Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5973
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5973, 312 aa
1>>>pF1KE5973 312 - 312 aa - 312 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5982+/-0.00155; mu= 14.4887+/- 0.091
mean_var=195.2173+/-69.563, 0's: 0 Z-trim(99.0): 442 B-trim: 306 in 1/49
Lambda= 0.091794
statistics sampled from 5046 (5561) to 5046 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.491), E-opt: 0.2 (0.171), width: 16
Scan time: 1.290
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31818.1 OR6C1 gene_id:390321|Hs108|chr12 ( 312) 1987 276.9 1.4e-74
CCDS31819.1 OR6C3 gene_id:254786|Hs108|chr12 ( 311) 1617 227.9 7.8e-60
CCDS31820.1 OR6C75 gene_id:390323|Hs108|chr12 ( 312) 1519 214.9 6.3e-56
CCDS31816.1 OR6C74 gene_id:254783|Hs108|chr12 ( 312) 1471 208.6 5.1e-54
CCDS31823.1 OR6C76 gene_id:390326|Hs108|chr12 ( 312) 1446 205.3 5.1e-53
CCDS31827.1 OR6C4 gene_id:341418|Hs108|chr12 ( 309) 1395 198.5 5.5e-51
CCDS31824.1 OR6C2 gene_id:341416|Hs108|chr12 ( 312) 1395 198.5 5.5e-51
CCDS31821.1 OR6C65 gene_id:403282|Hs108|chr12 ( 312) 1380 196.5 2.2e-50
CCDS31825.1 OR6C70 gene_id:390327|Hs108|chr12 ( 312) 1369 195.1 6e-50
CCDS31817.1 OR6C6 gene_id:283365|Hs108|chr12 ( 314) 1355 193.2 2.2e-49
CCDS58241.1 OR2AP1 gene_id:121129|Hs108|chr12 ( 309) 1328 189.6 2.6e-48
CCDS31826.2 OR6C68 gene_id:403284|Hs108|chr12 ( 312) 1300 185.9 3.4e-47
CCDS31696.1 OR6M1 gene_id:390261|Hs108|chr11 ( 313) 981 143.7 1.8e-34
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 960 140.9 1.2e-33
CCDS31700.1 OR6T1 gene_id:219874|Hs108|chr11 ( 323) 955 140.3 1.9e-33
CCDS31695.1 OR6X1 gene_id:390260|Hs108|chr11 ( 312) 939 138.1 8.3e-33
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 935 137.6 1.2e-32
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 928 136.7 2.3e-32
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 926 136.4 2.8e-32
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 918 135.4 5.7e-32
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 916 135.1 6.8e-32
CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1 ( 308) 913 134.7 9e-32
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 912 134.6 1e-31
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 909 134.2 1.3e-31
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 907 133.9 1.6e-31
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 906 133.7 1.7e-31
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 906 133.8 1.7e-31
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 905 133.6 1.9e-31
CCDS32038.1 OR6S1 gene_id:341799|Hs108|chr14 ( 331) 905 133.7 1.9e-31
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 899 132.8 3.3e-31
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 893 132.0 5.7e-31
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 885 131.0 1.2e-30
CCDS47728.1 OR6V1 gene_id:346517|Hs108|chr7 ( 313) 881 130.5 1.7e-30
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 880 130.3 1.9e-30
CCDS43661.1 OR9A4 gene_id:130075|Hs108|chr7 ( 314) 879 130.2 2.1e-30
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 878 130.1 2.3e-30
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 877 129.9 2.5e-30
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 877 129.9 2.5e-30
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 876 129.8 2.7e-30
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 874 129.5 3.3e-30
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 873 129.4 3.6e-30
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 873 129.4 3.6e-30
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 870 129.0 4.8e-30
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 869 128.9 5.1e-30
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 869 128.9 5.2e-30
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 868 128.7 5.6e-30
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 868 128.7 5.6e-30
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 866 128.5 6.7e-30
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 866 128.6 7.2e-30
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 864 128.2 8.1e-30
>>CCDS31818.1 OR6C1 gene_id:390321|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 1987 init1: 1987 opt: 1987 Z-score: 1452.5 bits: 276.9 E(32554): 1.4e-74
Smith-Waterman score: 1987; 99.0% identity (99.4% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MRNHTEITEFILLGLTDDPNFQVVIFVFLLITYMLSITGNLTLITITLLDSHLQTPMYFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MRNHTEITEFILLGLTDDPNFQVVIFVFLLITYMLSITGNLTLITITLLDSHLQTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LRNFSILEISFTTVSIPKFLGNIISGDKTISFNNCIVQLFFFILLGVTEFYLLAAMSYDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LRNFSILEISFTTVSIPKFLGNIISGDKTISFNNCIVQLFFFILLGVTEFYLLAAMSYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YVAICKPLHYLSIMNRRVCTLLVFTSWLVSFLIIFPALMLLLKLDYCRSNIIDHFTCDYF
::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::
CCDS31 YVAICKPLHCLSIMNRRVCTLLVFTSWLVSFLIIFPALMLLLKLHYCRSNIIDHFTCDYF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PLLQLACSDTKFLEVMGFSCAAFTLMFTLALIFLSYIYIIRTILRIPSTSQRTKAFSTCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PLLQLACSDTKFLEVMGFSCAAFTLMFTLALIFLSYIYIIRTILRIPSTSQRTKAFSTCS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SHMVVISISYGSCIFMYIKPSAKDRVSLSKGVAILNTSVAPMMNPFIYSLRNQQVKQAFI
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SHMVVVSISYGSCIFMYIKPSAKDRVSLSKGVAILNTSVAPMMNPFIYSLRNQQVKQAFI
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 NMARKTVFFTST
::::::::::::
CCDS31 NMARKTVFFTST
310
>>CCDS31819.1 OR6C3 gene_id:254786|Hs108|chr12 (311 aa)
initn: 1662 init1: 1617 opt: 1617 Z-score: 1187.7 bits: 227.9 E(32554): 7.8e-60
Smith-Waterman score: 1617; 75.7% identity (93.9% similar) in 309 aa overlap (3-311:2-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MRNHTEITEFILLGLTDDPNFQVVIFVFLLITYMLSITGNLTLITITLLDSHLQTPMYFF
::: .:::.::::.:::..:.:::.::.:::.::.:::::.::.:..:::::::::::
CCDS31 MNHTMVTEFVLLGLSDDPDLQIVIFLFLFITYILSVTGNLTIITLTFVDSHLQTPMYFF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LRNFSILEISFTTVSIPKFLGNIISGDKTISFNNCIVQLFFFILLGVTEFYLLAAMSYDR
:::::.:::::::: ::.::: ::. .::::.::: .::::::..::::::.:.::::::
CCDS31 LRNFSFLEISFTTVCIPRFLGAIITRNKTISYNNCAAQLFFFIFMGVTEFYILTAMSYDR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YVAICKPLHYLSIMNRRVCTLLVFTSWLVSFLIIFPALMLLLKLDYCRSNIIDHFTCDYF
:::::::::: :::::..:::::. .:: .:: ::: :::::.:::: ::.::::.::::
CCDS31 YVAICKPLHYTSIMNRKLCTLLVLCAWLSGFLTIFPPLMLLLQLDYCASNVIDHFACDYF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PLLQLACSDTKFLEVMGFSCAAFTLMFTLALIFLSYIYIIRTILRIPSTSQRTKAFSTCS
:::::.:::: .:::.:: : ::.:::::..:::.:::::::::::.::: :::::::
CCDS31 PLLQLSCSDTWLLEVIGFYFALVTLLFTLALVILSYMYIIRTILRIPSASQRKKAFSTCS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SHMVVISISYGSCIFMYIKPSAKDRVSLSKGVAILNTSVAPMMNPFIYSLRNQQVKQAFI
:::.::::::::::::: .::::...::.::.::::::::::.:::::.::::::::::
CCDS31 SHMIVISISYGSCIFMYANPSAKEKASLTKGIAILNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQAFK
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 NMARKTVFFTST
:...:.::...
CCDS31 NVVHKVVFYANQ
300 310
>>CCDS31820.1 OR6C75 gene_id:390323|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 1575 init1: 1519 opt: 1519 Z-score: 1117.6 bits: 214.9 E(32554): 6.3e-56
Smith-Waterman score: 1519; 71.4% identity (91.2% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MRNHTEITEFILLGLTDDPNFQVVIFVFLLITYMLSITGNLTLITITLLDSHLQTPMYFF
::: : .:.:::::::.::..:::.:.:::.:::::.:::: .::.:: : :::::::::
CCDS31 MRNSTAVTDFILLGLTSDPQWQVVLFIFLLVTYMLSVTGNLIIITLTLSDPHLQTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LRNFSILEISFTTVSIPKFLGNIISGDKTISFNNCIVQLFFFILLGVTEFYLLAAMSYDR
:::::.::::::.: ::.:: ....:..:::.:.:..::::::.::::::::::::::::
CCDS31 LRNFSFLEISFTSVCIPRFLVTVVTGNRTISYNGCVAQLFFFIFLGVTEFYLLAAMSYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YVAICKPLHYLSIMNRRVCTLLVFTSWLVSFLIIFPALMLLLKLDYCRSNIIDHFTCDYF
.:::::::: ::. ::::::::.:::..:::::: .::::.::.: ::.:::: ::
CCDS31 CMAICKPLHYTIIMSTRVCTLLVFSSWLAGFLIIFPPVMLLLQLDFCASNVIDHFICDSS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PLLQLACSDTKFLEVMGFSCAAFTLMFTLALIFLSYIYIIRTILRIPSTSQRTKAFSTCS
:.:::.:..:.:::.:.: :. ::: ::.:..::: ::::::.::: ::: :::::::
CCDS31 PMLQLSCTNTHFLELMAFFLAVVTLMVTLTLVILSYTNIIRTILKIPSMSQRKKAFSTCS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SHMVVISISYGSCIFMYIKPSAKDRVSLSKGVAILNTSVAPMMNPFIYSLRNQQVKQAFI
:::.:.::::.:::::::: ::..::.::::::.:::::::..:::::.:::.::::::
CCDS31 SHMIVVSISYSSCIFMYIKTSARERVTLSKGVAVLNTSVAPLLNPFIYTLRNKQVKQAFK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 NMARKTVFFTST
.:..: .:
CCDS31 SMVQKMIFSLNK
310
>>CCDS31816.1 OR6C74 gene_id:254783|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 1523 init1: 1471 opt: 1471 Z-score: 1083.2 bits: 208.6 E(32554): 5.1e-54
Smith-Waterman score: 1471; 68.4% identity (90.6% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MRNHTEITEFILLGLTDDPNFQVVIFVFLLITYMLSITGNLTLITITLLDSHLQTPMYFF
::::: ...::::::::::..::.::..:..:::::::::::.::.:::: ::.::::::
CCDS31 MRNHTTVANFILLGLTDDPQLQVIIFLLLFFTYMLSITGNLTIITLTLLDLHLKTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LRNFSILEISFTTVSIPKFLGNIISGDKTISFNNCIVQLFFFILLGVTEFYLLAAMSYDR
:::::.::.::::: ::::: .. .::::::.:.: .:::: ::::.:::.:::::::.:
CCDS31 LRNFSFLEVSFTTVYIPKFLVSMATGDKTISYNDCAAQLFFTILLGATEFFLLAAMSYER
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YVAICKPLHYLSIMNRRVCTLLVFTSWLVSFLIIFPALMLLLKLDYCRSNIIDHFTCDYF
:::::::::: .::. :::.::::.::...:::::: :.. :.::.: .: .::: ::
CCDS31 YVAICKPLHYTTIMSSRVCSLLVFASWMAGFLIIFPPLLMGLQLDFCAANTVDHFFCDVS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PLLQLACSDTKFLEVMGFSCAAFTLMFTLALIFLSYIYIIRTILRIPSTSQRTKAFSTCS
:.:::.:.:: ..:.: . : .::. ::.:..::: ::::::.:::..:: :::::::
CCDS31 PILQLSCTDTDIIELMMLLSAILTLLVTLVLVILSYTNIIRTILKIPSSQQRKKAFSTCS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SHMVVISISYGSCIFMYIKPSAKDRVSLSKGVAILNTSVAPMMNPFIYSLRNQQVKQAFI
:::::.:::::::::::.:::::.::::.::.:.:.::::::.:::::.:::.:::..:
CCDS31 SHMVVVSISYGSCIFMYVKPSAKERVSLNKGIALLSTSVAPMLNPFIYTLRNKQVKDVFK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 NMARKTVFFTST
. ..: .:.
CCDS31 HTVKKIELFSMK
310
>>CCDS31823.1 OR6C76 gene_id:390326|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 1128 init1: 1128 opt: 1446 Z-score: 1065.3 bits: 205.3 E(32554): 5.1e-53
Smith-Waterman score: 1446; 69.5% identity (89.5% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MRNHTEITEFILLGLTDDPNFQVVIFVFLLITYMLSITGNLTLITITLLDSHLQTPMYFF
:.:.: .:.::::::::.:..::::: ::..::.::.:::::.:..:::::::.::::::
CCDS31 MKNRTSVTDFILLGLTDNPQLQVVIFSFLFLTYVLSVTGNLTIISLTLLDSHLKTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LRNFSILEISFTTVSIPKFLGNIISGDKTISFNNCIVQLFFFILLGVTEFYLLAAMSYDR
::::: ::::::.: :.:: .:..:::.::.: : .::::::.:: :::.:::.::::
CCDS31 LRNFS-LEISFTSVCNPRFLISILTGDKSISYNACAAQLFFFIFLGSTEFFLLASMSYDC
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YVAICKPLHYLSIMNRRVCTLLVFTSWLVSFLIIFPALMLLLKLDYCRSNIIDHFTCDYF
:::::::::: .::. :.: :...:::..::.::: : . :.::.: ::.:::::::
CCDS31 YVAICKPLHYTTIMSDRICYQLIISSWLAGFLVIFPPLAMGLQLDFCDSNVIDHFTCDSA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PLLQLACSDTKFLEVMGFSCAAFTLMFTLALIFLSYIYIIRTILRIPSTSQRTKAFSTCS
::::..:.::. ::.:.: : :::. :: :..::: :::::::::::..:: :::::::
CCDS31 PLLQISCTDTSTLELMSFILALFTLISTLILVILSYTYIIRTILRIPSAQQRKKAFSTCS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SHMVVISISYGSCIFMYIKPSAKDRVSLSKGVAILNTSVAPMMNPFIYSLRNQQVKQAFI
::..:.:::::::::::.: :::. :.:.:::::::::::::.:::::.::::::::::
CCDS31 SHVIVVSISYGSCIFMYVKTSAKEGVALTKGVAILNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQAFK
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 NMARKTVFFTST
.. ::
CCDS31 DVLRKISHKKKKH
300 310
>>CCDS31827.1 OR6C4 gene_id:341418|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 1405 init1: 1377 opt: 1395 Z-score: 1028.9 bits: 198.5 E(32554): 5.5e-51
Smith-Waterman score: 1395; 66.4% identity (88.9% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MRNHTEITEFILLGLTDDPNFQVVIFVFLLITYMLSITGNLTLITITLLDSHLQTPMYFF
:.:.: . ::::::::..:..::.::.::..:::::: ::::.::.:::: :::::::::
CCDS31 MKNRTMFGEFILLGLTNQPELQVMIFIFLFLTYMLSILGNLTIITLTLLDPHLQTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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70 80 90 100 110 120
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130 140 150 160 170 180
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CCDS31 PLVELACSDTSLLELMVILLAVVTLMVTLVLVTLSYTYIIRTILRIPSAQQRTKAFSTCS
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CCDS31 SHMIVISLSYGSCMFMYINPSAKEGGAFNKGIAVLITSVTPLLNPFIYTLRNQQVKQAFK
250 260 270 280 290 300
310
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. ..: :
CCDS31 DSVKKIVKL
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CCDS31 SHMIVVSIAYGSCIFIYIKPSAKDEVAINKGVSVLTTSVAPLLNPFIYTLRNKQVKQAFS
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310
pF1KE5 NMARKTVFFTST
. .. .:..
CCDS31 DSIKRIAFLSKK
310
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10 20 30 40 50 60
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CCDS31 MPNMTSIREFILLGFTDNPELQVVIFFFMLITYLLSVSGNMIIIMLTLSNIHLKTPMYFF
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CCDS31 PMLLIACTDTQFLELMAFLLAVFTLMVTLALVVLSYTLILKTILKIPSAQQRKKAFSTCS
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310
pF1KE5 NMARKTVFFTST
....:
CCDS31 EFTKKILSLNKQ
310
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CCDS31 YVAICKPLRYMSIMSNKVCYQLVFSSWVTGFLIIFTPLILGLNLDFCASNIIDHFICDIS
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310
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]