : ..::
XP_011 YDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFC
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pF1KE6 DLVPVLSLACTDTSMILIEDVIHAVTIIIT-FLIIALSYVRIVTVILRIPSSEGRQKAFS
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pF1KE6 TCAGHLMVFPIFFGSVSLMYLRFSDTYPPVLDTAIALMFTVLAPFFNPIIYSLRNKDMNN
::..:: : .:.... .:. ... :: ....::..:..::.::::::. ...
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300 310
pF1KE6 AIKKLFCLQKVLNKPGG
:.::.
XP_011 ALKKVVGRVVFSV
300 310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 851 init1: 520 opt: 779 Z-score: 766.3 bits: 150.0 E(85289): 6.1e-36
Smith-Waterman score: 779; 40.0% identity (74.1% similar) in 305 aa overlap (1-303:1-304)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MESGNQSTVTEFIFTGFP-QLQDGSLLYFFPLLFIYTFIIIDNLLIFSAVRLDTHLHNPM
: . :::.:.::.. :. : :. ::. : .: .: .. ::::. .: .:. ::.::
NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVF-FLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPM
10 20 30 40 50
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pF1KE6 YNFISIFSFLEIWYTTATIPKMLSNLISEKKAISMTGCILQMYFFHSLENSEGILLTTMA
: :.: .::..: .. .:.::::.: : : ..::. ::. :::: . . ...::..::
NP_036 YFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMA
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pF1KE6 IDRYVAICNPLRYQMIMTPRLCAQLSAGSCLFGFLILLPEIVMISTLPFCGPNQIHQIFC
:..::.:.::.: :: .::: : :: . . : .: . .... : ::. : : ..::
NP_036 YDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFC
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pF1KE6 DLVPVLSLACTDTSMILIEDVIHAVTIIIT-FLIIALSYVRIVTVILRIPSSEGRQKAFS
:..:.:.:.:.:: . . . ... ..:: :: : ::..:. ..:..::..:: ::::
NP_036 DVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFS
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pF1KE6 TCAGHLMVFPIFFGSVSLMYLRFSDTYPPVLDTAIALMFTVLAPFFNPIIYSLRNKDMNN
::..:: : .:.... .:. ... :: ....::..:..::.::::::. ...
NP_036 TCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKG
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 AIKKLFCLQKVLNKPGG
:.::.
NP_036 ALKKVVGRVVFSV
300 310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 851 init1: 520 opt: 779 Z-score: 766.1 bits: 150.0 E(85289): 6.2e-36
Smith-Waterman score: 779; 40.0% identity (74.1% similar) in 305 aa overlap (1-303:11-314)
10 20 30 40
pF1KE6 MESGNQSTVTEFIFTGFP-QLQDGSLLYFFPLLFIYTFIIIDNLLIFSAV
: . :::.:.::.. :. : :. ::. : .: .: .. ::::. .:
XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVF-FLSMYLATVLGNLLIILSV
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pF1KE6 RLDTHLHNPMYNFISIFSFLEIWYTTATIPKMLSNLISEKKAISMTGCILQMYFFHSLEN
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XP_011 SIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVD
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...::..:: :..::.:.::.: :: .::: : :: . . : .: . .... : ::
XP_011 MDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFC
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pF1KE6 GPNQIHQIFCDLVPVLSLACTDTSMILIEDVIHAVTIIIT-FLIIALSYVRIVTVILRIP
. : : ..:::..:.:.:.:.:: . . . ... ..:: :: : ::..:. ..:..:
XP_011 ADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVP
180 190 200 210 220 230
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pF1KE6 SSEGRQKAFSTCAGHLMVFPIFFGSVSLMYLRFSDTYPPVLDTAIALMFTVLAPFFNPII
:..:: ::::::..:: : .:.... .:. ... :: ....::..:..::.:
XP_011 STKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFI
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:::::. ...:.::.
XP_011 YSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
300 310 320
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 720 init1: 485 opt: 735 Z-score: 724.0 bits: 142.1 E(85289): 1.4e-33
Smith-Waterman score: 735; 37.6% identity (71.9% similar) in 306 aa overlap (1-304:1-305)
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pF1KE6 MESGNQSTVTEFIFTGFPQLQDGSLLYFFPLLFIYTFIIIDNLLIFSAVRLDTHLHNPMY
: . ::. :.:::. :. . : . : .: .:. .. : :: .:::..::.:::
NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE6 NFISIFSFLEIWYTTATIPKMLSNLISEKKAISMTGCILQMYFFHSLENSEGILLTTMAI
:.. .:.... :.:...:..:.....:.::: . .: :..: .: . : .::..::
NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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190 200 210 220 230 240
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pF1KE6 CAGHLMVFPIFFGSVSLMYLRFSDTYPPVLDTAI-ALMFTVLAPFFNPIIYSLRNKDMNN
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NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQ-PHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
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NP_036 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
315 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]