Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5982
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5982, 313 aa
1>>>pF1KE5982 313 - 313 aa - 313 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4575+/-0.00128; mu= 14.5607+/- 0.074
mean_var=148.4713+/-47.657, 0's: 0 Z-trim(101.9): 370 B-trim: 375 in 1/49
Lambda= 0.105257
statistics sampled from 6285 (6721) to 6285 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.546), E-opt: 0.2 (0.206), width: 16
Scan time: 1.700
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 ( 313) 2049 323.9 1e-88
CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 1924 304.9 5.3e-83
CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 ( 308) 1304 210.7 1.2e-54
CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 ( 307) 1268 205.3 5.1e-53
CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 ( 316) 1243 201.5 7.2e-52
CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 1144 186.4 2.4e-47
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 1127 183.9 1.4e-46
CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 ( 310) 1124 183.4 2e-46
CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 1093 178.7 5.1e-45
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 1091 178.4 6.3e-45
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 1091 178.4 6.3e-45
CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 ( 307) 1084 177.3 1.3e-44
CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 ( 314) 1081 176.9 1.8e-44
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 1072 175.5 4.7e-44
CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 ( 348) 1063 174.2 1.3e-43
CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 ( 309) 1059 173.5 1.8e-43
CCDS31563.1 OR4D11 gene_id:219986|Hs108|chr11 ( 311) 1046 171.6 7.2e-43
CCDS32343.1 OR4F4 gene_id:26682|Hs108|chr15 ( 305) 1044 171.2 8.8e-43
CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 ( 305) 1033 169.6 2.8e-42
CCDS30547.1 OR4F5 gene_id:79501|Hs108|chr1 ( 305) 1029 169.0 4.3e-42
CCDS53636.1 OR4D10 gene_id:390197|Hs108|chr11 ( 311) 1029 169.0 4.3e-42
CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15 ( 312) 1027 168.7 5.3e-42
CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 ( 314) 1025 168.4 6.6e-42
CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 ( 343) 1022 168.0 9.6e-42
CCDS72675.1 OR4F29 gene_id:729759|Hs108|chr1 ( 312) 1014 166.7 2.1e-41
CCDS43415.1 OR4F3 gene_id:26683|Hs108|chr5 ( 312) 1014 166.7 2.1e-41
CCDS41221.1 OR4F16 gene_id:81399|Hs108|chr1 ( 312) 1014 166.7 2.1e-41
CCDS32342.1 OR4F15 gene_id:390649|Hs108|chr15 ( 312) 1013 166.5 2.3e-41
CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11 ( 314) 1013 166.5 2.3e-41
CCDS34792.1 OR4F21 gene_id:441308|Hs108|chr8 ( 312) 1010 166.1 3.2e-41
CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 ( 309) 1009 165.9 3.5e-41
CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 ( 309) 1008 165.8 3.9e-41
CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 ( 344) 1002 164.9 7.9e-41
CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 ( 304) 993 163.5 1.9e-40
CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 ( 370) 991 163.3 2.6e-40
CCDS31487.1 OR4X1 gene_id:390113|Hs108|chr11 ( 305) 985 162.3 4.4e-40
CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11 ( 309) 984 162.1 4.9e-40
CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11 ( 329) 979 161.4 8.6e-40
CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11 ( 309) 976 160.9 1.1e-39
CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 ( 309) 963 158.9 4.5e-39
CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 ( 310) 958 158.2 7.6e-39
CCDS32029.1 OR4L1 gene_id:122742|Hs108|chr14 ( 312) 958 158.2 7.6e-39
CCDS31504.1 OR4P4 gene_id:81300|Hs108|chr11 ( 312) 950 157.0 1.8e-38
CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 ( 323) 949 156.8 2e-38
CCDS32047.1 OR10G2 gene_id:26534|Hs108|chr14 ( 310) 935 154.7 8.6e-38
CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 ( 309) 926 153.3 2.2e-37
CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11 ( 315) 925 153.2 2.5e-37
CCDS31705.1 OR10G7 gene_id:390265|Hs108|chr11 ( 311) 912 151.2 9.6e-37
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 901 149.5 3.1e-36
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 892 148.2 8.1e-36
>>CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 (313 aa)
initn: 2049 init1: 2049 opt: 2049 Z-score: 1706.2 bits: 323.9 E(32554): 1e-88
Smith-Waterman score: 2049; 100.0% identity (100.0% similar) in 313 aa overlap (1-313:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 METANYTKVTEFVLTGLSQTPEVQLVLFVIFLSFYLFILPGNILIICTISLDPHLTSPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 METANYTKVTEFVLTGLSQTPEVQLVLFVIFLSFYLFILPGNILIICTISLDPHLTSPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLANLAFLDIWYSSITAPEMLIDFFVERKIISFDGCIAQLFFLHFAGASEMFLLTVMAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FLLANLAFLDIWYSSITAPEMLIDFFVERKIISFDGCIAQLFFLHFAGASEMFLLTVMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DLYTAICRPLHYATIMNQRLCCILVALSWRGGFIHSIIQVALIVRLPFCGPNELDSYFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DLYTAICRPLHYATIMNQRLCCILVALSWRGGFIHSIIQVALIVRLPFCGPNELDSYFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ITQVVRIACANTFPEELVMICSSGLISVVCLIALLMSYAFLLALFKKLSGSGENTNRAMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ITQVVRIACANTFPEELVMICSSGLISVVCLIALLMSYAFLLALFKKLSGSGENTNRAMS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TCYSHITIVVLMFGPSIYIYARPFDSFSLDKVVSVFNTLIFPLRNPIIYTLRNKEVKAAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TCYSHITIVVLMFGPSIYIYARPFDSFSLDKVVSVFNTLIFPLRNPIIYTLRNKEVKAAM
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 RKLVTKYILCKEK
:::::::::::::
CCDS32 RKLVTKYILCKEK
310
>>CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 (313 aa)
initn: 1924 init1: 1924 opt: 1924 Z-score: 1603.6 bits: 304.9 E(32554): 5.3e-83
Smith-Waterman score: 1924; 93.9% identity (97.8% similar) in 313 aa overlap (1-313:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 METANYTKVTEFVLTGLSQTPEVQLVLFVIFLSFYLFILPGNILIICTISLDPHLTSPMY
:::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::
CCDS32 METANYTKVTEFVLTGLSQTREVQLVLFVIFLSFYLFILPGNILIICTIRLDPHLTSPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLANLAFLDIWYSSITAPEMLIDFFVERKIISFDGCIAQLFFLHFAGASEMFLLTVMAF
:::::::.:::::::::::.:::::::::::::: :::::::::::.::::::::::::.
CCDS32 FLLANLALLDIWYSSITAPKMLIDFFVERKIISFGGCIAQLFFLHFVGASEMFLLTVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DLYTAICRPLHYATIMNQRLCCILVALSWRGGFIHSIIQVALIVRLPFCGPNELDSYFCD
: :.:::::::::::::.::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DRYAAICRPLHYATIMNRRLCCILVALSWMGGFIHSIIQVALIVRLPFCGPNELDSYFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ITQVVRIACANTFPEELVMICSSGLISVVCLIALLMSYAFLLALFKKLSGSGENTNRAMS
::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.:: ::::::::::::
CCDS32 ITQVVRIACANTFPEELVMICSSGLISVVCFIALLMSYAFLLALLKKHSGSGENTNRAMS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TCYSHITIVVLMFGPSIYIYARPFDSFSLDKVVSVFNTLIFPLRNPIIYTLRNKEVKAAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::: ::::::::::::::::
CCDS32 TCYSHITIVVLMFGPSIYIYARPFDSFSLDKVVSVFHTVIFPLLNPIIYTLRNKEVKAAM
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 RKLVTKYILCKEK
::.:::::::.::
CCDS32 RKVVTKYILCEEK
310
>>CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 (308 aa)
initn: 1294 init1: 980 opt: 1304 Z-score: 1094.9 bits: 210.7 E(32554): 1.2e-54
Smith-Waterman score: 1304; 60.3% identity (85.5% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 METANYTKVTEFVLTGLSQTPEVQLVLFVIFLSFYLFILPGNILIICTISLDPHLTSPMY
::: : : ::::.: ::.:. ..::..::. : :::.:::::.::: ::. :: ::.:.:
CCDS32 METQNLTVVTEFILLGLTQSQDAQLLVFVLVLIFYLIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAPLY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLANLAFLDIWYSSITAPEMLIDFFVERKIISFDGCIAQLFFLHFAGASEMFLLTVMAF
:.:.:::.:: :: :..:.::.::. :.:.::. .::.::::::: ::.:::::.::::
CCDS32 FFLGNLALLDASYSFIVVPRMLVDFLSEKKVISYRSCITQLFFLHFLGAGEMFLLVVMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DLYTAICRPLHYATIMNQRLCCILVALSWRGGFIHSIIQVALIVRLPFCGPNELDSYFCD
: : ::::::::.:::: : : : . : :::::::.:::::..:::::::.::..:::
CCDS32 DRYIAICRPLHYSTIMNPRACYALSLVLWLGGFIHSIVQVALILHLPFCGPNQLDNFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ITQVVRIACANTFPEELVMICSSGLISVVCLIALLMSYAFLLALFKKLSGSGENTNRAMS
. ::...::.::: ::.:. .:::.:..:...:: ::: .: ... :. :.. .:.:
CCDS32 VPQVIKLACTNTFVVELLMVSNSGLLSLLCFLGLLASYAVILCRIREHSSEGKS--KAIS
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TCYSHITIVVLMFGPSIYIYARPFDSFSLDKVVSVFNTLIFPLRNPIIYTLRNKEVKAAM
:: .:: :. :::::.:.::. ::..: :::::.:.:.:::: ::.::::::.::::.:
CCDS32 TCTTHIIIIFLMFGPAIFIYTCPFQAFPADKVVSLFHTVIFPLMNPVIYTLRNQEVKASM
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 RKLVTKYILCKEK
:::......:
CCDS32 RKLLSQHMFC
300
>>CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 (307 aa)
initn: 1256 init1: 946 opt: 1268 Z-score: 1065.3 bits: 205.3 E(32554): 5.1e-53
Smith-Waterman score: 1268; 58.1% identity (83.8% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 METANYTKVTEFVLTGLSQTPEVQLVLFVIFLSFYLFILPGNILIICTISLDPHLTSPMY
::. : : . ::.: ::.:. ..::..::. : ::..:::::.::: ::. :: ::.:.:
CCDS32 MESENRTVIREFILLGLTQSQDIQLLVFVLVLIFYFIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAPLY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLANLAFLDIWYSSITAPEMLIDFFVERKIISFDGCIAQLFFLHFAGASEMFLLTVMAF
:.:.:::::: :: :.::.::.::. .::::. :::.::::::: :..: .::.::::
CCDS32 FFLGNLAFLDASYSFIVAPRMLVDFLSAKKIISYRGCITQLFFLHFLGGGEGLLLVVMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DLYTAICRPLHYATIMNQRLCCILVALSWRGGFIHSIIQVALIVRLPFCGPNELDSYFCD
: : :::::::: :.:: : : .. : :::.::::::.::.::::::::.::..:::
CCDS32 DRYIAICRPLHYPTVMNPRTCYAMMLALWLGGFVHSIIQVVLILRLPFCGPNQLDNFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ITQVVRIACANTFPEELVMICSSGLISVVCLIALLMSYAFLLALFKKLSGSGENTNRAMS
. ::...::..:: ::.:. .:::....:...:: ::: .: .. ..:.: :.:::
CCDS32 VPQVIKLACTDTFVVELLMVFNSGLMTLLCFLGLLASYAVILCRIR--GSSSEAKNKAMS
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TCYSHITIVVLMFGPSIYIYARPFDSFSLDKVVSVFNTLIFPLRNPIIYTLRNKEVKAAM
:: .:: .. .::::.:.::.::: .: :::::.:.:.:::: ::.::::::.::::.:
CCDS32 TCITHIIVIFFMFGPGIFIYTRPFRAFPADKVVSLFHTVIFPLLNPVIYTLRNQEVKASM
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 RKLVTKYILCKEK
.:. .:.:
CCDS32 KKVFNKHIA
300
>>CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 (316 aa)
initn: 1241 init1: 947 opt: 1243 Z-score: 1044.7 bits: 201.5 E(32554): 7.2e-52
Smith-Waterman score: 1243; 55.6% identity (83.9% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 METANYTKVTEFVLTGLSQTPEVQLVLFVIFLSFYLFILPGNILIICTISLDPHLTSPMY
:. :: : ::::.: ::.:. ..::..::..: :::.:::::.::: :: :: ::.:.:
CCDS32 MKIANNTVVTEFILLGLTQSQDIQLLVFVLILIFYLIILPGNFLIIFTIRSDPGLTAPLY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLANLAFLDIWYSSITAPEMLIDFFVERKIISFDGCIAQLFFLHFAGASEMFLLTVMAF
..:.:::::: :: :.::.::.::. :.:.::. :::.::::::: :..: .::.::::
CCDS32 LFLGNLAFLDASYSFIVAPRMLVDFLSEKKVISYRGCITQLFFLHFLGGGEGLLLVVMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DLYTAICRPLHYATIMNQRLCCILVALSWRGGFIHSIIQVALIVRLPFCGPNELDSYFCD
: : ::::::: .:.:: : : .. : :::.::::::.::.::::::::.::..:::
CCDS32 DRYIAICRPLHCSTVMNPRACYAMMLALWLGGFVHSIIQVVLILRLPFCGPNQLDNFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ITQVVRIACANTFPEELVMICSSGLISVVCLIALLMSYAFLLALFKKLSGSGENTNRAMS
. ::...::.. : ::.:. .:::....:...:: ::: .: .. .. :. :.:::
CCDS32 VRQVIKLACTDMFVVELLMVFNSGLMTLLCFLGLLASYAVILCHVRRAASEGK--NKAMS
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TCYSHITIVVLMFGPSIYIYARPFDSFSLDKVVSVFNTLIFPLRNPIIYTLRNKEVKAAM
:: ... :..:::::.:.:: :: .. ::.::.:.:.:::: ::.::::::.:::..:
CCDS32 TCTTRVIIILLMFGPAIFIYMCPFRALPADKMVSLFHTVIFPLMNPMIYTLRNQEVKTSM
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 RKLVTKYILCKEK
..:......:.
CCDS32 KRLLSRHVVCQVDFIIRN
300 310
>>CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 (318 aa)
initn: 897 init1: 868 opt: 1144 Z-score: 963.4 bits: 186.4 E(32554): 2.4e-47
Smith-Waterman score: 1144; 52.8% identity (82.5% similar) in 303 aa overlap (1-303:1-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 METANYTKVTEFVLTGLSQTPEVQLVLFVIFLSFYLFILPGNILIICTISLDPHLTSPMY
:. ::...:. ::: ::::. :...:.:..: . :.. . ::.::. .. :::: . ::
CCDS31 MNPANHSQVAGFVLLGLSQVWELRFVFFTVFSAVYFMTVVGNLLIVVIVTSDPHLHTTMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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CCDS31 FLLGNLSFLDFCYSSITAPRMLVDLLSGNPTISFGGCLTQLFFFHFIGGIKIFLLTVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DLYTAICRPLHYATIMNQRLCCILVALSWRGGFIHSIIQVALIVRLPFCGPNELDSYFCD
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CCDS31 DRYIAISQPLHYTLIMNQTVCALLMAASWVGGFIHSIVQIALTIQLPFCGPDKLDNFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ITQVVRIACANTFPEELVMICSSGLISVVCLIALLMSYAFLLALFKKLSGSGENTNRAMS
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CCDS31 VPQLIKLACTDTFVLELLMVSNNGLVTLMCFLVLLGSYTALLVMLR--SHSREGRSKALS
190 200 210 220 230
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CCDS31 TCASHIAVVTLIFVPCIYVYTRPFRTFPMDKAVSVLYTIVTPMLNPAIYTLRNKEVIMAM
240 250 260 270 280 290
310
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.::
CCDS31 KKLWRRKKDPIGPLEHRPLH
300 310
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CCDS32 YYFLGHLSFIDLCLSCVTVPKMLGDFLQQGKSISFSGCLAQIYFLHFLGASEMFLLTVMA
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CCDS32 STCASHLTVVSLIFVPCVFIYLRPFCSFSVDKIFSLFYTVITPMLNPLIYTLRNTDMKTA
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300 310
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CCDS32 MKKLRIKPCGIPLPC
300 310
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CCDS32 LSTCSAHIMVVTLFFGPCIFVYVRPFSRFSVDKLLSVFYTIFTPLLNPIIYTLRNEEMKA
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::.:: .. .
CCDS32 AMKKLQNRRVTFQ
300 310
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CCDS32 DLPLVIELACMDTYEMEIMTLTNSGLISLSCFLALIISYTIILIGVRCRSSSG--SSKAL
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CCDS32 STLTAHITVVILFFGPCIYFYIWPFSRLPVDKFLSVFYTVCTPLLNPIIYSLRNEDVKAA
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CCDS32 MWKLRNRHVNSWKN
300 310
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CCDS42 MEPQNTTQVSMFVLLGFSQTQELQKFLFLLFLLVYVTTIVGNLLIMVTVTFDCRLHTPMY
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]