Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5960
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5960, 312 aa
1>>>pF1KE5960 312 - 312 aa - 312 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8156+/-0.00137; mu= 13.0530+/- 0.079
mean_var=143.1829+/-43.744, 0's: 0 Z-trim(101.4): 384 B-trim: 770 in 2/45
Lambda= 0.107184
statistics sampled from 6047 (6521) to 6047 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.53), E-opt: 0.2 (0.2), width: 16
Scan time: 1.230
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32342.1 OR4F15 gene_id:390649|Hs108|chr15 ( 312) 2062 331.4 5.5e-91
CCDS34792.1 OR4F21 gene_id:441308|Hs108|chr8 ( 312) 1527 248.7 4.4e-66
CCDS43415.1 OR4F3 gene_id:26683|Hs108|chr5 ( 312) 1525 248.4 5.5e-66
CCDS41221.1 OR4F16 gene_id:81399|Hs108|chr1 ( 312) 1525 248.4 5.5e-66
CCDS72675.1 OR4F29 gene_id:729759|Hs108|chr1 ( 312) 1525 248.4 5.5e-66
CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15 ( 312) 1492 243.3 1.9e-64
CCDS32343.1 OR4F4 gene_id:26682|Hs108|chr15 ( 305) 1233 203.2 2.1e-52
CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 ( 305) 1221 201.3 7.6e-52
CCDS30547.1 OR4F5 gene_id:79501|Hs108|chr1 ( 305) 1217 200.7 1.2e-51
CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 ( 323) 1175 194.3 1.1e-49
CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 ( 314) 1150 190.4 1.6e-48
CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 ( 343) 1145 189.6 2.8e-48
CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 ( 348) 1145 189.7 2.9e-48
CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 1130 187.3 1.3e-47
CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 ( 304) 1110 184.2 1.1e-46
CCDS32029.1 OR4L1 gene_id:122742|Hs108|chr14 ( 312) 1077 179.1 3.9e-45
CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 ( 310) 1072 178.3 6.7e-45
CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 1060 176.5 2.4e-44
CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 ( 314) 1049 174.8 7.9e-44
CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 ( 308) 1028 171.5 7.4e-43
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 1024 170.9 1.1e-42
CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 ( 313) 1013 169.2 3.7e-42
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 1011 168.9 4.6e-42
CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 ( 307) 1005 167.9 8.7e-42
CCDS31563.1 OR4D11 gene_id:219986|Hs108|chr11 ( 311) 1004 167.8 9.8e-42
CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 ( 307) 1000 167.2 1.5e-41
CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 ( 370) 993 166.2 3.5e-41
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 988 165.3 5.4e-41
CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 ( 309) 983 164.5 9.2e-41
CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 ( 309) 983 164.5 9.2e-41
CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 ( 316) 980 164.1 1.3e-40
CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 977 163.6 1.8e-40
CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 ( 344) 974 163.2 2.6e-40
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 973 163.0 2.7e-40
CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 ( 309) 965 161.8 6.4e-40
CCDS53636.1 OR4D10 gene_id:390197|Hs108|chr11 ( 311) 960 161.0 1.1e-39
CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 ( 309) 952 159.7 2.6e-39
CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11 ( 329) 950 159.5 3.3e-39
CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11 ( 309) 947 159.0 4.4e-39
CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 ( 309) 941 158.0 8.3e-39
CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11 ( 314) 928 156.0 3.4e-38
CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 ( 310) 916 154.2 1.2e-37
CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11 ( 309) 914 153.9 1.5e-37
CCDS31487.1 OR4X1 gene_id:390113|Hs108|chr11 ( 305) 911 153.4 2.1e-37
CCDS31504.1 OR4P4 gene_id:81300|Hs108|chr11 ( 312) 909 153.1 2.6e-37
CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11 ( 315) 873 147.5 1.2e-35
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 868 146.8 2.1e-35
CCDS31704.1 OR10G8 gene_id:219869|Hs108|chr11 ( 311) 855 144.7 8.4e-35
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 839 142.3 4.8e-34
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 838 142.1 5.2e-34
>>CCDS32342.1 OR4F15 gene_id:390649|Hs108|chr15 (312 aa)
initn: 2062 init1: 2062 opt: 2062 Z-score: 1746.9 bits: 331.4 E(32554): 5.5e-91
Smith-Waterman score: 2062; 100.0% identity (100.0% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNGMNHSVVSEFVFMGLTNSREIQLLLFVFSLLFYFASMMGNLVIVFTVTMDAHLHSPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MNGMNHSVVSEFVFMGLTNSREIQLLLFVFSLLFYFASMMGNLVIVFTVTMDAHLHSPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLANLSIIDMAFCSITAPKMICDIFKKHKAISFRGCITQIFFSHALGGTEMVLLIAMAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FLLANLSIIDMAFCSITAPKMICDIFKKHKAISFRGCITQIFFSHALGGTEMVLLIAMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYMAICKPLHYLTIMSPRMCLYFLATSSIIGLIHSLVQLVFVVDLPFCGPNIFDSFYCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DRYMAICKPLHYLTIMSPRMCLYFLATSSIIGLIHSLVQLVFVVDLPFCGPNIFDSFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LPRLLRLACTNTQELEFMVTVNSGLISVGSFVLLVISYIFILFTVWKHSSGGLAKALSTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LPRLLRLACTNTQELEFMVTVNSGLISVGSFVLLVISYIFILFTVWKHSSGGLAKALSTL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SAHVTVVILFFGPLMFFYTWPSPTSHLDKYLAIFDAFITPFLNPVIYTFRNKDMKVAMRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SAHVTVVILFFGPLMFFYTWPSPTSHLDKYLAIFDAFITPFLNPVIYTFRNKDMKVAMRR
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LCSRLAHFTKIL
::::::::::::
CCDS32 LCSRLAHFTKIL
310
>>CCDS34792.1 OR4F21 gene_id:441308|Hs108|chr8 (312 aa)
initn: 1527 init1: 1527 opt: 1527 Z-score: 1299.8 bits: 248.7 E(32554): 4.4e-66
Smith-Waterman score: 1527; 71.1% identity (90.4% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNGMNHSVVSEFVFMGLTNSREIQLLLFVFSLLFYFASMMGNLVIVFTVTMDAHLHSPMY
:.: ::::::::.:.:::.: ::::::.::: ..: ::. ::. :::.:: : :::::::
CCDS34 MDGENHSVVSEFLFLGLTHSWEIQLLLLVFSSVLYVASITGNIFIVFSVTTDPHLHSPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLANLSIIDMAFCSITAPKMICDIFKKHKAISFRGCITQIFFSHALGGTEMVLLIAMAF
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CCDS34 FLLASLSFIDLGACSVTSPKMIYDLFRKRKVISFGGCIAQIFFIHVIGGVEMVLLIAMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYMAICKPLHYLTIMSPRMCLYFLATSSIIGLIHSLVQLVFVVDLPFCGPNIFDSFYCD
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CCDS34 DRYVALCKPLHYLTIMSPRMCLSFLAVAWTLGVSHSLFQLAFLVNLAFCGPNVLDSFYCD
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190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LPRLLRLACTNTQELEFMVTVNSGLISVGSFVLLVISYIFILFTVWKHSSGGLAKALSTL
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CCDS34 LPRLLRLACTDTYRLQFMVTVNSGFICVGTFFILLISYVFILFTVWKHSSGGSSKALSTL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SAHVTVVILFFGPLMFFYTWPSPTSHLDKYLAIFDAFITPFLNPVIYTFRNKDMKVAMRR
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CCDS34 SAHSTVVLLFFGPPMFVYTRPHPNSQMDKFLAIFDAVLTPFLNPVVYTFRNKEMKAAIKR
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LCSRLAHFTKIL
.:..:. . ::
CCDS34 VCKQLVIYKKIS
310
>>CCDS43415.1 OR4F3 gene_id:26683|Hs108|chr5 (312 aa)
initn: 1557 init1: 1510 opt: 1525 Z-score: 1298.2 bits: 248.4 E(32554): 5.5e-66
Smith-Waterman score: 1525; 70.7% identity (90.7% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNGMNHSVVSEFVFMGLTNSREIQLLLFVFSLLFYFASMMGNLVIVFTVTMDAHLHSPMY
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CCDS43 MDGENHSVVSEFLFLGLTHSWEIQLLLLVFSSVLYVASITGNILIVFSVTTDPHLHSPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 FLLANLSIIDMAFCSITAPKMICDIFKKHKAISFRGCITQIFFSHALGGTEMVLLIAMAF
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CCDS43 FLLASLSFIDLGACSVTSPKMIYDLFRKRKVISFGGCIAQIFFIHVVGGVEMVLLIAMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYMAICKPLHYLTIMSPRMCLYFLATSSIIGLIHSLVQLVFVVDLPFCGPNIFDSFYCD
:::.:.:::::::::::::::: :::.. .:. ::: ::.:.:.: :::::..::::::
CCDS43 DRYVALCKPLHYLTIMSPRMCLSFLAVAWTLGVSHSLFQLAFLVNLAFCGPNVLDSFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LPRLLRLACTNTQELEFMVTVNSGLISVGSFVLLVISYIFILFTVWKHSSGGLAKALSTL
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CCDS43 LPRLLRLACTDTYRLQFMVTVNSGFICVGTFFILLISYVFILFTVWKHSSGGSSKALSTL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SAHVTVVILFFGPLMFFYTWPSPTSHLDKYLAIFDAFITPFLNPVIYTFRNKDMKVAMRR
::: :::.::::: :: :: : :.:..::.:::::: .:::::::.::::::.::.:..:
CCDS43 SAHSTVVLLFFGPPMFVYTRPHPNSQMDKFLAIFDAVLTPFLNPVVYTFRNKEMKAAIKR
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LCSRLAHFTKIL
.:..:. . .:
CCDS43 VCKQLVIYKRIS
310
>>CCDS41221.1 OR4F16 gene_id:81399|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1557 init1: 1510 opt: 1525 Z-score: 1298.2 bits: 248.4 E(32554): 5.5e-66
Smith-Waterman score: 1525; 70.7% identity (90.7% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNGMNHSVVSEFVFMGLTNSREIQLLLFVFSLLFYFASMMGNLVIVFTVTMDAHLHSPMY
:.: ::::::::.:.:::.: ::::::.::: ..: ::. ::..:::.:: : :::::::
CCDS41 MDGENHSVVSEFLFLGLTHSWEIQLLLLVFSSVLYVASITGNILIVFSVTTDPHLHSPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLANLSIIDMAFCSITAPKMICDIFKKHKAISFRGCITQIFFSHALGGTEMVLLIAMAF
::::.::.::.. ::.:.:::: :.:.:.:.::: :::.:::: :..::.::::::::::
CCDS41 FLLASLSFIDLGACSVTSPKMIYDLFRKRKVISFGGCIAQIFFIHVVGGVEMVLLIAMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYMAICKPLHYLTIMSPRMCLYFLATSSIIGLIHSLVQLVFVVDLPFCGPNIFDSFYCD
:::.:.:::::::::::::::: :::.. .:. ::: ::.:.:.: :::::..::::::
CCDS41 DRYVALCKPLHYLTIMSPRMCLSFLAVAWTLGVSHSLFQLAFLVNLAFCGPNVLDSFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LPRLLRLACTNTQELEFMVTVNSGLISVGSFVLLVISYIFILFTVWKHSSGGLAKALSTL
::::::::::.: .:.::::::::.: ::.: .:.:::.::::::::::::: .::::::
CCDS41 LPRLLRLACTDTYRLQFMVTVNSGFICVGTFFILLISYVFILFTVWKHSSGGSSKALSTL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SAHVTVVILFFGPLMFFYTWPSPTSHLDKYLAIFDAFITPFLNPVIYTFRNKDMKVAMRR
::: :::.::::: :: :: : :.:..::.:::::: .:::::::.::::::.::.:..:
CCDS41 SAHSTVVLLFFGPPMFVYTRPHPNSQMDKFLAIFDAVLTPFLNPVVYTFRNKEMKAAIKR
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LCSRLAHFTKIL
.:..:. . .:
CCDS41 VCKQLVIYKRIS
310
>>CCDS72675.1 OR4F29 gene_id:729759|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1557 init1: 1510 opt: 1525 Z-score: 1298.2 bits: 248.4 E(32554): 5.5e-66
Smith-Waterman score: 1525; 70.7% identity (90.7% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNGMNHSVVSEFVFMGLTNSREIQLLLFVFSLLFYFASMMGNLVIVFTVTMDAHLHSPMY
:.: ::::::::.:.:::.: ::::::.::: ..: ::. ::..:::.:: : :::::::
CCDS72 MDGENHSVVSEFLFLGLTHSWEIQLLLLVFSSVLYVASITGNILIVFSVTTDPHLHSPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLANLSIIDMAFCSITAPKMICDIFKKHKAISFRGCITQIFFSHALGGTEMVLLIAMAF
::::.::.::.. ::.:.:::: :.:.:.:.::: :::.:::: :..::.::::::::::
CCDS72 FLLASLSFIDLGACSVTSPKMIYDLFRKRKVISFGGCIAQIFFIHVVGGVEMVLLIAMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYMAICKPLHYLTIMSPRMCLYFLATSSIIGLIHSLVQLVFVVDLPFCGPNIFDSFYCD
:::.:.:::::::::::::::: :::.. .:. ::: ::.:.:.: :::::..::::::
CCDS72 DRYVALCKPLHYLTIMSPRMCLSFLAVAWTLGVSHSLFQLAFLVNLAFCGPNVLDSFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LPRLLRLACTNTQELEFMVTVNSGLISVGSFVLLVISYIFILFTVWKHSSGGLAKALSTL
::::::::::.: .:.::::::::.: ::.: .:.:::.::::::::::::: .::::::
CCDS72 LPRLLRLACTDTYRLQFMVTVNSGFICVGTFFILLISYVFILFTVWKHSSGGSSKALSTL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SAHVTVVILFFGPLMFFYTWPSPTSHLDKYLAIFDAFITPFLNPVIYTFRNKDMKVAMRR
::: :::.::::: :: :: : :.:..::.:::::: .:::::::.::::::.::.:..:
CCDS72 SAHSTVVLLFFGPPMFVYTRPHPNSQMDKFLAIFDAVLTPFLNPVVYTFRNKEMKAAIKR
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LCSRLAHFTKIL
.:..:. . .:
CCDS72 VCKQLVIYKRIS
310
>>CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15 (312 aa)
initn: 1515 init1: 1487 opt: 1492 Z-score: 1270.6 bits: 243.3 E(32554): 1.9e-64
Smith-Waterman score: 1492; 70.5% identity (89.4% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNGMNHSVVSEFVFMGLTNSREIQLLLFVFSLLFYFASMMGNLVIVFTVTMDAHLHSPMY
:. ::::::::::.::..::.::::::.: .:: .:.::::.::.::: : .:.::::
CCDS32 MDEANHSVVSEFVFLGLSDSRKIQLLLFLFFSVFYVSSLMGNLLIVLTVTSDPRLQSPMY
10 20 30 40 50 60
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310
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CCDS32 LRKWDAHSSVKF
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pF1KE5 FLLANLSIIDMAFCSITAPKMICDIFKKHKAISFRGCITQIFFSHALGGTEMVLLIAMAF
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CCDS30 FLLANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGF
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CCDS30 DRYIAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVTWGIGFLHSVSQLAFAVHLLFCGPNEVDSFYCD
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CCDS30 LPRVIKLACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHRPLDKSSKALSTL
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CCDS30 LRKWDAHSSVKF
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CCDS32 MDKSNSSVVSEFVLLGLCSSQKLQLFYFCFFSVLYTVIVLGNLLIILTVTSDTSLHSPMY
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CCDS32 FLLGNLSFVDICQASFATPKMIADFLSAHETISFSGCIAQIFFIHLFTGGEMVLLVSMAY
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