Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5975
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5975, 312 aa
1>>>pF1KE5975 312 - 312 aa - 312 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8497+/-0.00045; mu= 18.9192+/- 0.028
mean_var=99.2948+/-25.131, 0's: 0 Z-trim(110.6): 303 B-trim: 1190 in 1/50
Lambda= 0.128710
statistics sampled from 18618 (19040) to 18618 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.575), E-opt: 0.2 (0.223), width: 16
Scan time: 7.480
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 1057 207.2 3.7e-53
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 982 193.2 5.6e-49
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 931 183.8 4e-46
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 919 181.6 1.9e-45
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 912 180.2 4.6e-45
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 910 179.8 5.8e-45
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 901 178.2 1.9e-44
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 901 178.2 1.9e-44
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 901 178.2 1.9e-44
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 892 176.5 6.1e-44
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 892 176.5 6.1e-44
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 892 176.5 6.1e-44
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 889 176.0 8.9e-44
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 881 174.5 2.5e-43
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 868 172.1 1.3e-42
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 856 169.8 6.3e-42
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 849 168.5 1.5e-41
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 846 168.0 2.3e-41
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 832 165.4 1.4e-40
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 824 163.9 3.8e-40
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 509 105.4 1.6e-22
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 497 103.2 7.4e-22
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 213 50.5 5.7e-06
NP_000016 (OMIM: 109691,601665) beta-3 adrenergic ( 408) 210 50.0 9.5e-06
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 199 47.8 3.3e-05
NP_000672 (OMIM: 104210) alpha-2A adrenergic recep ( 465) 198 47.9 4.8e-05
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 191 46.4 9.5e-05
NP_001265429 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 187 45.8 0.00018
NP_000666 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a [H ( 412) 187 45.8 0.00018
NP_001265426 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 187 45.8 0.00018
NP_001265427 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 187 45.8 0.00018
NP_001265428 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 187 45.8 0.00018
XP_011521963 (OMIM: 600446) PREDICTED: adenosine r ( 116) 180 43.8 0.00021
NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471) 186 45.6 0.00023
NP_000862 (OMIM: 601109) 5-hydroxytryptamine recep ( 440) 179 44.3 0.00054
NP_000674 (OMIM: 104250) alpha-2C adrenergic recep ( 462) 179 44.3 0.00055
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 177 43.8 0.0006
XP_011542714 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 308) 176 43.6 0.00063
NP_000901 (OMIM: 162642) neuropeptide Y receptor t ( 381) 177 43.9 0.00064
XP_005263090 (OMIM: 162642) PREDICTED: neuropeptid ( 381) 177 43.9 0.00064
XP_005263091 (OMIM: 162642) PREDICTED: neuropeptid ( 381) 177 43.9 0.00064
XP_016868585 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 317) 176 43.6 0.00065
XP_011542713 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 324) 176 43.6 0.00065
NP_001309433 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 342) 176 43.6 0.00068
NP_001309432 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 370) 176 43.7 0.00071
NP_001309431 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 372) 176 43.7 0.00071
NP_000669 (OMIM: 104219) alpha-1D adrenergic recep ( 572) 178 44.3 0.00072
XP_006716356 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 429) 176 43.7 0.00078
NP_150645 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 429) 176 43.7 0.00078
NP_150647 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 455) 176 43.8 0.00081
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
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Smith-Waterman score: 1057; 52.6% identity (80.2% similar) in 308 aa overlap (4-310:5-312)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSANTSMVTEFLLLGFSHL-ADLQGLLFSVFLTIYLLTVAGNFLIVVLVSTDAALQSPM
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NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
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60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFFLRTLSALEIGYTSVTVPLLLHHLLTGRRHISRSGCALQMFFFLFFGATECCLLAAMA
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pF1KE5 YDRYAAICEPLRYPLLLSHRVCLQLAGSAWACGVLVGLGHTPFIFSLPFCGPNTIPQFFC
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NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCSSHLIMVSLFYGTALFIYIRPKASYDPATDPLVSLFYAVVTPILNPIIYSLRNTEVKA
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NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
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300 310
pF1KE5 ALKRTIQKTVPMEI
::.::..:.. .
NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP
310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
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Smith-Waterman score: 982; 49.0% identity (76.5% similar) in 306 aa overlap (4-309:5-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSANTSMVTEFLLLGFSHLADLQGLLFSVFLTIYLLTVAGNFLIVVLVSTDAALQSPMY
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NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
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pF1KE5 FFLRTLSALEIGYTSVTVPLLLHHLLTGRRHISRSGCALQMFFFLFFGATECCLLAAMAY
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NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
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pF1KE5 DRYAAICEPLRYPLLLSHRVCLQLAGSAWACGVLVGLGHTPFIFSLPFCGPNTIPQFFCE
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CSSHLIMVSLFYGTALFIYIRPKASYDPATDPLVSLFYAVVTPILNPIIYSLRNTEVKAA
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NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQQEKS--VSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA
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300 310
pF1KE5 LKRTIQKTVPMEI
:... .. :
NP_003 LRKVATRNFP
300
>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
initn: 954 init1: 926 opt: 931 Z-score: 949.1 bits: 183.8 E(85289): 4e-46
Smith-Waterman score: 931; 45.9% identity (72.6% similar) in 307 aa overlap (4-310:3-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSANTSMVTEFLLLGFSHLADLQGLLFSVFLTIYLLTVAGNFLIVVLVSTDAALQSPMYF
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pF1KE5 RYAAICEPLRYPLLLSHRVCLQLAGSAWACGVLVGLGHTPFIFSLPFCGPNTIPQFFCEI
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NP_009 RYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCEV
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pF1KE5 QPVLQLVCGDTSLNELQIILATALLILCPFGLILGSYGRILVTIFRIPSVAGRRKAFSTC
...: : ::: ::.:. .:...... :..::: ::: : ...:: :. ::::::.::
NP_009 PALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGTC
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pF1KE5 SSHLIMVSLFYGTALFIYIRPKASYDPATDPLVSLFYAVVTPILNPIIYSLRNTEVKAAL
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NP_009 SSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEVTRAF
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310
pF1KE5 KRTIQKTVPMEI
.: . : . .
NP_009 RRLLGKEMGLTQS
300 310
>>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo (327 aa)
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Smith-Waterman score: 919; 46.7% identity (75.8% similar) in 306 aa overlap (4-305:6-311)
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pF1KE5 MSANTSMVTEFLLLGFSHLADLQGLLFSVFLTIYLLTVAGNFLIVVLVSTDAALQSPM
... :.::.:::: : :: :::...: :.:... : ::.. . . ..:..::
NP_003 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLHKPM
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pF1KE5 YFFLRTLSALEIGYTSVTVPLLLHHLLTGRR-H---ISRSGCALQMFFFLFFGATECCLL
:::: ..: ::: :..::.: .: .. ... : :: :: :..::: .: ::: ::
NP_003 YFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVLL
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NP_003 AVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPNIIN
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pF1KE5 QFFCEIQPVLQLVCGDTSLNELQIILATALLILCPFGLILGSYGRILVTIFRIPSVAGRR
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NP_003 HFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAGRY
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pF1KE5 KAFSTCSSHLIMVSLFYGTALFIYIRPKASYDPATDPLVSLFYAVVTPILNPIIYSLRNT
::::::.::: .: .::....::: :::: :. :::..:::..:.:::::: :::
NP_003 KAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLRNQ
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300 310
pF1KE5 EVKAALKRTIQKTVPMEI
::: :: :..
NP_003 EVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
310 320
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 912; 45.4% identity (73.2% similar) in 306 aa overlap (4-308:7-311)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSANTSMVTEFLLLGFSHLADLQGLLFSVFLTIYLLTVAGNFLIVVLVSTDAALQSP
: ..::::.:::: .:: .:: .:::.: . . ::. ...:. : ::.:
NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
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pF1KE5 MYFFLRTLSALEIGYTSVTVPLLLHHLLTGRRHISRSGCALQMFFFLFFGATECCLLAAM
::::: .:: ... : : :: .: ..:. . :: :::::..:: :. :: .::::
NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
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pF1KE5 AYDRYAAICEPLRYPLLLSHRVCLQLAGSAWACGVLVGLGHTPFIFSLPFCGPNTIPQFF
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NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
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pF1KE5 CEIQPVLQLVCGDTSLNE-LQIILATALLILCPFGLILGSYGRILVTIFRIPSVAGRRKA
:.. :.:.: : ::..:: : .... :.: : .:. :: ::.....: : .::.:.
NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIIC-FIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKT
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pF1KE5 FSTCSSHLIMVSLFYGTALFIYIRPKASYDPATDPLVSLFYAVVTPILNPIIYSLRNTEV
::::.::: :... :: :::: ::. :.: :: ..:.::.. :.:::.:::::: .:
NP_006 FSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDV
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pF1KE5 KAALKRTIQKTVPMEI
: : ...... :
NP_006 KDAAEKVLRSKVDSS
300 310
>>XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory recep (300 aa)
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Smith-Waterman score: 910; 46.9% identity (73.1% similar) in 294 aa overlap (4-297:3-296)
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pF1KE5 MSANTSMVTEFLLLGFSHLADLQGLLFSVFLTIYLLTVAGNFLIVVLVSTDAALQSPMYF
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XP_011 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMYF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLRTLSALEIGYTSVTVPLLLHHLLTGRRHISRSGCALQMFFFLFFGATECCLLAAMAYD
:: .:: :.. .:. :: .: .: .. :: :..:.:.:: .:.::: ::..::.:
XP_011 FLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAFD
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pF1KE5 RYAAICEPLRYPLLLSHRVCLQLAGSAWACGVLVGLGHTPFIFSLPFCGPNTIPQFFCEI
::.:.:.::.: .. :.: :::. ::. :.. .. .:: . :::: . .: ::.
XP_011 RYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCEV
120 130 140 150 160 170
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pF1KE5 QPVLQLVCGDTSLNELQIILATALLILCPFGLILGSYGRILVTIFRIPSVAGRRKAFSTC
...: : ::: ::.:. .:...... :..::: ::: : ...:: :. ::::::.::
XP_011 PALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGTC
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XP_011 SSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEQKRRG
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310
pF1KE5 KRTIQKTVPMEI
XP_011 S
300
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pF1KE5 LKRTIQKTVPMEI
::... ..:
NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
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Smith-Waterman score: 901; 45.2% identity (74.1% similar) in 305 aa overlap (4-308:5-309)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSANTSMVTEFLLLGFSHLADLQGLLFSVFLTIYLLTVAGNFLIVVLVSTDAALQSPMY
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pF1KE5 DRYAAICEPLRYPLLLSHRVCLQLAGSAWACGVLVGLGHTPFIFSLPFCGPNTIPQFFCE
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300 310
pF1KE5 LKRTIQKTVPMEI
::... ..:
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
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pF1KE5 MSANTSMVTEFLLLGFSHLADLQGLLFSVFLTIYLLTVAGNFLIVVLVS
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pF1KE5 PNTIPQFFCEIQPVLQLVCGDTSLNELQIILATALLILCPFGLILGSYGRILVTIFRIPS
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XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
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XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
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310 320
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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pF1KE5 MSANTSMVTEFLLLGFSHLADLQGLLFSVFLTIYLLTVAGNFLIVVLVSTDAALQSPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLRTLSALEIGYTSVTVPLLLHHLLTGRRHISRSGCALQMFFFLFFGATECCLLAAMAY
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRYAAICEPLRYPLLLSHRVCLQLAGSAWACGVLVGLGHTPFIFSLPFCGPNTIPQFFCE
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 IQPVLQLVCGDTSLNELQIILATALLILCPFGLILGSYGRILVTIFRIPSVAGRRKAFST
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]