Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5985
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5985, 313 aa
1>>>pF1KE5985 313 - 313 aa - 313 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2678+/-0.0013; mu= 16.1697+/- 0.077
mean_var=153.6644+/-51.120, 0's: 0 Z-trim(101.9): 388 B-trim: 834 in 2/47
Lambda= 0.103464
statistics sampled from 6244 (6734) to 6244 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.547), E-opt: 0.2 (0.207), width: 16
Scan time: 1.640
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33799.1 OR5H15 gene_id:403274|Hs108|chr3 ( 313) 2045 318.0 6e-87
CCDS33797.1 OR5H1 gene_id:26341|Hs108|chr3 ( 313) 1955 304.6 6.6e-83
CCDS33798.1 OR5H14 gene_id:403273|Hs108|chr3 ( 310) 1751 274.1 9.6e-74
CCDS33800.1 OR5H6 gene_id:79295|Hs108|chr3 ( 325) 1653 259.5 2.5e-69
CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 1645 258.3 5.6e-69
CCDS33796.1 OR5AC2 gene_id:81050|Hs108|chr3 ( 309) 1229 196.2 2.7e-50
CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 ( 308) 1092 175.7 3.9e-44
CCDS33802.1 OR5K4 gene_id:403278|Hs108|chr3 ( 321) 1087 175.0 6.7e-44
CCDS33804.1 OR5K2 gene_id:402135|Hs108|chr3 ( 316) 1075 173.2 2.3e-43
CCDS33803.1 OR5K3 gene_id:403277|Hs108|chr3 ( 321) 1046 168.9 4.7e-42
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 991 160.7 1.4e-39
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 990 160.5 1.5e-39
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 978 158.8 5.4e-39
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 976 158.5 6.7e-39
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 965 156.8 2e-38
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 964 156.6 2.2e-38
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 961 156.2 3e-38
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 959 156.0 4e-38
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 957 155.6 4.7e-38
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 953 155.0 6.9e-38
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 949 154.4 1e-37
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 943 153.5 2e-37
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 940 153.1 2.7e-37
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 938 152.8 3.3e-37
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 931 151.7 6.8e-37
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 923 150.6 1.6e-36
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 919 149.9 2.3e-36
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 919 149.9 2.3e-36
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 919 149.9 2.3e-36
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 910 148.6 5.9e-36
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 910 148.6 6e-36
CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 ( 309) 905 147.8 9.9e-36
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 902 147.4 1.4e-35
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 899 147.0 1.9e-35
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 897 146.6 2.3e-35
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 896 146.5 2.5e-35
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 896 146.5 2.5e-35
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 893 146.1 3.7e-35
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 890 145.6 4.7e-35
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 889 145.4 5.2e-35
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 881 144.3 1.2e-34
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 876 143.5 2e-34
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 876 143.5 2e-34
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 875 143.4 2.3e-34
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 874 143.2 2.5e-34
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 874 143.3 2.6e-34
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 873 143.1 2.7e-34
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 871 142.8 3.3e-34
CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 868 142.3 4.5e-34
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 861 141.3 9.6e-34
>>CCDS33799.1 OR5H15 gene_id:403274|Hs108|chr3 (313 aa)
initn: 2045 init1: 2045 opt: 2045 Z-score: 1674.5 bits: 318.0 E(32554): 6e-87
Smith-Waterman score: 2045; 100.0% identity (100.0% similar) in 313 aa overlap (1-313:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLGLIAVIWKDPHLHIPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLGLIAVIWKDPHLHIPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LLLGNLAFVDAWISSTVTPKMLNNFLAKSKMISLSECKIQFFSIAIGVTTECFLLATMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LLLGNLAFVDAWISSTVTPKMLNNFLAKSKMISLSECKIQFFSIAIGVTTECFLLATMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICKPLLYPAIMTNGLCIRLLILSYIAGILHALIHEGFLFRLTFCNSNIVHHIYCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DRYVAICKPLLYPAIMTNGLCIRLLILSYIAGILHALIHEGFLFRLTFCNSNIVHHIYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TIPLSKISCTDSSINFLMVFIFSGSIQVFSIVTILISYTFVLFTVLEKKSDKGVRKAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TIPLSKISCTDSSINFLMVFIFSGSIQVFSIVTILISYTFVLFTVLEKKSDKGVRKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CGAHLFSVCLYYGPLLLMYVGPASPQADGQNMVEPLFYTVIIPLLNPIIYSLRNKQVIVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CGAHLFSVCLYYGPLLLMYVGPASPQADGQNMVEPLFYTVIIPLLNPIIYSLRNKQVIVS
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 FIKMLKRNVKVSY
:::::::::::::
CCDS33 FIKMLKRNVKVSY
310
>>CCDS33797.1 OR5H1 gene_id:26341|Hs108|chr3 (313 aa)
initn: 1955 init1: 1955 opt: 1955 Z-score: 1601.9 bits: 304.6 E(32554): 6.6e-83
Smith-Waterman score: 1955; 94.6% identity (98.7% similar) in 313 aa overlap (1-313:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLGLIAVIWKDPHLHIPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLGLIAVIWKDPHLHIPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LLLGNLAFVDAWISSTVTPKMLNNFLAKSKMISLSECKIQFFSIAIGVTTECFLLATMAY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::
CCDS33 LLLGNLAFVDAWISSTVTPKMLNNFLAKSKMISLSECKIQFFSFAISVTTECFLLATMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICKPLLYPAIMTNGLCIRLLILSYIAGILHALIHEGFLFRLTFCNSNIVHHIYCD
:::::::::::::::::::::::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DRYVAICKPLLYPAIMTNGLCIRLLILSYVGGILHALIHEGFLFRLTFCNSNIVHHIYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TIPLSKISCTDSSINFLMVFIFSGSIQVFSIVTILISYTFVLFTVLEKKSDKGVRKAFST
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::..:.:::::::::::::
CCDS33 TIPLSKISCTDSSINFLMVFIFSGSIQVFSIVTILVSYTFVLFAILKKKSDKGVRKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CGAHLFSVCLYYGPLLLMYVGPASPQADGQNMVEPLFYTVIIPLLNPIIYSLRNKQVIVS
:::::::: :::::::..:::::::::: :.:::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS33 CGAHLFSVSLYYGPLLFIYVGPASPQADDQDMVEPLFYTVIIPLLNPIIYSLRNKQVTVS
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 FIKMLKRNVKVSY
: ::::..:::::
CCDS33 FTKMLKKHVKVSY
310
>>CCDS33798.1 OR5H14 gene_id:403273|Hs108|chr3 (310 aa)
initn: 1751 init1: 1751 opt: 1751 Z-score: 1437.4 bits: 274.1 E(32554): 9.6e-74
Smith-Waterman score: 1751; 86.4% identity (95.1% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLGLIAVIWKDPHLHIPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLGLIAVIWKDPHLHIPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LLLGNLAFVDAWISSTVTPKMLNNFLAKSKMISLSECKIQFFSIAIGVTTECFLLATMAY
::::::::::: .::.:: ::: :::::::::::::::::.::.::.:::::::::::::
CCDS33 LLLGNLAFVDALLSSSVTLKMLINFLAKSKMISLSECKIQLFSFAISVTTECFLLATMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICKPLLYPAIMTNGLCIRLLILSYIAGILHALIHEGFLFRLTFCNSNIVHHIYCD
:::::::::::::::::::::::::::::..:.::::::::::::::::::::..:.:::
CCDS33 DRYVAICKPLLYPAIMTNGLCIRLLILSYVGGLLHALIHEGFLFRLTFCNSNIIQHFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TIPLSKISCTDSSINFLMVFIFSGSIQVFSIVTILISYTFVLFTVLEKKSDKGVRKAFST
::: ::: :::::::::::::.::::::.: :.:::: :::.:.:.::: ::.::::::
CCDS33 IIPLLKISYTDSSINFLMVFIFAGSIQVFTIGTVLISYIFVLYTILKKKSVKGMRKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CGAHLFSVCLYYGPLLLMYVGPASPQADGQNMVEPLFYTVIIPLLNPIIYSLRNKQVIVS
:::::.:: :::::: .::.: :::::: :.:.: ::::::.:::::.::::::::::.:
CCDS33 CGAHLLSVSLYYGPLAFMYMGSASPQADDQDMMESLFYTVIVPLLNPMIYSLRNKQVIAS
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 FIKMLKRNVKVSY
: ::.:::
CCDS33 FTKMFKRNDV
310
>>CCDS33800.1 OR5H6 gene_id:79295|Hs108|chr3 (325 aa)
initn: 1653 init1: 1653 opt: 1653 Z-score: 1358.1 bits: 259.5 E(32554): 2.5e-69
Smith-Waterman score: 1653; 81.2% identity (92.9% similar) in 309 aa overlap (1-309:17-325)
10 20 30 40
pF1KE5 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLG
::::::::::::::::::.::. :::::::::::::::::::::
CCDS33 MFLYLCFIFQRTCSEEMEEENATLLTEFVLTGFLHQPDCKIPLFLAFLVIYLITIMGNLG
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 LIAVIWKDPHLHIPMYLLLGNLAFVDAWISSTVTPKMLNNFLAKSKMISLSECKIQFFSI
::..:::::::::::::.::.:::::: .::::::::: :::::::::::::: .::::.
CCDS33 LIVLIWKDPHLHIPMYLFLGSLAFVDASLSSTVTPKMLINFLAKSKMISLSECMVQFFSL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 AIGVTTECFLLATMAYDRYVAICKPLLYPAIMTNGLCIRLLILSYIAGILHALIHEGFLF
. ::::::::::::::::::::: ::::.:::: :::.::.::.:.:.:::::::.: :
CCDS33 VTTVTTECFLLATMAYDRYVAICKALLYPVIMTNELCIQLLVLSFIGGLLHALIHEAFSF
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 RLTFCNSNIVHHIYCDTIPLSKISCTDSSINFLMVFIFSGSIQVFSIVTILISYTFVLFT
:::::::::..:.::: ::: :::::::::::::::::.::.:::.: :::::::..:::
CCDS33 RLTFCNSNIIQHFYCDIIPLLKISCTDSSINFLMVFIFAGSVQVFTIGTILISYTIILFT
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 VLEKKSDKGVRKAFSTCGAHLFSVCLYYGPLLLMYVGPASPQADGQNMVEPLFYTVIIPL
.::::: ::.::: :::::::.:: :::::: . :.: :::::: :.:.: ::::::.::
CCDS33 ILEKKSIKGIRKAVSTCGAHLLSVSLYYGPLTFKYLGSASPQADDQDMMESLFYTVIVPL
250 260 270 280 290 300
290 300 310
pF1KE5 LNPIIYSLRNKQVIVSFIKMLKRNVKVSY
:::.::::::::::.:: ::.: ::
CCDS33 LNPMIYSLRNKQVIASFTKMFKSNV
310 320
>>CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 (314 aa)
initn: 1645 init1: 1645 opt: 1645 Z-score: 1351.8 bits: 258.3 E(32554): 5.6e-69
Smith-Waterman score: 1645; 78.6% identity (93.9% similar) in 309 aa overlap (1-309:6-314)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLGLIAVIWKDPHL
::..:.::::::::::. :::.::.::::.:::::::::. ::::::.::.::.:
CCDS33 MSNEDMEQDNTTLLTEFVLTGLTYQPEWKMPLFLVFLVIYLITIVWNLGLIALIWNDPQL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 HIPMYLLLGNLAFVDAWISSTVTPKMLNNFLAKSKMISLSECKIQFFSIAIGVTTECFLL
:::::..::.::::::::::::::::: :::::..::::::: :::::.:.: :::::::
CCDS33 HIPMYFFLGSLAFVDAWISSTVTPKMLVNFLAKNRMISLSECMIQFFSFAFGGTTECFLL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 ATMAYDRYVAICKPLLYPAIMTNGLCIRLLILSYIAGILHALIHEGFLFRLTFCNSNIVH
::::::::::::::::::.::.:.:::::: .:...:.::::::: ..::::::::::.:
CCDS33 ATMAYDRYVAICKPLLYPVIMNNSLCIRLLAFSFLGGFLHALIHEVLIFRLTFCNSNIIH
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 HIYCDTIPLSKISCTDSSINFLMVFIFSGSIQVFSIVTILISYTFVLFTVLEKKSDKGVR
:.::: ::: ::::: :::::::::.:::::::.:::.: ::::.:::.:.::: .:::
CCDS33 HFYCDIIPLFMISCTDPSINFLMVFILSGSIQVFTIVTVLNSYTFALFTILKKKSVRGVR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 KAFSTCGAHLFSVCLYYGPLLLMYVGPASPQADGQNMVEPLFYTVIIPLLNPIIYSLRNK
::::::::::.:: ::::::..::. ::::::: :.:.. .:::.:::::::::::::::
CCDS33 KAFSTCGAHLLSVSLYYGPLIFMYLRPASPQADDQDMIDSVFYTIIIPLLNPIIYSLRNK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 QVIVSFIKMLKRNVKVSY
::: :: ::.::::
CCDS33 QVIDSFTKMVKRNV
310
>>CCDS33796.1 OR5AC2 gene_id:81050|Hs108|chr3 (309 aa)
initn: 1213 init1: 1213 opt: 1229 Z-score: 1016.3 bits: 196.2 E(32554): 2.7e-50
Smith-Waterman score: 1229; 59.3% identity (83.4% similar) in 307 aa overlap (1-307:3-309)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEEENATLLTEFVLTGFLYQPQWKIPLFLAFLVIYLITIMGNLGLIAVIWKDPHLHIP
. : : ::.:::::::. .: .. .:..:::.::::..::::::..::.:::::.:
CCDS33 MDISEGNKTLVTEFVLTGLTDRPWLHVLFFVVFLVVYLITMVGNLGLIVLIWNDPHLHMP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 MYLLLGNLAFVDAWISSTVTPKMLNNFLAKSKMISLSECKIQFFSIAIGVTTECFLLATM
:::.::.::: :: :...::.:: ::: :. ::::.:: ::. .: ..:::::::. :
CCDS33 MYLFLGGLAFSDACTSTSITPRMLVNFLDKTAMISLAECITQFYFFASSATTECFLLVMM
70 80 90 100 110 120
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CCDS33 CEILQLFKISCNGPSINALMIFIFGAFIQIPTLMTIIISYTRVLFDILKKKSEKGRSKAF
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CCDS33 STCGAHLLSVSLYYGTLIFMYVRPASGLAEDQDKVYSLFYTIIIPLLNPFIYSLRNKKVM
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CCDS33 HALRRVIRK
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CCDS43 LRKILMKK
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CCDS33 CASHFLSVSIFY-ICLLMYIGP-SEEGDKDTPVA-IFYAIVIPLLNPFIYSLRNKEVI-N
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CCDS33 MVEENHTMKNEFILTGFTDHPELKTLLFVVFFAIYLITVVGNISLVALIFTHCRLHTPMY
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CCDS33 TLPLYRLSCVDPFINELVLFIFSGSVQVFTIGSVLISYLYILLTIFRMKSKEGRAKAFST
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CCDS33 LRKILLKIKSQGSVNK
310
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]