Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5979
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5979, 313 aa
1>>>pF1KE5979 313 - 313 aa - 313 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3522+/-0.0013; mu= 15.6080+/- 0.077
mean_var=150.9842+/-49.736, 0's: 0 Z-trim(100.7): 414 B-trim: 700 in 2/48
Lambda= 0.104378
statistics sampled from 5681 (6223) to 5681 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.518), E-opt: 0.2 (0.191), width: 16
Scan time: 1.890
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31696.1 OR6M1 gene_id:390261|Hs108|chr11 ( 313) 1996 313.4 1.5e-85
CCDS32038.1 OR6S1 gene_id:341799|Hs108|chr14 ( 331) 1073 174.4 1e-43
CCDS31700.1 OR6T1 gene_id:219874|Hs108|chr11 ( 323) 1056 171.9 6.1e-43
CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1 ( 308) 1023 166.9 1.9e-41
CCDS31695.1 OR6X1 gene_id:390260|Hs108|chr11 ( 312) 1020 166.4 2.6e-41
CCDS31827.1 OR6C4 gene_id:341418|Hs108|chr12 ( 309) 1015 165.7 4.3e-41
CCDS31819.1 OR6C3 gene_id:254786|Hs108|chr12 ( 311) 980 160.4 1.7e-39
CCDS58241.1 OR2AP1 gene_id:121129|Hs108|chr12 ( 309) 972 159.2 3.8e-39
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 970 158.9 4.7e-39
CCDS31816.1 OR6C74 gene_id:254783|Hs108|chr12 ( 312) 966 158.3 7.2e-39
CCDS31818.1 OR6C1 gene_id:390321|Hs108|chr12 ( 312) 964 158.0 8.8e-39
CCDS31820.1 OR6C75 gene_id:390323|Hs108|chr12 ( 312) 963 157.8 9.8e-39
CCDS31824.1 OR6C2 gene_id:341416|Hs108|chr12 ( 312) 962 157.7 1.1e-38
CCDS43661.1 OR9A4 gene_id:130075|Hs108|chr7 ( 314) 949 155.7 4.2e-38
CCDS31823.1 OR6C76 gene_id:390326|Hs108|chr12 ( 312) 941 154.5 9.7e-38
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 936 153.8 1.7e-37
CCDS31821.1 OR6C65 gene_id:403282|Hs108|chr12 ( 312) 933 153.3 2.2e-37
CCDS31825.1 OR6C70 gene_id:390327|Hs108|chr12 ( 312) 932 153.2 2.5e-37
CCDS31817.1 OR6C6 gene_id:283365|Hs108|chr12 ( 314) 928 152.6 3.8e-37
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 921 151.5 8e-37
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 911 150.0 2.2e-36
CCDS7772.1 OR6A2 gene_id:8590|Hs108|chr11 ( 327) 911 150.0 2.3e-36
CCDS31826.2 OR6C68 gene_id:403284|Hs108|chr12 ( 312) 901 148.5 6.3e-36
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 900 148.3 7e-36
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 897 147.9 9.6e-36
CCDS34767.1 OR9A2 gene_id:135924|Hs108|chr7 ( 310) 893 147.3 1.5e-35
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 893 147.3 1.5e-35
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 892 147.2 1.7e-35
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 891 147.0 1.8e-35
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 890 146.8 2e-35
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 889 146.7 2.2e-35
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 889 146.7 2.2e-35
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 888 146.5 2.5e-35
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 886 146.3 3.1e-35
CCDS32032.1 OR11G2 gene_id:390439|Hs108|chr14 ( 345) 884 146.0 3.9e-35
CCDS32017.1 OR11H12 gene_id:440153|Hs108|chr14 ( 326) 883 145.8 4.2e-35
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 878 145.0 7e-35
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 874 144.4 1.1e-34
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 873 144.3 1.2e-34
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 873 144.3 1.2e-34
CCDS47728.1 OR6V1 gene_id:346517|Hs108|chr7 ( 313) 869 143.7 1.8e-34
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 869 143.7 1.8e-34
CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 ( 320) 869 143.7 1.8e-34
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 869 143.7 1.8e-34
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 868 143.5 2e-34
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 868 143.5 2e-34
CCDS74807.1 OR11H1 gene_id:81061|Hs108|chr22 ( 326) 868 143.6 2e-34
CCDS32033.1 OR11H6 gene_id:122748|Hs108|chr14 ( 330) 866 143.3 2.5e-34
CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1 ( 317) 863 142.8 3.4e-34
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 862 142.6 3.8e-34
>>CCDS31696.1 OR6M1 gene_id:390261|Hs108|chr11 (313 aa)
initn: 1996 init1: 1996 opt: 1996 Z-score: 1649.6 bits: 313.4 E(32554): 1.5e-85
Smith-Waterman score: 1996; 99.7% identity (99.7% similar) in 313 aa overlap (1-313:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGNWSTVTEITLIAFPALLEIRISLFVVLVVTYTLTATGNITIISLIWIDHRLQTPMYFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MGNWSTVTEITLIAFPALLEIRISLFVVLVVTYTLTATGNITIISLIWIDHRLQTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LSNLSFLDILYTTVITPKLLACLLGEEKTISFAGCMIQTYFYFFLGTVEFILLAVMSFDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LSNLSFLDILYTTVITPKLLACLLGEEKTISFAGCMIQTYFYFFLGTVEFILLAVMSFDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YMAICDPLHYTVIMNSRACLLLVLGCWVGAFLSVLFPTIVVTRLPYCRKEINHFFCDIAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YMAICDPLHYTVIMNSRACLLLVLGCWVGAFLSVLFPTIVVTRLPYCRKEINHFFCDIAP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LLQVACINTHLIEKINFLLSALVILSSLAFTTGSYVYIISTILRIPSTQGRQKAFSTCAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LLQVACINTHLIEKINFLLSALVILSSLAFTTGSYVYIISTILRIPSTQGRQKAFSTCAS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 HITVVSIAHGSNIFVYVRPNQNSSLDYDKVAAVLIKVVTPLLNPFIYSLRNEKVQEVLRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HITVVSIAHGSNIFVYVRPNQNSSLDYDKVAAVLITVVTPLLNPFIYSLRNEKVQEVLRE
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 TVNRIMTLIQRKT
:::::::::::::
CCDS31 TVNRIMTLIQRKT
310
>>CCDS32038.1 OR6S1 gene_id:341799|Hs108|chr14 (331 aa)
initn: 1069 init1: 596 opt: 1073 Z-score: 898.2 bits: 174.4 E(32554): 1e-43
Smith-Waterman score: 1073; 51.6% identity (82.1% similar) in 308 aa overlap (2-306:5-312)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGNWST-VTEITLIAFPALLEIRISLFVVLVVTYTLTATGNITIISLIWIDHRLQTP
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CCDS32 MSPDGNHSSDPTEFVLAGLPNLNSARVELFSVFLLVYLLNLTGNVLIVGVVRADTRLQTP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 MYFFLSNLSFLDILYTTVITPKLLACLLGEEKTISFAGCMIQTYFYFFLGTVEFILLAVM
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CCDS32 MYFFLGNLSCLEILLTSVIIPKMLSNFLSRQHTISFAACITQFYFYFFLGASEFLLLAVM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 SFDRYMAICDPLHYTVIMNSRACLLLVLGCWVGAFLSVLFPTIVVTRLPYCRKE--INHF
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CCDS32 SADRYLAICHPLRYPLLMSGAVCFRVALACWVGGLVPVLGPTVAVALLPFCKQGAVVQHF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 FCDIAPLLQVACINTHLIEKINFLLSALVILSSLAFTTGSYVYIISTILRIPSTQGRQKA
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CCDS32 FCDSGPLLRLACTNTKKLEETDFVLASLVIVSSLLITAVSYGLIVLAVLSIPSASGRQKA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FSTCASHITVVSIAHGSNIFVYVRPNQNSSLDYDKVAAVLIKVVTPLLNPFIYSLRNEKV
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CCDS32 FSTCTSHLIVVTLFYGSAIFLYVRPSQSGSVDTNWAVTVITTFVTPLLNPFIYALRNEQV
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 QEVLRETVNRIMTLIQRKT
.:.:.. ...
CCDS32 KEALKDMFRKVVAGVLGNLLLDKCLSEKAVK
310 320 330
>>CCDS31700.1 OR6T1 gene_id:219874|Hs108|chr11 (323 aa)
initn: 1074 init1: 604 opt: 1056 Z-score: 884.4 bits: 171.9 E(32554): 6.1e-43
Smith-Waterman score: 1056; 52.5% identity (83.4% similar) in 301 aa overlap (3-302:5-305)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGNWSTVTEITLIAFPALLEIRISLFVVLVVTYTLTATGNITIISLIWIDHRLQTPMY
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CCDS31 MNPENWTQVTSFVLLGFPSSHLIQFLVFLGLMVTYIVTATGKLLIIVLSWIDQRLHIQMY
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60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLSNLSFLDILYTTVITPKLLACLLGEEKTISFAGCMIQTYFYFFLGTVEFILLAVMSF
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CCDS31 FFLRNFSFLELLLVTVVVPKMLVVILTGDHTISFVSCIIQSYLYFFLGTTDFFLLAVMSL
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120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYMAICDPLHYTVIMNSRACLLLVLGCWVGAFLSVLFPTIVVTRLPYCRKE-INHFFCD
:::.::: ::.: ..::...: :::. :...:: :: ::.... ::.: . :.::: :
CCDS31 DRYLAICRPLRYETLMNGHVCSQLVLASWLAGFLWVLCPTVLMASLPFCGPNGIDHFFRD
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pF1KE5 IAPLLQVACINTHLIEKINFLLSALVILSSLAFTTGSYVYIISTILRIPSTQGRQKAFST
:::...: .:::.. . :.::.::.:.:::.:. ::. :..:.:: :.. :.:::::
CCDS31 SWPLLRLSCGDTHLLKLVAFMLSTLVLLGSLALTSVSYACILATVLRAPTAAERRKAFST
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CASHITVVSIAHGSNIFVYVRPNQNSSLDYDKVAAVLIKVVTPLLNPFIYSLRNEKVQEV
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CCDS31 CASHLTVVVIIYGSSIFLYIRMSEAQSKLLNKGASVLSCIITPLLNPFIFTLRNDKVQQA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 LRETVNRIMTLIQRKT
:::..
CCDS31 LREALGWPRLTAVMKLRVTSQRK
310 320
>>CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1 (308 aa)
initn: 1075 init1: 547 opt: 1023 Z-score: 857.8 bits: 166.9 E(32554): 1.9e-41
Smith-Waterman score: 1023; 52.3% identity (80.2% similar) in 298 aa overlap (2-298:4-301)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGNWSTVTEITLIAFPALLEIRISLFVVLVVTYTLTATGNITIISLIWIDHRLQTPMY
:: . .. :..::. ...:::....: : ::..::..:. :. .:.:.::::
CCDS31 MDTGNKTLPQDFLLLGFPGSQTLQLSLFMLFLVMYILTVSGNVAILMLVSTSHQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLSNLSFLDILYTTVITPKLLACLLGEEKTISFAGCMIQTYFYFFLGTVEFILLAVMSF
:::::::::.: :::. .:: :: :::. .::::..:..: :: : :: .:..:::.:..
CCDS31 FFLSNLSFLEIWYTTAAVPKALAILLGRSQTISFTSCLLQMYFVFSLGCTEYFLLAAMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYMAICDPLHYTVIMNSRACLLLVLGCWVGAFLSVLFPTIVVTRLPYCR-KEINHFFCD
:: .::: :::: .::.: :.:: :: .:... :: ... : .: . :::::::
CCDS31 DRCLAICYPLHYGAIMSSLLSAQLALGSWVCGFVAIAVPTALISGLSFCGPRAINHFFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 IAPLLQVACINTHLIEKINFLLSALVILSSLAFTTGSYVYIISTILRIPSTQGRQKAFST
::: . .:: ::. .: . :.....::::: .: ::::::::::::::..::.:::::
CCDS31 IAPWIALACTNTQAVELVAFVIAVVVILSSCLITFVSYVYIISTILRIPSASGRSKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CASHITVVSIAHGSNIFVYVRPNQNSSLDYDKVAAVLIKVVTPLLNPFIYSLRNEKVQEV
:.::.::: : .::..:..:: . ...:: :.. :: ::::.::::::.:::..:.:.
CCDS31 CSSHLTVVLIWYGSTVFLHVRTSIKDALDLIKAVHVLNTVVTPVLNPFIYTLRNKEVRET
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 LRETVNRIMTLIQRKT
:
CCDS31 LLKKWKGK
>>CCDS31695.1 OR6X1 gene_id:390260|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1080 init1: 548 opt: 1020 Z-score: 855.3 bits: 166.4 E(32554): 2.6e-41
Smith-Waterman score: 1020; 47.9% identity (81.5% similar) in 303 aa overlap (1-302:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGNWSTVTEITLIAFPALLEIRISLFVVLVVTYTLTATGNITIISLIWIDHRLQTPMYFF
: : ...::. :..::.. .. ::... .:: :: .:: ::. .: . ::: :::::
CCDS31 MRNGTVITEFILLGFPVIQGLQTPLFIAIFLTYILTLAGNGLIIATVWAEPRLQIPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LSNLSFLDILYTTVITPKLLACLLGEEKTISFAGCMIQTYFYFFLGTVEFILLAVMSFDR
: :::::.: :::.. ::::. .. . .: .. :..:..:.::.::.::..:..:::::
CCDS31 LCNLSFLEIWYTTTVIPKLLGTFVVARTVICMSCCLLQAFFHFFVGTTEFLILTIMSFDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE5 YMAICDPLHYTVIMNSRACLLLVLGCWVGAFLSVLFPTIVVTRLPYCRKE-INHFFCDIA
:..::.:::. .::.:. :: :.:. :: .: :. :... .::.: .. :.::.::..
CCDS31 YLTICNPLHHPTIMTSKLCLQLALSSWVVGFTIVFCQTMLLIQLPFCGNNVISHFYCDVG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 PLLQVACINTHLIEKINFLLSALVILSSLAFTTGSYVYIISTILRIPSTQGRQKAFSTCA
: :..:::.: ..: .. . . ::: .:: :. ::.::.:.::::::. :.::.:::::
CCDS31 PSLKAACIDTSILELLGVIATILVIPGSLLFNMISYIYILSAILRIPSATGHQKTFSTCA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 SHITVVSIAHGSNIFVYVRPNQNSSLDYDKVAAVLIKVVTPLLNPFIYSLRNEKVQEVLR
::.::::. .:. .:.:.::. .::. .::..:: ..:::::::::..::..:. .::
CCDS31 SHLTVVSLLYGAVLFMYLRPTAHSSFKINKVVSVLNTILTPLLNPFIYTIRNKEVKGALR
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 ETVNRIMTLIQRKT
...
CCDS31 KAMTCPKTGHAK
310
>>CCDS31827.1 OR6C4 gene_id:341418|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 1026 init1: 519 opt: 1015 Z-score: 851.3 bits: 165.7 E(32554): 4.3e-41
Smith-Waterman score: 1015; 47.2% identity (79.6% similar) in 309 aa overlap (1-308:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGNWSTVTEITLIAFPALLEIRISLFVVLVVTYTLTATGNITIISLIWIDHRLQTPMYFF
: : . :. :... :... .:. : .:: :. ::.:::.: .: .::::::::
CCDS31 MKNRTMFGEFILLGLTNQPELQVMIFIFLFLTYMLSILGNLTIITLTLLDPHLQTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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CCDS31 NVVHKVVFYANQ
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300
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