Result of FASTA (omim) for
pFN21AE6014
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6014, 314 aa
1>>>pF1KE6014 314 - 314 aa - 314 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1997+/-0.000545; mu= 16.1710+/- 0.034
mean_var=85.6474+/-22.575, 0's: 0 Z-trim(106.9): 364 B-trim: 1821 in 2/47
Lambda= 0.138585
statistics sampled from 14494 (14995) to 14494 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.509), E-opt: 0.2 (0.176), width: 16
Scan time: 3.890
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 830 176.7 5.7e-44
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 785 167.7 2.8e-41
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 770 164.7 2.2e-40
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 770 164.7 2.3e-40
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 750 160.7 3.6e-39
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 746 159.9 6.3e-39
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 736 157.9 2.5e-38
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 736 157.9 2.5e-38
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 736 157.9 2.6e-38
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 733 157.3 3.7e-38
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 733 157.3 3.8e-38
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 730 156.7 5.8e-38
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 730 156.7 5.8e-38
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 730 156.7 5.8e-38
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 720 154.7 2.3e-37
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 712 153.1 6.9e-37
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 711 152.9 8e-37
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 707 152.1 1.4e-36
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 687 148.1 2.2e-35
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 661 142.9 8.1e-34
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 505 111.7 2e-24
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 491 108.9 1.4e-23
NP_001307687 (OMIM: 601122) 5-hydroxytryptamine re ( 439) 239 58.6 2.6e-08
XP_006712545 (OMIM: 601122) PREDICTED: 5-hydroxytr ( 456) 239 58.7 2.7e-08
NP_000858 (OMIM: 601122) 5-hydroxytryptamine recep ( 481) 239 58.7 2.8e-08
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 225 55.7 1.5e-07
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 219 54.5 3.4e-07
NP_000016 (OMIM: 109691,601665) beta-3 adrenergic ( 408) 219 54.6 4e-07
NP_000673 (OMIM: 104260,607876) alpha-2B adrenergi ( 450) 218 54.5 4.9e-07
NP_004239 (OMIM: 600895) prolactin-releasing pepti ( 370) 216 54.0 5.6e-07
XP_016874705 (OMIM: 602927) PREDICTED: probable G- ( 415) 211 53.0 1.2e-06
XP_011518927 (OMIM: 602927) PREDICTED: probable G- ( 415) 211 53.0 1.2e-06
XP_016874702 (OMIM: 602927) PREDICTED: probable G- ( 434) 211 53.0 1.3e-06
XP_016874703 (OMIM: 602927) PREDICTED: probable G- ( 434) 211 53.0 1.3e-06
XP_011518926 (OMIM: 602927) PREDICTED: probable G- ( 434) 211 53.0 1.3e-06
XP_016874701 (OMIM: 602927) PREDICTED: probable G- ( 434) 211 53.0 1.3e-06
XP_016874704 (OMIM: 602927) PREDICTED: probable G- ( 434) 211 53.0 1.3e-06
XP_011518925 (OMIM: 602927) PREDICTED: probable G- ( 434) 211 53.0 1.3e-06
NP_006134 (OMIM: 602927) probable G-protein couple ( 415) 210 52.8 1.4e-06
NP_004215 (OMIM: 300207) melatonin-related recepto ( 617) 210 53.0 1.9e-06
NP_001041695 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 ( 326) 204 51.5 2.7e-06
NP_000665 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 [Ho ( 326) 204 51.5 2.7e-06
NP_795344 (OMIM: 118445) gastrin/cholecystokinin t ( 447) 205 51.8 3e-06
NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471) 205 51.9 3.1e-06
XP_005253267 (OMIM: 118445) PREDICTED: gastrin/cho ( 516) 205 51.9 3.3e-06
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 202 51.1 3.5e-06
XP_011532064 (OMIM: 167055) PREDICTED: oxytocin re ( 389) 202 51.2 4e-06
NP_000907 (OMIM: 167055) oxytocin receptor [Homo s ( 389) 202 51.2 4e-06
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 202 51.2 4.3e-06
NP_000859 (OMIM: 312861) 5-hydroxytryptamine recep ( 458) 202 51.3 4.6e-06
>>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo (327 aa)
initn: 829 init1: 627 opt: 830 Z-score: 910.4 bits: 176.7 E(85289): 5.7e-44
Smith-Waterman score: 830; 41.3% identity (74.0% similar) in 312 aa overlap (4-311:5-310)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MLMNYSS-ATEFYLLGFPGSEELHHILFAIFFFFYLVTLMGNTVIIMIVCVDKRLQSPM
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NP_003 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLHKPM
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pF1KE6 YFFLGHLSALEILVTTIIVPVMLWGLLLPGM---QTIYLSACVVQLFLYLAVGTTEFALL
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NP_003 YFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVLL
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pF1KE6 GAMAVDRYVAVCNPLRYNIIMNRHTCNFVVLVSWVFGFLFQIWPVYVMFQLTYCKSNVVN
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pF1KE6 NFFCDRGQLLKLSCNNTLFTEFILFLMAVFVLFGSLIPTIVSNAYIISTILKIPSSSGRR
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NP_003 HFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAGRY
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pF1KE6 KSFSTCASHFTCVVIGYGSCLFLYVKPKQTQAADYNWVVSLMVSVVTPFLNPFIFTLRND
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NP_003 KAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLRNQ
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300 310
pF1KE6 KVIEALRDGVKRCCQLFRN
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NP_003 EVKRAL------CCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
310 320
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 760 init1: 529 opt: 785 Z-score: 862.0 bits: 167.7 E(85289): 2.8e-41
Smith-Waterman score: 785; 40.1% identity (71.4% similar) in 297 aa overlap (4-300:7-302)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MLMNYSSATEFYLLGFPGSEELHHILFAIFFFFYLVTLMGNTVIIMIVCVDKRLQSP
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pF1KE6 MAVDRYVAVCNPLRYNIIMNRHTCNFVVLVSWVFGFLFQIWPVYVMFQLTYCKSNVVNNF
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pF1KE6 FCDRGQLLKLSCNNTLFTEFILFLMAVFVLFGSLIPTIVSNAYIISTILKIPSSSGRRKS
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pF1KE6 FSTCASHFTCVVIGYGSCLFLYVKPKQTQAADYNWVVSLMVSVVTPFLNPFIFTLRNDKV
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NP_006 FSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDV
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300 310
pF1KE6 IEALRDGVKRCCQLFRN
.:
NP_006 KDAAEKVLRSKVDSS
300 310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
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Smith-Waterman score: 770; 38.1% identity (72.3% similar) in 307 aa overlap (4-309:6-311)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MLMNYSSATEFYLLGFPGSEELHHILFAIFFFFYLVTLMGNTVIIMIVCVDKRLQSPM
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pF1KE6 AVDRYVAVCNPLRYNIIMNRHTCNFVVLVSWVFGFLFQIWPVYVMFQLTYCKSNVVNNFF
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pF1KE6 CDRGQLLKLSCNNTLFTEFILFLMAVFVLFGSLIPTIVSNAYIISTILKIPSSSGRRKSF
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pF1KE6 STCASHFTCVVIGYGSCLFLYVKPKQTQAADYNWVVSLMVSVVTPFLNPFIFTLRNDKVI
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NP_001 NTCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIK
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pF1KE6 EALRDGVKR-CCQLFRN
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NP_001 DALKRLQKRKCC
300 310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 773 init1: 549 opt: 770 Z-score: 845.8 bits: 164.7 E(85289): 2.3e-40
Smith-Waterman score: 770; 38.1% identity (75.2% similar) in 307 aa overlap (4-307:5-307)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MLMNYSSATEFYLLGFPGSEELHHILFAIFFFFYLVTLMGNTVIIMIVCVDKRLQSPMY
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NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
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NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEK-KTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMA
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pF1KE6 VDRYVAVCNPLRYNIIMNRHTCNFVVLVSWVF--GFL-FQIWPVYVMFQLTYCKSNVVNN
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pF1KE6 FFCDRGQLLKLSCNNTLFTEFILFLMAVFVLFGSLIPTIVSNAYIISTILKIPSSSGRRK
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NP_003 AFSTCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKE
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pF1KE6 VIEALRDGVKRCCQLFRN
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NP_003 VKKALANVISRKRTSSFL
300 310
>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
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Smith-Waterman score: 750; 41.2% identity (71.1% similar) in 301 aa overlap (2-302:1-300)
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pF1KE6 MLMNYSSATEFYLLGFPGSEELHHILFAIFFFFYLVTLMGNTVIIMIVCVDKRLQSPMYF
..: ::. : :::: :.. ::.. . ::.::.:::.::.. .: .:.:::::
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pF1KE6 DRYVAVCNPLRYNIIMNRHTCNFVVLVSWVFGFLFQIWPVYVMFQLTYCKSNVVNNFFCD
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NP_009 DRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCE
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pF1KE6 RGQLLKLSCNNTLFTEFILFLMAVFVLFGSLIPTIVSNAYIISTILKIPSSSGRRKSFST
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NP_009 VPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGT
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NP_009 CSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEVTRA
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pF1KE6 LRDGVKRCCQLFRN
.:
NP_009 FRRLLGKEMGLTQS
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>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
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Smith-Waterman score: 746; 40.1% identity (72.6% similar) in 299 aa overlap (4-301:5-301)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MLMNYSSATEFYLLGFPGSEELHHILFAIFFFFYLVTLMGNTVIIMIVCVDKRLQSPMY
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NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY
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pF1KE6 FFLGHLSALEILVTTIIVPVMLWGLLLPGM-QTIYLSACVVQLFLYLAVGTTEFALLGAM
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NP_001 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNL--NGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVM
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pF1KE6 AVDRYVAVCNPLRYNIIMNRHTCNFVVLVSWVFGFLFQIWPVYVMFQLTYCKSNVVNNFF
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NP_001 AYDRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFL
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pF1KE6 CDRGQLLKLSCNNTLFTEFILFLMAVFVLFGSLIPTIVSNAYIISTILKIPSSSGRRKSF
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NP_001 REMPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKAF
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NP_001 GTCGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREVK
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pF1KE6 EALRDGVKRCCQLFRN
::
NP_001 GALGRLLLGKRELGKE
300 310
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XP_011 STCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLK
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::. : :
XP_011 GALKKVVGRVVFSV
300 310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 756 init1: 512 opt: 736 Z-score: 809.1 bits: 157.9 E(85289): 2.5e-38
Smith-Waterman score: 736; 38.4% identity (73.4% similar) in 305 aa overlap (4-307:5-307)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MLMNYSSATEFYLLGFPGSEELHHILFAIFFFFYLVTLMGNTVIIMIVCVDKRLQSPMY
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KE6 FFLGHLSALEILVTTIIVPVMLWGLLLPGMQTIYLSACVVQL-FLYLAVGTTEFALLGAM
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NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILE-TQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNF-LLAVM
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pF1KE6 AVDRYVAVCNPLRYNIIMNRHTCNFVVLVSWVFGFLFQIWPVYVMFQLTYCKSNVVNNFF
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NP_036 AYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFF
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pF1KE6 CDRGQLLKLSCNNTLFTEFILFLMAVFVLFGSLIPTIVSNAYIISTILKIPSSSGRRKSF
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pF1KE6 STCASHFTCVVIGYGSCLFLYVKPKQTQAADYNWVVSLMVSVVTPFLNPFIFTLRNDKVI
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NP_036 STCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLK
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pF1KE6 EALRDGVKRCCQLFRN
::. : :
NP_036 GALKKVVGRVVFSV
300 310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
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pF1KE6 MLMNYSSATEFYLLGFPGSEELHHILFAIFFFFYLVTLMGNTVIIMIVC
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XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILE-TQTISFCGCLTQMYFVFMFVD
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pF1KE6 TTEFALLGAMAVDRYVAVCNPLRYNIIMNRHTCNFVVLVSWVFGFLFQIWPVYVMFQLTY
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XP_011 PSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPF
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>>XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory recep (300 aa)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]