FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5979, 313 aa
1>>>pF1KE5979 313 - 313 aa - 313 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8598+/-0.000549; mu= 18.6166+/- 0.035
mean_var=109.6467+/-33.277, 0's: 0 Z-trim(106.7): 383 B-trim: 948 in 1/47
Lambda= 0.122483
statistics sampled from 14195 (14750) to 14195 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.482), E-opt: 0.2 (0.173), width: 16
Scan time: 7.010
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 911 172.7 8.8e-43
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 897 170.2 4.8e-42
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 878 166.9 4.9e-41
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XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 868 165.1 1.7e-40
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 868 165.1 1.7e-40
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 868 165.1 1.7e-40
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 861 163.9 3.9e-40
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 842 160.5 4e-39
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 841 160.3 4.6e-39
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 804 153.8 4.2e-37
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 797 152.6 9.9e-37
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 769 147.6 3e-35
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 767 147.3 3.9e-35
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 767 147.3 3.9e-35
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 759 145.8 1e-34
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 740 142.5 1e-33
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 732 141.1 2.8e-33
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 518 103.3 7e-22
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 460 93.0 8.5e-19
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 207 48.3 2.5e-05
XP_016856596 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 389) 204 47.9 4e-05
NP_001516 (OMIM: 602392) orexin receptor type 1 [H ( 425) 204 47.9 4.2e-05
XP_016856594 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 204 47.9 4.2e-05
XP_016856595 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 204 47.9 4.2e-05
NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471) 201 47.5 6.4e-05
NP_001517 (OMIM: 602393) orexin receptor type 2 [H ( 444) 198 46.9 9e-05
XP_016866287 (OMIM: 602393) PREDICTED: orexin rece ( 461) 198 46.9 9.2e-05
NP_006574 (OMIM: 605224) visual pigment-like recep ( 337) 195 46.2 0.00011
NP_000862 (OMIM: 601109) 5-hydroxytryptamine recep ( 440) 196 46.6 0.00011
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 191 45.5 0.00018
NP_001035262 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 360) 188 45.0 0.00027
NP_955525 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine recep ( 378) 188 45.1 0.00028
NP_001035259 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 387) 188 45.1 0.00028
NP_000861 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine recep ( 388) 188 45.1 0.00028
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 187 44.8 0.00028
NP_001273339 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 411) 188 45.1 0.00029
NP_001035263 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 428) 188 45.1 0.0003
NP_071640 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor iso ( 359) 187 44.8 0.0003
XP_006714928 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 362) 187 44.8 0.0003
NP_001124527 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor ( 397) 187 44.9 0.00032
XP_016864915 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 187 44.9 0.00033
XP_006714927 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 187 44.9 0.00033
XP_011532850 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 187 44.9 0.00033
XP_011532851 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 187 44.9 0.00033
XP_005265961 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 187 44.9 0.00033
NP_001041695 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 ( 326) 184 44.3 0.00041
NP_000665 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 [Ho ( 326) 184 44.3 0.00041
>>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo (327 aa)
initn: 925 init1: 436 opt: 911 Z-score: 889.0 bits: 172.7 E(85289): 8.8e-43
Smith-Waterman score: 911; 46.1% identity (76.1% similar) in 297 aa overlap (7-298:10-306)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGNWSTVTEITLIAFPALLEIRISLFVVLVVTYTLTATGNITIISLIWIDHRLQTPM
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NP_003 YFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVLL
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pF1KE5 AVMSFDRYMAICDPLHYTVIMNSRACLLLVLGCWVGAFLSVLFPTIVVTRLPYCRKEI-N
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NP_003 KAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLRNQ
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300 310
pF1KE5 KVQEVLRETVNRIMTLIQRKT
.:...:
NP_003 EVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
310 320
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 897; 44.9% identity (80.2% similar) in 303 aa overlap (3-304:5-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGNWSTVTEITLIAFPALLEIRISLFVVLVVTYTLTATGNITIISLIWIDHRLQTPMY
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pF1KE5 DRYMAICDPLHYTVIMNSRACLLLVLGCWVGAFLSVLFPTIVVTRLPYCRKE-INHFFCD
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NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CASHITVVSIAHGSNIFVYVRPNQNSSLDYDKVAAVLIKVVTPLLNPFIYSLRNEKVQEV
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NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
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300 310
pF1KE5 LRETVNRIMTLIQRKT
: ....:
NP_003 LANVISRKRTSSFL
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
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Smith-Waterman score: 878; 45.2% identity (74.1% similar) in 305 aa overlap (3-306:5-309)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGNWSTVTEITLIAFPALLEIRISLFVVLVVTYTLTATGNITIISLIWIDHRLQTPMY
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pF1KE5 FFLSNLSFLDILYTTVITPKLLACLLGEEKTISFAGCMIQTYFYFFLGTVEFILLAVMSF
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pF1KE5 IAPLLQVACINTHLIEKINFLLSALVILSSLAFTTGSYVYIISTILRIPSTQGRQKAFST
..:::...: .::: : : . .:::... . .::..: :.:..:::.:: :::::
NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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pF1KE5 CASHITVVSIAHGSNIFVYVRPNQNSSLDYDKVAAVLIKVVTPLLNPFIYSLRNEKVQEV
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NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
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300 310
pF1KE5 LRETVNRIMTLIQRKT
:...:.:..
NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE5 MGNWSTVTEITLIAFPALLEIRISLFVVLVVTYTLTATGNITIISLIWIDHRLQTPMY
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pF1KE5 FFLSNLSFLDILYTTVITPKLLACLLGEEKTISFAGCMIQTYFYFFLGTVEFILLAVMSF
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XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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pF1KE5 DRYMAICDPLHYTVIMNSRACLLLVLGCWVGAFLSVLFPTIVVTRLPYCRKE-INHFFCD
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XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE5 IAPLLQVACINTHLIEKINFLLSALVILSSLAFTTGSYVYIISTILRIPSTQGRQKAFST
..:::...: .::: : : . .:::... . .::..: :.:..:::.:: :::::
XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
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pF1KE5 LRETVNRIMTLIQRKT
:...:.:..
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
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10 20 30 40
pF1KE5 MGNWSTVTEITLIAFPALLEIRISLFVVLVVTYTLTATGNITIISLIW
: :.:.:. :... . . ::: .. : :. ::. :: .
XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
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pF1KE5 IDHRLQTPMYFFLSNLSFLDILYTTVITPKLLACLLGEEKTISFAGCMIQTYFYFFLGTV
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XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
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pF1KE5 EFILLAVMSFDRYMAICDPLHYTVIMNSRACLLLVLGCWVGAFLSVLFPTIVVTRLPYCR
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XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
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pF1KE5 KE-INHFFCDIAPLLQVACINTHLIEKINFLLSALVILSSLAFTTGSYVYIISTILRIPS
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XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
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pF1KE5 SLRNEKVQEVLRETVNRIMTLIQRKT
::::. .. .:...:.:..
XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
310 320
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 817 init1: 487 opt: 868 Z-score: 848.1 bits: 165.1 E(85289): 1.7e-40
Smith-Waterman score: 868; 43.8% identity (77.6% similar) in 299 aa overlap (1-295:1-298)
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pF1KE5 MG--NWSTVTEITLIAFPALLEIRISLFVVLVVTYTLTATGNITIISLIWIDHRLQTPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KE5 FFLSNLSFLDILYTTVITPKLLACLLGEEKTISFAGCMIQTYFYFFLGTVEFILLAVMSF
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYMAICDPLHYTVIMNSRACLLLVLGCWVGAFLSVLFPTIVVTRLPYCR-KEINHFFCD
:::.:.:: :.:..::.. : :.. ::..:.: : .. .::.:: : :.:. :.
XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 IAPLLQVACINTHLIEKINFLLSALVIL-SSLAFTTGSYVYIISTILRIPSTQGRQKAFS
. ....::..: : .....:..:.: . . .. ::. ::::::.: : .::.:::
XP_011 LLAVVRLACVDTSSNE-VTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH
190 200 210 220 230
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pF1KE5 TCASHITVVSIAHGSNIFVYVRPNQNSSLDYDKVAAVLIKVVTPLLNPFIYSLRNEKVQE
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XP_011 TCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 VLRETVNRIMTLIQRKT
XP_011 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE5 MG--NWSTVTEITLIAFPALLEIRISLFVVLVVTYTLTATGNITIISLIWIDHRLQTPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KE5 DRYMAICDPLHYTVIMNSRACLLLVLGCWVGAFLSVLFPTIVVTRLPYCR-KEINHFFCD
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 IAPLLQVACINTHLIEKINFLLSALVIL-SSLAFTTGSYVYIISTILRIPSTQGRQKAFS
. ....::..: : .....:..:.: . . .. ::. ::::::.: : .::.:::
XP_011 LLAVVRLACVDTSSNE-VTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH
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pF1KE5 TCASHITVVSIAHGSNIFVYVRPNQNSSLDYDKVAAVLIKVVTPLLNPFIYSLRNEKVQE
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XP_011 TCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 VLRETVNRIMTLIQRKT
XP_011 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 852 init1: 417 opt: 868 Z-score: 848.1 bits: 165.1 E(85289): 1.7e-40
Smith-Waterman score: 868; 42.9% identity (73.5% similar) in 310 aa overlap (1-308:3-312)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGNWSTVTEITLIAFPAL-LEIRISLFVVLVVTYTLTATGNITIISLIWIDHRLQTPM
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NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
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pF1KE5 YFFLSNLSFLDILYTTVITPKLLACLLGEEKTISFAGCMIQTYFYFFLGTVEFILLAVMS
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NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
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pF1KE5 FDRYMAICDPLHYTVIMNSRACLLLVLGCWVGAFLSVLFPTIVVTRLPYC-RKEINHFFC
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NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCASHITVVSIAHGSNIFVYVRPNQNSSLDYDKVAAVLIKVVTPLLNPFIYSLRNEKVQE
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NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
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300 310
pF1KE5 VLRETVNRIMTLIQRKT
.: .: .....:
NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP
310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 817 init1: 487 opt: 868 Z-score: 848.1 bits: 165.1 E(85289): 1.7e-40
Smith-Waterman score: 868; 43.8% identity (77.6% similar) in 299 aa overlap (1-295:1-298)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MG--NWSTVTEITLIAFPALLEIRISLFVVLVVTYTLTATGNITIISLIWIDHRLQTPMY
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NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KE5 FFLSNLSFLDILYTTVITPKLLACLLGEEKTISFAGCMIQTYFYFFLGTVEFILLAVMSF
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NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KE5 DRYMAICDPLHYTVIMNSRACLLLVLGCWVGAFLSVLFPTIVVTRLPYCR-KEINHFFCD
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NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 IAPLLQVACINTHLIEKINFLLSALVIL-SSLAFTTGSYVYIISTILRIPSTQGRQKAFS
. ....::..: : .....:..:.: . . .. ::. ::::::.: : .::.:::
NP_036 LLAVVRLACVDTSSNE-VTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH
190 200 210 220 230
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pF1KE5 TCASHITVVSIAHGSNIFVYVRPNQNSSLDYDKVAAVLIKVVTPLLNPFIYSLRNEKVQE
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NP_036 TCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
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300 310
pF1KE5 VLRETVNRIMTLIQRKT
NP_036 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 827 init1: 519 opt: 861 Z-score: 841.5 bits: 163.9 E(85289): 3.9e-40
Smith-Waterman score: 861; 43.9% identity (71.8% similar) in 305 aa overlap (3-306:8-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGNWSTVTEITLIAFPALLEIRISLFVVLVVTYTLTATGNITIISLIWIDHRLQT
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
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pF1KE5 MSFDRYMAICDPLHYTVIMNSRACLLLVLGCWVGAFLSVLFPTIVVTRLPYC-RKEINHF
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NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
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NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]