Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5967
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5967, 312 aa
1>>>pF1KE5967 312 - 312 aa - 312 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7764+/-0.00139; mu= 12.6960+/- 0.081
mean_var=143.0050+/-46.529, 0's: 0 Z-trim(100.8): 410 B-trim: 728 in 2/43
Lambda= 0.107250
statistics sampled from 5728 (6256) to 5728 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.532), E-opt: 0.2 (0.192), width: 16
Scan time: 1.990
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 ( 312) 2033 327.3 9.7e-90
CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 ( 313) 1525 248.6 4.5e-66
CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 1488 242.9 2.4e-64
CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 ( 314) 1190 196.8 1.8e-50
CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 ( 315) 1141 189.2 3.5e-48
CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 ( 312) 1103 183.4 2e-46
CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 ( 317) 1086 180.7 1.3e-45
CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 ( 342) 1083 180.3 1.8e-45
CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 ( 314) 1060 176.7 2e-44
CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 ( 314) 1056 176.1 3.1e-44
CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 ( 318) 1055 175.9 3.5e-44
CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 ( 321) 1052 175.5 4.9e-44
CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 ( 314) 1051 175.3 5.4e-44
CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 ( 320) 1022 170.8 1.2e-42
CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 ( 312) 987 165.4 5.1e-41
CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 ( 312) 986 165.2 5.7e-41
CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 ( 326) 983 164.8 8.1e-41
CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 ( 324) 972 163.1 2.6e-40
CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 ( 321) 971 162.9 2.9e-40
CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 ( 312) 963 161.7 6.7e-40
CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 ( 325) 954 160.3 1.8e-39
CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 ( 320) 941 158.3 7.2e-39
CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 ( 317) 940 158.1 8e-39
CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 ( 321) 938 157.8 1e-38
CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 ( 317) 937 157.7 1.1e-38
CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 ( 324) 933 157.1 1.7e-38
CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 ( 311) 928 156.3 2.9e-38
CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 ( 323) 928 156.3 2.9e-38
CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 ( 329) 915 154.3 1.2e-37
CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 ( 318) 894 151.0 1.1e-36
CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 886 149.8 2.8e-36
CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 874 147.9 9.4e-36
CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 ( 320) 859 145.6 4.8e-35
CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 856 145.1 6.5e-35
CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 ( 310) 855 145.0 7.2e-35
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 848 143.9 1.6e-34
CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 840 142.7 3.8e-34
CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 ( 312) 829 141.0 1.2e-33
CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 766 131.2 1e-30
CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 ( 350) 748 128.5 7.5e-30
CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 ( 324) 730 125.7 4.9e-29
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 722 124.4 1.1e-28
CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 720 124.1 1.4e-28
CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 718 123.8 1.8e-28
CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 712 122.9 3.6e-28
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 706 121.9 6.4e-28
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 679 117.8 1.1e-26
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 585 103.2 2.7e-22
CCDS31639.1 OR2AT4 gene_id:341152|Hs108|chr11 ( 320) 579 102.3 5.3e-22
CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 ( 311) 551 97.9 1e-20
>>CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 2033 init1: 2033 opt: 2033 Z-score: 1724.6 bits: 327.3 E(32554): 9.7e-90
Smith-Waterman score: 2033; 100.0% identity (100.0% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSVLNNSEVKLFLLIGIPGLEHAHIWFSIPICLMYLLAIMGNCTILFIIKTEPSLHEPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MSVLNNSEVKLFLLIGIPGLEHAHIWFSIPICLMYLLAIMGNCTILFIIKTEPSLHEPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YFLAMLAVSDMGLSLSSLPTMLRVFLFNAMGISPNACFAQEFFIHGFTVMESSVLLIMSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YFLAMLAVSDMGLSLSSLPTMLRVFLFNAMGISPNACFAQEFFIHGFTVMESSVLLIMSL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRFLAIHNPLRYSSILTSNRVAKMGLILAIRSILLVIPFPFTLRRLKYCQKNLLSHSYCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DRFLAIHNPLRYSSILTSNRVAKMGLILAIRSILLVIPFPFTLRRLKYCQKNLLSHSYCL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 HQDTMKLACSDNKTNVIYGFFIALCTMLDLALIVLSYVLILKTILSIASLAERLKALNTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HQDTMKLACSDNKTNVIYGFFIALCTMLDLALIVLSYVLILKTILSIASLAERLKALNTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 VSHICAVLTFYVPIITLAAMHHFAKHKSPLVVILIADMFLLVPPLMNPIVYCVKTRQIWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VSHICAVLTFYVPIITLAAMHHFAKHKSPLVVILIADMFLLVPPLMNPIVYCVKTRQIWE
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 KILGKLLNVCGR
::::::::::::
CCDS31 KILGKLLNVCGR
310
>>CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 (313 aa)
initn: 1507 init1: 1507 opt: 1525 Z-score: 1299.7 bits: 248.6 E(32554): 4.5e-66
Smith-Waterman score: 1525; 71.0% identity (90.8% similar) in 314 aa overlap (1-312:1-311)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSVLNNS--EVKLFLLIGIPGLEHAHIWFSIPICLMYLLAIMGNCTILFIIKTEPSLHEP
::..:.: :. :.:.:.::::.::::.::::: :::.::.:: :::::::::::::::
CCDS31 MSIINTSYVEITTFFLVGMPGLEYAHIWISIPICSMYLIAILGNGTILFIIKTEPSLHEP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 MYYFLAMLAVSDMGLSLSSLPTMLRVFLFNAMGISPNACFAQEFFIHGFTVMESSVLLIM
:::::.:::.::.:::::::::.: .::::: :: :::::::::::::.:.::::::::
CCDS31 MYYFLSMLAMSDLGLSLSSLPTVLSIFLFNAPEISSNACFAQEFFIHGFSVLESSVLLIM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 SLDRFLAIHNPLRYSSILTSNRVAKMGLILAIRSILLVIPFPFTLRRLKYCQKNLLSHSY
:.::::::::::::.::::. :::..:......:.:::.::::::: :.::.:: :::::
CCDS31 SFDRFLAIHNPLRYTSILTTVRVAQIGIVFSFKSMLLVLPFPFTLRNLRYCKKNQLSHSY
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 CLHQDTMKLACSDNKTNVIYGFFIALCTMLDLALIVLSYVLILKTILSIASLAERLKALN
:::::.::::::::. .:::::: ::: :.:. ::..::.:::::.:.::: :.:::::
CCDS31 CLHQDVMKLACSDNRIDVIYGFFGALCLMVDFILIAVSYTLILKTVLGIASKKEQLKALN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCVSHICAVLTFYVPIITLAAMHHFAKHKSPLVVILIADMFLLVPPLMNPIVYCVKTRQI
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CCDS31 TCVSHICAVIIFYLPIINLAVVHRFARHVSPLINVLMANVLLLVPPLTNPIVYCVKTKQI
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 WEKILGKLLNVCGR
....:: : :
CCDS31 RVRVVAKL---CQRKI
310
>>CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 (313 aa)
initn: 1472 init1: 1472 opt: 1488 Z-score: 1268.8 bits: 242.9 E(32554): 2.4e-64
Smith-Waterman score: 1488; 70.5% identity (90.9% similar) in 308 aa overlap (1-306:1-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSVLNNS--EVKLFLLIGIPGLEHAHIWFSIPICLMYLLAIMGNCTILFIIKTEPSLHEP
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CCDS31 MSIINTSYVEITTFFLVGMPGLEYAHIWISIPICSMYLIAILGNGTILFIIKTEPSLHGP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 MYYFLAMLAVSDMGLSLSSLPTMLRVFLFNAMGISPNACFAQEFFIHGFTVMESSVLLIM
:::::.:::.::.:::::::::.: .::::: : .::::::::::::.:.::::::::
CCDS31 MYYFLSMLAMSDLGLSLSSLPTVLSIFLFNAPETSSSACFAQEFFIHGFSVLESSVLLIM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 SLDRFLAIHNPLRYSSILTSNRVAKMGLILAIRSILLVIPFPFTLRRLKYCQKNLLSHSY
:.::::::::::::.::::. :::..:......:.:::.::::::: :.::.:: :::::
CCDS31 SFDRFLAIHNPLRYTSILTTVRVAQIGIVFSFKSMLLVLPFPFTLRSLRYCKKNQLSHSY
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 CLHQDTMKLACSDNKTNVIYGFFIALCTMLDLALIVLSYVLILKTILSIASLAERLKALN
:::::.::::::::. .:::::: ::: :.:. ::..::.:::::. .::: :.:::::
CCDS31 CLHQDVMKLACSDNRIDVIYGFFGALCLMVDFILIAVSYTLILKTVPGIASKKEELKALN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCVSHICAVLTFYVPIITLAAMHHFAKHKSPLVVILIADMFLLVPPLMNPIVYCVKTRQI
:::::::::. ::.:::.::..:.:: : :::. .:.:...:::::::.::::::::.::
CCDS31 TCVSHICAVIIFYLPIINLAVVHRFAGHVSPLINVLMANVLLLVPPLMKPIVYCVKTKQI
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 WEKILGKLLNVCGR
....::
CCDS31 RVRVVAKLCQWKI
310
>>CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1202 init1: 823 opt: 1190 Z-score: 1019.6 bits: 196.8 E(32554): 1.8e-50
Smith-Waterman score: 1190; 60.6% identity (84.2% similar) in 292 aa overlap (12-302:17-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSVLNNSEVKLFLLIGIPGLEHAHIWFSIPICLMYLLAIMGNCTILFIIKTEPSL
::: ::::::. :::.:::.:.:::..: :::::::::::: ::
CCDS31 MTLGSLGNSSSSVSATFLLSGIPGLERMHIWISIPLCFMYLVSIPGNCTILFIIKTERSL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 HEPMYYFLAMLAVSDMGLSLSSLPTMLRVFLFNAMGISPNACFAQEFFIHGFTVMESSVL
::::: ::.:::. :.:::: .:::.: .: .: :: .::::: :::: :. .:::::
CCDS31 HEPMYLFLSMLALIDLGLSLCTLPTVLGIFWVGAREISHDACFAQLFFIHCFSFLESSVL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LIMSLDRFLAIHNPLRYSSILTSNRVAKMGLILAIRSILLVIPFPFTLRRLKYCQKNLLS
: :..:::.:: .::.: ::::.. ....::. ::. :..:.:: :.:. :: . .::
CCDS31 LSMAFDRFVAICHPLHYVSILTNTVIGRIGLVSLGRSVALIFPLPFMLKRFPYCGSPVLS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 HSYCLHQDTMKLACSDNKTNVIYGFFIALCTM-LDLALIVLSYVLILKTILSIASLAERL
:::::::..:::::.: :.: :::.:. . :. .: ::..::.:::.:.::::: :::.
CCDS31 HSYCLHQEVMKLACADMKANSIYGMFVIVSTVGIDSLLILFSYALILRTVLSIASRAERF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 KALNTCVSHICAVLTFYVPIITLAAMHHFAKHKSPLVVILIADMFLLVPPLMNPIVYCVK
:::::::::::::: ::.:.: :...:.:.:. :: .... :.:: ::.:::::: ::
CCDS31 KALNTCVSHICAVLLFYTPMIGLSVIHRFGKQAPHLVQVVMGFMYLLFPPVMNPIVYSVK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 TRQIWEKILGKLLNVCGR
:.:: ...
CCDS31 TKQIRDRVTHAFCY
310
>>CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 1099 init1: 729 opt: 1141 Z-score: 978.6 bits: 189.2 E(32554): 3.5e-48
Smith-Waterman score: 1141; 54.8% identity (82.6% similar) in 310 aa overlap (1-307:1-310)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSVLNNSEV--KLFLLIGIPGLEHAHIWFSIPICLMYLLAIMGNCTILFIIKTEPSLHEP
:. :::.. .:.: :.::::..: :.:: .:: ::.:.::: ::: .: : :::.:
CCDS31 MGDWNNSDAVEPIFILRGFPGLEYVHSWLSILFCLAYLVAFMGNVTILSVIWIESSLHQP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 MYYFLAMLAVSDMGLSLSSLPTMLRVFLFNAMGISPNACFAQEFFIHGFTVMESSVLLIM
::::...:::.:.:.:::.::::: :. ..: :. .::.:: :::: :: .:::::: :
CCDS31 MYYFISILAVNDLGMSLSTLPTMLAVLWLDAPEIQASACYAQLFFIHTFTFLESSVLLAM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 SLDRFLAIHNPLRYSSILTSNRVAKMGLILAIRSILLVIPFPFTLRRLKYCQKNLLSHSY
..:::.:: .::.: .:::.. ..:.:: .::. .:.: :. ::. .::. : :::..
CCDS31 AFDRFVAICHPLHYPTILTNSVIGKIGLACLLRSLGVVLPTPLLLRHYHYCHGNALSHAF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 CLHQDTMKLACSDNKTNVIYGFFIALCTM-LDLALIVLSYVLILKTILSIASLAERLKAL
:::::...:.:.: .:: :::. ... :. .: .:.:::::::.:.:.::: :.::::
CCDS31 CLHQDVLRLSCTDARTNSIYGLCVVIATLGVDSIFILLSYVLILNTVLDIASREEQLKAL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 NTCVSHICAVLTFYVPIITLAAMHHFAKHKSPLVVILIADMFLLVPPLMNPIVYCVKTRQ
::::::::.:: :.::.: .. .:.:.:: ::.: ::.::..::.::..::::: :.:.:
CCDS31 NTCVSHICVVLIFFVPVIGVSMVHRFGKHLSPIVHILMADIYLLLPPVLNPIVYSVRTKQ
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 IWEKILGKLLNVCGR
: :: :..
CCDS31 IRLGILHKFVLRRRF
310
>>CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1086 init1: 761 opt: 1103 Z-score: 946.9 bits: 183.4 E(32554): 2e-46
Smith-Waterman score: 1103; 51.3% identity (82.6% similar) in 304 aa overlap (1-303:1-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSVLNNSEVKLFLLIGIPGLEHAHIWFSIPICLMYLLAIMGNCTILFIIKTEPSLHEPMY
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CCDS31 MGLFNVTHPAFFLLTGIPGLESSHSWLSGPLCVMYAVALGGNTVILQAVRVEPSLHEPMY
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CCDS31 YFLSMLSFSDVAISMATLPTVLRTFCLNARNITFDACLIQMFLIHFFSMMESGILLAMSF
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CCDS31 DRYVAICDPLRYATVLTTEVIAAMGLGAAARSFITLFPLPFLIKRLPICRSNVLSHSYCL
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CCDS31 HPDMMRLACADISINSIYGLFVLVSTFGMDLFFIFLSYVLILRSVMATASREERLKALNT
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CCDS31 CVSHILAVLAFYVPMIGVSTVHRFGKHVPCYIHVLMSNVYLFVPPVLNPLIYSAKTKEIR
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CCDS31 RAIFRMFHHIKI
310
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: :
CCDS31 IQWGMLNFLSLKNMHSR
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310 320 330 340
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