Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6009
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6009, 314 aa
1>>>pF1KE6009 314 - 314 aa - 314 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9533+/-0.00152; mu= 12.2915+/- 0.088
mean_var=212.5447+/-75.939, 0's: 0 Z-trim(100.0): 426 B-trim: 356 in 1/49
Lambda= 0.087973
statistics sampled from 5445 (5951) to 5445 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.504), E-opt: 0.2 (0.183), width: 16
Scan time: 1.770
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31817.1 OR6C6 gene_id:283365|Hs108|chr12 ( 314) 2037 272.5 3e-73
CCDS31825.1 OR6C70 gene_id:390327|Hs108|chr12 ( 312) 1507 205.2 5.3e-53
CCDS31816.1 OR6C74 gene_id:254783|Hs108|chr12 ( 312) 1488 202.8 2.8e-52
CCDS31820.1 OR6C75 gene_id:390323|Hs108|chr12 ( 312) 1467 200.2 1.8e-51
CCDS31823.1 OR6C76 gene_id:390326|Hs108|chr12 ( 312) 1465 199.9 2.1e-51
CCDS31819.1 OR6C3 gene_id:254786|Hs108|chr12 ( 311) 1414 193.4 1.9e-49
CCDS31821.1 OR6C65 gene_id:403282|Hs108|chr12 ( 312) 1398 191.4 7.7e-49
CCDS31824.1 OR6C2 gene_id:341416|Hs108|chr12 ( 312) 1386 189.9 2.2e-48
CCDS31827.1 OR6C4 gene_id:341418|Hs108|chr12 ( 309) 1360 186.6 2.2e-47
CCDS58241.1 OR2AP1 gene_id:121129|Hs108|chr12 ( 309) 1344 184.5 8.9e-47
CCDS31818.1 OR6C1 gene_id:390321|Hs108|chr12 ( 312) 1336 183.5 1.8e-46
CCDS31826.2 OR6C68 gene_id:403284|Hs108|chr12 ( 312) 1297 178.6 5.6e-45
CCDS31700.1 OR6T1 gene_id:219874|Hs108|chr11 ( 323) 953 134.9 7.9e-32
CCDS31696.1 OR6M1 gene_id:390261|Hs108|chr11 ( 313) 934 132.5 4.1e-31
CCDS31695.1 OR6X1 gene_id:390260|Hs108|chr11 ( 312) 925 131.4 9.1e-31
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 923 131.2 1.2e-30
CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1 ( 308) 922 131.0 1.2e-30
CCDS32038.1 OR6S1 gene_id:341799|Hs108|chr14 ( 331) 914 130.0 2.5e-30
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 906 129.0 5e-30
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 905 128.8 5.3e-30
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 904 128.7 5.8e-30
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 903 128.6 6.3e-30
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 893 127.3 1.5e-29
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 891 127.1 1.8e-29
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 889 126.8 2.2e-29
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 889 126.8 2.2e-29
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 887 126.6 2.6e-29
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 886 126.5 3e-29
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 885 126.3 3.1e-29
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 883 126.1 3.8e-29
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 882 125.9 4e-29
CCDS43667.1 OR6B1 gene_id:135946|Hs108|chr7 ( 311) 881 125.8 4.4e-29
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 876 125.1 6.8e-29
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 873 124.8 8.8e-29
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 872 124.6 9.6e-29
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 871 124.5 1.1e-28
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 870 124.4 1.2e-28
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 870 124.4 1.2e-28
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 866 123.9 1.6e-28
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 866 123.9 1.6e-28
CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 ( 303) 864 123.6 1.9e-28
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 864 123.6 1.9e-28
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 864 123.7 2e-28
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 862 123.4 2.4e-28
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 862 123.4 2.4e-28
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 862 123.5 2.5e-28
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 861 123.2 2.5e-28
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 860 123.1 2.8e-28
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 860 123.1 2.8e-28
CCDS47728.1 OR6V1 gene_id:346517|Hs108|chr7 ( 313) 859 123.0 3e-28
>>CCDS31817.1 OR6C6 gene_id:283365|Hs108|chr12 (314 aa)
initn: 2037 init1: 2037 opt: 2037 Z-score: 1428.6 bits: 272.5 E(32554): 3e-73
Smith-Waterman score: 2037; 100.0% identity (100.0% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKNKSMEIEFILLGLTDDPQLQIVIFLFLFLNYTLSLMGNLIIIILTLLDPRLKTPMYFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MKNKSMEIEFILLGLTDDPQLQIVIFLFLFLNYTLSLMGNLIIIILTLLDPRLKTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LRNFSFLEVIFTTVCIPRFLITIVTRDKTISYNNCATQLFFILLPGVTEFYLLAAMSYDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LRNFSFLEVIFTTVCIPRFLITIVTRDKTISYNNCATQLFFILLPGVTEFYLLAAMSYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YVAICKPLHYPIIMSSKVCYQLVLSSWVTGFLIIFPPLVMGLKLDFCASKTIDHFMCETS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YVAICKPLHYPIIMSSKVCYQLVLSSWVTGFLIIFPPLVMGLKLDFCASKTIDHFMCETS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 PILQISCTDTHVLELMSFTLAVVTLVVTLVLVILSYTCIIKTILKFSSAQQRNKAFSTCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PILQISCTDTHVLELMSFTLAVVTLVVTLVLVILSYTCIIKTILKFSSAQQRNKAFSTCT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 SHMIVVSMTYGSCIFMYIKPSAKERVTVSKGVALLYTSIAPLLNPFIYTLRNQQVKEVFW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SHMIVVSMTYGSCIFMYIKPSAKERVTVSKGVALLYTSIAPLLNPFIYTLRNQQVKEVFW
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 DVLQKNLCFSKRPF
::::::::::::::
CCDS31 DVLQKNLCFSKRPF
310
>>CCDS31825.1 OR6C70 gene_id:390327|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 1522 init1: 1498 opt: 1507 Z-score: 1065.1 bits: 205.2 E(32554): 5.3e-53
Smith-Waterman score: 1507; 73.4% identity (90.7% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKNKSMEIEFILLGLTDDPQLQIVIFLFLFLNYTLSLMGNLIIIILTLLDPRLKTPMYFF
:::.. .::::::::::. ::::::::::.:: .::..::. :: : ::: .::::::::
CCDS31 MKNHTRQIEFILLGLTDNSQLQIVIFLFLLLNCVLSMIGNFTIIALILLDSQLKTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LRNFSFLEVIFTTVCIPRFLITIVTRDKTISYNNCATQLFFILLPGVTEFYLLAAMSYDR
::::::::. :::.::::::::::::.:::: :.: .:::: .. :::::.::::.::::
CCDS31 LRNFSFLEISFTTACIPRFLITIVTREKTISCNGCISQLFFYIFLGVTEFFLLAALSYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YVAICKPLHYPIIMSSKVCYQLVLSSWVTGFLIIFPPLVMGLKLDFCASKTIDHFMCETS
::::::::.: :::.:::::::.::::::::::: ::..::.::::::. ::::.:. :
CCDS31 YVAICKPLRYMSIMSNKVCYQLVFSSWVTGFLIIFTPLILGLNLDFCASNIIDHFICDIS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 PILQISCTDTHVLELMSFTLAVVTLVVTLVLVILSYTCIIKTILKFSSAQQRNKAFSTCT
:::.::.:::.:::..: :::.::.::: ::::::. :::::::: ::::..::::::.
CCDS31 LILQLSCSDTHLLELIAFLLAVMTLIVTLFLVILSYSYIIKTILKFPSAQQKKKAFSTCS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 SHMIVVSMTYGSCIFMYIKPSAKERVTVSKGVALLYTSIAPLLNPFIYTLRNQQVKEVFW
:::::::.:::::.:.::::::.:::..::::..: ::.:::::::::::::::::..:
CCDS31 SHMIVVSITYGSCMFIYIKPSANERVALSKGVTVLNTSVAPLLNPFIYTLRNQQVKQAFK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 DVLQKNLCFSKRPF
:..: . : .
CCDS31 AVFRKIFSASDK
310
>>CCDS31816.1 OR6C74 gene_id:254783|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 1506 init1: 1474 opt: 1488 Z-score: 1052.0 bits: 202.8 E(32554): 2.8e-52
Smith-Waterman score: 1488; 70.2% identity (90.4% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKNKSMEIEFILLGLTDDPQLQIVIFLFLFLNYTLSLMGNLIIIILTLLDPRLKTPMYFF
:.:.. .:::::::::::::..:::.::..: ::. ::: :: ::::: .::::::::
CCDS31 MRNHTTVANFILLGLTDDPQLQVIIFLLLFFTYMLSITGNLTIITLTLLDLHLKTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LRNFSFLEVIFTTVCIPRFLITIVTRDKTISYNNCATQLFFILLPGVTEFYLLAAMSYDR
::::::::: :::: ::.::....: :::::::.::.:::: .: :.:::.:::::::.:
CCDS31 LRNFSFLEVSFTTVYIPKFLVSMATGDKTISYNDCAAQLFFTILLGATEFFLLAAMSYER
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YVAICKPLHYPIIMSSKVCYQLVLSSWVTGFLIIFPPLVMGLKLDFCASKTIDHFMCETS
:::::::::: ::::.:: ::..::..:::::::::.:::.:::::..:.:::.:..:
CCDS31 YVAICKPLHYTTIMSSRVCSLLVFASWMAGFLIIFPPLLMGLQLDFCAANTVDHFFCDVS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 PILQISCTDTHVLELMSFTLAVVTLVVTLVLVILSYTCIIKTILKFSSAQQRNKAFSTCT
::::.::::: ..::: . :..::.::::::::::: ::.::::. :.:::.::::::.
CCDS31 PILQLSCTDTDIIELMMLLSAILTLLVTLVLVILSYTNIIRTILKIPSSQQRKKAFSTCS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 SHMIVVSMTYGSCIFMYIKPSAKERVTVSKGVALLYTSIAPLLNPFIYTLRNQQVKEVFW
:::.:::..::::::::.::::::::...::.::: ::.::.::::::::::.:::.::
CCDS31 SHMVVVSISYGSCIFMYVKPSAKERVSLNKGIALLSTSVAPMLNPFIYTLRNKQVKDVFK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 DVLQKNLCFSKRPF
...: :: .
CCDS31 HTVKKIELFSMK
310
>>CCDS31820.1 OR6C75 gene_id:390323|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 1451 init1: 1451 opt: 1467 Z-score: 1037.6 bits: 200.2 E(32554): 1.8e-51
Smith-Waterman score: 1467; 70.3% identity (91.6% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKNKSMEIEFILLGLTDDPQLQIVIFLFLFLNYTLSLMGNLIIIILTLLDPRLKTPMYFF
:.:.. .:::::::.::: :.:.:.::...: ::. :::::: ::: ::.:.::::::
CCDS31 MRNSTAVTDFILLGLTSDPQWQVVLFIFLLVTYMLSVTGNLIIITLTLSDPHLQTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LRNFSFLEVIFTTVCIPRFLITIVTRDKTISYNNCATQLFFILLPGVTEFYLLAAMSYDR
::::::::. ::.:::::::.:.:: ..:::::.:..::::... :::::::::::::::
CCDS31 LRNFSFLEISFTSVCIPRFLVTVVTGNRTISYNGCVAQLFFFIFLGVTEFYLLAAMSYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YVAICKPLHYPIIMSSKVCYQLVLSSWVTGFLIIFPPLVMGLKLDFCASKTIDHFMCETS
.:::::::: ::::..:: ::.:::..::::::::... :.::::::..::::.:..:
CCDS31 CMAICKPLHYTIIMSTRVCTLLVFSSWLAGFLIIFPPVMLLLQLDFCASNVIDHFICDSS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 PILQISCTDTHVLELMSFTLAVVTLVVTLVLVILSYTCIIKTILKFSSAQQRNKAFSTCT
:.::.:::.:: ::::.: ::::::.:::.::::::: ::.::::. : .::.::::::.
CCDS31 PMLQLSCTNTHFLELMAFFLAVVTLMVTLTLVILSYTNIIRTILKIPSMSQRKKAFSTCS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 SHMIVVSMTYGSCIFMYIKPSAKERVTVSKGVALLYTSIAPLLNPFIYTLRNQQVKEVFW
:::::::..:.:::::::: ::.::::.:::::.: ::.:::::::::::::.:::..:
CCDS31 SHMIVVSISYSSCIFMYIKTSARERVTLSKGVAVLNTSVAPLLNPFIYTLRNKQVKQAFK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 DVLQKNLCFSKRPF
...:: . ::
CCDS31 SMVQK-MIFSLNK
310
>>CCDS31823.1 OR6C76 gene_id:390326|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 1464 init1: 1171 opt: 1465 Z-score: 1036.2 bits: 199.9 E(32554): 2.1e-51
Smith-Waterman score: 1465; 71.1% identity (90.2% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKNKSMEIEFILLGLTDDPQLQIVIFLFLFLNYTLSLMGNLIIIILTLLDPRLKTPMYFF
:::.. .::::::::.::::.::: ::::.:.::. ::: :: ::::: .::::::::
CCDS31 MKNRTSVTDFILLGLTDNPQLQVVIFSFLFLTYVLSVTGNLTIISLTLLDSHLKTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LRNFSFLEVIFTTVCIPRFLITIVTRDKTISYNNCATQLFFILLPGVTEFYLLAAMSYDR
::::: ::. ::.:: :::::.:.: ::.:::: ::.::::... : :::.:::.::::
CCDS31 LRNFS-LEISFTSVCNPRFLISILTGDKSISYNACAAQLFFFIFLGSTEFFLLASMSYDC
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YVAICKPLHYPIIMSSKVCYQLVLSSWVTGFLIIFPPLVMGLKLDFCASKTIDHFMCETS
:::::::::: :::...::::..:::..:::.:::::.:::.:::: :..:::: :...
CCDS31 YVAICKPLHYTTIMSDRICYQLIISSWLAGFLVIFPPLAMGLQLDFCDSNVIDHFTCDSA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 PILQISCTDTHVLELMSFTLAVVTLVVTLVLVILSYTCIIKTILKFSSAQQRNKAFSTCT
:.:::::::: .:::::: ::. ::. ::.::::::: ::.:::.. :::::.::::::.
CCDS31 PLLQISCTDTSTLELMSFILALFTLISTLILVILSYTYIIRTILRIPSAQQRKKAFSTCS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 SHMIVVSMTYGSCIFMYIKPSAKERVTVSKGVALLYTSIAPLLNPFIYTLRNQQVKEVFW
::.::::..::::::::.: :::: :...::::.: ::.::.::::::::::::::..:
CCDS31 SHVIVVSISYGSCIFMYVKTSAKEGVALTKGVAILNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQAFK
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 DVLQKNLCFSKRPF
:::.:
CCDS31 DVLRKISHKKKKH
300 310
>>CCDS31819.1 OR6C3 gene_id:254786|Hs108|chr12 (311 aa)
initn: 1446 init1: 1402 opt: 1414 Z-score: 1001.3 bits: 193.4 E(32554): 1.9e-49
Smith-Waterman score: 1414; 65.8% identity (89.7% similar) in 310 aa overlap (3-312:2-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MKNKSMEIEFILLGLTDDPQLQIVIFLFLFLNYTLSLMGNLIIIILTLLDPRLKTPMYFF
:..: ::.::::.:::.::::::::::..: ::. ::: :: ::..: .:.::::::
CCDS31 MNHTMVTEFVLLGLSDDPDLQIVIFLFLFITYILSVTGNLTIITLTFVDSHLQTPMYFF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
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CCDS31 LRNFSFLEISFTTVCIPRFLGAIITRNKTISYNNCAAQLFFFIFMGVTEFYILTAMSYDR
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CCDS31 YVAICKPLHYTSIMNRKLCTLLVLCAWLSGFLTIFPPLMLLLQLDYCASNVIDHFACDYF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
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CCDS31 PLLQLSCSDTWLLEVIGFYFALVTLLFTLALVILSYMYIIRTILRIPSASQRKKAFSTCS
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CCDS31 SHMIVISISYGSCIFMYANPSAKEKASLTKGIAILNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQAFK
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310
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.:..: . ....
CCDS31 NVVHKVVFYANQ
300 310
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CCDS31 MPNMTSIREFILLGFTDNPELQVVIFFFMLITYLLSVSGNMIIIMLTLSNIHLKTPMYFF
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CCDS31 SHMIVVSVSYGSCIFMCVKTSAKEGMALSKGVAVLNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQALR
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310
pF1KE6 DVLQKNLCFSKRPF
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CCDS31 EFTKKILSLNKQ
310
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CCDS31 MKNHTVIRTFILLGLTGDPHLQVLLFIFLFLTYMLSVTGNLTIITLTLVDHHLKTPMYFF
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CCDS31 LRNFSFLEVSFTTVCIPRFLYNISMGDNTITYNACASQIFFVILFGATEFFLLAAMSYDR
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310
pF1KE6 DVLQKNLCFSKRPF
: ... .::.
CCDS31 DSIKRIAFLSKK
310
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CCDS31 YVAICKPLHYLTIMSSRVCIQLVFCSWLGGFLAILPPIILMTQVDFCVSNILNHYYCDYG
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CCDS31 PLVELACSDTSLLELMVILLAVVTLMVTLVLVTLSYTYIIRTILRIPSAQQRTKAFSTCS
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CCDS58 LRNFSFLEISFTNIFIPRVLISITTGNKSISFAGCFTQYFFAMFLGATEFYLLAAMSYDR
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CCDS58 YVAICKPLHYTTIMSSRICIQLIFCSWLGGLMAIIPTITLMSQQDFCASNRLNHYFCDYE
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CCDS58 PLLELSCSDTSLIEKVVFLVASVTLVVTLVLVILSYAFIIKTILKLPSAQQRTKAFSTCS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]