Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5983
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5983, 313 aa
1>>>pF1KE5983 313 - 313 aa - 313 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7123+/-0.00141; mu= 13.3026+/- 0.082
mean_var=123.8824+/-39.673, 0's: 0 Z-trim(100.3): 386 B-trim: 725 in 2/43
Lambda= 0.115231
statistics sampled from 5567 (6051) to 5567 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.509), E-opt: 0.2 (0.186), width: 16
Scan time: 1.620
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 2016 347.3 8.9e-96
CCDS31512.1 OR5D16 gene_id:390144|Hs108|chr11 ( 328) 1646 285.8 3e-77
CCDS31508.1 OR5D14 gene_id:219436|Hs108|chr11 ( 314) 1455 254.1 1.1e-67
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 1235 217.5 1.1e-56
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 1178 208.0 7.7e-54
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 1091 193.5 1.7e-49
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1081 191.9 5.5e-49
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1070 190.0 1.9e-48
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 1065 189.2 3.5e-48
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 1060 188.4 6.2e-48
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 1059 188.2 6.9e-48
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 1056 187.7 9.8e-48
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 1051 186.9 1.7e-47
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 1051 186.9 1.8e-47
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 1048 186.4 2.5e-47
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1047 186.2 2.8e-47
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 1047 186.2 2.8e-47
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 1045 185.9 3.5e-47
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 1033 184.0 1.5e-46
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 1031 183.6 1.7e-46
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 1031 183.6 1.8e-46
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 1025 182.6 3.5e-46
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 1025 182.6 3.6e-46
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 1024 182.4 3.9e-46
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 1022 182.1 5.2e-46
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 1020 181.8 6.4e-46
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 1013 180.6 1.5e-45
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 1010 180.1 2e-45
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 1009 179.9 2.2e-45
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 1005 179.3 3.9e-45
CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11 ( 310) 1002 178.7 4.9e-45
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 1002 178.8 5e-45
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 998 178.1 7.9e-45
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 996 177.8 9.9e-45
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 995 177.6 1.2e-44
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 983 175.6 4.4e-44
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 983 175.6 4.4e-44
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 980 175.1 6.3e-44
CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 ( 309) 978 174.8 7.8e-44
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 977 174.6 8.9e-44
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 976 174.4 9.9e-44
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 974 174.1 1.2e-43
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 973 173.9 1.4e-43
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 965 172.6 3.5e-43
CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 961 171.9 5.5e-43
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 958 171.4 7.9e-43
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 958 171.4 7.9e-43
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 956 171.1 9.9e-43
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 955 170.9 1.1e-42
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 954 170.8 1.3e-42
>>CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 (313 aa)
initn: 2016 init1: 2016 opt: 2016 Z-score: 1833.0 bits: 347.3 E(32554): 8.9e-96
Smith-Waterman score: 2016; 99.4% identity (100.0% similar) in 313 aa overlap (1-313:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLLTDRNTSGTTFTLLGFSDYPELQVPLFLVFLAIYNVTVLGNIGLIVIIKINPKLHTPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MLLTDRNTSGTTFTLLGFSDYPELQVPLFLVFLAIYNVTVLGNIGLIVIIKINPKLHTPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YFFLSQLSFVDFCYSSIIAPKMLVNLVVKDRTISFLGCVVQFFFFCTFVVTESFLLAVMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YFFLSQLSFVDFCYSSIIAPKMLVNLVVKDRTISFLGCVVQFFFFCTFVVTESFLLAVMA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YDRFVAICNPLLYTVDMSQKLCVLLVVGSYAWGVSCSLELTCSALKLCFHGFNTINHFFC
:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YDRFVAICNPLLYTVNMSQKLCVLLVVGSYAWGVSCSLELTCSALKLCFHGFNTINHFFC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 EFSSLLSLSCSDTYINQWLLFFLATFNEISTLLIVLTSYAFIVVTILKMRSVSGRRKAFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EFSSLLSLSCSDTYINQWLLFFLATFNEISTLLIVLTSYAFIVVTILKMRSVSGRRKAFS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TCASHLTAITIFHGTILFLYCVPNSKNSRRTVKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKDVKD
:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TCASHLTAITIFHGTILFLYCVPNSKNSRHTVKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKDVKD
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 TVTEILDTKVFSY
:::::::::::::
CCDS31 TVTEILDTKVFSY
310
>>CCDS31512.1 OR5D16 gene_id:390144|Hs108|chr11 (328 aa)
initn: 1689 init1: 1624 opt: 1646 Z-score: 1500.3 bits: 285.8 E(32554): 3e-77
Smith-Waterman score: 1646; 80.1% identity (93.9% similar) in 312 aa overlap (1-311:1-312)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLLTDRNTSG-TTFTLLGFSDYPELQVPLFLVFLAIYNVTVLGNIGLIVIIKINPKLHTP
:.::.:::.. .:::::::::: :::.:::.::::.:. .:.::.:.:::::::::::::
CCDS31 MFLTERNTTSEATFTLLGFSDYLELQIPLFFVFLAVYGFSVVGNLGMIVIIKINPKLHTP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 MYFFLSQLSFVDFCYSSIIAPKMLVNLVVKDRTISFLGCVVQFFFFCTFVVTESFLLAVM
:::::..:::::::::::::: :::::::.:::::: ::.::::::::::::: .:.:::
CCDS31 MYFFLNHLSFVDFCYSSIIAPMMLVNLVVEDRTISFSGCLVQFFFFCTFVVTELILFAVM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 AYDRFVAICNPLLYTVDMSQKLCVLLVVGSYAWGVSCSLELTCSALKLCFHGFNTINHFF
:::.:::::::::::: .:::::..::: :::::.::: :.:::::: :::::::::::
CCDS31 AYDHFVAICNPLLYTVAISQKLCAMLVVVLYAWGVACSLTLACSALKLSFHGFNTINHFF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 CEFSSLLSLSCSDTYINQWLLFFLATFNEISTLLIVLTSYAFIVVTILKMRSVSGRRKAF
::.:::.::: :.:..: ::: .:::::::::::.:::::::.:: ::: :.::.::.:
CCDS31 CELSSLISLSYPDSYLSQLLLFTVATFNEISTLLIILTSYAFIIVTTLKMPSASGHRKVF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 STCASHLTAITIFHGTILFLYCVPNSKNSRRTVKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKDVK
::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS31 STCASHLTAITIFHGTILFLYCVPNSKNSRHTVKVASVFYTVVIPLLNPLIYSLRNKDVK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 DTVTEILDTKVFSY
:.. .:..:: :
CCDS31 DAIRKIINTKYFHIKHRHWYPFNFVIEQ
310 320
>>CCDS31508.1 OR5D14 gene_id:219436|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1466 init1: 1444 opt: 1455 Z-score: 1328.9 bits: 254.1 E(32554): 1.1e-67
Smith-Waterman score: 1455; 71.1% identity (88.4% similar) in 311 aa overlap (1-310:1-311)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLLTDRNTSGT-TFTLLGFSDYPELQVPLFLVFLAIYNVTVLGNIGLIVIIKINPKLHTP
:... :: : ::.::::.:::.::.::::::: .: .::.::.:.:.:::::::.:::
CCDS31 MMMVLRNLSMEPTFALLGFTDYPKLQIPLFLVFLLMYVITVVGNLGMIIIIKINPKFHTP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 MYFFLSQLSFVDFCYSSIIAPKMLVNLVVKDRTISFLGCVVQFFFFCTFVVTESFLLAVM
::::::.:::::::::::..::.: :::. :..: ...:..:.:. :: :::::::::::
CCDS31 MYFFLSHLSFVDFCYSSIVTPKLLENLVMADKSIFYFSCMMQYFLSCTAVVTESFLLAVM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 AYDRFVAICNPLLYTVDMSQKLCVLLVVGSYAWGVSCSLELTCSALKLCFHGFNTINHFF
:::::::::::::::: :::.::.:::.::: ::. : : : ::.: : : :.:::::
CCDS31 AYDRFVAICNPLLYTVAMSQRLCALLVAGSYLWGMFGPLVLLCYALRLNFSGPNVINHFF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 CEFSSLLSLSCSDTYINQWLLFFLATFNEISTLLIVLTSYAFIVVTILKMRSVSGRRKAF
::...:.:.: :: : . ::: .:::::. ::::.::::.:: ::.::.::::::.:::
CCDS31 CEYTALISVSGSDILIPHLLLFSFATFNEMCTLLIILTSYVFIFVTVLKIRSVSGRHKAF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 STCASHLTAITIFHGTILFLYCVPNSKNSRRTVKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKDVK
:: :::::.:::::::::::::::::::::.:::::::::::: ::::::::::::::::
CCDS31 STWASHLTSITIFHGTILFLYCVPNSKNSRQTVKVASVFYTVVNPMLNPLIYSLRNKDVK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 DTVTEILDTKVFSY
:. ... :.:
CCDS31 DAFWKLIHTQVPFH
310
>>CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1254 init1: 1226 opt: 1235 Z-score: 1131.3 bits: 217.5 E(32554): 1.1e-56
Smith-Waterman score: 1235; 62.3% identity (84.3% similar) in 305 aa overlap (8-312:7-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLLTDRNTSGTTFTLLGFSDYPELQVPLFLVFLAIYNVTVLGNIGLIVIIKINPKLHTPM
:. . : :::.:: :::.: :::.:: ::.::.:.:.:. ..:... .::::.
CCDS31 MGKENCTTVAEFILLGLSDVPELRVCLFLLFLLIYGVTLLANLGMTALIQVSSRLHTPV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YFFLSQLSFVDFCYSSIIAPKMLVNLVVKDRTISFLGCVVQFFFFCTFVVTESFLLAVMA
:::::.::::::::::::.::::.:. ::..::::::.:::..::: ::: :::::::
CCDS31 YFFLSHLSFVDFCYSSIIVPKMLANIFNKDKAISFLGCMVQFYLFCTCGVTEVFLLAVMA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YDRFVAICNPLLYTVDMSQKLCVLLVVGSYAWGVSCSLELTCSALKLCFHGFNTINHFFC
::::::::::::: : ::::: : :. : :. ::: . ::.. :. :.::::::
CCDS31 YDRFVAICNPLLYMVTMSQKLRVELTSCCYFCGTVCSLIHSSLALRILFYRSNVINHFFC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 EFSSLLSLSCSDTYINQWLLFFLATFNEISTLLIVLTSYAFIVVTILKMRSVSGRRKAFS
.. ::::.:::. .:. :::..::.:: :..:.:::: .:..::::..:. .:.::::
CCDS31 DLPPLLSLACSDVTVNETLLFLVATLNESVTIMIILTSYLLILTTILKIHSAESRHKAFS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TCASHLTAITIFHGTILFLYCVPNSKNSRRTVKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKDVKD
::::::::::. :::::..:: :.: :: . :::.::::::::::::::::::::::.
CCDS31 TCASHLTAITVSHGTILYIYCRPSSGNSGDVDKVATVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKDVNK
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 TVTEILDTKVFSY
.. ... .:. :
CCDS31 ALRKVMGSKIHS
300 310
>>CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1160 init1: 1160 opt: 1178 Z-score: 1080.0 bits: 208.0 E(32554): 7.7e-54
Smith-Waterman score: 1178; 57.6% identity (80.7% similar) in 311 aa overlap (1-310:1-311)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLLTDRN-TSGTTFTLLGFSDYPELQVPLFLVFLAIYNVTVLGNIGLIVIIKINPKLHTP
: .:::: : : : :::: ::::. :::.::..: . ..:::::...:.:.:.:.::
CCDS79 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 MYFFLSQLSFVDFCYSSIIAPKMLVNLVVKDRTISFLGCVVQFFFFCTFVVTESFLLAVM
::::::.:::::.:: : :.::::::.. ....::. ::..::.:::::. ::::.::.:
CCDS79 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 AYDRFVAICNPLLYTVDMSQKLCVLLVVGSYAWGVSCSLELTCSALKLCFHGFNTINHFF
::::.::::::::::: ::. .:. :.: :: : :: : :. : . :.:::::
CCDS79 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 CEFSSLLSLSCSDTYINQWLLFFLATFNEISTLLIVLTSYAFIVVTILKMRSVSGRRKAF
:.. ::.:::.:: ::.::: .. :: ..:.. :: ::....::.:: :::.:.:
CCDS79 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 STCASHLTAITIFHGTILFLYCVPNSKNSRRTVKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKDVK
::::::::..::..::.::.: :. : : :. :::::. ::.::::::::::::::
CCDS79 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 DTVTEILDTKVFSY
:.. ..: .::
CCDS79 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 (308 aa)
initn: 1140 init1: 1072 opt: 1091 Z-score: 1002.0 bits: 193.5 E(32554): 1.7e-49
Smith-Waterman score: 1091; 55.4% identity (80.0% similar) in 305 aa overlap (3-306:1-305)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLLTDRNTS-GTTFTLLGFSDYPELQVPLFLVFLAIYNVTVLGNIGLIVIIKINPKLHTP
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CCDS31 MTMENYSMAAQFVLDGLTQQAELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMILLIAVSPLLHTP
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CCDS31 MYYFLSSLSFVDFCYSSVITPKMLVNFLGKKNTILYSECMVQLFFFVVFVVAEGYLLTAM
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CCDS31 AYDRYVAICSPLLYNAIMSSWVCSLLVLAAFFLGFLSALTHTSAMMKLSFCKSHIINHYF
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CCDS31 CDVLPLLNLSCSNTHLNELLLFIIAGFNTLVPTLAVAVSYAFILYSILHIRSSEGRSKAF
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CCDS31 GTCSSHLMAVVIFFGSITFMYFKPPSSNSLDQEKVSSVFYTTVIPMLNPLIYSLRNKDVK
240 250 260 270 280 290
300 310
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.. ..:
CCDS31 KALRKVLVGK
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CCDS31 MENNTEVTEFILVGLTDDPELQIPLFIVFLFIYLITLVGNLGMIELILLDSCLHTPM
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CCDS31 AFKKTVGKAKASIGFIF
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CCDS31 YDRHAAVCRPLHYTTTMTAGVCALLATGSYVSGFLNASIHAAGTFRLSFCGSNEINHFFC
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CCDS31 ALWKILNKLYPQY
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CCDS31 CDRYVAICSPLLYRVIMSPRVCSLLVAAVFSVGFTDAVIHGGCILRLSFCGSNIIKHYFC
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CCDS31 DIVPLIKLSCSSTYIDELLIFVIGGFNMVATSLTIIISYAFILTSILRIHSKKGRCKAFS
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CCDS31 TCSSHLTAVLMFYGSLMSMYLKPASSSSLTQEKVSSVFYTTVILMLNPLIYSLRNNEVRN
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CCDS31 ALMKLLRRKISLSPG
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CCDS31 YFFLSHLSFCDLCYSTATGPKMLVDLLAKNKSIPFYGCALQFLVFCIFADSECLLLSVMA
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]