Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5980
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5980, 313 aa
1>>>pF1KE5980 313 - 313 aa - 313 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.2818+/-0.000557; mu= 21.5493+/- 0.035
mean_var=98.4907+/-26.140, 0's: 0 Z-trim(107.0): 340 B-trim: 1788 in 2/48
Lambda= 0.129234
statistics sampled from 14600 (15107) to 14600 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.506), E-opt: 0.2 (0.177), width: 16
Scan time: 5.950
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 975 193.1 6.2e-49
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 890 177.2 3.7e-44
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 859 171.5 2e-42
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NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 836 167.2 4e-41
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 836 167.2 4e-41
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 822 164.6 2.5e-40
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 815 163.3 6e-40
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NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 807 161.8 1.7e-39
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 807 161.8 1.7e-39
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 806 161.6 1.9e-39
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 799 160.3 4.7e-39
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 797 159.9 6.2e-39
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 790 158.6 1.5e-38
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 789 158.4 1.7e-38
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 789 158.4 1.7e-38
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 782 157.1 4.2e-38
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 779 156.5 6.3e-38
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 759 152.8 8.1e-37
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 516 107.5 3.6e-23
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 507 105.8 1.2e-22
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 208 50.1 7.1e-06
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 188 46.4 9.7e-05
NP_000504 (OMIM: 300821,303700,303800) medium-wave ( 364) 184 45.7 0.00017
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NP_001496 (OMIM: 601805) G-protein coupled estroge ( 375) 179 44.8 0.00033
NP_001035055 (OMIM: 601805) G-protein coupled estr ( 375) 179 44.8 0.00033
NP_001091671 (OMIM: 601805) G-protein coupled estr ( 375) 179 44.8 0.00033
XP_005265876 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 328) 178 44.5 0.00035
XP_006714884 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 331) 178 44.5 0.00035
XP_005265875 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 366) 178 44.6 0.00037
XP_011532740 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 389) 178 44.6 0.00038
XP_011532739 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 402) 178 44.7 0.00039
NP_000670 (OMIM: 104220) alpha-1B adrenergic recep ( 520) 178 44.8 0.00045
XP_011532737 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 556) 178 44.9 0.00046
NP_859528 (OMIM: 609042) opsin-5 [Homo sapiens] ( 354) 173 43.6 0.00069
XP_016865900 (OMIM: 609042) PREDICTED: opsin-5 iso ( 298) 172 43.3 0.00071
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XP_016865905 (OMIM: 609042) PREDICTED: opsin-5 iso ( 408) 173 43.7 0.00075
XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 174 44.1 0.00076
NP_064445 (OMIM: 300822,303700,303900) long-wave-s ( 364) 172 43.5 0.0008
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 171 43.2 0.00086
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NP_001006633 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 172 43.6 0.00091
XP_011514071 (OMIM: 118493) PREDICTED: muscarinic ( 466) 172 43.6 0.00091
NP_001006631 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 172 43.6 0.00091
NP_001006630 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 172 43.6 0.00091
NP_001006629 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 172 43.6 0.00091
NP_001006632 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466) 172 43.6 0.00091
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE5 METANYTKVTEFVLTGLSQTREVQLVLFVIFLSFYLFILPGNILIICTIRLDPHLTSPMY
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310
pF1KE5 RKVVTKYILCEEK
::. ..
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300
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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pF1KE5 METANYTKVTEFVLTGLSQTREVQLVLFVIFLSFYLFILPGNILIICTIRLDPHLTSP
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pF1KE5 CDITQVVRIACANTFPEELVMICSSGLISVVCFIALLMSYAF-LLALLKKHSGSGENTNR
::. .....:..: .: .. .. . ..::: ...:: : ::..:: .: ::.. .
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pF1KE5 AMSTCYSHITIVVLMFGPSIYIYARPFDSFS--LDKVVSVFHTVIFPLLNPIIYTLRNKE
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pF1KE5 VKAAMRKVVTKYILCEEK
:: : .::. . .
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300 310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 859; 42.1% identity (75.7% similar) in 309 aa overlap (1-306:1-307)
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NP_003 STCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVK
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pF1KE5 AAMRKVVTKYILCEEK
:. .:...
NP_003 KALANVISRKRTSSFL
300 310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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pF1KE5 METANYTKVTEFVLTGLSQTREVQLVLFVIFLSFYLFILPGNILIICTIRLDPHLTSPMY
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pF1KE5 AMRKVVTKYILCEEK
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XP_011 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
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Smith-Waterman score: 836; 42.7% identity (74.1% similar) in 309 aa overlap (1-307:1-308)
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pF1KE5 METANYTKVTEFVLTGLSQTREVQLVLFVIFLSFYLFILPGNILIICTIRLDPHLTSPMY
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pF1KE5 ITQVVRIACANTFPEELVMICSSGLISVVCFIALLMSYAFLLALLKKHSGSGENTNRAMS
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pF1KE5 AMRKVVTKYILCEEK
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NP_036 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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Smith-Waterman score: 836; 42.7% identity (74.1% similar) in 309 aa overlap (1-307:1-308)
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pF1KE5 METANYTKVTEFVLTGLSQTREVQLVLFVIFLSFYLFILPGNILIICTIRLDPHLTSPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KE5 FLLANLALLDIWYSSITAPKMLIDFFVERKIISFGGCIAQLFFLHFVGASEMFLLTVMAY
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYAAICRPLHYATIMNRRLCCILVALSWMGGFIHSIIQVALIVRLPFCGPNELDSYFCD
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ITQVVRIACANTFPEELVMICSSGLISVVCFIALLMSYAFLLALLKKHSGSGENTNRAMS
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQ-SREGRKKAFH
190 200 210 220 230
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pF1KE5 TCYSHITIVVLMFGPSIYIYARPFDSFSL--DKVVSVFHTVIFPLLNPIIYTLRNKEVKA
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XP_011 TCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 AMRKVVTKYILCEEK
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XP_011 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo (327 aa)
initn: 832 init1: 375 opt: 822 Z-score: 845.1 bits: 164.6 E(85289): 2.5e-40
Smith-Waterman score: 822; 43.5% identity (72.1% similar) in 308 aa overlap (1-300:1-306)
10 20 30 40 50
pF1KE5 METANYT-KVTEFVLTGLSQTREVQLVLFVIFLSFYLFILPGNILIICTIRLDPHLTSPM
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NP_003 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLHKPM
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 YFLLANLALLDIWYSSITAPKMLIDFFVERK----IISFGGCIAQLFFLHFVGASEMFLL
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NP_003 YFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVLL
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pF1KE5 TVMAYDRYAAICRPLHYATIMNRRLCCILVALSWMGGFIHSIIQVALIVRLPFCGPNELD
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NP_003 AVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPNIIN
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pF1KE5 SYFCDITQVVRIACANTFPEELVMICSSGLISVVCFIALLMSY-AFLLALLKKHSGSGEN
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NP_003 HFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAGRY
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TNRAMSTCYSHITIVVLMFGPSIYIYARP--FDSFSLDKVVSVFHTVIFPLLNPIIYTLR
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NP_003 --KAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLR
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pF1KE5 NKEVKAAMRKVVTKYILCEEK
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NP_003 NQEVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
300 310 320
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 693 init1: 602 opt: 815 Z-score: 838.2 bits: 163.3 E(85289): 6e-40
Smith-Waterman score: 815; 39.2% identity (77.4% similar) in 296 aa overlap (12-304:15-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 METANYTKVTEFVLTGLSQTREVQLVLFVIFLSFYLFILPGNILIICTIRLDPHLTS
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
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pF1KE5 PMYFLLANLALLDIWYSSITAPKMLIDFFVERKIISFGGCIAQLFFLHFVGASEMFLLTV
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
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pF1KE5 MAYDRYAAICRPLHYATIMNRRLCCILVALSWMGGFIHSIIQVALIVRLPFCGPNELDSY
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NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
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pF1KE5 FCDITQVVRIACANTFPEELVMICSSGLISVVCFIALLMSY-AFLLALLKKHSGSGENTN
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NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTG--LQ
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pF1KE5 RAMSTCYSHITIVVLMFGPSIYIYARPFDSFSLD--KVVSVFHTVIFPLLNPIIYTLRNK
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NP_001 KVFGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNK
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pF1KE5 EVKAAMRKVVTKYILCEEK
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NP_001 VVRGAVKRLMGWE
300 310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 787 init1: 605 opt: 807 Z-score: 830.2 bits: 161.8 E(85289): 1.7e-39
Smith-Waterman score: 807; 38.8% identity (75.3% similar) in 312 aa overlap (1-309:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 METANYTKVTEFVLTGLSQTREVQLVLFVIFLSFYLFILPGNILIICTIRLDPHLTSPMY
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pF1KE5 FLLANLALLDIWYSSITAPKMLIDFFVERKIISFGGCIAQLFFLHFVGASEMFLLTVMAY
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XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRYAAICRPLHYATIMNRRLCCILVALSWMGGFIHSIIQVALIVRLPFCGPNELDSYFCD
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XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE5 ITQVVRIACANTFPEELVMICSSGLISVVCFIALLMSYAFLL-ALLKKHSGSGENTNRAM
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XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGR--WKAF
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XP_011 STCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLK
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300 310
pF1KE5 AAMRKVVTKYILCEEK
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XP_011 GALKKVVGRVVFSV
300 310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 787 init1: 605 opt: 807 Z-score: 830.2 bits: 161.8 E(85289): 1.7e-39
Smith-Waterman score: 807; 38.8% identity (75.3% similar) in 312 aa overlap (1-309:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 METANYTKVTEFVLTGLSQTREVQLVLFVIFLSFYLFILPGNILIICTIRLDPHLTSPMY
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 FLLANLALLDIWYSSITAPKMLIDFFVERKIISFGGCIAQLFFLHFVGASEMFLLTVMAY
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NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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pF1KE5 DRYAAICRPLHYATIMNRRLCCILVALSWMGGFIHSIIQVALIVRLPFCGPNELDSYFCD
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NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 ITQVVRIACANTFPEELVMICSSGLISVVCFIALLMSYAFLL-ALLKKHSGSGENTNRAM
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NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGR--WKAF
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 STCYSHITIVVLMFGPSIYIYARPFDSFSLDK--VVSVFHTVIFPLLNPIIYTLRNKEVK
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NP_036 GALKKVVGRVVFSV
300 310
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]