Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5977
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5977, 312 aa
1>>>pF1KE5977 312 - 312 aa - 312 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4746+/-0.00141; mu= 8.8788+/- 0.081
mean_var=199.6871+/-73.286, 0's: 0 Z-trim(101.2): 427 B-trim: 350 in 1/46
Lambda= 0.090761
statistics sampled from 5891 (6421) to 5891 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.54), E-opt: 0.2 (0.197), width: 16
Scan time: 2.210
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31107.1 OR2M3 gene_id:127062|Hs108|chr1 ( 312) 2045 281.5 5.8e-76
CCDS31105.1 OR2M5 gene_id:127059|Hs108|chr1 ( 312) 1930 266.4 2e-71
CCDS31111.1 OR2M7 gene_id:391196|Hs108|chr1 ( 312) 1909 263.7 1.3e-70
CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 ( 347) 1903 263.0 2.5e-70
CCDS31108.1 OR2M4 gene_id:26245|Hs108|chr1 ( 311) 1549 216.5 2.1e-56
CCDS31100.1 OR2T8 gene_id:343172|Hs108|chr1 ( 312) 1263 179.1 3.9e-45
CCDS31109.1 OR2T33 gene_id:391195|Hs108|chr1 ( 320) 1253 177.8 9.8e-45
CCDS31110.1 OR2T12 gene_id:127064|Hs108|chr1 ( 320) 1224 174.0 1.4e-43
CCDS4461.1 OR2V2 gene_id:285659|Hs108|chr5 ( 315) 1197 170.5 1.6e-42
CCDS58992.1 OR2V1 gene_id:26693|Hs108|chr5 ( 315) 1180 168.2 7.3e-42
CCDS31116.1 OR2T2 gene_id:401992|Hs108|chr1 ( 324) 1154 164.8 7.9e-41
CCDS31115.1 OR2T1 gene_id:26696|Hs108|chr1 ( 369) 1154 164.9 8.5e-41
CCDS31123.1 OR2T35 gene_id:403244|Hs108|chr1 ( 323) 1140 163.0 2.8e-40
CCDS31121.1 OR2T10 gene_id:127069|Hs108|chr1 ( 312) 1118 160.1 2e-39
CCDS31124.1 OR2T27 gene_id:403239|Hs108|chr1 ( 317) 1114 159.6 2.9e-39
CCDS31113.1 OR2T4 gene_id:127074|Hs108|chr1 ( 348) 1109 159.0 4.9e-39
CCDS31104.1 OR2L3 gene_id:391192|Hs108|chr1 ( 312) 1103 158.1 7.9e-39
CCDS31118.1 OR2T5 gene_id:401993|Hs108|chr1 ( 315) 1098 157.5 1.2e-38
CCDS55695.1 OR2T29 gene_id:343563|Hs108|chr1 ( 315) 1098 157.5 1.2e-38
CCDS31102.1 OR2AK2 gene_id:391191|Hs108|chr1 ( 335) 1079 155.0 7.2e-38
CCDS31114.1 OR2T6 gene_id:254879|Hs108|chr1 ( 308) 1063 152.9 2.9e-37
CCDS31103.1 OR2L2 gene_id:26246|Hs108|chr1 ( 312) 1062 152.8 3.2e-37
CCDS1637.1 OR2L13 gene_id:284521|Hs108|chr1 ( 312) 1060 152.5 3.9e-37
CCDS34696.1 OR2AE1 gene_id:81392|Hs108|chr7 ( 323) 1056 152.0 5.7e-37
CCDS31117.1 OR2T3 gene_id:343173|Hs108|chr1 ( 318) 1054 151.7 6.8e-37
CCDS58068.1 OR2L5 gene_id:81466|Hs108|chr1 ( 312) 1041 150.0 2.2e-36
CCDS31413.1 OR2AG2 gene_id:338755|Hs108|chr11 ( 316) 1041 150.0 2.2e-36
CCDS31120.1 OR2T34 gene_id:127068|Hs108|chr1 ( 318) 1038 149.6 2.9e-36
CCDS31414.1 OR2AG1 gene_id:144125|Hs108|chr11 ( 316) 1019 147.1 1.6e-35
CCDS32895.1 OR2Z1 gene_id:284383|Hs108|chr19 ( 314) 1008 145.7 4.4e-35
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 941 136.9 1.9e-32
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 940 136.8 2.2e-32
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 938 136.5 2.5e-32
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 938 136.6 2.6e-32
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 935 136.1 3.3e-32
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 924 134.7 9.1e-32
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 919 134.0 1.4e-31
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 919 134.1 1.4e-31
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 916 133.7 1.8e-31
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 916 133.7 1.8e-31
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 915 133.6 2.2e-31
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 914 133.4 2.2e-31
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 913 133.3 2.6e-31
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 911 133.0 2.9e-31
CCDS34323.1 OR2Y1 gene_id:134083|Hs108|chr5 ( 311) 908 132.6 3.8e-31
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 907 132.5 4.2e-31
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 905 132.2 5e-31
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 903 132.0 6.1e-31
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 899 131.4 8.6e-31
CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16 ( 312) 899 131.4 8.6e-31
>>CCDS31107.1 OR2M3 gene_id:127062|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 2045 init1: 2045 opt: 2045 Z-score: 1477.2 bits: 281.5 E(32554): 5.8e-76
Smith-Waterman score: 2045; 100.0% identity (100.0% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MARENSTFNSDFILLGIFNHSPTHTFLFFLVLAIFSVAFMGNSVMVLLIYLDTQLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MARENSTFNSDFILLGIFNHSPTHTFLFFLVLAIFSVAFMGNSVMVLLIYLDTQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LLLSQLSLMDLMLICTTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCATQIFFYTSLLGSECFLLAVMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LLLSQLSLMDLMLICTTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCATQIFFYTSLLGSECFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYTAICHPLRYTNLMSPKICGLMTAFSWILGSTDGIIDVVATFSFSYCGSREIAHFFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DRYTAICHPLRYTNLMSPKICGLMTAFSWILGSTDGIIDVVATFSFSYCGSREIAHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FPSLLILSCSDTSIFEKILFICCIVMIVFPVAIIIASYARVILAVIHMGSGEGRRKAFTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FPSLLILSCSDTSIFEKILFICCIVMIVFPVAIIIASYARVILAVIHMGSGEGRRKAFTT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHLLVVGMYYGAALFMYIRPTSDRSPTQDKMVSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CSSHLLVVGMYYGAALFMYIRPTSDRSPTQDKMVSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 FMKILGKGKSGE
::::::::::::
CCDS31 FMKILGKGKSGE
310
>>CCDS31105.1 OR2M5 gene_id:127059|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1930 init1: 1930 opt: 1930 Z-score: 1395.8 bits: 266.4 E(32554): 2e-71
Smith-Waterman score: 1930; 92.9% identity (97.4% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MARENSTFNSDFILLGIFNHSPTHTFLFFLVLAIFSVAFMGNSVMVLLIYLDTQLHTPMY
:: ::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MAWENQTFNSDFILLGIFNHSPTHTFLFFLVLAIFSVAFMGNSVMVLLIYLDTQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LLLSQLSLMDLMLICTTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCATQIFFYTSLLGSECFLLAVMAY
.::::: ::::::::.::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.:
CCDS31 FLLSQLFLMDLMLICSTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCATQIFFYVSLLGSECFLLAVMSY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYTAICHPLRYTNLMSPKICGLMTAFSWILGSTDGIIDVVATFSFSYCGSREIAHFFCD
::: :::::::::::: :::::::::::::::: :.:::.::::::::::::::::::::
CCDS31 DRYIAICHPLRYTNLMRPKICGLMTAFSWILGSMDAIIDAVATFSFSYCGSREIAHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FPSLLILSCSDTSIFEKILFICCIVMIVFPVAIIIASYARVILAVIHMGSGEGRRKAFTT
:::::::::.:::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FPSLLILSCNDTSIFEKVLFICCIVMIVFPVAIIIASYARVILAVIHMGSGEGRRKAFTT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHLLVVGMYYGAALFMYIRPTSDRSPTQDKMVSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
:::::.::::::::.::::::::::::: :::.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CSSHLMVVGMYYGAGLFMYIRPTSDRSPMQDKLVSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 FMKILGKGKSGE
. :.::::: ::
CCDS31 LRKVLGKGKCGE
310
>>CCDS31111.1 OR2M7 gene_id:391196|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1928 init1: 1909 opt: 1909 Z-score: 1381.0 bits: 263.7 E(32554): 1.3e-70
Smith-Waterman score: 1909; 91.7% identity (97.8% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MARENSTFNSDFILLGIFNHSPTHTFLFFLVLAIFSVAFMGNSVMVLLIYLDTQLHTPMY
:: ::.::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS31 MAWENQTFNSDFLLLGIFNHSPTHTFLFFLVLAIFSVAFMGNSIMVLLIYLDTQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LLLSQLSLMDLMLICTTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCATQIFFYTSLLGSECFLLAVMAY
.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::.:
CCDS31 FLLSQLSLMDLMLICTTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCATQIFFYISLLGSECFLLAVMSY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYTAICHPLRYTNLMSPKICGLMTAFSWILGSTDGIIDVVATFSFSYCGSREIAHFFCD
:::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::: ::
CCDS31 DRYTAICHPLRYTNLMRPKICGLMTAFSWILGSTDGIIDAVATFSFSYCGSREIAHFCCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FPSLLILSCSDTSIFEKILFICCIVMIVFPVAIIIASYARVILAVIHMGSGEGRRKAFTT
:::::::::.::::::...:::::::.::::::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FPSLLILSCNDTSIFEEVIFICCIVMLVFPVAIIITSYARVILAVIHMGSGEGRRKAFTT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHLLVVGMYYGAALFMYIRPTSDRSPTQDKMVSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
:::::.::::::::.::: :.::: .:: :::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS31 CSSHLMVVGMYYGAGLFMCIQPTSHHSPMQDKMVSVFYTIVTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 FMKILGKGKSGE
.::::::::::.
CCDS31 LMKILGKGKSGD
310
>>CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 (347 aa)
initn: 1903 init1: 1903 opt: 1903 Z-score: 1376.3 bits: 263.0 E(32554): 2.5e-70
Smith-Waterman score: 1903; 92.3% identity (97.7% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MARENSTFNSDFILLGIFNHSPTHTFLFFLVLAIFSVAFMGNSVMVLLIYLDTQLHTPMY
:: ::.:::::::::::::::: :::::::::.:: ::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MAWENQTFNSDFILLGIFNHSPPHTFLFFLVLGIFLVAFMGNSVMVLLIYLDTQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LLLSQLSLMDLMLICTTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCATQIFFYTSLLGSECFLLAVMAY
.::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::: :: ::::::::::::
CCDS31 FLLSQLSLMDLMLICTTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCVTQIFFYISLSGSECFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYTAICHPLRYTNLMSPKICGLMTAFSWILGSTDGIIDVVATFSFSYCGSREIAHFFCD
::: ::::::::::::.:::::::..:::::::::::::.:::::::.:::::::::::.
CCDS31 DRYIAICHPLRYTNLMNPKICGLMATFSWILGSTDGIIDAVATFSFSFCGSREIAHFFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FPSLLILSCSDTSIFEKILFICCIVMIVFPVAIIIASYARVILAVIHMGSGEGRRKAFTT
:::::::::.::::::...:::::::.::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS31 FPSLLILSCNDTSIFEEVIFICCIVMLVFPVAIIIASYARVILAVIHMGSGEGRCKAFTT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHLLVVGMYYGAALFMYIRPTSDRSPTQDKMVSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
:::::.:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CSSHLMVVGMYYGAALFMYIRPTSDHSPTQDKMVSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 FMKILGKGKSGE
::::::::::
CCDS31 FMKILGKGKSESELPHKLYVLLFAKFFFLISIFFYDVKILALIMYIA
310 320 330 340
>>CCDS31108.1 OR2M4 gene_id:26245|Hs108|chr1 (311 aa)
initn: 1545 init1: 1545 opt: 1549 Z-score: 1126.2 bits: 216.5 E(32554): 2.1e-56
Smith-Waterman score: 1549; 74.4% identity (90.6% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MARENSTFNSDFILLGIFNHSPTHTFLFFLVLAIFSVAFMGNSVMVLLIYLDTQLHTPMY
:. ::.:::: ::::::::::::::::: :::.:::.:.: : ::::::.. :::::::
CCDS31 MVWENQTFNSIFILLGIFNHSPTHTFLFSLVLGIFSLALMENISMVLLIYIEKQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LLLSQLSLMDLMLICTTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCATQIFFYTSLLGSECFLLAVMAY
.::::::::::::::::.::: :.::::.::::.:::.::::::.::::.::::::::::
CCDS31 FLLSQLSLMDLMLICTTLPKMIFSYLSGKKSISLAGCGTQIFFYVSLLGAECFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYTAICHPLRYTNLMSPKICGLMTAFSWILGSTDGIIDVVATFSFSYCGSREIAHFFCD
:::.::::::.:: ::.::.: .::. :: ::: :::: ..:..:::::.: :: :::::
CCDS31 DRYVAICHPLQYTILMNPKLCVFMTVASWTLGSLDGIIVLAAVLSFSYCSSLEIHHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FPSLLILSCSDTSIFEKILFICCIVMIVFPVAIIIASYARVILAVIHMGSGEGRRKAFTT
.:: :::..:: ::..: :::.::..:::..:: ::..:. :::::::::.:::::::
CCDS31 VAALLPLSCTETSAFERLLVICCVVMLIFPVSVIILSYSHVLRAVIHMGSGESRRKAFTT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHLLVVGMYYGAALFMYIRPTSDRSPTQDKMVSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
::::: :::.:::::.:::.::.: ..: ::::::.::::::::::::::::::::: ::
CCDS31 CSSHLSVVGLYYGAAMFMYMRPASKHTPDQDKMVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVFRA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 FMKILGKGKSGE
..:.: : :
CCDS31 LQKVLKKRKLI
310
>>CCDS31100.1 OR2T8 gene_id:343172|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1263 init1: 1263 opt: 1263 Z-score: 923.8 bits: 179.1 E(32554): 3.9e-45
Smith-Waterman score: 1263; 57.6% identity (86.2% similar) in 304 aa overlap (4-307:2-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MARENSTFNSDFILLGIFNHSPTHTFLFFLVLAIFSVAFMGNSVMVLLIYLDTQLHTPMY
::....: :::::.:::. .: ::..::.: ....:::.:.:::. : .::::::
CCDS31 MENGSYTSYFILLGLFNHTRAHQVLFMMVLSIVLTSLFGNSLMILLIHWDHRLHTPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LLLSQLSLMDLMLICTTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCATQIFFYTSLLGSECFLLAVMAY
.:::::::::.::. ::::::: .::.:::.:: :::..:::: .: :.::::::.:::
CCDS31 FLLSQLSLMDVMLVSTTVPKMAADYLTGSKAISRAGCGAQIFFLPTLGGGECFLLAAMAY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYTAICHPLRYTNLMSPKICGLMTAFSWILGSTDGIIDVVATFSFSYCGSREIAHFFCD
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CCDS31 DRYAAVCHPLRYPTLMSWQLCLRMTMSSWLLGAADGLLQAVATLSFPYCGAHEIDHFFCE
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. . ::
CCDS31 LKRWLGTCVNLKHQQNEAHRSR
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CCDS58 EVQALLKLACADTSLFDTLLFACCVFMLLLPFSIIMASYACILGAVLRIRSAQAWKKALA
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]