Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6001
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6001, 314 aa
1>>>pF1KE6001 314 - 314 aa - 314 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0224+/-0.00122; mu= 11.2174+/- 0.070
mean_var=172.0003+/-60.697, 0's: 0 Z-trim(102.0): 383 B-trim: 385 in 1/46
Lambda= 0.097793
statistics sampled from 6305 (6773) to 6305 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.552), E-opt: 0.2 (0.208), width: 16
Scan time: 2.010
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31544.1 OR9Q2 gene_id:219957|Hs108|chr11 ( 314) 2046 301.9 4.3e-82
CCDS31543.1 OR9Q1 gene_id:219956|Hs108|chr11 ( 310) 1491 223.6 1.6e-58
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 1261 191.1 9.4e-49
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1102 168.7 5.2e-42
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 1043 160.4 1.7e-39
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 1036 159.4 3.4e-39
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1011 155.9 3.9e-38
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 1009 155.6 4.8e-38
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 1006 155.2 6.3e-38
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 1006 155.2 6.4e-38
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 1003 154.7 8.5e-38
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 1003 154.8 8.7e-38
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 993 153.3 2.3e-37
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 993 153.3 2.3e-37
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 991 153.1 2.9e-37
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 987 152.6 4.4e-37
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 985 152.2 4.9e-37
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 984 152.0 5.4e-37
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 981 151.6 7.2e-37
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 969 149.9 2.3e-36
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 969 149.9 2.4e-36
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 966 149.5 3.2e-36
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 966 149.6 3.4e-36
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 963 149.1 4.2e-36
CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 ( 308) 960 148.7 5.6e-36
CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11 ( 310) 957 148.2 7.6e-36
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 957 148.2 7.6e-36
CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 956 148.1 8.3e-36
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 956 148.1 8.4e-36
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 956 148.1 8.4e-36
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 954 147.8 1e-35
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 953 147.7 1.1e-35
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 953 147.7 1.1e-35
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 952 147.5 1.2e-35
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 945 146.6 2.5e-35
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 944 146.4 2.7e-35
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 944 146.5 2.9e-35
CCDS35131.1 OR5C1 gene_id:392391|Hs108|chr9 ( 320) 942 146.1 3.3e-35
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 940 145.8 4e-35
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 939 145.7 4.5e-35
CCDS31538.1 OR5AK2 gene_id:390181|Hs108|chr11 ( 309) 936 145.3 5.9e-35
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 934 145.0 7.2e-35
CCDS33804.1 OR5K2 gene_id:402135|Hs108|chr3 ( 316) 932 144.7 8.8e-35
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 927 144.0 1.4e-34
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 926 143.9 1.6e-34
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 925 143.7 1.7e-34
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 923 143.4 2.1e-34
CCDS31512.1 OR5D16 gene_id:390144|Hs108|chr11 ( 328) 921 143.2 2.6e-34
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 920 143.0 2.8e-34
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 920 143.0 2.9e-34
>>CCDS31544.1 OR9Q2 gene_id:219957|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 2046 init1: 2046 opt: 2046 Z-score: 1587.3 bits: 301.9 E(32554): 4.3e-82
Smith-Waterman score: 2046; 100.0% identity (100.0% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAERNYTVVTEFFLTAFTEHLQWRVPLFLIFLSFYLATMLGNTGMILLIRGDRRLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MAERNYTVVTEFFLTAFTEHLQWRVPLFLIFLSFYLATMLGNTGMILLIRGDRRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLSHLSLVDICYSSAIIPQMLAVLWEHGTTISQARCAAQFFLFTFFASIDCYLLAIMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FFLSHLSLVDICYSSAIIPQMLAVLWEHGTTISQARCAAQFFLFTFFASIDCYLLAIMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYTAVCQPLLYVTIITEKARWGLVTGAYVAGFFSAFVRTVTAFTLSFCGNNEINFIFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DRYTAVCQPLLYVTIITEKARWGLVTGAYVAGFFSAFVRTVTAFTLSFCGNNEINFIFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LPPLLKLSCGDSYTQEVVIIVFALFVMPACILVILVSYLFIIVAILQIHSAGGRAKTFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LPPLLKLSCGDSYTQEVVIIVFALFVMPACILVILVSYLFIIVAILQIHSAGGRAKTFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CASHLTAVALFFGTLIFMYLRDNTGQSSEGDRVVSVLYTVVTPMLNPLIYSLRNKEVKEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CASHLTAVALFFGTLIFMYLRDNTGQSSEGDRVVSVLYTVVTPMLNPLIYSLRNKEVKEA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 TRKALSKSKPARRP
::::::::::::::
CCDS31 TRKALSKSKPARRP
310
>>CCDS31543.1 OR9Q1 gene_id:219956|Hs108|chr11 (310 aa)
initn: 1514 init1: 1110 opt: 1491 Z-score: 1164.2 bits: 223.6 E(32554): 1.6e-58
Smith-Waterman score: 1491; 73.5% identity (90.9% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAERNYTVVTEFFLTAFTEHLQWRVPLFLIFLSFYLATMLGNTGMILLIRGDRRLHTPMY
::: : :.::::.: ::::. .: .::::.:: .:: :.::: ::.:: :..::.:::
CCDS31 MAEMNLTLVTEFLLIAFTEYPEWALPLFLLFLFMYLITVLGNLEMIILILMDHQLHAPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLSHLSLVDICYSSAIIPQMLAVLWEHGTTISQARCAAQFFLFTFFASIDCYLLAIMAY
:.::::...:.:::: .::::::: :::...: .::::::::::::.::::::::.:::
CCDS31 FLLSHLAFMDVCYSSITVPQMLAVLLEHGAALSYTRCAAQFFLFTFFGSIDCYLLALMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYTAVCQPLLYVTIITEKARWGLVTGAYVAGFFSAFVRTVTAFTLSFCGNNEINFIFCD
::: :::::::::::.:..:: .::.::::::..::.::::.::::::::..::.:::::
CCDS31 DRYLAVCQPLLYVTILTQQARLSLVAGAYVAGLISALVRTVSAFTLSFCGTSEIDFIFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LPPLLKLSCGDSYTQEVVIIVFALFVMPACILVILVSYLFIIVAILQIHSAGGRAKTFST
:::::::.::.::::::.::.::.::.:: ..:::::::::::::. : ::..::::::
CCDS31 LPPLLKLTCGESYTQEVLIIMFAIFVIPASMVVILVSYLFIIVAIMGI-PAGSQAKTFST
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CASHLTAVALFFGTLIFMYLRDNTGQSSEGDRVVSVLYTVVTPMLNPLIYSLRNKEVKEA
:.::::::.:::::::::::: :. :::: .:::::::: : ::::::::::::::::::
CCDS31 CTSHLTAVSLFFGTLIFMYLRGNSDQSSEKNRVVSVLYTEVIPMLNPLIYSLRNKEVKEA
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 TRKALSKSKPARRP
:: :...:
CCDS31 LRKILNRAKLS
300 310
>>CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1261 init1: 1261 opt: 1261 Z-score: 988.8 bits: 191.1 E(32554): 9.4e-49
Smith-Waterman score: 1261; 63.0% identity (86.5% similar) in 303 aa overlap (1-303:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAERNYTVVTEFFLTAFTEHLQWRVPLFLIFLSFYLATMLGNTGMILLIRGDRRLHTPMY
::. : : ::::.: .: .: . ..::::.::::::.:.:::.:::.::. : .:.::::
CCDS31 MAKNNLTRVTEFILMGFMDHPKLEIPLFLVFLSFYLVTLLGNVGMIMLIQVDVKLYTPMY
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pF1KE6 FFLSHLSLVDICYSSAIIPQMLAVLWEHGTTISQARCAAQFFLFTFFASIDCYLLAIMAY
::::::::.: ::.:.: ::.::.: :.:: ..:::::::::. :. .:.:::.:::
CCDS31 FFLSHLSLLDACYTSVITPQILATLATGKTVISYGHCAAQFFLFTICAGTECFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE6 DRYTAVCQPLLYVTIITEKARWGLVTGAYVAGFFSAFVRTVTAFTLSFCGNNEINFIFCD
:::.:. .::::.. .. . :.::.:::: : .:..::. .:::::: .:.:::.:::
CCDS31 DRYAAIRNPLLYTVAMNPRLCWSLVVGAYVCGVSGAILRTTCTFTLSFCKDNQINFFFCD
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190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LPPLLKLSCGDSYTQEVVIIVFALFVMPACILVILVSYLFIIVAILQIHSAGGRAKTFST
:::::::.:.:. . :.::: :. ::. : :::.:::.:: .::...:.:::::::::
CCDS31 LPPLLKLACSDTANIEIVIIFFGNFVILANASVILISYLLIIKTILKVKSSGGRAKTFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CASHLTAVALFFGTLIFMYLRDNTGQSSEGDRVVSVLYTVVTPMLNPLIYSLRNKEVKEA
::::.::::::::.::::::....:.: : :.::::.:::: :::::::::::::.::.:
CCDS31 CASHITAVALFFGALIFMYLQSGSGKSLEEDKVVSVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKDVKDA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 TRKALSKSKPARRP
::
CCDS31 FRKVARRLQVSLSM
310
>>CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1109 init1: 693 opt: 1102 Z-score: 867.6 bits: 168.7 E(32554): 5.2e-42
Smith-Waterman score: 1102; 55.6% identity (81.0% similar) in 306 aa overlap (5-310:3-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAERNYTVVTEFFLTAFTEHLQWRVPLFLIFLSFYLATMLGNTGMILLIRGDRRLHTPMY
: : ::::.: ..:. . ..::.: :: .:: :.::: ::...:..: .::::::
CCDS31 MENSTEVTEFILLGLTDDPNLQIPLLLAFLFIYLITLLGNGGMMVIIHSDSHLHTPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 FFLSHLSLVDICYSSAIIPQMLAVLWEHGTTISQARCAAQFFLFTFFASIDCYLLAIMAY
::::.:::::. ::::. :. .:.: .:: ::::::.:. ::...::::: :::
CCDS31 FFLSNLSLVDLGYSSAVAPKTVAALRSGDKAISYDGCAAQFFFFVGFATVECYLLASMAY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 DRYTAVCQPLLYVTIITEKARWGLVTGAYVAGFFSAFVRTVTAFTLSFCGNNEINFIFCD
::..:::.:: :.: .: . :.::.::.::..: .... .: :::::.:::: .:::
CCDS31 DRHAAVCRPLHYTTTMTAGVCALLATGSYVSGFLNASIHAAGTFRLSFCGSNEINHFFCD
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LPPLLKLSCGDSYTQEVVIIVFALFVMPACILVILVSYLFIIVAILQIHSAGGRAKTFST
.:::: :::.:. ...:..: : : . .::::.::.:: ..: ..::: :. :.:::
CCDS31 IPPLLALSCSDTRISKLVVFV-AGFNVFFTLLVILISYFFICITIQRMHSAEGQKKVFST
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 CASHLTAVALFFGTLIFMYLRDNTGQSSEGDRVVSVLYTVVTPMLNPLIYSLRNKEVKEA
:::::::...:.::.:::::. :..:: . :...::.:::: :::::::::::::::: :
CCDS31 CASHLTALSIFYGTIIFMYLQPNSSQSVDTDKIASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEVKSA
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 TRKALSKSKPARRP
: :.: :
CCDS31 LWKILNKLYPQY
300
>>CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 (324 aa)
initn: 1097 init1: 1043 opt: 1043 Z-score: 822.4 bits: 160.4 E(32554): 1.7e-39
Smith-Waterman score: 1043; 49.0% identity (80.9% similar) in 304 aa overlap (4-307:5-308)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MAERNYTVVTEFFLTAFTEHLQWRVPLFLIFLSFYLATMLGNTGMILLIRGDRRLHTPM
:: :.::.:.: ....: : .. ::..::..:: :. : ..: ::. : .:: ::
CCDS31 MAVGRNNTIVTKFILLGLSDHPQMKIFLFMLFLGLYLLTLAWNLSLIALIKMDSHLHMPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 YFFLSHLSLVDICYSSAIIPQMLAVLWEHGTTISQARCAAQFFLFTFFASIDCYLLAIMA
:::::.::..:::: :. :.::. . . ::: . ::.:.:.: .. .:.::: ::
CCDS31 YFFLSNLSFLDICYVSSTAPKMLSDIITEQKTISFVGCATQYFVFCGMGLTECFLLAAMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 YDRYTAVCQPLLYVTIITEKARWGLVTGAYVAGFFSAFVRTVTAFTLSFCGNNEINFIFC
::::.:.:.::::...:.. .:.::::.::.:.:..: ... .::: :: .::
CCDS31 YDRYAAICNPLLYTVLISHTLCLKMVVGAYVGGFLSSFIETYSVYQHDFCGPYMINHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 DLPPLLKLSCGDSYTQEVVIIVFALFVMPACILVILVSYLFIIVAILQIHSAGGRAKTFS
::::.: :::.:..:.::: .. .. : . .::.:.:: .:..:...: :: ::.:.::
CCDS31 DLPPVLALSCSDTFTSEVVTFIVSVVVGIVSVLVVLISYGYIVAAVVKISSATGRTKAFS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 TCASHLTAVALFFGTLIFMYLRDNTGQSSEGDRVVSVLYTVVTPMLNPLIYSLRNKEVKE
:::::::::.::.:. .:::.: ... : . :.:::..:..: :..::.:::.::::.:.
CCDS31 TCASHLTAVTLFYGSGFFMYMRPSSSYSLNRDKVVSIFYALVIPVVNPIIYSFRNKEIKN
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE6 ATRKALSKSKPARRP
: :::. .
CCDS31 AMRKAMERDPGISHGGPFIFMTLG
310 320
>>CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 (316 aa)
initn: 1070 init1: 1036 opt: 1036 Z-score: 817.2 bits: 159.4 E(32554): 3.4e-39
Smith-Waterman score: 1036; 50.7% identity (79.9% similar) in 304 aa overlap (4-307:10-313)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MAERNYTVVTEFFLTAFTEHLQWRVPLFLIFLSFYLATMLGNTGMILLIRGDRR
:: : ::::.: ..... . . :: .:: .:.:.:.:: :::.::. :
CCDS31 MRLMKEVRGRNQTEVTEFLLLGLSDNPDLQGVLFALFLLIYMANMVGNLGMIVLIKIDLC
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CCDS31 LHTPMYFFLSSLSFVDASYSSSVTPKMLVNLMAENKAISFHGCAAQFYFFGSFLGTECFL
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CCDS31 LAMMAYDRYAAIWNPLLYPVLVSGRICFLLIATSFLAGCGNAAIHTGMTFRLSFCGSNRI
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CCDS31 HKAFSTCASYLMAVTIFFGTILFMYLRPTSSYSMEQDKVVSVFYTVIIPVLNPLIYSLKN
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300 310
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CCDS31 KDVKKALKKILWKHIL
310
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CCDS31 MENNTEVTEFILVGLTDDPELQIPLFIVFLFIYLITLVGNLGMIELILLDSCLHTPMY
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CCDS31 FFLSNLSLVDFGYSSAVTPKVMVGFLTGDKFILYNACATQFFFFVAFITAESFLLASMAY
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CCDS31 APPLLTLSCSDNYISEMVIFFVVGFNDLFSILVILISYLFIFITIMKMRSPEGRQKAFST
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CCDS31 CASHLTAVSIFYGTGIFMYLRPNSSHFMGTDKMASVFYAIVIPMLNPLVYSLRNKEVKSA
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310
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CCDS31 FKKTVGKAKASIGFIF
300 310
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CCDS31 MSGLPSDMDLYKLQLNNFTEVTMFILISFTEEFDVQVFLFLLFLAIYLFTLIGNLGLVVP
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CCDS31 IIGDFWLHSPMYYFLGVLSFLDVCYSTVVTPKMLVNFLAKNKSISFLGCATQMFLACTFG
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CCDS31 TTECFLLAAMAYDRYVAIYNPLLYSVSMSPRVYVPLITASYVASILHATIHTVATFSLSF
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CCDS31 CGSNEIRHVFCNMPPLLAISCSDTHVIQLLFFYFVGSIEIVTILIVLISYGFILLAILKM
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CCDS31 QSAEGRRKVFSTCGAHLTGVTIYHGTILFMYVRPSSSYTSDNDMIVSIFYTIVIPMLNPI
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CCDS31 IYSLRNKDVKEAIKRLLVRNWFINKL
310 320
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CCDS79 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
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CCDS79 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
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CCDS31 YFLSNLSFLDISCSTAITPKMLANFLASRKSISPYGCALQMFFFASFADAECLILAAMAY
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