Result of FASTA (omim) for
pFN21AE6017
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6017, 315 aa
1>>>pF1KE6017 315 - 315 aa - 315 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7090+/-0.000519; mu= 19.0997+/- 0.032
mean_var=107.1810+/-29.111, 0's: 0 Z-trim(107.7): 271 B-trim: 924 in 1/48
Lambda= 0.123884
statistics sampled from 15387 (15796) to 15387 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.523), E-opt: 0.2 (0.185), width: 16
Scan time: 4.990
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 1238 232.9 6.6e-61
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 808 156.0 9.1e-38
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 802 154.9 1.9e-37
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 798 154.2 3.2e-37
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 798 154.2 3.2e-37
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 798 154.2 3.2e-37
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 795 153.7 4.5e-37
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 790 152.8 8.4e-37
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 789 152.6 9.5e-37
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 788 152.4 1.1e-36
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 788 152.4 1.1e-36
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 788 152.4 1.1e-36
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 788 152.5 1.1e-36
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 776 150.3 4.7e-36
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 759 147.3 3.9e-35
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 752 146.0 9.4e-35
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 726 141.4 2.4e-33
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 725 141.2 2.7e-33
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 714 139.2 1e-32
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 701 136.9 5.2e-32
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 530 106.3 8.3e-23
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 498 100.6 4.4e-21
XP_011541141 (OMIM: 125853,600804) PREDICTED: mela ( 362) 221 51.2 3.8e-06
NP_005950 (OMIM: 125853,600804) melatonin receptor ( 362) 221 51.2 3.8e-06
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 200 47.4 5e-05
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 199 47.2 5.4e-05
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 197 46.8 6.9e-05
NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 197 46.8 7e-05
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 193 46.1 0.00012
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 185 44.7 0.0003
NP_000697 (OMIM: 600821) vasopressin V1a receptor ( 418) 186 45.0 0.00031
NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 185 44.9 0.00038
XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 185 45.0 0.00041
NP_005949 (OMIM: 600665) melatonin receptor type 1 ( 350) 182 44.2 0.00047
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 180 43.8 0.00058
XP_016855652 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 181 44.3 0.00071
XP_016855647 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 181 44.3 0.00071
XP_016855643 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 181 44.3 0.00071
XP_011542347 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 181 44.3 0.00071
XP_011542349 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 181 44.3 0.00071
XP_005273089 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 181 44.3 0.00071
XP_016855645 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 181 44.3 0.00071
XP_011542343 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 181 44.3 0.00071
XP_016855651 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 181 44.3 0.00071
XP_016855648 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 181 44.3 0.00071
XP_011542345 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 181 44.3 0.00071
XP_016855644 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 181 44.3 0.00071
XP_016855646 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 181 44.3 0.00071
XP_016855642 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 181 44.3 0.00071
XP_016855641 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 181 44.3 0.00071
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
initn: 1240 init1: 632 opt: 1238 Z-score: 1214.4 bits: 232.9 E(85289): 6.6e-61
Smith-Waterman score: 1238; 60.7% identity (85.5% similar) in 303 aa overlap (1-302:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MRQNNNITEFVLLGFSQDPGVQKALFVMFLLTYLVTVVGNLLIVVDIIASPSLGSPMYFF
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NP_001 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LACLSFIDAAYSTTISPKLIVGLFCDKKTISFQGCMGQLFIDHFFGGAEVFLLVVMACDR
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70 80 90 100 110 120
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pF1KE6 YVAICKPLHYLTIMNRQVCFLLLVVAMIGGFVHSAFQIV-VYSLPFCGPNVIVHFSCDMH
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NP_001 YVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 PLLELACTDTYFIGLTVVVNSGAICMVIFNLLLISYGVILSSLKTYSQEKRGKALSTCSS
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NP_001 PLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTCVS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 GSTVVVLFFVPCIFIYVRPVSNFPTDKFMTVFYTIITHMLSPLIYTLRNSEMRNAIEKLL
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NP_001 HITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRKLC
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 GKKLTIFIIGGVSVLM
..:
NP_001 SRKDISGDK
>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
initn: 792 init1: 474 opt: 808 Z-score: 799.0 bits: 156.0 E(85289): 9.1e-38
Smith-Waterman score: 808; 43.6% identity (71.3% similar) in 307 aa overlap (1-303:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MRQNNNITEFVLLGFSQDPGVQKALFVMFLLTYLVTVVGNLLIVVDIIASPSLGSPMYFF
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NP_009 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMYFF
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70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LACLSFIDAAYSTTISPKLIVGLFCDKKTISFQGCMGQLFIDHFFGGAEVFLLVVMACDR
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NP_009 LSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAFDR
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pF1KE6 YVAICKPLHYLTIMNRQVCFLLLVVAMIGGFVHSAFQI-VVYSLPFCGPNVIVHFSCDMH
:::.:.:::: ::.. ..:. : :: . :.:.:. : . :::: . : :..
NP_009 YVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCEVP
130 140 150 160 170 180
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pF1KE6 PLLELACTDTYFIGLTVVVNSGAICMVIFNLLLISYGVIL-SSLKTYSQEKRGKALSTCS
:..:.: :: . . :.: : : .: ..:.:.:::.: . :. : . : ::..:::
NP_009 ALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGTCS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 SGSTVVVLFFVPCIFIYVRPVSNFPTD--KFMTVFYTIITHMLSPLIYTLRNSEMRNAIE
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NP_009 SHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEVTRAFR
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 KLLGKKLTIFIIGGVSVLM
.::::..
NP_009 RLLGKEMGLTQS
310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 718 init1: 448 opt: 802 Z-score: 793.2 bits: 154.9 E(85289): 1.9e-37
Smith-Waterman score: 802; 41.7% identity (71.8% similar) in 309 aa overlap (2-303:6-311)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MRQNNNITEFVLLGFSQDPGVQKALFVMFLLTYLVTVVGNLLIVVDIIASPSLGSP
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NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
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pF1KE6 MYFFLACLSFIDAAYSTTISPKLIVGLFCDKKTISFQGCMGQLFIDHFFGGAEVFLLVVM
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NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
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pF1KE6 ACDRYVAICKPLHYLTIMNRQVCFLLLVVAMIGG----FVHSAFQIVVYSLPFCGPNVIV
: :::::::.:: : ..:.: .:. :.:....:: .::..: .. : .: :::
NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFI---LKYCDKNVIN
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pF1KE6 HFSCDMHPLLELACTDTYFIGLTVVVNSGAICMVIFNLLLISYG-VILSSLKTYSQEKRG
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NP_006 HFFCDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRK
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240 250 260 270 280
pF1KE6 KALSTCSSGSTVVVLFFVPCIFIYVRPVSNF-P-TDKFMTVFYTIITHMLSPLIYTLRNS
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NP_006 KTFSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNK
240 250 260 270 280 290
290 300 310
pF1KE6 EMRNAIEKLLGKKLTIFIIGGVSVLM
....: ::.: .:.
NP_006 DVKDAAEKVLRSKVDSS
300 310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 792 init1: 448 opt: 798 Z-score: 789.3 bits: 154.2 E(85289): 3.2e-37
Smith-Waterman score: 798; 43.7% identity (75.3% similar) in 300 aa overlap (7-301:9-307)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MRQNNNITEFVLLGFSQDPGVQKALFVMFLLTYLVTVVGNLLIVVDIIASPSLGSPMY
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NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KE6 FFLACLSFIDAAYSTTISPKLIVGLFCDKKTISFQGCMGQLFIDHFFGGAEVFLLVVMAC
:::. ::..:..:.:.. :.:.. .. ..:.: ::.: .:::.. .:: : ::.:::
NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KE6 DRYVAICKPLHYLTIMNRQVCFLLLVVAMIGGFVHSAFQIVV-YSLPFCGPNVIVHFSCD
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NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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pF1KE6 MHPLLELACTDTYFIGLTVVVNSGAICMVIFNLLLISYGVILSS-LKTYSQEKRGKALST
. ...:::.:: .:..:.: .. :. : :.:.:: :.:. :: :.: : ::. :
NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 CSSGSTVVVLFFVPCIFIYVRPVSNFPT---DKFMTVFYTIITHMLSPLIYTLRNSEMRN
:.: :::.: . :: :..: :. :. .:...:::.:.: ::.:.::.:::.:...
NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSS-PSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 AIEKLLGKKLTIFIIGGVSVLM
: .::: :
NP_036 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 792 init1: 448 opt: 798 Z-score: 789.3 bits: 154.2 E(85289): 3.2e-37
Smith-Waterman score: 798; 43.7% identity (75.3% similar) in 300 aa overlap (7-301:9-307)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MRQNNNITEFVLLGFSQDPGVQKALFVMFLLTYLVTVVGNLLIVVDIIASPSLGSPMY
..::.:::.:.: .. .:::.::. :.:::.:: :::. : . : .:::
XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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60 70 80 90 100 110
pF1KE6 FFLACLSFIDAAYSTTISPKLIVGLFCDKKTISFQGCMGQLFIDHFFGGAEVFLLVVMAC
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KE6 DRYVAICKPLHYLTIMNRQVCFLLLVVAMIGGFVHSAFQIVV-YSLPFCGPNVIVHFSCD
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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pF1KE6 MHPLLELACTDTYFIGLTVVVNSGAICMVIFNLLLISYGVILSS-LKTYSQEKRGKALST
. ...:::.:: .:..:.: .. :. : :.:.:: :.:. :: :.: : ::. :
XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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pF1KE6 CSSGSTVVVLFFVPCIFIYVRPVSNFPT---DKFMTVFYTIITHMLSPLIYTLRNSEMRN
:.: :::.: . :: :..: :. :. .:...:::.:.: ::.:.::.:::.:...
XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSS-PSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 AIEKLLGKKLTIFIIGGVSVLM
: .::: :
XP_011 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 792 init1: 448 opt: 798 Z-score: 789.3 bits: 154.2 E(85289): 3.2e-37
Smith-Waterman score: 798; 43.7% identity (75.3% similar) in 300 aa overlap (7-301:9-307)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MRQNNNITEFVLLGFSQDPGVQKALFVMFLLTYLVTVVGNLLIVVDIIASPSLGSPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 FFLACLSFIDAAYSTTISPKLIVGLFCDKKTISFQGCMGQLFIDHFFGGAEVFLLVVMAC
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 DRYVAICKPLHYLTIMNRQVCFLLLVVAMIGGFVHSAFQIVV-YSLPFCGPNVIVHFSCD
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 MHPLLELACTDTYFIGLTVVVNSGAICMVIFNLLLISYGVILSS-LKTYSQEKRGKALST
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 CSSGSTVVVLFFVPCIFIYVRPVSNFPT---DKFMTVFYTIITHMLSPLIYTLRNSEMRN
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSS-PSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 AIEKLLGKKLTIFIIGGVSVLM
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XP_011 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
initn: 777 init1: 436 opt: 795 Z-score: 786.6 bits: 153.7 E(85289): 4.5e-37
Smith-Waterman score: 795; 41.3% identity (73.0% similar) in 300 aa overlap (7-299:6-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MRQNNNITEFVLLGFSQDPGVQKALFVMFLLTYLVTVVGNLLIVVDIIASPSLGSPMYFF
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NP_001 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGNMLIIIAKIYNNTLHTPMYVF
10 20 30 40 50
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pF1KE6 LACLSFIDAAYSTTISPKLIVGLFCDKKTISFQGCMGQLFIDHFFGGAEVFLLVVMACDR
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NP_001 LLTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLFLFTWSLGAEMVLFTTMAYDR
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pF1KE6 YVAICKPLHYLTIMNRQVCFLLL----VVAMIGGFVHSAFQIVVYSLPFCGPNVIVHFSC
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NP_001 YVAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVMAIAVTNSWVHTAL---IMRLTFCGPNTIDHFFC
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pF1KE6 DMHPLLELACTDTYFIGLTVVVNSGAICMVIFNLLLISYG-VILSSLKTYSQEKRGKALS
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NP_001 EIPPLLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISYGFIIVAILRIRTVEGKRKAFS
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pF1KE6 TCSSGSTVVVLFFVPCIFIYVRPVSN--FPTDKFMTVFYTIITHMLSPLIYTLRNSEMRN
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NP_001 TCSSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVTPTLNPMVYSFQNREMQA
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 AIEKLLGKKLTIFIIGGVSVLM
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NP_001 GIRKVFAFLKH
300
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 743 init1: 418 opt: 790 Z-score: 781.7 bits: 152.8 E(85289): 8.4e-37
Smith-Waterman score: 790; 42.1% identity (72.2% similar) in 309 aa overlap (1-302:1-309)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MRQNNNITE---FVLLGFSQDPGVQKALFVMFLLTYLVTVVGNLLIVVDIIASPSLGSPM
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NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
10 20 30 40 50 60
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pF1KE6 YFFLACLSFIDAAYSTTISPKLIVGLFCDKKTISFQGCMGQLFIDHFFGGAEVFLLVVMA
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NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
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120 130 140 150 160 170
pF1KE6 CDRYVAICKPLHYLTIMNRQVCFLLLVVAMIGGFVHSAFQI-VVYSLPFCGPNVIVHFSC
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NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
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pF1KE6 DMHPLLELACTDTYFIGLTVVVNSGAICMVIFNLLLISYGVI-LSSLKTYSQEKRGKALS
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NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
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240 250 260 270 280 290
pF1KE6 TCSSGSTVVVLFFVPCIFIYVRPVSNFPT--DKFMTVFYTIITHMLSPLIYTLRNSEMRN
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NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD
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300 310
pF1KE6 AIEKLLGKKLTIFIIGGVSVLM
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NP_001 ALKRLQKRKCC
310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 771 init1: 438 opt: 789 Z-score: 780.7 bits: 152.6 E(85289): 9.5e-37
Smith-Waterman score: 789; 41.0% identity (73.9% similar) in 295 aa overlap (10-300:15-309)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MRQNNNITEFVLLGFSQDPGVQKALFVMFLLTYLVTVVGNLLIVVDIIASPSLGS
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
10 20 30 40 50 60
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pF1KE6 PMYFFLACLSFIDAAYSTTISPKLIVGLFCDKKTISFQGCMGQLFIDHFFGGAEVFLLVV
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
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pF1KE6 MACDRYVAICKPLHYLTIMNRQVCFLLLVVAMIGGFVHSAFQI-VVYSLPFCGPNVIVHF
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NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
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NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
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NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
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300 310
pF1KE6 RNAIEKLLGKKLTIFIIGGVSVLM
:.:...:.:
NP_001 RGAVKRLMGWE
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 742 init1: 436 opt: 788 Z-score: 779.7 bits: 152.4 E(85289): 1.1e-36
Smith-Waterman score: 788; 41.3% identity (73.8% similar) in 305 aa overlap (5-301:7-307)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MRQNNNITEFVLLGFSQDPGVQKALFVMFLLTYLVTVVGNLLIVVDIIASPSLGSPMY
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE6 FFLACLSFIDAAYSTTISPKLIVGLFCDKKTISFQGCMGQLFIDHFFGGAEVFLLVVMAC
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NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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NP_036 FCDVTPLLKLSCSDTH-LNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]