FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5993, 314 aa
1>>>pF1KE5993 314 - 314 aa - 314 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5112+/-0.00139; mu= 14.2024+/- 0.082
mean_var=126.1807+/-38.891, 0's: 0 Z-trim(100.5): 378 B-trim: 683 in 2/45
Lambda= 0.114177
statistics sampled from 5673 (6141) to 5673 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.523), E-opt: 0.2 (0.189), width: 16
Scan time: 1.950
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 2036 347.6 7.2e-96
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 1534 265.0 5.6e-71
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 1516 262.0 4.3e-70
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1441 249.6 2.3e-66
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 1396 242.2 3.9e-64
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1185 207.5 1.1e-53
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 1173 205.5 4.5e-53
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 1157 202.8 2.7e-52
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 1138 199.7 2.4e-51
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 1120 196.8 2.1e-50
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 1112 195.5 5e-50
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 1107 194.6 8.3e-50
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 1105 194.3 1e-49
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 1104 194.1 1.2e-49
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 1102 193.8 1.5e-49
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 1102 193.8 1.5e-49
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 1101 193.6 1.6e-49
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 1100 193.5 1.9e-49
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 1099 193.3 2.1e-49
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 1099 193.3 2.1e-49
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 1097 193.0 2.6e-49
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 1096 192.8 3.1e-49
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 1095 192.6 3.3e-49
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 1087 191.3 8.4e-49
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 1086 191.2 9.1e-49
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 1086 191.2 9.2e-49
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 1086 191.2 9.2e-49
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 1083 190.7 1.3e-48
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 1082 190.5 1.4e-48
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 1074 189.2 3.6e-48
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 1070 188.5 5.7e-48
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 1065 187.7 1e-47
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 1063 187.4 1.2e-47
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 1063 187.4 1.3e-47
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 1062 187.2 1.5e-47
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 1061 187.1 1.6e-47
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 1061 187.1 1.7e-47
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 1058 186.5 2.2e-47
CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 ( 309) 1055 186.0 3.1e-47
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 1053 185.7 3.9e-47
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 1052 185.6 4.5e-47
CCDS31538.1 OR5AK2 gene_id:390181|Hs108|chr11 ( 309) 1050 185.2 5.5e-47
CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 ( 308) 1045 184.4 9.8e-47
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 1044 184.2 1.1e-46
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 1042 183.9 1.4e-46
CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 1042 183.9 1.4e-46
CCDS33804.1 OR5K2 gene_id:402135|Hs108|chr3 ( 316) 1040 183.6 1.8e-46
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 1039 183.5 2e-46
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 1036 182.9 2.8e-46
CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 1033 182.4 3.8e-46
>>CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 2036 init1: 2036 opt: 2036 Z-score: 1834.7 bits: 347.6 E(32554): 7.2e-96
Smith-Waterman score: 2036; 99.7% identity (99.7% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MENNTEVTEFILVGLTDDPELQIPLFIVFLFIYLITLVGNLGMIELILLDSCLHTPMYFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MENNTEVTEFILVGLTDDPELQIPLFIVFLFIYLITLVGNLGMIELILLDSCLHTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LSNLSLVDFGYSSAVTPKVMVGFLTGDKFILYNACATQFFFFVAFITAESFLLASMAYDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LSNLSLVDFGYSSAVTPKVMVGFLTGDKFILYNACATQFFFFVAFITAESFLLASMAYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YAALCKPLHYTTTMTTNVCARLAIGSYICGFLNASIHTGNTFRLSFCRSNVVEHFFCDAP
:::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YAALCKPLHYTTTMTTNVCACLAIGSYICGFLNASIHTGNTFRLSFCRSNVVEHFFCDAP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PLLTLSCSDNYISEMVIFFVVGFNDLFSILVILISYLFIFITIMKMRSPEGRQKAFSTCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PLLTLSCSDNYISEMVIFFVVGFNDLFSILVILISYLFIFITIMKMRSPEGRQKAFSTCA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SHLTAVSIFYGTGIFMYLRPNSSHFMGTDKMASVFYAIVIPMLNPLVYSLRNKEVKSAFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SHLTAVSIFYGTGIFMYLRPNSSHFMGTDKMASVFYAIVIPMLNPLVYSLRNKEVKSAFK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 KTVGKAKASIGFIF
::::::::::::::
CCDS31 KTVGKAKASIGFIF
310
>>CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1555 init1: 1534 opt: 1534 Z-score: 1387.8 bits: 265.0 E(32554): 5.6e-71
Smith-Waterman score: 1534; 74.7% identity (90.4% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MENNTEVTEFILVGLTDDPELQIPLFIVFLFIYLITLVGNLGMIELILLDSCLHTPMYFF
:::.::::.:::.:::.: :::.::::.: :::.::::::::.: ::. :::::.:::::
CCDS31 MENKTEVTQFILLGLTNDSELQVPLFITFPFIYIITLVGNLGIIVLIFWDSCLHNPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LSNLSLVDFGYSSAVTPKVMVGFLTGDKFILYNACATQFFFFVAFITAESFLLASMAYDR
::::::::: ::::::: ::.::: :: : :::::.:...:::: :.:..:::::::::
CCDS31 LSNLSLVDFCYSSAVTPIVMAGFLIEDKVISYNACAAQMYIFVAFATVENYLLASMAYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YAALCKPLHYTTTMTTNVCARLAIGSYICGFLNASIHTGNTFRLSFCRSNVVEHFFCDAP
:::.::::::::::::.::::::::::.:::::::::::.:: ::::.:: :.::::: :
CCDS31 YAAVCKPLHYTTTMTTTVCARLAIGSYLCGFLNASIHTGDTFSLSFCKSNEVHHFFCDIP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PLLTLSCSDNYISEMVIFFVVGFNDLFSILVILISYLFIFITIMKMRSPEGRQKAFSTCA
...::::: .:::.:...::.:: ....::::::: ::::::.::.: :: .::::
CCDS31 AVMVLSCSDRHISELVLIYVVSFNIFIALLVILISYTFIFITILKMHSASVYQKPLSTCA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SHLTAVSIFYGTGIFMYLRPNSSHFMGTDKMASVFYAIVIPMLNPLVYSLRNKEVKSAFK
::. ::.::::: :::::.:.::: : ::::: :::..::::::::::::::::::::::
CCDS31 SHFIAVGIFYGTIIFMYLQPSSSHSMDTDKMAPVFYTMVIPMLNPLVYSLRNKEVKSAFK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 KTVGKAKASIGFIF
:.: ::: :.:.
CCDS31 KVVEKAKLSVGWSV
310
>>CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1572 init1: 1516 opt: 1516 Z-score: 1371.8 bits: 262.0 E(32554): 4.3e-70
Smith-Waterman score: 1516; 73.0% identity (91.5% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MENNTEVTEFILVGLTDDPELQIPLFIVFLFIYLITLVGNLGMIELILLDSCLHTPMYFF
::: ::::.:::.:::. :::::::::.: ::::.:: :::::. :::.:::::::::::
CCDS31 MENCTEVTKFILLGLTSVPELQIPLFILFTFIYLLTLCGNLGMMLLILMDSCLHTPMYFF
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pF1KE5 LSNLSLVDFGYSSAVTPKVMVGFLTGDKFILYNACATQFFFFVAFITAESFLLASMAYDR
::::::::::::::::::::.::: ::: : :::::.:.:::::. :.:..:::::::::
CCDS31 LSNLSLVDFGYSSAVTPKVMAGFLRGDKVISYNACAVQMFFFVALATVENYLLASMAYDR
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130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YAALCKPLHYTTTMTTNVCARLAIGSYICGFLNASIHTGNTFRLSFCRSNVVEHFFCDAP
:::.:::::::::::..: : ::.:::.:::::::.: :. : ::::.::.:.:::::.:
CCDS31 YAAVCKPLHYTTTMTASVGACLALGSYVCGFLNASFHIGGIFSLSFCKSNLVHHFFCDVP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PLLTLSCSDNYISEMVIFFVVGFNDLFSILVILISYLFIFITIMKMRSPEGRQKAFSTCA
...:::::.. ::... :. .:: .: .:::.::::::::::.::.: .:.:::.::::
CCDS31 AVMALSCSDKHTSEVILVFMSSFNIFFVLLVIFISYLFIFITILKMHSAKGHQKALSTCA
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pF1KE5 SHLTAVSIFYGTGIFMYLRPNSSHFMGTDKMASVFYAIVIPMLNPLVYSLRNKEVKSAFK
::.::::.:::: ::.::.:.::: : ::::::::::..::::::.::::::.::..:::
CCDS31 SHFTAVSVFYGTVIFIYLQPSSSHSMDTDKMASVFYAMIIPMLNPVVYSLRNREVQNAFK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 KTVGKAKASIGFIF
:.. . :
CCDS31 KVLRRQKFL
>>CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1447 init1: 964 opt: 1441 Z-score: 1305.1 bits: 249.6 E(32554): 2.3e-66
Smith-Waterman score: 1441; 71.5% identity (91.5% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MENNTEVTEFILVGLTDDPELQIPLFIVFLFIYLITLVGNLGMIELILLDSCLHTPMYFF
:::.::::::::.::::::.:::::...:::::::::.:: ::. .: :: ::::::::
CCDS31 MENSTEVTEFILLGLTDDPNLQIPLLLAFLFIYLITLLGNGGMMVIIHSDSHLHTPMYFF
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 LSNLSLVDFGYSSAVTPKVMVGFLTGDKFILYNACATQFFFFVAFITAESFLLASMAYDR
::::::::.::::::.::..... .::: : :..::.::::::.: :.: .:::::::::
CCDS31 LSNLSLVDLGYSSAVAPKTVAALRSGDKAISYDGCAAQFFFFVGFATVECYLLASMAYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YAALCKPLHYTTTMTTNVCARLAIGSYICGFLNASIHTGNTFRLSFCRSNVVEHFFCDAP
.::.:.:::::::::..::: :: :::. ::::::::...::::::: :: ..::::: :
CCDS31 HAAVCRPLHYTTTMTAGVCALLATGSYVSGFLNASIHAAGTFRLSFCGSNEINHFFCDIP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PLLTLSCSDNYISEMVIFFVVGFNDLFSILVILISYLFIFITIMKMRSPEGRQKAFSTCA
:::.:::::. ::..:.: :.::: .:..:::::::.:: :::..:.: ::..:.:::::
CCDS31 PLLALSCSDTRISKLVVF-VAGFNVFFTLLVILISYFFICITIQRMHSAEGQKKVFSTCA
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SHLTAVSIFYGTGIFMYLRPNSSHFMGTDKMASVFYAIVIPMLNPLVYSLRNKEVKSAFK
:::::.:::::: :::::.::::. . :::.:::::..::::::::.:::::::::::.
CCDS31 SHLTALSIFYGTIIFMYLQPNSSQSVDTDKIASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEVKSALW
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 KTVGKAKASIGFIF
: ..:
CCDS31 KILNKLYPQY
300
>>CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1428 init1: 1396 opt: 1396 Z-score: 1264.9 bits: 242.2 E(32554): 3.9e-64
Smith-Waterman score: 1396; 66.6% identity (87.9% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MENNTEVTEFILVGLTDDPELQIPLFIVFLFIYLITLVGNLGMIELILLDSCLHTPMYFF
:::::::.::::.:::. ::::.::::.: .::::::.:::::: :::::: ::::::::
CCDS31 MENNTEVSEFILLGLTNAPELQVPLFIMFTLIYLITLTGNLGMIILILLDSHLHTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LSNLSLVDFGYSSAVTPKVMVGFLTGDKFILYNACATQFFFFVAFITAESFLLASMAYDR
::::::. .::::::::::..:.: :: : :.:::.:.:: ..: :.:..::.::::::
CCDS31 LSNLSLAGIGYSSAVTPKVLTGLLIEDKAISYSACAAQMFFCAVFATVENYLLSSMAYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YAALCKPLHYTTTMTTNVCARLAIGSYICGFLNASIHTGNTFRLSFCRSNVVEHFFCDAP
:::.:.:::::::::: ::: :::: :. :::::::. :.::::::: :::..::::: :
CCDS31 YAAVCNPLHYTTTMTTRVCACLAIGCYVIGFLNASIQIGDTFRLSFCMSNVIHHFFCDKP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PLLTLSCSDNYISEMVIFFVVGFNDLFSILVILISYLFIFITIMKMRSPEGRQKAFSTCA
..::.::...:::... .. .:: .:..:: :::::::.:::.: .. .: :: .:::.
CCDS31 AVITLTCSEKHISELILVLISSFNVFFALLVTLISYLFILITILKRHTGKGYQKPLSTCG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SHLTAVSIFYGTGIFMYLRPNSSHFMGTDKMASVFYAIVIPMLNPLVYSLRNKEVKSAFK
::: :. .:: : :.::.::.::: : :::.:::::...::::.:.::.::::.::.::
CCDS31 SHLIAIFLFYITVIIMYIRPSSSHSMDTDKIASVFYTMIIPMLSPIVYTLRNKDVKNAFM
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 KTVGKAKASIGFIF
:.: ::: :. .:
CCDS31 KVVEKAKYSLDSVF
310
>>CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1202 init1: 1173 opt: 1185 Z-score: 1077.2 bits: 207.5 E(32554): 1.1e-53
Smith-Waterman score: 1185; 58.5% identity (84.1% similar) in 301 aa overlap (3-303:5-305)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MENNTEVTEFILVGLTDDPELQIPLFIVFLFIYLITLVGNLGMIELILLDSCLHTPMY
: :..:::::::::: ::..:::..:: :::.:.:::::.: :: :. :.::::
CCDS41 MAHINCTQATEFILVGLTDHQELKMPLFVLFLSIYLFTVVGNLGLILLIRADTSLNTPMY
10 20 30 40 50 60
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CCDS41 DMPLLRLTCSDTRFKQLWIFACAGIMFISSLLIVFVSYMFIISAILRMHSAEGRQKAFST
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CCDS41 LKKIIINKN
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CCDS31 LHTPMYFFLSSLSFVDASYSSSVTPKMLVNLMAENKAISFHGCAAQFYFFGSFLGTECFL
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CCDS31 HKAFSTCASYLMAVTIFFGTILFMYLRPTSSYSMEQDKVVSVFYTVIIPVLNPLIYSLKN
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CCDS31 KDVKKALKKILWKHIL
310
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CCDS31 MTMENYSMAAQFVLDGLTQQAELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMILLIAVSPLLHTPMY
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CCDS31 YFLSSLSFVDFCYSSVITPKMLVNFLGKKNTILYSECMVQLFFFVVFVVAEGYLLTAMAY
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CCDS31 DRYVAICSPLLYNAIMSSWVCSLLVLAAFFLGFLSALTHTSAMMKLSFCKSHIINHYFCD
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CCDS31 VLPLLNLSCSNTHLNELLLFIIAGFNTLVPTLAVAVSYAFILYSILHIRSSEGRSKAFGT
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CCDS31 CSSHLMAVVIFFGSITFMYFKPPSSNSLDQEKVSSVFYTTVIPMLNPLIYSLRNKDVKKA
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CCDS31 LRKVLVGK
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CCDS73 MSGENNSSVTEFILAGLSEQPELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMTTLIWLSSHLHTPMY
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CCDS73 YFLSSLSFIDFCHSTVITPKMLVNFVTEKNIISYPECMTQLYFFLVFAIAECHMLAAMAY
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CCDS73 DRYMAICSPLLYSVIISNKACFSLILGVYIIGLVCASVHTGCMFRVQFCKFDLINHYFCD
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CCDS73 CSSHMLAVVIFFGSAAFMYLQPSSISSMDQGKVSSVFYTIIVPMLNPLIYSLRNKDVHVS
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CCDS73 LKKMLQRRTLL
310
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CCDS32 KPSQSPRCSTSFMVVPSFSIAEHWRRMKGANLSQGMEFELLGLTTDPQLQRLLFVVFLGM
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]