Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5990
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5990, 314 aa
1>>>pF1KE5990 314 - 314 aa - 314 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6167+/-0.000676; mu= 14.2232+/- 0.041
mean_var=132.4620+/-36.971, 0's: 0 Z-trim(104.9): 468 B-trim: 811 in 1/47
Lambda= 0.111437
statistics sampled from 12637 (13217) to 12637 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.473), E-opt: 0.2 (0.155), width: 16
Scan time: 5.260
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 1015 175.8 9.9e-44
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XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 818 144.2 3.5e-34
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NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 809 142.7 9.3e-34
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 802 141.6 2e-33
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NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 783 138.5 1.7e-32
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 781 138.2 2e-32
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 780 138.0 2.3e-32
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 767 135.9 1e-31
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 748 132.9 8.6e-31
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 585 106.7 6.5e-23
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 498 92.7 1.1e-18
NP_001043 (OMIM: 182454) somatostatin receptor typ ( 388) 230 49.7 1.1e-05
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 224 48.7 2e-05
NP_004215 (OMIM: 300207) melatonin-related recepto ( 617) 227 49.5 2.1e-05
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 217 47.6 4.4e-05
NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471) 217 47.7 5.4e-05
NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337) 212 46.8 7.6e-05
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 210 46.4 9.2e-05
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NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 209 46.4 0.00012
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NP_001138758 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 420) 209 46.4 0.00012
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 209 46.4 0.00012
NP_001008505 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 446) 209 46.4 0.00013
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 207 45.9 0.00013
NP_001272453 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 493) 209 46.5 0.00013
NP_001138751 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 493) 209 46.5 0.00013
NP_000673 (OMIM: 104260,607876) alpha-2B adrenergi ( 450) 207 46.1 0.00016
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NP_000729 (OMIM: 118510) muscarinic acetylcholine ( 460) 206 46.0 0.00018
NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 204 45.5 0.00018
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
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310
pF1KE5 LKNRFLNFNKAMPS
: .:
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>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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300 310
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: : .:.
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300 310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
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pF1KE5 MDVGNKSTMSEFVLLGLSNSWELQMFFFMVFSLLYVATMVGNSLIVITVIVDPHLHSPMY
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XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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pF1KE5 MDVGNKSTMSEFVLLGLSNSWELQMFFFMVFSLLYVATMVGNSLIVITVIVDPHLHSPMY
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
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pF1KE5 MRKLKNRFLNFNKAMPS
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XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
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pF1KE5 PMYFLLTNLSIIDMSLASFATPKMITDYLTGHKTISFDGCLTQIFFLHLFTGTEIILLMA
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 MSFDRYIAICKPLHYASVISPQVCVALVVASWIMGVMHSMSQVIFALTLPFCGPYEVDSF
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NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 FCDLPVVFQLACVDTYVLGLFMISTSGIIALSCFIVLFNSY-VIVLVTVKHHSSRGSSKA
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NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LSTCTAHFIVVFLFFGPCIFIYMWPLSSFLTD--KILSVFYTIFTPTLNPIIYTLRNQEV
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NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 KIAMRKLKNRFLNFNKAMPS
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NP_001 RGAVKRLMGWE
310
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 770 init1: 504 opt: 845 Z-score: 758.3 bits: 148.5 E(85289): 1.7e-35
Smith-Waterman score: 845; 39.4% identity (72.9% similar) in 317 aa overlap (1-313:1-317)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MDVGNKSTMSEFVLLGLSN-SWELQMFFFMVFSLLYVATMVGNSLIVITVIVDPHLHSPM
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NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFLLTNLSIIDMSLASFATPKMITDYLTGHKTISFDGCLTQIFFLHLFTGTEIILLMAMS
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NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
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120 130 140 150 160 170
pF1KE5 FDRYIAICKPLHYASVISPQVCVALVVASWIMGVMHSMSQVIFALTLPFCGPYEVDSFFC
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NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
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180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DLPVVFQLACVDTYVLGLF-MISTSGIIALSCFIVLFNSYVIVLVTVKHHSSRGSSKALS
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NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCTAHFIVVFLFFGPCIFIYMWPLS--SFLTDKILSVFYTIFTPTLNPIIYTLRNQEVKI
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NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 AMRKLKNRFLNFNKAMPS
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NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 796 init1: 606 opt: 818 Z-score: 734.9 bits: 144.1 E(85289): 3.4e-34
Smith-Waterman score: 818; 38.1% identity (75.6% similar) in 307 aa overlap (1-304:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDVGNKSTMSEFVLLGLSNSWELQMFFFMVFSLLYVATMVGNSLIVITVIVDPHLHSPMY
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLTNLSIIDMSLASFATPKMITDYLTGHKTISFDGCLTQIFFLHLFTGTEIILLMAMSF
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NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRYIAICKPLHYASVISPQVCVALVVASWIMGVMHSMSQVIFALTLPFCGPYEVDSFFCD
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NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE5 LPVVFQLACVDTYVLGLFMISTSGIIALSCFIVLFNSYVIVLVTV-KHHSSRGSSKALST
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NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CTAHFIVVFLFFGPCIFIYMWPLSSFLTDK--ILSVFYTIFTPTLNPIIYTLRNQEVKIA
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NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 MRKLKNRFLNFNKAMPS
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NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 796 init1: 606 opt: 818 Z-score: 734.9 bits: 144.1 E(85289): 3.4e-34
Smith-Waterman score: 818; 38.1% identity (75.6% similar) in 307 aa overlap (1-304:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDVGNKSTMSEFVLLGLSNSWELQMFFFMVFSLLYVATMVGNSLIVITVIVDPHLHSPMY
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XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLTNLSIIDMSLASFATPKMITDYLTGHKTISFDGCLTQIFFLHLFTGTEIILLMAMSF
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XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYIAICKPLHYASVISPQVCVALVVASWIMGVMHSMSQVIFALTLPFCGPYEVDSFFCD
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XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE5 LPVVFQLACVDTYVLGLFMISTSGIIALSCFIVLFNSYVIVLVTV-KHHSSRGSSKALST
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XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CTAHFIVVFLFFGPCIFIYMWPLSSFLTDK--ILSVFYTIFTPTLNPIIYTLRNQEVKIA
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XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 MRKLKNRFLNFNKAMPS
..:. .:
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 796 init1: 606 opt: 818 Z-score: 734.7 bits: 144.2 E(85289): 3.5e-34
Smith-Waterman score: 818; 38.1% identity (75.6% similar) in 307 aa overlap (1-304:11-317)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MDVGNKSTMSEFVLLGLSNSWELQMFFFMVFSLLYVATMVGNSLIVITVI
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XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 VDPHLHSPMYFLLTNLSIIDMSLASFATPKMITDYLTGHKTISFDGCLTQIFFLHLFTGT
.: ::.::::.:.:::..:. .. ..:::..... .:::: :::::..:. .:.
XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 EIILLMAMSFDRYIAICKPLHYASVISPQVCVALVVASWIMGVMHSMSQVIFALTLPFCG
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XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
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pF1KE5 PYEVDSFFCDLPVVFQLACVDTYVLGLFMISTSGIIALSCFIVLFNSYVIVLVTV-KHHS
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XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
190 200 210 220 230 240
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pF1KE5 SRGSSKALSTCTAHFIVVFLFFGPCIFIYMWPLSSFLTDK--ILSVFYTIFTPTLNPIIY
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XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
250 260 270 280 290 300
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310 320
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60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 08:34:06 2016 done: Tue Nov 8 08:34:07 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]