Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5969
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5969, 312 aa
1>>>pF1KE5969 312 - 312 aa - 312 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2699+/-0.00131; mu= 10.0446+/- 0.076
mean_var=203.1108+/-74.657, 0's: 0 Z-trim(101.9): 431 B-trim: 399 in 1/46
Lambda= 0.089993
statistics sampled from 6157 (6695) to 6157 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.551), E-opt: 0.2 (0.206), width: 16
Scan time: 1.650
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31105.1 OR2M5 gene_id:127059|Hs108|chr1 ( 312) 2074 283.0 2.1e-76
CCDS31111.1 OR2M7 gene_id:391196|Hs108|chr1 ( 312) 1943 266.0 2.7e-71
CCDS31107.1 OR2M3 gene_id:127062|Hs108|chr1 ( 312) 1930 264.3 8.8e-71
CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 ( 347) 1894 259.7 2.4e-69
CCDS31108.1 OR2M4 gene_id:26245|Hs108|chr1 ( 311) 1558 216.0 3e-56
CCDS31100.1 OR2T8 gene_id:343172|Hs108|chr1 ( 312) 1238 174.4 9.8e-44
CCDS31109.1 OR2T33 gene_id:391195|Hs108|chr1 ( 320) 1233 173.8 1.6e-43
CCDS31110.1 OR2T12 gene_id:127064|Hs108|chr1 ( 320) 1217 171.7 6.6e-43
CCDS4461.1 OR2V2 gene_id:285659|Hs108|chr5 ( 315) 1213 171.2 9.3e-43
CCDS58992.1 OR2V1 gene_id:26693|Hs108|chr5 ( 315) 1197 169.1 3.9e-42
CCDS31116.1 OR2T2 gene_id:401992|Hs108|chr1 ( 324) 1163 164.7 8.5e-41
CCDS31123.1 OR2T35 gene_id:403244|Hs108|chr1 ( 323) 1149 162.9 3e-40
CCDS31115.1 OR2T1 gene_id:26696|Hs108|chr1 ( 369) 1144 162.3 5.1e-40
CCDS31124.1 OR2T27 gene_id:403239|Hs108|chr1 ( 317) 1106 157.3 1.4e-38
CCDS31121.1 OR2T10 gene_id:127069|Hs108|chr1 ( 312) 1105 157.2 1.5e-38
CCDS31102.1 OR2AK2 gene_id:391191|Hs108|chr1 ( 335) 1101 156.7 2.3e-38
CCDS31113.1 OR2T4 gene_id:127074|Hs108|chr1 ( 348) 1101 156.7 2.3e-38
CCDS31104.1 OR2L3 gene_id:391192|Hs108|chr1 ( 312) 1097 156.1 3.2e-38
CCDS31118.1 OR2T5 gene_id:401993|Hs108|chr1 ( 315) 1083 154.3 1.1e-37
CCDS55695.1 OR2T29 gene_id:343563|Hs108|chr1 ( 315) 1083 154.3 1.1e-37
CCDS34696.1 OR2AE1 gene_id:81392|Hs108|chr7 ( 323) 1083 154.3 1.1e-37
CCDS31114.1 OR2T6 gene_id:254879|Hs108|chr1 ( 308) 1073 153.0 2.7e-37
CCDS1637.1 OR2L13 gene_id:284521|Hs108|chr1 ( 312) 1062 151.6 7.4e-37
CCDS31103.1 OR2L2 gene_id:26246|Hs108|chr1 ( 312) 1059 151.2 9.7e-37
CCDS31117.1 OR2T3 gene_id:343173|Hs108|chr1 ( 318) 1051 150.2 2e-36
CCDS58068.1 OR2L5 gene_id:81466|Hs108|chr1 ( 312) 1038 148.5 6.4e-36
CCDS31120.1 OR2T34 gene_id:127068|Hs108|chr1 ( 318) 1035 148.1 8.5e-36
CCDS31413.1 OR2AG2 gene_id:338755|Hs108|chr11 ( 316) 1033 147.8 1e-35
CCDS32895.1 OR2Z1 gene_id:284383|Hs108|chr19 ( 314) 1030 147.4 1.3e-35
CCDS31414.1 OR2AG1 gene_id:144125|Hs108|chr11 ( 316) 1017 145.8 4.3e-35
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 981 141.1 1.1e-33
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 945 136.4 2.8e-32
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 945 136.4 2.8e-32
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 943 136.1 3.3e-32
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 939 135.6 4.7e-32
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 938 135.5 5.2e-32
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 935 135.1 6.9e-32
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 929 134.3 1.2e-31
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 929 134.3 1.2e-31
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 929 134.3 1.2e-31
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 927 134.1 1.4e-31
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 927 134.1 1.5e-31
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 926 133.9 1.5e-31
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 920 133.1 2.6e-31
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 914 132.4 4.5e-31
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 910 131.9 6.5e-31
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 909 131.7 7.1e-31
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 909 131.7 7.2e-31
CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16 ( 312) 908 131.6 7.7e-31
CCDS43672.1 OR2A14 gene_id:135941|Hs108|chr7 ( 310) 906 131.3 9.2e-31
>>CCDS31105.1 OR2M5 gene_id:127059|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 2074 init1: 2074 opt: 2074 Z-score: 1485.3 bits: 283.0 E(32554): 2.1e-76
Smith-Waterman score: 2074; 100.0% identity (100.0% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAWENQTFNSDFILLGIFNHSPTHTFLFFLVLAIFSVAFMGNSVMVLLIYLDTQLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MAWENQTFNSDFILLGIFNHSPTHTFLFFLVLAIFSVAFMGNSVMVLLIYLDTQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLSQLFLMDLMLICSTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCATQIFFYVSLLGSECFLLAVMSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FLLSQLFLMDLMLICSTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCATQIFFYVSLLGSECFLLAVMSY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYIAICHPLRYTNLMRPKICGLMTAFSWILGSMDAIIDAVATFSFSYCGSREIAHFFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DRYIAICHPLRYTNLMRPKICGLMTAFSWILGSMDAIIDAVATFSFSYCGSREIAHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FPSLLILSCNDTSIFEKVLFICCIVMIVFPVAIIIASYARVILAVIHMGSGEGRRKAFTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FPSLLILSCNDTSIFEKVLFICCIVMIVFPVAIIIASYARVILAVIHMGSGEGRRKAFTT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHLMVVGMYYGAGLFMYIRPTSDRSPMQDKLVSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CSSHLMVVGMYYGAGLFMYIRPTSDRSPMQDKLVSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LRKVLGKGKCGE
::::::::::::
CCDS31 LRKVLGKGKCGE
310
>>CCDS31111.1 OR2M7 gene_id:391196|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 2010 init1: 1943 opt: 1943 Z-score: 1393.4 bits: 266.0 E(32554): 2.7e-71
Smith-Waterman score: 1943; 92.6% identity (97.4% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAWENQTFNSDFILLGIFNHSPTHTFLFFLVLAIFSVAFMGNSVMVLLIYLDTQLHTPMY
::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS31 MAWENQTFNSDFLLLGIFNHSPTHTFLFFLVLAIFSVAFMGNSIMVLLIYLDTQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLSQLFLMDLMLICSTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCATQIFFYVSLLGSECFLLAVMSY
:::::: ::::::::.::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::
CCDS31 FLLSQLSLMDLMLICTTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCATQIFFYISLLGSECFLLAVMSY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYIAICHPLRYTNLMRPKICGLMTAFSWILGSMDAIIDAVATFSFSYCGSREIAHFFCD
::: ::::::::::::::::::::::::::::: :.::::::::::::::::::::: ::
CCDS31 DRYTAICHPLRYTNLMRPKICGLMTAFSWILGSTDGIIDAVATFSFSYCGSREIAHFCCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FPSLLILSCNDTSIFEKVLFICCIVMIVFPVAIIIASYARVILAVIHMGSGEGRRKAFTT
::::::::::::::::.:.:::::::.::::::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FPSLLILSCNDTSIFEEVIFICCIVMLVFPVAIIITSYARVILAVIHMGSGEGRRKAFTT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHLMVVGMYYGAGLFMYIRPTSDRSPMQDKLVSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
:::::::::::::::::: :.::: .::::::.:::::::.:::::::::::::::::::
CCDS31 CSSHLMVVGMYYGAGLFMCIQPTSHHSPMQDKMVSVFYTIVTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LRKVLGKGKCGE
: :.::::: :.
CCDS31 LMKILGKGKSGD
310
>>CCDS31107.1 OR2M3 gene_id:127062|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1930 init1: 1930 opt: 1930 Z-score: 1384.2 bits: 264.3 E(32554): 8.8e-71
Smith-Waterman score: 1930; 92.9% identity (97.4% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAWENQTFNSDFILLGIFNHSPTHTFLFFLVLAIFSVAFMGNSVMVLLIYLDTQLHTPMY
:: ::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MARENSTFNSDFILLGIFNHSPTHTFLFFLVLAIFSVAFMGNSVMVLLIYLDTQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLSQLFLMDLMLICSTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCATQIFFYVSLLGSECFLLAVMSY
.::::: ::::::::.::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.:
CCDS31 LLLSQLSLMDLMLICTTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCATQIFFYTSLLGSECFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYIAICHPLRYTNLMRPKICGLMTAFSWILGSMDAIIDAVATFSFSYCGSREIAHFFCD
::: :::::::::::: :::::::::::::::: :.:::.::::::::::::::::::::
CCDS31 DRYTAICHPLRYTNLMSPKICGLMTAFSWILGSTDGIIDVVATFSFSYCGSREIAHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FPSLLILSCNDTSIFEKVLFICCIVMIVFPVAIIIASYARVILAVIHMGSGEGRRKAFTT
:::::::::.:::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FPSLLILSCSDTSIFEKILFICCIVMIVFPVAIIIASYARVILAVIHMGSGEGRRKAFTT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHLMVVGMYYGAGLFMYIRPTSDRSPMQDKLVSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
:::::.::::::::.::::::::::::: :::.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CSSHLLVVGMYYGAALFMYIRPTSDRSPTQDKMVSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LRKVLGKGKCGE
. :.::::: ::
CCDS31 FMKILGKGKSGE
310
>>CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 (347 aa)
initn: 1894 init1: 1894 opt: 1894 Z-score: 1358.5 bits: 259.7 E(32554): 2.4e-69
Smith-Waterman score: 1894; 91.3% identity (97.1% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAWENQTFNSDFILLGIFNHSPTHTFLFFLVLAIFSVAFMGNSVMVLLIYLDTQLHTPMY
:::::::::::::::::::::: :::::::::.:: ::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MAWENQTFNSDFILLGIFNHSPPHTFLFFLVLGIFLVAFMGNSVMVLLIYLDTQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLSQLFLMDLMLICSTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCATQIFFYVSLLGSECFLLAVMSY
:::::: ::::::::.:::::::::::::::::::::.::::::.:: ::::::::::.:
CCDS31 FLLSQLSLMDLMLICTTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCVTQIFFYISLSGSECFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYIAICHPLRYTNLMRPKICGLMTAFSWILGSMDAIIDAVATFSFSYCGSREIAHFFCD
:::::::::::::::: :::::::..::::::: :.:::::::::::.:::::::::::.
CCDS31 DRYIAICHPLRYTNLMNPKICGLMATFSWILGSTDGIIDAVATFSFSFCGSREIAHFFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FPSLLILSCNDTSIFEKVLFICCIVMIVFPVAIIIASYARVILAVIHMGSGEGRRKAFTT
::::::::::::::::.:.:::::::.::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS31 FPSLLILSCNDTSIFEEVIFICCIVMLVFPVAIIIASYARVILAVIHMGSGEGRCKAFTT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHLMVVGMYYGAGLFMYIRPTSDRSPMQDKLVSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
::::::::::::::.::::::::::.:: :::.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CSSHLMVVGMYYGAALFMYIRPTSDHSPTQDKMVSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LRKVLGKGKCGE
. :.:::::
CCDS31 FMKILGKGKSESELPHKLYVLLFAKFFFLISIFFYDVKILALIMYIA
310 320 330 340
>>CCDS31108.1 OR2M4 gene_id:26245|Hs108|chr1 (311 aa)
initn: 1573 init1: 1551 opt: 1558 Z-score: 1123.2 bits: 216.0 E(32554): 3e-56
Smith-Waterman score: 1558; 74.4% identity (90.3% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAWENQTFNSDFILLGIFNHSPTHTFLFFLVLAIFSVAFMGNSVMVLLIYLDTQLHTPMY
:.:::::::: ::::::::::::::::: :::.:::.:.: : ::::::.. :::::::
CCDS31 MVWENQTFNSIFILLGIFNHSPTHTFLFSLVLGIFSLALMENISMVLLIYIEKQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLSQLFLMDLMLICSTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCATQIFFYVSLLGSECFLLAVMSY
:::::: ::::::::.:.::: :.::::.::::.:::.:::::::::::.::::::::.:
CCDS31 FLLSQLSLMDLMLICTTLPKMIFSYLSGKKSISLAGCGTQIFFYVSLLGAECFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYIAICHPLRYTNLMRPKICGLMTAFSWILGSMDAIIDAVATFSFSYCGSREIAHFFCD
:::.::::::.:: :: ::.: .::. :: :::.:.:: .:..:::::.: :: :::::
CCDS31 DRYVAICHPLQYTILMNPKLCVFMTVASWTLGSLDGIIVLAAVLSFSYCSSLEIHHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FPSLLILSCNDTSIFEKVLFICCIVMIVFPVAIIIASYARVILAVIHMGSGEGRRKAFTT
.:: :::..:: ::..: :::.::..:::..:: ::..:. :::::::::.:::::::
CCDS31 VAALLPLSCTETSAFERLLVICCVVMLIFPVSVIILSYSHVLRAVIHMGSGESRRKAFTT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHLMVVGMYYGAGLFMYIRPTSDRSPMQDKLVSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
::::: :::.::::..:::.::.: ..: :::.::.::::::::::::::::::::: ::
CCDS31 CSSHLSVVGLYYGAAMFMYMRPASKHTPDQDKMVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVFRA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LRKVLGKGKCGE
:.::: : :
CCDS31 LQKVLKKRKLI
310
>>CCDS31100.1 OR2T8 gene_id:343172|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1269 init1: 1238 opt: 1238 Z-score: 898.7 bits: 174.4 E(32554): 9.8e-44
Smith-Waterman score: 1238; 56.6% identity (84.2% similar) in 304 aa overlap (4-307:2-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MAWENQTFNSDFILLGIFNHSPTHTFLFFLVLAIFSVAFMGNSVMVLLIYLDTQLHTPMY
:: ...: :::::.:::. .: ::..::.: ....:::.:.:::. : .::::::
CCDS31 MENGSYTSYFILLGLFNHTRAHQVLFMMVLSIVLTSLFGNSLMILLIHWDHRLHTPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLSQLFLMDLMLICSTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCATQIFFYVSLLGSECFLLAVMSY
:::::: :::.::. .:::::: .::.:::.:: :::..:::: .: :.::::::.:.:
CCDS31 FLLSQLSLMDVMLVSTTVPKMAADYLTGSKAISRAGCGAQIFFLPTLGGGECFLLAAMAY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
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CCDS31 DRYAAVCHPLRYPTLMSWQLCLRMTMSSWLLGAADGLLQAVATLSFPYCGAHEIDHFFCE
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CCDS31 LKRWLGTCVNLKHQQNEAHRSR
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CCDS58 EVQALLKLACADTSLFDTLLFACCVFMLLLPFSIIMASYACILGAVLRIRSAQAWKKALA
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CCDS58 ALRKGLDRCRIGSQH
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]