FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6004, 314 aa
1>>>pF1KE6004 314 - 314 aa - 314 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7396+/-0.00118; mu= 13.4960+/- 0.068
mean_var=190.1538+/-67.459, 0's: 0 Z-trim(103.1): 380 B-trim: 395 in 1/47
Lambda= 0.093008
statistics sampled from 6778 (7243) to 6778 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.562), E-opt: 0.2 (0.222), width: 16
Scan time: 2.020
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32895.1 OR2Z1 gene_id:284383|Hs108|chr19 ( 314) 2056 289.2 2.7e-78
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CCDS31123.1 OR2T35 gene_id:403244|Hs108|chr1 ( 323) 1079 158.2 8.1e-39
CCDS31109.1 OR2T33 gene_id:391195|Hs108|chr1 ( 320) 1076 157.7 1.1e-38
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CCDS31124.1 OR2T27 gene_id:403239|Hs108|chr1 ( 317) 1070 156.9 1.9e-38
CCDS31116.1 OR2T2 gene_id:401992|Hs108|chr1 ( 324) 1068 156.7 2.3e-38
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CCDS31414.1 OR2AG1 gene_id:144125|Hs108|chr11 ( 316) 1033 152.0 5.8e-37
CCDS31115.1 OR2T1 gene_id:26696|Hs108|chr1 ( 369) 1032 151.9 6.9e-37
CCDS31108.1 OR2M4 gene_id:26245|Hs108|chr1 ( 311) 1031 151.7 6.9e-37
CCDS31111.1 OR2M7 gene_id:391196|Hs108|chr1 ( 312) 1030 151.6 7.6e-37
CCDS31105.1 OR2M5 gene_id:127059|Hs108|chr1 ( 312) 1030 151.6 7.6e-37
CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 ( 347) 1017 149.9 2.7e-36
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CCDS31104.1 OR2L3 gene_id:391192|Hs108|chr1 ( 312) 1006 148.3 7.1e-36
CCDS31103.1 OR2L2 gene_id:26246|Hs108|chr1 ( 312) 989 146.1 3.4e-35
CCDS31102.1 OR2AK2 gene_id:391191|Hs108|chr1 ( 335) 987 145.8 4.3e-35
CCDS31114.1 OR2T6 gene_id:254879|Hs108|chr1 ( 308) 981 145.0 7.2e-35
CCDS31113.1 OR2T4 gene_id:127074|Hs108|chr1 ( 348) 975 144.2 1.3e-34
CCDS31118.1 OR2T5 gene_id:401993|Hs108|chr1 ( 315) 967 143.1 2.7e-34
CCDS55695.1 OR2T29 gene_id:343563|Hs108|chr1 ( 315) 967 143.1 2.7e-34
CCDS58068.1 OR2L5 gene_id:81466|Hs108|chr1 ( 312) 959 142.0 5.6e-34
CCDS31121.1 OR2T10 gene_id:127069|Hs108|chr1 ( 312) 957 141.8 6.8e-34
CCDS34696.1 OR2AE1 gene_id:81392|Hs108|chr7 ( 323) 950 140.8 1.3e-33
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CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 903 134.6 1.1e-31
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 900 134.1 1.4e-31
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CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 896 133.6 2e-31
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 887 132.4 4.5e-31
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 886 132.2 5e-31
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 884 132.0 6e-31
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 883 131.8 6.6e-31
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 877 131.1 1.2e-30
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 875 130.8 1.4e-30
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 873 130.5 1.7e-30
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 871 130.2 2e-30
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 870 130.1 2.2e-30
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 865 129.4 3.5e-30
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CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 862 129.0 4.6e-30
CCDS4656.1 OR2W1 gene_id:26692|Hs108|chr6 ( 320) 854 128.0 9.9e-30
CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16 ( 312) 852 127.7 1.2e-29
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 851 127.5 1.3e-29
CCDS43666.1 OR2F2 gene_id:135948|Hs108|chr7 ( 317) 849 127.3 1.6e-29
>>CCDS32895.1 OR2Z1 gene_id:284383|Hs108|chr19 (314 aa)
initn: 2056 init1: 2056 opt: 2056 Z-score: 1519.0 bits: 289.2 E(32554): 2.7e-78
Smith-Waterman score: 2056; 100.0% identity (100.0% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGDVNQSVASDFILVGLFSHSGSRQLLFSLVAVMFVIGLLGNTVLLFLIRVDSRLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MGDVNQSVASDFILVGLFSHSGSRQLLFSLVAVMFVIGLLGNTVLLFLIRVDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FLLSQLSLFDIGCPMVTIPKMASDFLRGEGATSYGGGAAQIFFLTLMGVAEGVLLVLMSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FLLSQLSLFDIGCPMVTIPKMASDFLRGEGATSYGGGAAQIFFLTLMGVAEGVLLVLMSY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DRYVAVCQPLQYPVLMRRQVCLLMMGSSWVVGVLNASIQTSITLHFPYCASRIVDHFFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 VPALLKLSCADTCAYEMALSTSGVLILMLPLSLIATSYGHVLQAVLSMRSEEARHKAVTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VPALLKLSCADTCAYEMALSTSGVLILMLPLSLIATSYGHVLQAVLSMRSEEARHKAVTT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CSSHITVVGLFYGAAVFMYMVPCAYHSPQQDNVVSLFYSLVTPTLNPLIYSLRNPEVWMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CSSHITVVGLFYGAAVFMYMVPCAYHSPQQDNVVSLFYSLVTPTLNPLIYSLRNPEVWMA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 LVKVLSRAGLRQMC
::::::::::::::
CCDS32 LVKVLSRAGLRQMC
310
>>CCDS31100.1 OR2T8 gene_id:343172|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1077 init1: 1077 opt: 1088 Z-score: 817.0 bits: 159.3 E(32554): 3.5e-39
Smith-Waterman score: 1088; 53.5% identity (79.5% similar) in 303 aa overlap (5-307:3-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGDVNQSVASDFILVGLFSHSGSRQLLFSLVAVMFVIGLLGNTVLLFLIRVDSRLHTPMY
: : .: :::.:::.:. ..:.:: .: . . .:.::.....::. : :::::::
CCDS31 MENGSYTSYFILLGLFNHTRAHQVLFMMVLSIVLTSLFGNSLMILLIHWDHRLHTPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FLLSQLSLFDIGCPMVTIPKMASDFLRGEGATSYGGGAAQIFFLTLMGVAEGVLLVLMSY
::::::::.:. .:.::::.:.: : : : .: .:::::: .: .: ::. :.:
CCDS31 FLLSQLSLMDVMLVSTTVPKMAADYLTGSKAISRAGCGAQIFFLPTLGGGECFLLAAMAY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYVAVCQPLQYPVLMRRQVCLLMMGSSWVVGVLNASIQTSITLHFPYCASRIVDHFFCE
:::.:::.::.::.:: :.:: : : :..:. .. .:. :: ::::... .::::::
CCDS31 DRYAAVCHPLRYPTLMSWQLCLRMNLSCWLLGAADGLLQAVATLSFPYCGAHEIDHFFCE
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 VPALLKLSCADTCAYEMALSTSGVLILMLPLSLIATSYGHVLQAVLSMRSEEARHKAVTT
.:.:..:.:::: ..: :. ::.:..:.::: .::: .: ::: ::: :::.:: .:
CCDS31 TPVLVRLACADTSVFENAMYICCVLMLLVPFSLILSSYGLILAAVLHMRSTEARKKAFAT
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CSSHITVVGLFYGAAVFMYMVPCAYHSPQQDNVVSLFYSLVTPTLNPLIYSLRNPEVWMA
::::..:::::::::.: :: : ...: ..:.::: ::.. :: :::::::..: :: :
CCDS31 CSSHVAVVGLFYGAAIFTYMRPKSHRSTNHDKVVSAFYTMFTPLLNPLIYSVKNSEVKGA
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 LVKVLSRAGLRQMC
:.. ..:
CCDS31 LTRCMGRCVALSRE
300 310
>>CCDS31123.1 OR2T35 gene_id:403244|Hs108|chr1 (323 aa)
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Smith-Waterman score: 1079; 53.3% identity (79.6% similar) in 304 aa overlap (9-312:10-312)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MGDVNQSVASDFILVGLFSHSGSRQLLFSLVAVMFVIGLLGNTVLLFLIRVDSRLHTPM
...:.:.::..: . :::..: .::... .: :...::..::::::::
CCDS31 MGMEGLLQNSTNFVLTGLITHPAFPGLLFAVVFSIFVVAITANLVMILLIHMDSRLHTPM
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pF1KE6 YFLLSQLSLFDIGCPMVTIPKMASDFLRGEGATSYGGGAAQIFFLTLMGVAEGVLLVLMS
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CCDS31 YFLLSQLSIMDTIYICITVPKMLQDLLSKDKTISFLGCAVQIFYLTLIG-GEFFLLGLMA
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pF1KE6 YDRYVAVCQPLQYPVLMRRQVCLLMMGSSWVVGVLNASIQTSITLHFPYCASRIVDHFFC
::::::::.::.::.:: :.:::.:. .::: : :.. . : .:. ::.: :: ..::::
CCDS31 YDRYVAVCNPLRYPLLMNRRVCLFMVVGSWVGGSLDGFMLTPVTMSFPFCRSREINHFFC
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pF1KE6 EVPALLKLSCADTCAYEMALSTSGVLILMLPLSLIATSYGHVLQAVLSMRSEEARHKAVT
:.::.:::::.:: :: . . ::.:..:::.:..:: :.: .: : : :.:.:: .
CCDS31 EIPAVLKLSCTDTSLYETLMYACCVLMLLIPLSVISVSYTHILLTVHRMNSAEGRRKAFA
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pF1KE6 TCSSHITVVGLFYGAAVFMYMVPCAYHSPQQDNVVSLFYSLVTPTLNPLIYSLRNPEVWM
:::::: ::..::::: . ..: .::.:..:.::: ::...:: :::::::::: .:
CCDS31 TCSSHIMVVSVFYGAAFYTNVLPHSYHTPEKDKVVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKDVAA
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300 310
pF1KE6 ALVKVLSRAGLRQMC
:: :::.: : :
CCDS31 ALRKVLGRCGSSQSIRVATVIRKG
300 310 320
>>CCDS31109.1 OR2T33 gene_id:391195|Hs108|chr1 (320 aa)
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Smith-Waterman score: 1076; 53.0% identity (80.0% similar) in 300 aa overlap (6-305:4-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGDVNQSVASDFILVGLFSHSGSRQLLFSLVAVMFVIGLLGNTVLLFLIRVDSRLHTPMY
.... ::::.:::.:. ..:.:: .: . . .:.::.....::. : :::::::
CCDS31 MEMRNTTPDFILLGLFNHTRAHQVLFMMVLSIVLTSLFGNSLMILLIHWDHRLHTPMY
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pF1KE6 FLLSQLSLFDIGCPMVTIPKMASDFLRGEGATSYGGGAAQIFFLTLMGVAEGVLLVLMSY
::::::::.:. .:.::::.:.: : : : .: ..::::: .: .: ::. :.:
CCDS31 FLLSQLSLMDMMLVSTTVPKMAADYLTGSKAISRAGCGVQIFFLPTLGGGECFLLAAMAY
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pF1KE6 DRYVAVCQPLQYPVLMRRQVCLLMMGSSWVVGVLNASIQTSITLHFPYCASRIVDHFFCE
:::.:::.::.::.:: :.:: : : :..:. .. .:. .:: ::::... .::::::
CCDS31 DRYAAVCHPLRYPTLMSWQLCLRMTMSCWLLGAADGLLQAVVTLSFPYCGAHEIDHFFCE
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pF1KE6 VPALLKLSCADTCAYEMALSTSGVLILMLPLSLIATSYGHVLQAVLSMRSEEARHKAVTT
.:.:..:.:::: ..: :. ::.:..:.::: .::: .: ::: ::: :::.:: .:
CCDS31 TPVLVRLACADTSVFENAMYICCVLMLLVPFSLILSSYGLILAAVLHMRSTEARKKAFAT
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pF1KE6 CSSHITVVGLFYGAAVFMYMVPCAYHSPQQDNVVSLFYSLVTPTLNPLIYSLRNPEVWMA
::::..:::::::::.: :: : ...: ..:.::: ::.. :: :::::::..: :: :
CCDS31 CSSHVAVVGLFYGAAIFTYMRPKSHRSTNHDKVVSAFYTMFTPLLNPLIYSVKNSEVKGA
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 LVKVLSRAGLRQMC
: . :
CCDS31 LKRWLGTCVNIKHQQNEAHRSR
300 310 320
>>CCDS58992.1 OR2V1 gene_id:26693|Hs108|chr5 (315 aa)
initn: 1081 init1: 1062 opt: 1075 Z-score: 807.6 bits: 157.6 E(32554): 1.2e-38
Smith-Waterman score: 1075; 54.4% identity (79.9% similar) in 309 aa overlap (1-307:1-308)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MGD-VNQSVASDFILVGLFSHSGSRQLLFSLVAVMFVIGLLGNTVLLFLIRVDSRLHTPM
:: :::: .. :.:.:.:::: . .::: : :.:...: ::..:.::: .:. :::::
CCDS58 MGRWVNQSYTDGFFLLGIFSHSQTDLVLFSAVMVVFTVALCGNVLLIFLIYLDAGLHTPM
10 20 30 40 50 60
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pF1KE6 YFLLSQLSLFDIGCPMVTIPKMASDFLRGEGATSYGGGAAQI-FFLTLMGVAEGVLLVLM
::.::::::.:. .::::..:: :. . :. : . :: ::..:.: .::.:: ::
CCDS58 YFFLSQLSLMDLMLVCNIVPKMAANFLSGRKSISFVGCGIQIGFFVSLVG-SEGLLLGLM
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pF1KE6 SYDRYVAVCQPLQYPVLMRRQVCLLMMGSSWVVGVLNASIQTSITLHFPYCASRIVDHFF
.::::::: .::.::.:: ..::: . ::::. :.... :: .. .:::.:: :::::
CCDS58 AYDRYVAVSHPLHYPILMNQRVCLQITGSSWAFGIIDGVIQMVAAMGLPYCGSRSVDHFF
120 130 140 150 160 170
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pF1KE6 CEVPALLKLSCADTCAYEMALSTSGVLILMLPLSLIATSYGHVLQAVLSMRSEEARHKAV
::: :::::.:::: .. : . :..:.::.:.: .::. .: ::: .:: .: .::.
CCDS58 CEVQALLKLACADTSLFDTLLFACCVFMLLLPFSIIMASYACILGAVLRIRSAQAWKKAL
180 190 200 210 220 230
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pF1KE6 TTCSSHITVVGLFYGAAVFMYMVPCAYHSPQQDNVVSLFYSLVTPTLNPLIYSLRNPEVW
.:::::.:.: ::::::.:::. : :..:..:.:.:.::...:: :::::::::: ::
CCDS58 ATCSSHLTAVTLFYGAAMFMYLRPRRYRAPSHDKVASIFYTVLTPMLNPLIYSLRNGEVM
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 MALVKVLSRAGLRQMC
:: : :.:
CCDS58 GALRKGLDRCRIGSQH
300 310
>>CCDS31124.1 OR2T27 gene_id:403239|Hs108|chr1 (317 aa)
initn: 1103 init1: 1057 opt: 1070 Z-score: 803.9 bits: 156.9 E(32554): 1.9e-38
Smith-Waterman score: 1070; 53.2% identity (79.9% similar) in 308 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MGDVNQSVASDFILVGLFSHSGSRQLLFSLVAVMFVIGLLGNTVLLFLIRVDSRLHTPMY
: . : :: .::::.::::.. :::.:. ..:. .. .:.: ..::..:::::::::
CCDS31 MEQSNYSVYADFILLGLFSNARFPWLLFALILLVFLTSIASNVVKIILIHIDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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CCDS31 EVPALLKLSCTDTSAYETAMYVCCIMMLLIPFSVISGSYTRILITVYRMSEAEGRGKAVA
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CCDS31 TCSSHMVVVSLFYGAAMYTYVLPHSYHTPEQDKAVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKDVTG
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300 310
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CCDS31 ALQKVVGRCVSSGKVTTF
300 310
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CCDS31 YFLLSQLSIMDTIYICITVPKMLQDLLSKDKTISFLGCAVQIFLYLTLIG-GEFFLLGLM
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CCDS31 CEIPAVLKLSCTDTSLYETLMYACCVLMLLIPLSVISVSYTHILLTVHRMNSAEGRRKAF
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CCDS31 ATCSSHIMVVSVFYGAAFYTNVLPHSYHTPEKDKVVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKDVA
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CCDS31 AALRKVLGRCGSSQSIRVATVIRKG
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CCDS31 MELRNSTLGSGFILVGILNDSGSPELLYATFTILYMLALTSNGLLLLAITIEARLHMPMY
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CCDS31 LLLGQLSLMDLLFTSVVTPKALADFLRRENTISFGGCALQMFLALTMGSAEDLLLAFMAY
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CCDS31 DRYVAICHPLKYMTLMSPRVCWIMVATSWILASLIAIGHTMYTMHLPFCVSWEIRHLLCE
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CCDS31 IPPLLKLACADTSRYELIIYVTGVTFLLLPISAIVASYTLVLFTVLRMPSNEGRKKALVT
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CCDS31 CSSHLIVVGMFYGAATFMYVLPSSFHSPKQDNIISVFYTIVTPALNPLIYSLRNKEVMRA
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310
pF1KE6 LVKVLSRAGLRQMC
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CCDS31 LRRVLGKYILLAHSTL
310
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CCDS31 MEMRNTTPDFILLGLFNHTRAHQVLFMMLLATVLTSLFSNALMILLIHWDHRLHRPMY
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CCDS31 FLLSQLSLMDMMLVSTTVPKMAADYLTGNKAISRAGCGVQIFFLPTLGGGECFLLAAMAY
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CCDS31 APVLVRLACADTSVFENAMYICCVLMLLVPFSLILSSYGLILAAVLLMRSTEARKKAFAT
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CCDS31 CSSHVAVVGLFYGAGIFTYMRPKSHRSTNHDKVVSAFYTMFTPLLNPLIYSVRNSEVKEA
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CCDS31 LKRWLGTCVNLKHQQNEAHRSR
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CCDS44 METWVNQSYTDGFFLLGIFSHSTADLVLFSVVMAVFTVALCGNVLLIFLIYMDPHLHTPM
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CCDS44 YFFLSQLSLMDLMLVCTNVPKMAANFLSGRKSISFVGCGIQIGLFVCLVG-SEGLLLGLM
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CCDS44 AYDRYVAISHPLHYPILMNQRVCLQITGSSWAFGIIDGLIQMVVVMNFPYCGLRKVNHFF
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CCDS44 CEMLSLLKLACVDTSLFEKVIFACCVFMLLFPFSIIVASYAHILGTVLQMHSAQAWKKAL
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CCDS44 ATCSSHLTAVTLFYGAAMFIYLRPRHYRAPSHDKVASIFYTVLTPMLNPLIYSLRNREVM
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]