FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5972, 312 aa
1>>>pF1KE5972 312 - 312 aa - 312 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7548+/-0.000614; mu= 19.2972+/- 0.038
mean_var=131.3204+/-37.721, 0's: 0 Z-trim(105.3): 351 B-trim: 880 in 1/51
Lambda= 0.111920
statistics sampled from 12989 (13528) to 12989 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.474), E-opt: 0.2 (0.159), width: 16
Scan time: 6.230
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 864 152.1 1.4e-36
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 821 145.1 1.8e-34
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 815 144.1 3.4e-34
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 815 144.1 3.4e-34
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 810 143.3 6e-34
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 806 142.7 9.3e-34
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NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 791 140.3 5e-33
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 791 140.3 5e-33
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NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 782 138.8 1.4e-32
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XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 779 138.3 1.9e-32
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 779 138.3 1.9e-32
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 774 137.5 3.3e-32
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 774 137.5 3.3e-32
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 774 137.5 3.4e-32
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 767 136.4 7.2e-32
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 760 135.2 1.6e-31
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 729 130.2 5.1e-30
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 503 93.8 5e-19
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 495 92.5 1.2e-18
NP_001699 (OMIM: 190900,613522) short-wave-sensiti ( 348) 249 52.8 1.2e-06
NP_064445 (OMIM: 300822,303700,303900) long-wave-s ( 364) 226 49.1 1.6e-05
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 225 49.1 1.9e-05
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 222 48.5 2.5e-05
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 222 48.6 2.6e-05
NP_000504 (OMIM: 300821,303700,303800) medium-wave ( 364) 212 46.9 7.5e-05
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NP_001008504 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 392) 207 46.1 0.00014
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NP_000905 (OMIM: 600018) mu-type opioid receptor i ( 400) 207 46.1 0.00014
NP_001138756 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 403) 207 46.1 0.00014
NP_001138754 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 406) 207 46.1 0.00014
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 206 45.8 0.00014
NP_001272452 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 414) 207 46.1 0.00014
NP_001008503 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 418) 207 46.2 0.00014
NP_001138758 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 420) 207 46.2 0.00014
NP_001008505 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 446) 207 46.2 0.00015
NP_001138751 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 493) 207 46.3 0.00015
NP_001272453 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 493) 207 46.3 0.00015
NP_003848 (OMIM: 603691) galanin receptor type 2 [ ( 387) 203 45.5 0.00021
NP_001040 (OMIM: 182451) somatostatin receptor typ ( 391) 195 44.2 0.00052
XP_016883343 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 370) 193 43.8 0.00064
NP_000904 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 193 43.8 0.00064
NP_872588 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 193 43.8 0.00064
NP_001186948 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 370) 193 43.8 0.00064
XP_016883342 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 193 43.8 0.00065
XP_016883341 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 193 43.8 0.00065
XP_011527130 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 193 43.8 0.00065
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
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Smith-Waterman score: 864; 43.2% identity (77.6% similar) in 308 aa overlap (3-309:5-312)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MPNMTSIREFILLGFTDNP-ELQVVIFFFMLITYLLSVSGNMIIIMLTLSNIHLKTPM
: : : ::::..:.. : :.: ..:. .: ::....:: .::..::.. :..::
NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
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pF1KE5 YFFLRNFSFLEISFTTVFIPRFLINIATGDTTISYNASMAQVFFLILLGSTEFFLLAVMS
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NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
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NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
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pF1KE5 TCSSHMIVVSVSYGSCIFMCVKTSAKEGMALSKGVAVLNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQ
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NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
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300 310
pF1KE5 ALREFTKKILSLNKQ
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NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP
310
>>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo (327 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE5 MPNMTSIREFILLGFTDNPELQVVIFFFMLITYLLSVSGNMIIIMLTLSNIHLKTPM
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:::: :.::::: ..:: ::..: ... . ::... :.:..:.. :: :: ::
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:::.::::.::: :::: .:.:...: .. .:: .:: : . :.. :..: . :.
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pF1KE5 KAFSTCSSHMIVVSVSYGSCIFMCVKTSAKEGMALSKGVAVLNTSVAPMLNPFIYTLRNQ
::::::.::. :: . :.. ::. .. .: .. .: :.:: . ..:.:::.:: ::::
NP_003 KAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLRNQ
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300 310
pF1KE5 QVKQALREFTKKILSLNKQ
.::.::
NP_003 EVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
310 320
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
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Smith-Waterman score: 815; 39.3% identity (74.6% similar) in 303 aa overlap (3-305:6-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MPNMTSIREFILLGFTDNPELQVVIFFFMLITYLLSVSGNMIIIMLTLSNIHLKTPM
:.: : ::::::.: :.. :.: ..:. :. :.. :. .:.: . ::.:::
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NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
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pF1KE5 YDRYVAICKPLHYTTIMSNKVCNWLVISSWLAGFLIIFPPVIMGLQLDFCDSSTIDHFIC
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pF1KE5 DSSPMLLIACTDTQFLELMAFLLAVFTLMVTLALVVLSYTLILKTILKIPSAQQRKKAFS
: .:...:::: :...:. .:..: ... ....:: : .:.:: ::. :.:::.
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pF1KE5 TCSSHMIVVSVSYGSCIFMCVKTSAKEGMALSKGVAVLNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQ
::.::. .::. : : ::. ...:. . .... ..:. : : :::::.::.:::...:.
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300 310
pF1KE5 ALREFTKKILSLNKQ
::... :.
NP_001 ALKRLQKRKCC
310
>>NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 [Ho (312 aa)
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Smith-Waterman score: 815; 38.9% identity (77.2% similar) in 303 aa overlap (3-305:5-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MPNMTSIREFILLGFTDNPELQVVIFFFMLITYLLSVSGNMIIIMLTLSNIHLKTPMY
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pF1KE5 FFLRNFSFLEISFTTVFIPRFLINIATGDTTISYNASMAQVFFLILLGSTEFFLLAVMSY
::: :.::..: : .. .:..:..: . . ::: . ..::.::..... . ::::::.:
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pF1KE5 DRYVAICKPLHYTTIMSNKVCNWLVISSWLAGFLIIFPPVIMGLQLDFCDSSTIDHFICD
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. .: .::..: . ... .. ... . .: ...::. :..... . :.. . :::::
NP_001 PAQVLKVACSNTLLNNIVLYVATALLGVFPVAGILFSYSQIVSSLMGMSSTKGKYKAFST
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NP_001 CGSHLCVVSLFYGTGLGVYLSSAVTHSSQSSSTASVMYAMVTPMLNPFIYSLRNKDVKGA
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300 310
pF1KE5 LREFTKKILSLNKQ
:... ..
NP_001 LERLLSRADSCP
310
>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
initn: 809 init1: 809 opt: 810 Z-score: 730.5 bits: 143.3 E(85289): 6e-34
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pF1KE5 MPNMTSIREFILLGFTDNPELQVVIFFFMLITYLLSVSGNMIIIMLTLSNIHLKTPMY
: .. .::::::.: :.:. ..: .::.:::.. :: ::... . ::.::::
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pF1KE5 FFLRNFSFLEISFTTVFIPRFLINIATGDTTISYNASMAQVFFLILLGSTEFFLLAVMSY
::: ..:::..:::: ::..: :. : :::: . :.:... ::..: .:::::.:
NP_001 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMAY
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pF1KE5 DRYVAICKPLHYTTIMSNKVCNWLVISSWLAGFL--IIFPPVIMGLQLDFCDSSTIDHFI
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NP_001 DRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVT--LRLPRCGHHEVDHFL
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NP_001 REMPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKAF
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NP_001 GTCGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREVK
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pF1KE5 QALREFTKKILSLNKQ
::
NP_001 GALGRLLLGKRELGKE
300 310
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
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Smith-Waterman score: 806; 40.1% identity (73.1% similar) in 312 aa overlap (1-311:1-309)
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pF1KE5 MPNMTSIREFILLGFTDNPELQVVIFFFMLITYLLSVSGNMIIIMLTLSNIHLKTPMYFF
: : ... ::.:::.:.::..: .:: ... :...: : ..:.. .. : .:::.
NP_001 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLS
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pF1KE5 LRNFSFLEISFTTVFIPRFLINIATGDTTISYNASMAQVFFLILLGSTEFFLLAVMSYDR
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NP_001 LAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDH
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NP_001 YVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PMLLIACTDTQFLELMAFLLAVFTLMVTLALVVLSYTLILKTILKIPSAQQRKKAFSTCS
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NP_001 PLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCS-LRTHSLEARHKALSTCV
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pF1KE5 SHMIVVSVSYGSCIFMCVKTSAKEGMALSKGVAVLNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQALR
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NP_001 SHITVVILFFVPCIFVYMRPAAT--LPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIR
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310
pF1KE5 EF-TKKILSLNKQ
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NP_001 KLCSRKDISGDK
300
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initn: 795 init1: 795 opt: 799 Z-score: 720.9 bits: 141.5 E(85289): 2e-33
Smith-Waterman score: 799; 39.7% identity (71.9% similar) in 302 aa overlap (3-302:8-307)
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pF1KE5 MPNMTSIREFILLGFTDNPELQVVIFFFMLITYLLSVSGNMIIIMLTLSNIHLKT
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
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NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
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NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
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NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPA--MCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNK
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pF1KE5 QVKQALREFTKKILSLNKQ
:. :....
NP_001 VVRGAVKRLMGWE
300 310
>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
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Smith-Waterman score: 791; 38.7% identity (72.5% similar) in 313 aa overlap (1-311:1-311)
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NP_009 CSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEVTRA
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pF1KE5 LREFTKKILSLNKQ
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NP_009 FRRLLGKEMGLTQS
300 310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
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pF1KE5 LREFTKKILSLNKQ
:
NP_003 LANVISRKRTSSFL
310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]