Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5988
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5988, 313 aa
1>>>pF1KE5988 313 - 313 aa - 313 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9984+/-0.00123; mu= 11.7589+/- 0.072
mean_var=150.5447+/-53.836, 0's: 0 Z-trim(103.0): 401 B-trim: 864 in 2/47
Lambda= 0.104530
statistics sampled from 6676 (7207) to 6676 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.572), E-opt: 0.2 (0.221), width: 16
Scan time: 1.490
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS47728.1 OR6V1 gene_id:346517|Hs108|chr7 ( 313) 2064 323.9 1e-88
CCDS32038.1 OR6S1 gene_id:341799|Hs108|chr14 ( 331) 971 159.1 4.4e-39
CCDS31827.1 OR6C4 gene_id:341418|Hs108|chr12 ( 309) 924 152.0 5.7e-37
CCDS43661.1 OR9A4 gene_id:130075|Hs108|chr7 ( 314) 916 150.8 1.3e-36
CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1 ( 308) 909 149.7 2.7e-36
CCDS58241.1 OR2AP1 gene_id:121129|Hs108|chr12 ( 309) 908 149.5 3e-36
CCDS31819.1 OR6C3 gene_id:254786|Hs108|chr12 ( 311) 905 149.1 4.2e-36
CCDS31823.1 OR6C76 gene_id:390326|Hs108|chr12 ( 312) 890 146.8 2e-35
CCDS31820.1 OR6C75 gene_id:390323|Hs108|chr12 ( 312) 885 146.1 3.4e-35
CCDS34767.1 OR9A2 gene_id:135924|Hs108|chr7 ( 310) 871 144.0 1.5e-34
CCDS31696.1 OR6M1 gene_id:390261|Hs108|chr11 ( 313) 871 144.0 1.5e-34
CCDS31816.1 OR6C74 gene_id:254783|Hs108|chr12 ( 312) 870 143.8 1.6e-34
CCDS31825.1 OR6C70 gene_id:390327|Hs108|chr12 ( 312) 869 143.7 1.8e-34
CCDS31818.1 OR6C1 gene_id:390321|Hs108|chr12 ( 312) 862 142.6 3.7e-34
CCDS31695.1 OR6X1 gene_id:390260|Hs108|chr11 ( 312) 859 142.2 5.1e-34
CCDS31821.1 OR6C65 gene_id:403282|Hs108|chr12 ( 312) 859 142.2 5.1e-34
CCDS31817.1 OR6C6 gene_id:283365|Hs108|chr12 ( 314) 859 142.2 5.1e-34
CCDS31700.1 OR6T1 gene_id:219874|Hs108|chr11 ( 323) 858 142.0 5.8e-34
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 857 141.9 6.4e-34
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 851 141.0 1.2e-33
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 848 140.5 1.6e-33
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 846 140.2 2e-33
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 842 139.6 3e-33
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 841 139.4 3.4e-33
CCDS46559.1 OR6B2 gene_id:389090|Hs108|chr2 ( 312) 839 139.1 4.1e-33
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 839 139.2 4.2e-33
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 838 139.0 4.6e-33
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 837 138.8 5.1e-33
CCDS42837.1 OR6B3 gene_id:150681|Hs108|chr2 ( 331) 837 138.9 5.3e-33
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 834 138.4 7.2e-33
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 832 138.1 8.6e-33
CCDS7772.1 OR6A2 gene_id:8590|Hs108|chr11 ( 327) 830 137.8 1.1e-32
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 829 137.6 1.2e-32
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 828 137.5 1.3e-32
CCDS31824.1 OR6C2 gene_id:341416|Hs108|chr12 ( 312) 823 136.7 2.2e-32
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 823 136.7 2.2e-32
CCDS43667.1 OR6B1 gene_id:135946|Hs108|chr7 ( 311) 822 136.6 2.4e-32
CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1 ( 317) 821 136.4 2.7e-32
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 816 135.7 4.7e-32
CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 ( 322) 814 135.4 5.8e-32
CCDS31826.2 OR6C68 gene_id:403284|Hs108|chr12 ( 312) 813 135.2 6.3e-32
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 813 135.2 6.5e-32
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 812 135.1 7e-32
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 811 134.9 7.8e-32
CCDS4658.1 OR12D3 gene_id:81797|Hs108|chr6 ( 316) 810 134.8 8.6e-32
CCDS12335.1 OR10H1 gene_id:26539|Hs108|chr19 ( 318) 810 134.8 8.7e-32
CCDS32940.1 OR10H5 gene_id:284433|Hs108|chr19 ( 315) 807 134.3 1.2e-31
CCDS32032.1 OR11G2 gene_id:390439|Hs108|chr14 ( 345) 805 134.1 1.5e-31
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 802 133.6 2e-31
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 801 133.4 2.2e-31
>>CCDS47728.1 OR6V1 gene_id:346517|Hs108|chr7 (313 aa)
initn: 2064 init1: 2064 opt: 2064 Z-score: 1706.3 bits: 323.9 E(32554): 1e-88
Smith-Waterman score: 2064; 100.0% identity (100.0% similar) in 313 aa overlap (1-313:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MANLSQPSEFVLLGFSSFGELQALLYGPFLMLYLLAFMGNTIIIVMVIADTHLHTPMYFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MANLSQPSEFVLLGFSSFGELQALLYGPFLMLYLLAFMGNTIIIVMVIADTHLHTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LGNFSLLEILVTMTAVPRMLSDLLVPHKVITFTGCMVQFYFHFSLGSTSFLILTDMALDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LGNFSLLEILVTMTAVPRMLSDLLVPHKVITFTGCMVQFYFHFSLGSTSFLILTDMALDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 FVAICHPLRYGTLMSRAMCVQLAGAAWAAPFLAMVPTVLSRAHLDYCHGDVINHFFCDNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FVAICHPLRYGTLMSRAMCVQLAGAAWAAPFLAMVPTVLSRAHLDYCHGDVINHFFCDNE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PLLQLSCSDTRLLEFWDFLMALTFVLSSFLVTLISYGYIVTTVLRIPSASSCQKAFSTCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PLLQLSCSDTRLLEFWDFLMALTFVLSSFLVTLISYGYIVTTVLRIPSASSCQKAFSTCG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SHLTLVFIGYSSTIFLYVRPGKAHSVQVRKVVALVTSVLTPFLNPFILTFCNQTVKTVLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SHLTLVFIGYSSTIFLYVRPGKAHSVQVRKVVALVTSVLTPFLNPFILTFCNQTVKTVLQ
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 GQMQRLKGLCKAQ
:::::::::::::
CCDS47 GQMQRLKGLCKAQ
310
>>CCDS32038.1 OR6S1 gene_id:341799|Hs108|chr14 (331 aa)
initn: 1002 init1: 512 opt: 971 Z-score: 815.2 bits: 159.1 E(32554): 4.4e-39
Smith-Waterman score: 971; 47.9% identity (80.5% similar) in 303 aa overlap (5-306:9-311)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MANLSQPSEFVLLGFSSFGELQALLYGPFLMLYLLAFMGNTIIIVMVIADTHLHTP
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CCDS32 MSPDGNHSSDPTEFVLAGLPNLNSARVELFSVFLLVYLLNLTGNVLIVGVVRADTRLQTP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 MYFFLGNFSLLEILVTMTAVPRMLSDLLVPHKVITFTGCMVQFYFHFSLGSTSFLILTDM
:::::::.: ::::.: . .:.:::..: ...:.:..:..::::.: ::.. ::.:. :
CCDS32 MYFFLGNLSCLEILLTSVIIPKMLSNFLSRQHTISFAACITQFYFYFFLGASEFLLLAVM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 ALDRFVAICHPLRYGTLMSRAMCVQLAGAAWAAPFLAMVPTVLSRAHLDYC-HGDVINHF
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CCDS32 SADRYLAICHPLRYPLLMSGAVCFRVALACWVGGLVPVLGPTVAVALLPFCKQGAVVQHF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 FCDNEPLLQLSCSDTRLLEFWDFLMALTFVLSSFLVTLISYGYIVTTVLRIPSASSCQKA
:::. :::.:.:..:. :: ::..: ..::.:.: .::: :: .:: :::::. :::
CCDS32 FCDSGPLLRLACTNTKKLEETDFVLASLVIVSSLLITAVSYGLIVLAVLSIPSASGRQKA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FSTCGSHLTLVFIGYSSTIFLYVRPGKAHSVQVRKVVALVTSVLTPFLNPFILTFCNQTV
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CCDS32 FSTCTSHLIVVTLFYGSAIFLYVRPSQSGSVDTNWAVTVITTFVTPLLNPFIYALRNEQV
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 KTVLQGQMQRLKGLCKAQ
: .:. .....
CCDS32 KEALKDMFRKVVAGVLGNLLLDKCLSEKAVK
310 320 330
>>CCDS31827.1 OR6C4 gene_id:341418|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 971 init1: 916 opt: 924 Z-score: 777.2 bits: 152.0 E(32554): 5.7e-37
Smith-Waterman score: 924; 41.2% identity (78.4% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MANLSQPSEFVLLGFSSFGELQALLYGPFLMLYLLAFMGNTIIIVMVIADTHLHTPMYFF
: : .. .::.:::... :::.... ... :.:...:: ::.... : ::.::::::
CCDS31 MKNRTMFGEFILLGLTNQPELQVMIFIFLFLTYMLSILGNLTIITLTLLDPHLQTPMYFF
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70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LGNFSLLEILVTMTAVPRMLSDLLVPHKVITFTGCMVQFYFHFSLGSTSFLILTDMALDR
: :::.::: : .::.:... . .:::.:.::..:..: . ::.: : .:..:. ::
CCDS31 LRNFSFLEISFTSIFIPRFLTSMTTGNKVISFAGCLTQYFFAIFLGATEFYLLASMSYDR
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130 140 150 160 170 180
pF1KE5 FVAICHPLRYGTLMSRAMCVQLAGAAWAAPFLAMVPTVLSRAHLDYCHGDVINHFFCDNE
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CCDS31 YVAICKPLHYLTIMSSRVCIQLVFCSWLGGFLAILPPIILMTQVDFCVSNILNHYYCDYG
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190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PLLQLSCSDTRLLEFWDFLMALTFVLSSFLVTLISYGYIVTTVLRIPSASSCQKAFSTCG
::..:.:::: :::. .:.:.. .. ..... .:: ::. :.::::::.. ::::::.
CCDS31 PLVELACSDTSLLELMVILLAVVTLMVTLVLVTLSYTYIIRTILRIPSAQQRTKAFSTCS
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250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SHLTLVFIGYSSTIFLYVRPGKAHSVQVRKVVALVTSVLTPFLNPFILTFCNQTVKTVLQ
::. .. ..:.: .:.:. :. .. : .:.. . .::.::::: :. :: :: ...
CCDS31 SHMIVISLSYGSCMFMYINPSAKEGGAFNKGIAVLITSVTPLLNPFIYTLRNQQVKQAFK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 GQMQRLKGLCKAQ
.....
CCDS31 DSVKKIVKL
>>CCDS43661.1 OR9A4 gene_id:130075|Hs108|chr7 (314 aa)
initn: 938 init1: 655 opt: 916 Z-score: 770.6 bits: 150.8 E(32554): 1.3e-36
Smith-Waterman score: 916; 45.1% identity (78.4% similar) in 306 aa overlap (1-305:2-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MANLSQPSEFVLLGFSSFGELQALLYGPFLMLYLLAFMGNTIIIVMVIADTHLHTPMYF
. : :. .:: :::: . ::. .:.. :...::...::::.::..: .: .:..::::
CCDS43 MLMNYSSATEFYLLGFPGSEELHHILFAIFFFFYLVTLMGNTVIIMIVCVDKRLQSPMYF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FLGNFSLLEILVTMTAVPRMLSDLLVP-HKVITFTGCMVQFYFHFSLGSTSFLILTDMAL
:::..: :::::: :: :: ::.: ..: ...:.::.......:.: : .: ::.
CCDS43 FLGHLSALEILVTTIIVPVMLWGLLLPGMQTIYLSACVVQLFLYLAVGTTEFALLGAMAV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRFVAICHPLRYGTLMSRAMCVQLAGAAWAAPFLAMVPTVLSRAHLDYCHGDVINHFFCD
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CCDS43 DRYVAVCNPLRYNIIMNRHTCNFVVLVSWVFGFLFQIWPVYVMFQLTYCKSNVVNNFFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 NEPLLQLSCSDTRLLEFWDFLMALTFVLSSFLVTLISYGYIVTTVLRIPSASSCQKAFST
::.:::..: . :: ::::. ...:.. :..: .::..:.:.:::.:. .:.:::
CCDS43 RGQLLKLSCNNTLFTEFILFLMAVFVLFGSLIPTIVSNAYIISTILKIPSSSGRRKSFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CGSHLTLVFIGYSSTIFLYVRPGKAHSVQVRKVVALVTSVLTPFLNPFILTFCNQTVKTV
:.::.: : :::.: .::::.: ...... ::.:..::.::::::::.:. :. : .
CCDS43 CASHFTCVVIGYGSCLFLYVKPKQTQAADYNWVVSLMVSVVTPFLNPFIFTLRNDKVIEA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 LQGQMQRLKGLCKAQ
:. ..:
CCDS43 LRDGVKRCCQLFRN
310
>>CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1 (308 aa)
initn: 894 init1: 869 opt: 909 Z-score: 765.0 bits: 149.7 E(32554): 2.7e-36
Smith-Waterman score: 909; 46.6% identity (77.5% similar) in 307 aa overlap (3-308:5-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MANLSQPSEFVLLGFSSFGELQALLYGPFLMLYLLAFMGNTIIIVMVIADTHLHTPMY
: . :..:.:::: . :: :. ::..:.:. ::. :...: .. .::::::
CCDS31 MDTGNKTLPQDFLLLGFPGSQTLQLSLFMLFLVMYILTVSGNVAILMLVSTSHQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLGNFSLLEILVTMTAVPRMLSDLLVPHKVITFTGCMVQFYFHFSLGSTSFLILTDMAL
:::.:.:.::: : .:::. :. :: ..:.::.:..:.:: :::: : ...:. ::
CCDS31 FFLSNLSFLEIWYTTAAVPKALAILLGRSQTISFTSCLLQMYFVFSLGCTEYFLLAAMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRFVAICHPLRYGTLMSRAMCVQLAGAAWAAPFLAM-VPTVLSRAHLDYCHGDVINHFFC
:: .:::.::.::..:: . .::: ..:. :.:. :::.: . :..: .::::::
CCDS31 DRCLAICYPLHYGAIMSSLLSAQLALGSWVCGFVAIAVPTALI-SGLSFCGPRAINHFFC
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DNEPLLQLSCSDTRLLEFWDFLMALTFVLSSFLVTLISYGYIVTTVLRIPSASSCQKAFS
: : . :.:..:. .:. :..:.. .::: :.:..:: ::..:.:::::::. .::::
CCDS31 DIAPWIALACTNTQAVELVAFVIAVVVILSSCLITFVSYVYIISTILRIPSASGRSKAFS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCGSHLTLVFIGYSSTIFLYVRPGKAHSVQVRKVVALVTSVLTPFLNPFILTFCNQTVKT
::.::::.:.: :.::.::.:: . .... :.: ....:.:: ::::: :. :. :.
CCDS31 TCSSHLTVVLIWYGSTVFLHVRTSIKDALDLIKAVHVLNTVVTPVLNPFIYTLRNKEVRE
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 VLQGQMQRLKGLCKAQ
.: ... ::
CCDS31 TL---LKKWKGK
300
>>CCDS58241.1 OR2AP1 gene_id:121129|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 972 init1: 901 opt: 908 Z-score: 764.2 bits: 149.5 E(32554): 3e-36
Smith-Waterman score: 908; 41.4% identity (76.1% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MANLSQPSEFVLLGFSSFGELQALLYGPFLMLYLLAFMGNTIIIVMVIADTHLHTPMYFF
: : . .::.:::... :::. .. ... :::...:: :..... :.::.::::::
CCDS58 MKNKTVLTEFILLGLTDVPELQVAVFTFLFLAYLLSILGNLTILILTLLDSHLQTPMYFF
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 LGNFSLLEILVTMTAVPRMLSDLLVPHKVITFTGCMVQFYFHFSLGSTSFLILTDMALDR
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