Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5987
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5987, 313 aa
1>>>pF1KE5987 313 - 313 aa - 313 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9609+/-0.0014; mu= 11.8938+/- 0.082
mean_var=167.2372+/-58.461, 0's: 0 Z-trim(101.4): 392 B-trim: 789 in 2/44
Lambda= 0.099176
statistics sampled from 5999 (6505) to 5999 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.532), E-opt: 0.2 (0.2), width: 16
Scan time: 2.110
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 ( 313) 2005 300.0 1.6e-81
CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 1945 291.4 6e-79
CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 ( 312) 1549 234.8 6.8e-62
CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 ( 314) 1221 187.8 9.1e-48
CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 ( 315) 1180 182.0 5.3e-46
CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 ( 317) 1107 171.5 7.5e-43
CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 ( 342) 1091 169.3 3.8e-42
CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 ( 321) 1082 168.0 9e-42
CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 ( 318) 1077 167.2 1.5e-41
CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 ( 320) 1077 167.2 1.5e-41
CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 ( 312) 1073 166.7 2.2e-41
CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 ( 314) 1047 162.9 2.9e-40
CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 ( 314) 1028 160.2 1.9e-39
CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 ( 326) 1027 160.1 2.1e-39
CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 ( 324) 1020 159.1 4.2e-39
CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 ( 314) 1014 158.2 7.5e-39
CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 ( 312) 1005 156.9 1.8e-38
CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 ( 312) 1002 156.5 2.5e-38
CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 ( 312) 1002 156.5 2.5e-38
CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 ( 317) 989 154.6 9e-38
CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 976 152.9 3.5e-37
CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 ( 311) 959 150.3 1.7e-36
CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 ( 318) 953 149.5 3.2e-36
CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 ( 320) 953 149.5 3.2e-36
CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 ( 321) 949 148.9 4.8e-36
CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 ( 321) 941 147.8 1.1e-35
CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 ( 317) 936 147.1 1.7e-35
CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 ( 324) 935 146.9 1.9e-35
CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 ( 323) 928 145.9 3.9e-35
CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 ( 320) 924 145.4 5.7e-35
CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 ( 325) 921 144.9 7.8e-35
CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 ( 329) 917 144.4 1.2e-34
CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 896 141.3 9.1e-34
CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 ( 310) 887 140.0 2.2e-33
CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 ( 312) 878 138.8 5.4e-33
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 874 138.2 8.2e-33
CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 873 138.0 8.9e-33
CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 831 132.1 6e-31
CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 ( 350) 768 123.1 3.2e-28
CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 739 118.9 5.4e-27
CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 ( 324) 730 117.6 1.3e-26
CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 727 117.2 1.7e-26
CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 721 116.3 3.2e-26
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 717 115.7 4.7e-26
CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 713 115.2 7.6e-26
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 689 111.7 7.6e-25
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 682 110.7 1.5e-24
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 581 96.3 3.3e-20
CCDS30904.1 OR6K6 gene_id:128371|Hs108|chr1 ( 343) 556 92.7 4.2e-19
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 546 91.3 1.1e-18
>>CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 (313 aa)
initn: 2005 init1: 2005 opt: 2005 Z-score: 1577.3 bits: 300.0 E(32554): 1.6e-81
Smith-Waterman score: 2005; 99.4% identity (99.4% similar) in 313 aa overlap (1-313:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSIINTSYVEITTFFLVGMPGLEYAHIWISIPICSMYLIAILGNCTILFIIKTEPSLHEP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::
CCDS31 MSIINTSYVEITTFFLVGMPGLEYAHIWISIPICSMYLIAILGNGTILFIIKTEPSLHEP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 MYYFLSMLAMSDLGLSLSSLPTVLSIFLFNAPEISSNACFAQEFFIHGFSVLESSVLLIM
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CCDS31 MYYFLSMLAMSDLGLSLSSLPTVLSIFLFNAPEISSNACFAQEFFIHGFSVLESSVLLIM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 SFDRFLAIHNPLRYTSILTTVRVAQIGIVFSFKSMLLVLPFPFTLRNLRYCKKNQLSHSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SFDRFLAIHNPLRYTSILTTVRVAQIGIVFSFKSMLLVLPFPFTLRNLRYCKKNQLSHSY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 CLHQDVMKLACSDNRIDVIYGFFGALCLMVDFILIAVSYTLILKTVLGIASKKEQLKALN
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CCDS31 CLHQDVMKLACSDNRIDVIYGFFGALCLMVDFILIAVSYTLILKTVLGIASKKEQLKALN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TCVSHICAVIIFYLPIINLAVVHRFARHVSPLINVLMANVLLLVPPLMNPIVYCVKTKQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS31 TCVSHICAVIIFYLPIINLAVVHRFARHVSPLINVLMANVLLLVPPLTNPIVYCVKTKQI
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 RVRVVAKLCQRKI
:::::::::::::
CCDS31 RVRVVAKLCQRKI
310
>>CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 (313 aa)
initn: 1945 init1: 1945 opt: 1945 Z-score: 1530.9 bits: 291.4 E(32554): 6e-79
Smith-Waterman score: 1945; 96.8% identity (98.1% similar) in 313 aa overlap (1-313:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSIINTSYVEITTFFLVGMPGLEYAHIWISIPICSMYLIAILGNCTILFIIKTEPSLHEP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::: :
CCDS31 MSIINTSYVEITTFFLVGMPGLEYAHIWISIPICSMYLIAILGNGTILFIIKTEPSLHGP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 MYYFLSMLAMSDLGLSLSSLPTVLSIFLFNAPEISSNACFAQEFFIHGFSVLESSVLLIM
::::::::::::::::::::::::::::::::: ::.:::::::::::::::::::::::
CCDS31 MYYFLSMLAMSDLGLSLSSLPTVLSIFLFNAPETSSSACFAQEFFIHGFSVLESSVLLIM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 SFDRFLAIHNPLRYTSILTTVRVAQIGIVFSFKSMLLVLPFPFTLRNLRYCKKNQLSHSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS31 SFDRFLAIHNPLRYTSILTTVRVAQIGIVFSFKSMLLVLPFPFTLRSLRYCKKNQLSHSY
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190 200 210 220 230 240
pF1KE5 CLHQDVMKLACSDNRIDVIYGFFGALCLMVDFILIAVSYTLILKTVLGIASKKEQLKALN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::.:::::
CCDS31 CLHQDVMKLACSDNRIDVIYGFFGALCLMVDFILIAVSYTLILKTVPGIASKKEELKALN
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pF1KE5 TCVSHICAVIIFYLPIINLAVVHRFARHVSPLINVLMANVLLLVPPLMNPIVYCVKTKQI
:::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS31 TCVSHICAVIIFYLPIINLAVVHRFAGHVSPLINVLMANVLLLVPPLMKPIVYCVKTKQI
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 RVRVVAKLCQRKI
:::::::::: ::
CCDS31 RVRVVAKLCQWKI
310
>>CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1531 init1: 1531 opt: 1549 Z-score: 1224.7 bits: 234.8 E(32554): 6.8e-62
Smith-Waterman score: 1549; 71.7% identity (91.4% similar) in 314 aa overlap (1-311:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSIINTSYVEITTFFLVGMPGLEYAHIWISIPICSMYLIAILGNCTILFIIKTEPSLHEP
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CCDS31 MSVLNNS--EVKLFLLIGIPGLEHAHIWFSIPICLMYLLAIMGNCTILFIIKTEPSLHEP
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70 80 90 100 110 120
pF1KE5 MYYFLSMLAMSDLGLSLSSLPTVLSIFLFNAPEISSNACFAQEFFIHGFSVLESSVLLIM
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CCDS31 MYYFLAMLAVSDMGLSLSSLPTMLRVFLFNAMGISPNACFAQEFFIHGFTVMESSVLLIM
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130 140 150 160 170 180
pF1KE5 SFDRFLAIHNPLRYTSILTTVRVAQIGIVFSFKSMLLVLPFPFTLRNLRYCKKNQLSHSY
:.::::::::::::.::::. :::..:......:.:::.::::::: :.::.:: :::::
CCDS31 SLDRFLAIHNPLRYSSILTSNRVAKMGLILAIRSILLVIPFPFTLRRLKYCQKNLLSHSY
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190 200 210 220 230 240
pF1KE5 CLHQDVMKLACSDNRIDVIYGFFGALCLMVDFILIAVSYTLILKTVLGIASKKEQLKALN
:::::.::::::::. .:::::: ::: :.:. ::..::.:::::.:.::: :.:::::
CCDS31 CLHQDTMKLACSDNKTNVIYGFFIALCTMLDLALIVLSYVLILKTILSIASLAERLKALN
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250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TCVSHICAVIIFYLPIINLAVVHRFARHVSPLINVLMANVLLLVPPLMNPIVYCVKTKQI
:::::::::. ::.:::.::..:.::.: :::. .:.:...::::::::::::::::.::
CCDS31 TCVSHICAVLTFYVPIITLAAMHHFAKHKSPLVVILIADMFLLVPPLMNPIVYCVKTRQI
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 RVRVVAKL---CQRKI
....:: : :
CCDS31 WEKILGKLLNVCGR
300 310
>>CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1228 init1: 827 opt: 1221 Z-score: 971.0 bits: 187.8 E(32554): 9.1e-48
Smith-Waterman score: 1221; 60.8% identity (81.9% similar) in 309 aa overlap (2-309:5-313)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSIINTSYVEITTFFLVGMPGLEYAHIWISIPICSMYLIAILGNCTILFIIKTEPSL
:. :.: .::.: :.:::: :::::::.: :::..: :::::::::::: ::
CCDS31 MTLGSLGNSSSSVSATFLLSGIPGLERMHIWISIPLCFMYLVSIPGNCTILFIIKTERSL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 HEPMYYFLSMLAMSDLGLSLSSLPTVLSIFLFNAPEISSNACFAQEFFIHGFSVLESSVL
::::: ::::::. :::::: .:::::.:: .: ::: .::::: :::: :: ::::::
CCDS31 HEPMYLFLSMLALIDLGLSLCTLPTVLGIFWVGAREISHDACFAQLFFIHCFSFLESSVL
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120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LIMSFDRFLAIHNPLRYTSILTTVRVAQIGIVFSFKSMLLVLPFPFTLRNLRYCKKNQLS
: :.::::.:: .::.:.::::.. ...::.: .:. :..:.:: :. . :: . ::
CCDS31 LSMAFDRFVAICHPLHYVSILTNTVIGRIGLVSLGRSVALIFPLPFMLKRFPYCGSPVLS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 HSYCLHQDVMKLACSDNRIDVIYGFFGALCLM-VDFILIAVSYTLILKTVLGIASKKEQL
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CCDS31 HSYCLHQEVMKLACADMKANSIYGMFVIVSTVGIDSLLILFSYALILRTVLSIASRAERF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 KALNTCVSHICAVIIFYLPIINLAVVHRFARHVSPLINVLMANVLLLVPPLMNPIVYCVK
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CCDS31 KALNTCVSHICAVLLFYTPMIGLSVIHRFGKQAPHLVQVVMGFMYLLFPPVMNPIVYSVK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 TKQIRVRVVAKLCQRKI
::::: ::. .:
CCDS31 TKQIRDRVTHAFCY
310
>>CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 1183 init1: 734 opt: 1180 Z-score: 939.3 bits: 182.0 E(32554): 5.3e-46
Smith-Waterman score: 1180; 54.7% identity (84.5% similar) in 309 aa overlap (5-312:6-313)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSIINTSYVEITTFFLVGMPGLEYAHIWISIPICSMYLIAILGNCTILFIIKTEPSLHE
:.. :: :.: :.:::::.: :.:: .: ::.:..:: ::: .: : :::.
CCDS31 MGDWNNSDAVE-PIFILRGFPGLEYVHSWLSILFCLAYLVAFMGNVTILSVIWIESSLHQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 PMYYFLSMLAMSDLGLSLSSLPTVLSIFLFNAPEISSNACFAQEFFIHGFSVLESSVLLI
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CCDS31 PMYYFISILAVNDLGMSLSTLPTMLAVLWLDAPEIQASACYAQLFFIHTFTFLESSVLLA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 MSFDRFLAIHNPLRYTSILTTVRVAQIGIVFSFKSMLLVLPFPFTLRNLRYCKKNQLSHS
:.::::.:: .::.: .:::. ...::.. ..:. .::: :. ::. .::. : :::.
CCDS31 MAFDRFVAICHPLHYPTILTNSVIGKIGLACLLRSLGVVLPTPLLLRHYHYCHGNALSHA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 YCLHQDVMKLACSDNRIDVIYGFFGALCLM-VDFILIAVSYTLILKTVLGIASKKEQLKA
.::::::..:.:.: : . :::. .. . :: :.: .::.:::.::: :::..:::::
CCDS31 FCLHQDVLRLSCTDARTNSIYGLCVVIATLGVDSIFILLSYVLILNTVLDIASREEQLKA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LNTCVSHICAVIIFYLPIINLAVVHRFARHVSPLINVLMANVLLLVPPLMNPIVYCVKTK
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CCDS31 LNTCVSHICVVLIFFVPVIGVSMVHRFGKHLSPIVHILMADIYLLLPPVLNPIVYSVRTK
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 QIRVRVVAKLCQRKI
:::. .. :. :.
CCDS31 QIRLGILHKFVLRRRF
300 310
>>CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 (317 aa)
initn: 1108 init1: 731 opt: 1107 Z-score: 882.8 bits: 171.5 E(32554): 7.5e-43
Smith-Waterman score: 1107; 53.0% identity (83.4% similar) in 302 aa overlap (1-301:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSIINTSYVEITTFFLVGMPGLEYAHIWISIPICSMYLIAILGNCTILFIIKTEPSLHEP
:: .... : :.:. .::.: .:::::::.: .: :.:.:: ::: .:.::::.:.
CCDS31 MSQVTNTTQEGIYFILTDIPGFEASHIWISIPVCCLYTISIMGNTTILTVIRTEPSVHQR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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CCDS31 CLHQDMIRLVCADIRLNSWYGFALALLIIIVDPLLIVISYTLILKNILGTATWAERLRAL
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CCDS31 IQWGMLNFLSLKNMHSR
310
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CCDS31 EERHKLFQTCISHICAVLVFYIPIISLTMVHRFGKHLSPVAHVLIGNIYILFPPLMNPII
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CCDS31 YSVKTQQIHTRMLRLFSLKRY
310 320
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