Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5963
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5963, 312 aa
1>>>pF1KE5963 312 - 312 aa - 312 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4508+/-0.00154; mu= 15.3889+/- 0.090
mean_var=160.5873+/-54.034, 0's: 0 Z-trim(100.1): 422 B-trim: 650 in 2/46
Lambda= 0.101209
statistics sampled from 5482 (5997) to 5482 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.504), E-opt: 0.2 (0.184), width: 16
Scan time: 1.770
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31820.1 OR6C75 gene_id:390323|Hs108|chr12 ( 312) 2004 305.6 3.1e-83
CCDS31819.1 OR6C3 gene_id:254786|Hs108|chr12 ( 311) 1542 238.2 6.3e-63
CCDS31816.1 OR6C74 gene_id:254783|Hs108|chr12 ( 312) 1539 237.7 8.6e-63
CCDS31823.1 OR6C76 gene_id:390326|Hs108|chr12 ( 312) 1516 234.4 8.8e-62
CCDS31821.1 OR6C65 gene_id:403282|Hs108|chr12 ( 312) 1503 232.5 3.3e-61
CCDS31818.1 OR6C1 gene_id:390321|Hs108|chr12 ( 312) 1500 232.0 4.4e-61
CCDS31817.1 OR6C6 gene_id:283365|Hs108|chr12 ( 314) 1467 227.2 1.3e-59
CCDS31825.1 OR6C70 gene_id:390327|Hs108|chr12 ( 312) 1445 224.0 1.2e-58
CCDS31827.1 OR6C4 gene_id:341418|Hs108|chr12 ( 309) 1439 223.1 2.1e-58
CCDS31824.1 OR6C2 gene_id:341416|Hs108|chr12 ( 312) 1418 220.1 1.8e-57
CCDS58241.1 OR2AP1 gene_id:121129|Hs108|chr12 ( 309) 1362 211.9 5.1e-55
CCDS31826.2 OR6C68 gene_id:403284|Hs108|chr12 ( 312) 1341 208.8 4.3e-54
CCDS31700.1 OR6T1 gene_id:219874|Hs108|chr11 ( 323) 1014 161.1 1e-39
CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1 ( 308) 977 155.7 4.3e-38
CCDS31696.1 OR6M1 gene_id:390261|Hs108|chr11 ( 313) 969 154.5 9.7e-38
CCDS31695.1 OR6X1 gene_id:390260|Hs108|chr11 ( 312) 953 152.2 4.9e-37
CCDS32038.1 OR6S1 gene_id:341799|Hs108|chr14 ( 331) 925 148.1 8.6e-36
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 924 148.0 9.5e-36
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 923 147.8 1e-35
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 923 147.8 1e-35
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 922 147.7 1.1e-35
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 915 146.6 2.3e-35
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 914 146.5 2.5e-35
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 909 145.8 4.3e-35
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 905 145.2 6.3e-35
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 905 145.2 6.4e-35
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 902 144.7 8.6e-35
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 900 144.4 1e-34
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 900 144.4 1.1e-34
CCDS43667.1 OR6B1 gene_id:135946|Hs108|chr7 ( 311) 897 144.0 1.4e-34
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 897 144.0 1.5e-34
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 895 143.7 1.7e-34
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 891 143.1 2.6e-34
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 890 143.0 2.9e-34
CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 ( 309) 888 142.7 3.5e-34
CCDS31541.1 OR6Q1 gene_id:219952|Hs108|chr11 ( 317) 888 142.7 3.6e-34
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 888 142.7 3.6e-34
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 887 142.5 3.9e-34
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 887 142.6 4e-34
CCDS47728.1 OR6V1 gene_id:346517|Hs108|chr7 ( 313) 885 142.3 4.8e-34
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 881 141.7 7.2e-34
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 880 141.5 7.9e-34
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 880 141.6 8.5e-34
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 879 141.4 8.8e-34
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 877 141.1 1.1e-33
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 877 141.1 1.1e-33
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 875 140.8 1.3e-33
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 871 140.2 2e-33
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 871 140.2 2e-33
CCDS43661.1 OR9A4 gene_id:130075|Hs108|chr7 ( 314) 871 140.2 2e-33
>>CCDS31820.1 OR6C75 gene_id:390323|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 2004 init1: 2004 opt: 2004 Z-score: 1607.7 bits: 305.6 E(32554): 3.1e-83
Smith-Waterman score: 2004; 100.0% identity (100.0% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MRNSTAVTDFILLGLTSDPQWQVVLFIFLLVTYMLSVTGNLIIITLTLSDPHLQTPMYFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MRNSTAVTDFILLGLTSDPQWQVVLFIFLLVTYMLSVTGNLIIITLTLSDPHLQTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LRNFSFLEISFTSVCIPRFLVTVVTGNRTISYNGCVAQLFFFIFLGVTEFYLLAAMSYDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LRNFSFLEISFTSVCIPRFLVTVVTGNRTISYNGCVAQLFFFIFLGVTEFYLLAAMSYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 CMAICKPLHYTIIMSTRVCTLLVFSSWLAGFLIIFPPVMLLLQLDFCASNVIDHFICDSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CMAICKPLHYTIIMSTRVCTLLVFSSWLAGFLIIFPPVMLLLQLDFCASNVIDHFICDSS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PMLQLSCTNTHFLELMAFFLAVVTLMVTLTLVILSYTNIIRTILKIPSMSQRKKAFSTCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PMLQLSCTNTHFLELMAFFLAVVTLMVTLTLVILSYTNIIRTILKIPSMSQRKKAFSTCS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SHMIVVSISYSSCIFMYIKTSARERVTLSKGVAVLNTSVAPLLNPFIYTLRNKQVKQAFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SHMIVVSISYSSCIFMYIKTSARERVTLSKGVAVLNTSVAPLLNPFIYTLRNKQVKQAFK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 SMVQKMIFSLNK
::::::::::::
CCDS31 SMVQKMIFSLNK
310
>>CCDS31819.1 OR6C3 gene_id:254786|Hs108|chr12 (311 aa)
initn: 1582 init1: 1532 opt: 1542 Z-score: 1243.2 bits: 238.2 E(32554): 6.3e-63
Smith-Waterman score: 1542; 71.9% identity (91.9% similar) in 310 aa overlap (3-312:2-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MRNSTAVTDFILLGLTSDPQWQVVLFIFLLVTYMLSVTGNLIIITLTLSDPHLQTPMYFF
: : ::.:.::::..::. :.:.:.::..::.::::::: :::::. : :::::::::
CCDS31 MNHTMVTEFVLLGLSDDPDLQIVIFLFLFITYILSVTGNLTIITLTFVDSHLQTPMYFF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LRNFSFLEISFTSVCIPRFLVTVVTGNRTISYNGCVAQLFFFIFLGVTEFYLLAAMSYDR
::::::::::::.::::::: ...: :.:::::.:.::::::::.::::::.:.::::::
CCDS31 LRNFSFLEISFTTVCIPRFLGAIITRNKTISYNNCAAQLFFFIFMGVTEFYILTAMSYDR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 CMAICKPLHYTIIMSTRVCTLLVFSSWLAGFLIIFPPVMLLLQLDFCASNVIDHFICDSS
.::::::::: ::. ..:::::. .::.::: ::::.:::::::.::::::::: ::
CCDS31 YVAICKPLHYTSIMNRKLCTLLVLCAWLSGFLTIFPPLMLLLQLDYCASNVIDHFACDYF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PMLQLSCTNTHFLELMAFFLAVVTLMVTLTLVILSYTNIIRTILKIPSMSQRKKAFSTCS
:.:::::..: .::...:..:.:::. ::.:::::: ::::::.::: :::::::::::
CCDS31 PLLQLSCSDTWLLEVIGFYFALVTLLFTLALVILSYMYIIRTILRIPSASQRKKAFSTCS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SHMIVVSISYSSCIFMYIKTSARERVTLSKGVAVLNTSVAPLLNPFIYTLRNKQVKQAFK
:::::.::::.:::::: . ::.:...:.::.:.:::::::.::::::::::.:::::::
CCDS31 SHMIVISISYGSCIFMYANPSAKEKASLTKGIAILNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQAFK
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 SMVQKMIFSLNK
..:.:..: :.
CCDS31 NVVHKVVFYANQ
300 310
>>CCDS31816.1 OR6C74 gene_id:254783|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 1560 init1: 1533 opt: 1539 Z-score: 1240.8 bits: 237.7 E(32554): 8.6e-63
Smith-Waterman score: 1539; 73.0% identity (93.2% similar) in 311 aa overlap (1-310:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MRNSTAVTDFILLGLTSDPQWQVVLFIFLLVTYMLSVTGNLIIITLTLSDPHLQTPMYFF
::: :.:..:::::::.::: ::..:..:. :::::.:::: :::::: : ::.::::::
CCDS31 MRNHTTVANFILLGLTDDPQLQVIIFLLLFFTYMLSITGNLTIITLTLLDLHLKTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LRNFSFLEISFTSVCIPRFLVTVVTGNRTISYNGCVAQLFFFIFLGVTEFYLLAAMSYDR
::::::::.:::.: ::.:::...::..::::: :.::::: :.::.:::.:::::::.:
CCDS31 LRNFSFLEVSFTTVYIPKFLVSMATGDKTISYNDCAAQLFFTILLGATEFFLLAAMSYER
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 CMAICKPLHYTIIMSTRVCTLLVFSSWLAGFLIIFPPVMLLLQLDFCASNVIDHFICDSS
.::::::::: :::.:::.::::.::.:::::::::... :::::::.:..:::.:: :
CCDS31 YVAICKPLHYTTIMSSRVCSLLVFASWMAGFLIIFPPLLMGLQLDFCAANTVDHFFCDVS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PMLQLSCTNTHFLELMAFFLAVVTLMVTLTLVILSYTNIIRTILKIPSMSQRKKAFSTCS
:.::::::.: ..::: .. :..::.:::.:::::::::::::::::: .::::::::::
CCDS31 PILQLSCTDTDIIELMMLLSAILTLLVTLVLVILSYTNIIRTILKIPSSQQRKKAFSTCS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SHMIVVSISYSSCIFMYIKTSARERVTLSKGVAVLNTSVAPLLNPFIYTLRNKQVKQAFK
:::.::::::.::::::.: ::.:::.:.::.:.:.:::::.::::::::::::::..::
CCDS31 SHMVVVSISYGSCIFMYVKPSAKERVSLNKGIALLSTSVAPMLNPFIYTLRNKQVKDVFK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 SMVQKM-IFSLNK
:.:. .::.
CCDS31 HTVKKIELFSMK
310
>>CCDS31823.1 OR6C76 gene_id:390326|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 1557 init1: 1212 opt: 1516 Z-score: 1222.7 bits: 234.4 E(32554): 8.8e-62
Smith-Waterman score: 1516; 74.2% identity (91.2% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MRNSTAVTDFILLGLTSDPQWQVVLFIFLLVTYMLSVTGNLIIITLTLSDPHLQTPMYFF
:.: :.::::::::::..:: :::.: ::..::.::::::: ::.::: : ::.::::::
CCDS31 MKNRTSVTDFILLGLTDNPQLQVVIFSFLFLTYVLSVTGNLTIISLTLLDSHLKTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LRNFSFLEISFTSVCIPRFLVTVVTGNRTISYNGCVAQLFFFIFLGVTEFYLLAAMSYDR
::::: ::::::::: ::::....::...::::.:.:::::::::: :::.:::.::::
CCDS31 LRNFS-LEISFTSVCNPRFLISILTGDKSISYNACAAQLFFFIFLGSTEFFLLASMSYDC
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 CMAICKPLHYTIIMSTRVCTLLVFSSWLAGFLIIFPPVMLLLQLDFCASNVIDHFICDSS
.::::::::: ::: :.: :..::::::::.::::. . :::::: ::::::: :::.
CCDS31 YVAICKPLHYTTIMSDRICYQLIISSWLAGFLVIFPPLAMGLQLDFCDSNVIDHFTCDSA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PMLQLSCTNTHFLELMAFFLAVVTLMVTLTLVILSYTNIIRTILKIPSMSQRKKAFSTCS
:.::.:::.: ::::.:.::. ::. :: ::::::: ::::::.::: .::::::::::
CCDS31 PLLQISCTDTSTLELMSFILALFTLISTLILVILSYTYIIRTILRIPSAQQRKKAFSTCS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SHMIVVSISYSSCIFMYIKTSARERVTLSKGVAVLNTSVAPLLNPFIYTLRNKQVKQAFK
::.:::::::.::::::.::::.: :.:.::::.:::::::.::::::::::.:::::::
CCDS31 SHVIVVSISYGSCIFMYVKTSAKEGVALTKGVAILNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQAFK
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 SMVQKMIFSLNK
....:.
CCDS31 DVLRKISHKKKKH
300 310
>>CCDS31821.1 OR6C65 gene_id:403282|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 1521 init1: 1470 opt: 1503 Z-score: 1212.4 bits: 232.5 E(32554): 3.3e-61
Smith-Waterman score: 1503; 72.8% identity (92.6% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MRNSTAVTDFILLGLTSDPQWQVVLFIFLLVTYMLSVTGNLIIITLTLSDPHLQTPMYFF
: : :.. .:::::.:..:. :::.:.:.:.::.:::.::.::: ::::. ::.::::::
CCDS31 MPNMTSIREFILLGFTDNPELQVVIFFFMLITYLLSVSGNMIIIMLTLSNIHLKTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LRNFSFLEISFTSVCIPRFLVTVVTGNRTISYNGCVAQLFFFIFLGVTEFYLLAAMSYDR
::::::::::::.: :::::....::. :::::. .::.::.:.:: :::.:::.:::::
CCDS31 LRNFSFLEISFTTVFIPRFLINIATGDTTISYNASMAQVFFLILLGSTEFFLLAVMSYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 CMAICKPLHYTIIMSTRVCTLLVFSSWLAGFLIIFPPVMLLLQLDFCASNVIDHFICDSS
.::::::::: :::..::. ::.::::::::::::::.. :::::: :..:::::::::
CCDS31 YVAICKPLHYTTIMSNKVCNWLVISSWLAGFLIIFPPVIMGLQLDFCDSSTIDHFICDSS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 PMLQLSCTNTHFLELMAFFLAVVTLMVTLTLVILSYTNIIRTILKIPSMSQRKKAFSTCS
::: ..::.:.:::::::.::: ::::::.::.:::: :..::::::: .::::::::::
CCDS31 PMLLIACTDTQFLELMAFLLAVFTLMVTLALVVLSYTLILKTILKIPSAQQRKKAFSTCS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SHMIVVSISYSSCIFMYIKTSARERVTLSKGVAVLNTSVAPLLNPFIYTLRNKQVKQAFK
:::::::.::.::::: .::::.: ..::::::::::::::.::::::::::.:::::..
CCDS31 SHMIVVSVSYGSCIFMCVKTSAKEGMALSKGVAVLNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQALR
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 SMVQKMIFSLNK
...: :.::::
CCDS31 EFTKK-ILSLNKQ
310
>>CCDS31818.1 OR6C1 gene_id:390321|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 1556 init1: 1500 opt: 1500 Z-score: 1210.0 bits: 232.0 E(32554): 4.4e-61
Smith-Waterman score: 1500; 71.1% identity (90.6% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MRNSTAVTDFILLGLTSDPQWQVVLFIFLLVTYMLSVTGNLIIITLTLSDPHLQTPMYFF
::: : .:.:::::::.::..:::.:.:::.:::::.:::: .::.:: : :::::::::
CCDS31 MRNHTEITEFILLGLTDDPNFQVVIFVFLLITYMLSITGNLTLITITLLDSHLQTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LRNFSFLEISFTSVCIPRFLVTVVTGNRTISYNGCVAQLFFFIFLGVTEFYLLAAMSYDR
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310
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310
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CCDS31 DVLQKNLCFSKRPF
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CCDS31 YVAICKPLRYMSIMSNKVCYQLVFSSWVTGFLIIFTPLILGLNLDFCASNIIDHFICDIS
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CCDS31 SHMIVVSITYGSCMFIYIKPSANERVALSKGVTVLNTSVAPLLNPFIYTLRNQQVKQAFK
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310
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CCDS31 LRNFSFLEISFTSIFIPRFLTSMTTGNKVISFAGCLTQYFFAIFLGATEFYLLASMSYDR
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CCDS31 YVAICKPLHYLTIMSSRVCIQLVFCSWLGGFLAILPPIILMTQVDFCVSNILNHYYCDYG
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CCDS31 PLVELACSDTSLLELMVILLAVVTLMVTLVLVTLSYTYIIRTILRIPSAQQRTKAFSTCS
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CCDS31 LRNFSFLEVSFTTVCIPRFLYNISMGDNTITYNACASQIFFVILFGATEFFLLAAMSYDR
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CCDS31 YVAICKPLHYVVIMNNRVCTLLVLCCWVAGLMIIVPPLSLGLQLEFCDSNAIDHFSCDAG
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CCDS31 DSIKRIAFLSKK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]