FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6017, 315 aa
1>>>pF1KE6017 315 - 315 aa - 315 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7195+/-0.00119; mu= 13.1892+/- 0.070
mean_var=169.1712+/-58.985, 0's: 0 Z-trim(102.3): 400 B-trim: 389 in 1/47
Lambda= 0.098608
statistics sampled from 6424 (6899) to 6424 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.549), E-opt: 0.2 (0.212), width: 16
Scan time: 1.870
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11 ( 315) 2061 306.3 2e-83
CCDS31499.1 OR4A16 gene_id:81327|Hs108|chr11 ( 328) 1433 217.0 1.6e-56
CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 ( 309) 1353 205.6 4.1e-53
CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 ( 344) 1331 202.5 3.8e-52
CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 ( 309) 1238 189.2 3.5e-48
CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 ( 370) 1215 186.1 3.7e-47
CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11 ( 309) 1182 181.3 8.7e-46
CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11 ( 329) 1182 181.3 9e-46
CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11 ( 309) 1174 180.1 1.9e-45
CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 ( 310) 1161 178.3 6.9e-45
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 1145 176.0 3.3e-44
CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 ( 309) 1137 174.9 7.3e-44
CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 ( 309) 1130 173.9 1.5e-43
CCDS31487.1 OR4X1 gene_id:390113|Hs108|chr11 ( 305) 1119 172.3 4.3e-43
CCDS31504.1 OR4P4 gene_id:81300|Hs108|chr11 ( 312) 1106 170.4 1.6e-42
CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 ( 309) 1027 159.2 3.8e-39
CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 ( 343) 1025 159.0 4.9e-39
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 1019 158.1 8.4e-39
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 1013 157.2 1.5e-38
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 995 154.7 8.9e-38
CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 ( 310) 988 153.7 1.8e-37
CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 ( 314) 985 153.2 2.4e-37
CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 984 153.1 2.7e-37
CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 ( 307) 980 152.5 3.9e-37
CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 ( 316) 972 151.4 8.6e-37
CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 ( 308) 971 151.2 9.4e-37
CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 ( 305) 967 150.7 1.4e-36
CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 ( 307) 964 150.2 1.9e-36
CCDS53636.1 OR4D10 gene_id:390197|Hs108|chr11 ( 311) 961 149.8 2.5e-36
CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 ( 348) 958 149.5 3.6e-36
CCDS32343.1 OR4F4 gene_id:26682|Hs108|chr15 ( 305) 955 149.0 4.5e-36
CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 953 148.7 5.6e-36
CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 ( 304) 951 148.4 6.7e-36
CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 ( 314) 947 147.8 1e-35
CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 946 147.7 1.1e-35
CCDS30547.1 OR4F5 gene_id:79501|Hs108|chr1 ( 305) 937 146.4 2.7e-35
CCDS31563.1 OR4D11 gene_id:219986|Hs108|chr11 ( 311) 934 146.0 3.6e-35
CCDS32029.1 OR4L1 gene_id:122742|Hs108|chr14 ( 312) 934 146.0 3.6e-35
CCDS72675.1 OR4F29 gene_id:729759|Hs108|chr1 ( 312) 931 145.6 4.9e-35
CCDS41221.1 OR4F16 gene_id:81399|Hs108|chr1 ( 312) 931 145.6 4.9e-35
CCDS43415.1 OR4F3 gene_id:26683|Hs108|chr5 ( 312) 931 145.6 4.9e-35
CCDS34792.1 OR4F21 gene_id:441308|Hs108|chr8 ( 312) 928 145.1 6.6e-35
CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 ( 313) 925 144.7 8.9e-35
CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 ( 323) 918 143.7 1.8e-34
CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11 ( 314) 894 140.3 1.9e-33
CCDS32342.1 OR4F15 gene_id:390649|Hs108|chr15 ( 312) 873 137.3 1.5e-32
CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15 ( 312) 870 136.9 2e-32
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 857 135.0 7.3e-32
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 849 133.9 1.6e-31
CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 ( 324) 840 132.6 3.9e-31
>>CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 2061 init1: 2061 opt: 2061 Z-score: 1611.2 bits: 306.3 E(32554): 2e-83
Smith-Waterman score: 2061; 100.0% identity (100.0% similar) in 315 aa overlap (1-315:1-315)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MRQNNNITEFVLLGFSQDPGVQKALFVMFLLTYLVTVVGNLLIVVDIIASPSLGSPMYFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MRQNNNITEFVLLGFSQDPGVQKALFVMFLLTYLVTVVGNLLIVVDIIASPSLGSPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LACLSFIDAAYSTTISPKLIVGLFCDKKTISFQGCMGQLFIDHFFGGAEVFLLVVMACDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LACLSFIDAAYSTTISPKLIVGLFCDKKTISFQGCMGQLFIDHFFGGAEVFLLVVMACDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YVAICKPLHYLTIMNRQVCFLLLVVAMIGGFVHSAFQIVVYSLPFCGPNVIVHFSCDMHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 YVAICKPLHYLTIMNRQVCFLLLVVAMIGGFVHSAFQIVVYSLPFCGPNVIVHFSCDMHP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LLELACTDTYFIGLTVVVNSGAICMVIFNLLLISYGVILSSLKTYSQEKRGKALSTCSSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LLELACTDTYFIGLTVVVNSGAICMVIFNLLLISYGVILSSLKTYSQEKRGKALSTCSSG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 STVVVLFFVPCIFIYVRPVSNFPTDKFMTVFYTIITHMLSPLIYTLRNSEMRNAIEKLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 STVVVLFFVPCIFIYVRPVSNFPTDKFMTVFYTIITHMLSPLIYTLRNSEMRNAIEKLLG
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 KKLTIFIIGGVSVLM
:::::::::::::::
CCDS73 KKLTIFIIGGVSVLM
310
>>CCDS31499.1 OR4A16 gene_id:81327|Hs108|chr11 (328 aa)
initn: 1436 init1: 761 opt: 1433 Z-score: 1128.2 bits: 217.0 E(32554): 1.6e-56
Smith-Waterman score: 1433; 72.5% identity (88.6% similar) in 306 aa overlap (1-305:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MRQNNNITEFVLLGFSQDPGVQKALFVMFLLTYLVTVVGNLLIVVDIIASPSLGSPMYFF
:: ..:.:::::::..::: :.:.::::::: :.::.:::::: : :.:::::: ::::
CCDS31 MRPSSNVTEFVLLGLTQDPDVKKTLFVMFLLIYIVTMVGNLLIWVTTIGSPSLGSLMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LACLSFIDAAYSTTISPKLIVGLFCDKKTISFQGCMGQLFIDHFFGGAEVFLLVVMACDR
:: ::..:: :::..::::.. :.::: .::...:::::::.:..:::::::::::: ::
CCDS31 LAYLSLMDAIYSTAMSPKLMIDLLCDKIAISLSACMGQLFIEHLLGGAEVFLLVVMAYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE6 YVAICKPLHYLTIMNRQVCFLLLVVAMIGGFVHSAFQIV-VYSLPFCGPNVIVHFSCDMH
:::: ::::::.:::: ::.::::::::::::::. ::: .::::.:::::: : :::.
CCDS31 YVAISKPLHYLNIMNRLVCILLLVVAMIGGFVHSVVQIVFLYSLPICGPNVIDHSVCDMY
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 PLLELACTDTYFIGLTVVVNSGAICMVIFNLLLISYGVILSSLKTYSQEKRGKALSTCSS
::::: : ::::::::::.:.: ::::::..:::: ::::. :::::::.: ::: :: :
CCDS31 PLLELLCLDTYFIGLTVVANGGIICMVIFTFLLISCGVILNFLKTYSQEERHKALPTCIS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 GSTVVVLFFVPCIFIYVRPVSNFPTDKFMTVFYTIITHMLSPLIYTLRNSEMRNAIEKLL
::.: ::::::.::::::::: ::.:::::.::: ::.::::.::.:::.::...:
CCDS31 HIIVVALVFVPCIFMYVRPVSNFPFDKLMTVFYSIITLMLNPLIYSLRQSEMKNAMKNLW
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 GKKLTIFIIGGVSVLM
.::.:
CCDS31 CEKLSIVRKRVSPTLNIFIPSSKATNRR
310 320
>>CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 712 init1: 712 opt: 1353 Z-score: 1067.0 bits: 205.6 E(32554): 4.1e-53
Smith-Waterman score: 1353; 66.4% identity (85.9% similar) in 304 aa overlap (1-303:1-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MRQNNNITEFVLLGFSQDPGVQKALFVMFLLTYLVTVVGNLLIVVDIIASPSLGSPMYFF
:. .:.:.::::::.:.: ::.::::::: :..:.:::::::: . .: .::::::::
CCDS31 MEPRKNVTDFVLLGFTQNPKEQKVLFVMFLLFYILTMVGNLLIVVTVTVSETLGSPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LACLSFIDAAYSTTISPKLIVGLFCDKKTISFQGCMGQLFIDHFFGGAEVFLLVVMACDR
:: ::::: ::..:::.:: ::: ...::::.::.::::.:.:::.:::::.::: :
CCDS31 LAGLSFIDIIYSSSISPRLISGLFFGNNSISFQSCMAQLFIEHIFGGSEVFLLLVMAYDC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE6 YVAICKPLHYLTIMNRQVCFLLLVVAMIGGFVHSAFQI-VVYSLPFCGPNVIVHFSCDMH
:::::::::::.:: . :: .::::. .:::.::.::. ..:.::::::::: :: :::.
CCDS31 YVAICKPLHYLVIMRQWVCVVLLVVSWVGGFLHSVFQLSIIYGLPFCGPNVIDHFFCDMY
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 PLLELACTDTYFIGLTVVVNSGAICMVIFNLLLISYGVILSSLKTYSQEKRGKALSTCSS
:::.:.::::. ::: ::.:.: : ..: :::::::::: :::. ::. : ::::::::
CCDS31 PLLKLVCTDTHAIGLLVVANGGLACTIVFLLLLISYGVILHSLKNLSQKGRQKALSTCSS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 GSTVVVLFFVPCIFIYVRPVSNFPTDKFMTVFYTIITHMLSPLIYTLRNSEMRNAIEKLL
::::.:::::::.:.::. .:: :: ..::::.:: ::.::::::::::: .:..::
CCDS31 HMTVVVFFFVPCIFMYARPARTFPIDKSVSVFYTVITPMLNPLIYTLRNSEMTSAMKKLW
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 GKKLTIFIIGGVSVLM
. :
CCDS31 RRDLISSST
>>CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 (344 aa)
initn: 1330 init1: 727 opt: 1331 Z-score: 1049.6 bits: 202.5 E(32554): 3.8e-52
Smith-Waterman score: 1331; 64.4% identity (86.6% similar) in 306 aa overlap (1-305:31-336)
10 20 30
pF1KE6 MRQNNNITEFVLLGFSQDPGVQKALFVMFL
:...::.:::.:::..:.: ::.::: ::
CCDS31 MELLTNNLKFITDPFVCRLRHLSPTPSEEHMKNKNNVTEFILLGLTQNPEGQKVLFVTFL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 LTYLVTVVGNLLIVVDIIASPSLGSPMYFFLACLSFIDAAYSTTISPKLIVGLFCDKKTI
: :.::..:::::.: :.:: ::::::::::: :::::..:::...::.:: :. .::::
CCDS31 LIYMVTIMGNLLIIVTIMASQSLGSPMYFFLASLSFIDTVYSTAFAPKMIVDLLSEKKTI
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 SFQGCMGQLFIDHFFGGAEVFLLVVMACDRYVAICKPLHYLTIMNRQVCFLLLVVAMIGG
::::::.:::.::.:.::::.:::::: :::.::::::: : :::.:: :.:..: :::
CCDS31 SFQGCMAQLFMDHLFAGAEVILLVVMAYDRYMAICKPLHELITMNRRVCVLMLLAAWIGG
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200
pF1KE6 FVHSAFQIV-VYSLPFCGPNVIVHFSCDMHPLLELACTDTYFIGLTVVVNSGAICMVIFN
:.:: :.. .:.::::::::: .: ::..:::.::::.:: ::....:.:::: : :
CCDS31 FLHSLVQFLFIYQLPFCGPNVIDNFLCDLYPLLKLACTNTYVTGLSMIANGGAICAVTFF
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KE6 LLLISYGVILSSLKTYSQEKRGKALSTCSSGSTVVVLFFVPCIFIYVRPVSNFPTDKFMT
.:.:::::: :::: : : . ::. ::.: :::.::::::::.:.:: :.:: :: ::
CCDS31 TILLSYGVILHSLKTQSLEGKRKAFYTCASHVTVVILFFVPCIFLYARPNSTFPIDKSMT
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310
pF1KE6 VFYTIITHMLSPLIYTLRNSEMRNAIEKLLGKKLTIFIIGGVSVLM
: :.:: ::.::::::.:.::..:..:: .::...
CCDS31 VVLTFITPMLNPLIYTLKNAEMKSAMRKLWSKKVSLAGKWLYHS
310 320 330 340
>>CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1240 init1: 632 opt: 1238 Z-score: 978.6 bits: 189.2 E(32554): 3.5e-48
Smith-Waterman score: 1238; 60.7% identity (85.5% similar) in 303 aa overlap (1-302:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MRQNNNITEFVLLGFSQDPGVQKALFVMFLLTYLVTVVGNLLIVVDIIASPSLGSPMYFF
:.. ::.:::::::....: .:: .::.:.. :..:::: .:::: : ::::::::::.
CCDS73 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LACLSFIDAAYSTTISPKLIVGLFCDKKTISFQGCMGQLFIDHFFGGAEVFLLVVMACDR
:: :::::: ::.. .:.::. . ::.: :.::: :.: .::::::: .::.::: :.
CCDS73 LAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE6 YVAICKPLHYLTIMNRQVCFLLLVVAMIGGFVHSAFQIV-VYSLPFCGPNVIVHFSCDMH
::::::::::.::::. :: ::. :. .:::.:...::. ...::::::::: :: ::..
CCDS73 YVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 PLLELACTDTYFIGLTVVVNSGAICMVIFNLLLISYGVILSSLKTYSQEKRGKALSTCSS
:::.::::::... : ...::: ::.. : :::.:: ::: ::.:.: : : :::::: :
CCDS73 PLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTCVS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 GSTVVVLFFVPCIFIYVRPVSNFPTDKFMTVFYTIITHMLSPLIYTLRNSEMRNAIEKLL
:::.::::::::.:.::....: :: ...:::.:: ::.::::::.:..:.:::.::
CCDS73 HITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRKLC
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 GKKLTIFIIGGVSVLM
..:
CCDS73 SRKDISGDK
>>CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 (370 aa)
initn: 1027 init1: 601 opt: 1215 Z-score: 960.1 bits: 186.1 E(32554): 3.7e-47
Smith-Waterman score: 1215; 58.0% identity (86.3% similar) in 307 aa overlap (1-305:55-361)
10 20 30
pF1KE6 MRQNNNITEFVLLGFSQDPGVQKALFVMFL
:.... .:::::::.::.:.::. .::.::
CCDS31 PQIDLKQIFLCPNCRLYMIPVGAFIFSLGNMQNQSFVTEFVLLGLSQNPNVQEIVFVVFL
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80
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CCDS31 FVYIATVGGNMLIVVTILSSPALLVSPMYFFLGFLSFLDACFSSVITPKMIVDSLYVTKT
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90 100 110 120 130 140
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CCDS31 ISFEGCMMQLFAEHFFAGVEVIVLTAMAYDRYVAICKPLHYSSIMNRRLCGILMGVAWTG
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150 160 170 180 190 200
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CCDS31 GLLHSMIQILFTFQLPFCGPNVINHFMCDLYPLLELACTDTHIFGLMVVINSGFICIINF
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210 220 230 240 250 260
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270 280 290 300 310
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CCDS31 AIFYIILNPLLNPLIYTFRNKEVKQAMRRIWNRLMVVSDEKENIKL
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CCDS31 LTHLSLIDTVYSSSSAPKLIVDSFQEKKIISFNGCMAQAYAEHIFGATEIILLTVMACDC
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CCDS31 YVAICKPLNYTTIMSHSLCILLVAVAWVGGFLHATIQILFTVWLPFCGPNVIGHFMCDLY
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CCDS31 HIIVVVLFFVPCIFVYLRSVTTLPIDKAVAVFYTMVVPMLNPVVYTLRNAEVKSAIRKLW
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CCDS31 RKKVTSDND
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CCDS31 TVCGNMLIVVTITSSPTLASPVYFFLANLSFIDTFYSSSMAPKLIADSLYEGRTISYECC
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CCDS31 MAQLFGAHFLGGVEIILLTVMAYDRYVAICKPLHNTTIMTRHLCAMLVGVAWLGGFLHSL
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CCDS31 VQLLLVLWLPFCGPNVINHFACDLYPLLEVACTNTYVIGLLVVANSGLICLLNFLMLAAS
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CCDS31 YIVILYSLRSHSADGRCKALSTCGAHFIVVALFFVPCIFTYVHPFSTLPIDKNMALFYGI
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CCDS31 LTPMLNPLIYTLRNEEVKNAMRKLFTW
310 320
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CCDS31 MANRNNVTEFILLGLTENPKMQKIIFVVFSVIYINAMIGNVLIVVTITASPSLRSPMYFF
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CCDS31 LAYLSFIDACYSSVNTPKLITDSLYENKTILFNGCMTQVFGEHFFRGVEVILLTVMAYDH
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CCDS31 TLINLACTNTHTLGLFIAANSGFICLLNCLLLLVSCVVILYSLKTHSLEARHEALSTCVS
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CCDS31 HITVVILSFIPCIFVYMRPPATLPIDKAVAVFYTMITSMLNPLIYTLRNAQMKNAIRKLC
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CCDS31 SRKAISSVK
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CCDS31 HGKIISENKG
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]