Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5959
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5959, 312 aa
1>>>pF1KE5959 312 - 312 aa - 312 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9434+/-0.00121; mu= 11.9871+/- 0.070
mean_var=137.2294+/-44.292, 0's: 0 Z-trim(103.6): 387 B-trim: 936 in 2/45
Lambda= 0.109484
statistics sampled from 6994 (7492) to 6994 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.583), E-opt: 0.2 (0.23), width: 16
Scan time: 2.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31121.1 OR2T10 gene_id:127069|Hs108|chr1 ( 312) 2084 341.4 5.3e-94
CCDS55695.1 OR2T29 gene_id:343563|Hs108|chr1 ( 315) 1499 249.0 3.5e-66
CCDS31113.1 OR2T4 gene_id:127074|Hs108|chr1 ( 348) 1497 248.7 4.7e-66
CCDS31118.1 OR2T5 gene_id:401993|Hs108|chr1 ( 315) 1494 248.2 6.1e-66
CCDS31116.1 OR2T2 gene_id:401992|Hs108|chr1 ( 324) 1343 224.4 9.3e-59
CCDS31123.1 OR2T35 gene_id:403244|Hs108|chr1 ( 323) 1333 222.8 2.8e-58
CCDS31117.1 OR2T3 gene_id:343173|Hs108|chr1 ( 318) 1302 217.9 8.2e-57
CCDS31120.1 OR2T34 gene_id:127068|Hs108|chr1 ( 318) 1285 215.2 5.3e-56
CCDS31124.1 OR2T27 gene_id:403239|Hs108|chr1 ( 317) 1244 208.7 4.7e-54
CCDS31115.1 OR2T1 gene_id:26696|Hs108|chr1 ( 369) 1241 208.3 7.2e-54
CCDS31114.1 OR2T6 gene_id:254879|Hs108|chr1 ( 308) 1168 196.7 1.9e-50
CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 ( 347) 1147 193.5 2e-49
CCDS31108.1 OR2M4 gene_id:26245|Hs108|chr1 ( 311) 1134 191.4 7.9e-49
CCDS31107.1 OR2M3 gene_id:127062|Hs108|chr1 ( 312) 1118 188.8 4.5e-48
CCDS31105.1 OR2M5 gene_id:127059|Hs108|chr1 ( 312) 1105 186.8 1.9e-47
CCDS31109.1 OR2T33 gene_id:391195|Hs108|chr1 ( 320) 1103 186.5 2.4e-47
CCDS31111.1 OR2M7 gene_id:391196|Hs108|chr1 ( 312) 1101 186.1 2.9e-47
CCDS31100.1 OR2T8 gene_id:343172|Hs108|chr1 ( 312) 1076 182.2 4.5e-46
CCDS31110.1 OR2T12 gene_id:127064|Hs108|chr1 ( 320) 1068 180.9 1.1e-45
CCDS58992.1 OR2V1 gene_id:26693|Hs108|chr5 ( 315) 1027 174.5 9.7e-44
CCDS4461.1 OR2V2 gene_id:285659|Hs108|chr5 ( 315) 1027 174.5 9.7e-44
CCDS31103.1 OR2L2 gene_id:26246|Hs108|chr1 ( 312) 1026 174.3 1.1e-43
CCDS31104.1 OR2L3 gene_id:391192|Hs108|chr1 ( 312) 1014 172.4 4e-43
CCDS31102.1 OR2AK2 gene_id:391191|Hs108|chr1 ( 335) 1010 171.8 6.5e-43
CCDS31414.1 OR2AG1 gene_id:144125|Hs108|chr11 ( 316) 1008 171.5 7.8e-43
CCDS31413.1 OR2AG2 gene_id:338755|Hs108|chr11 ( 316) 1006 171.1 9.7e-43
CCDS58068.1 OR2L5 gene_id:81466|Hs108|chr1 ( 312) 1004 170.8 1.2e-42
CCDS34696.1 OR2AE1 gene_id:81392|Hs108|chr7 ( 323) 985 167.8 9.8e-42
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 960 163.9 1.5e-40
CCDS32895.1 OR2Z1 gene_id:284383|Hs108|chr19 ( 314) 957 163.4 2.1e-40
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 949 162.2 5.1e-40
CCDS1637.1 OR2L13 gene_id:284521|Hs108|chr1 ( 312) 948 162.0 5.5e-40
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 933 159.7 3.1e-39
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 927 158.7 5.5e-39
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 923 158.0 8.6e-39
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 913 156.4 2.5e-38
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 913 156.4 2.5e-38
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 913 156.5 2.6e-38
CCDS31565.1 OR10V1 gene_id:390201|Hs108|chr11 ( 309) 911 156.1 3.1e-38
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 905 155.2 6.1e-38
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 905 155.2 6.1e-38
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 905 155.2 6.1e-38
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 905 155.2 6.2e-38
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 902 154.7 8.5e-38
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 901 154.6 9.6e-38
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 901 154.6 9.8e-38
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 894 153.5 2.1e-37
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 891 153.0 2.8e-37
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 891 153.0 2.9e-37
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 890 152.8 3.1e-37
>>CCDS31121.1 OR2T10 gene_id:127069|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 2084 init1: 2084 opt: 2084 Z-score: 1801.1 bits: 341.4 E(32554): 5.3e-94
Smith-Waterman score: 2084; 100.0% identity (100.0% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MRLANQTLGGDFFLLGIFSQISHPGRLCLLIFSIFLMAVSWNITLILLIHIDSSLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MRLANQTLGGDFFLLGIFSQISHPGRLCLLIFSIFLMAVSWNITLILLIHIDSSLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFINQLSLIDLTYISVTVPKMLVNQLAKDKTISVLGCGTQMYFYLQLGGAECCLLAAMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FFINQLSLIDLTYISVTVPKMLVNQLAKDKTISVLGCGTQMYFYLQLGGAECCLLAAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICHPLRYSVLMSHRVCLLLASGCWFVGSVDGFMLTPIAMSFPFCRSHEIQHFFCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DRYVAICHPLRYSVLMSHRVCLLLASGCWFVGSVDGFMLTPIAMSFPFCRSHEIQHFFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VPAVLKLSCSDTSLYKIFMYLCCVIMLLIPVTVISVSYYYIILTIHKMNSVEGRKKAFTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VPAVLKLSCSDTSLYKIFMYLCCVIMLLIPVTVISVSYYYIILTIHKMNSVEGRKKAFTT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CSSHITVVSLFYGAAIYNYMLPSSYQTPEKDMMSSFFYTILTPVLNPIIYSFRNKDVTRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CSSHITVVSLFYGAAIYNYMLPSSYQTPEKDMMSSFFYTILTPVLNPIIYSFRNKDVTRA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LKKMLSVQKPPY
::::::::::::
CCDS31 LKKMLSVQKPPY
310
>>CCDS55695.1 OR2T29 gene_id:343563|Hs108|chr1 (315 aa)
initn: 1532 init1: 1489 opt: 1499 Z-score: 1301.6 bits: 249.0 E(32554): 3.5e-66
Smith-Waterman score: 1499; 71.7% identity (88.3% similar) in 307 aa overlap (2-308:6-312)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MRLANQTLGGDFFLLGIFSQISHPGRLCLLIFSIFLMAVSWNITLILLIHIDSSLH
:.::.: ::.:.:.: : .::. : ..:: .:: :.: : .:::::: :. ::
CCDS55 MANITRMANHTGRLDFILMGLFRQSKHPALLSVVIFVVFLKALSGNAVLILLIHCDAHLH
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 TPMYFFINQLSLIDLTYISVTVPKMLVNQLAKDKTISVLGCGTQMYFYLQLGGAECCLLA
.::::::.::::.:..::::::::::..:. . .:. :: ::..:: :.:.: :::
CCDS55 SPMYFFISQLSLMDMAYISVTVPKMLLDQVMGVNKVSAPECGMQMFLYLTLAGSEFFLLA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 AMAYDRYVAICHPLRYSVLMSHRVCLLLASGCWFVGSVDGFMLTPIAMSFPFCRSHEIQH
.::::::::::::::: :::.:::::.:::::::.:::::::::::.:::::::: ::.:
CCDS55 TMAYDRYVAICHPLRYPVLMNHRVCLFLASGCWFLGSVDGFMLTPITMSFPFCRSWEIHH
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 FFCEVPAVLKLSCSDTSLYKIFMYLCCVIMLLIPVTVISVSYYYIILTIHKMNSVEGRKK
:::::::: :::::::::. .::::::.:::::::.:: :: :.::.:.:::.:::::
CCDS55 FFCEVPAVTILSCSDTSLYETLMYLCCVLMLLIPVTIISSSYLLILLTVHRMNSAEGRKK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 AFTTCSSHITVVSLFYGAAIYNYMLPSSYQTPEKDMMSSFFYTILTPVLNPIIYSFRNKD
::.:::::.::: ::::::.:.:::::::.::::::: : :::::::::::.:::.::::
CCDS55 AFATCSSHLTVVILFYGAAVYTYMLPSSYHTPEKDMMVSVFYTILTPVLNPLIYSLRNKD
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 VTRALKKMLSVQKPPY
: ::::::.:.
CCDS55 VMGALKKMLTVRFVL
310
>>CCDS31113.1 OR2T4 gene_id:127074|Hs108|chr1 (348 aa)
initn: 1566 init1: 1493 opt: 1497 Z-score: 1299.4 bits: 248.7 E(32554): 4.7e-66
Smith-Waterman score: 1497; 71.6% identity (88.7% similar) in 310 aa overlap (3-312:35-343)
10 20 30
pF1KE5 MRLANQTLGGDFFLLGIFSQISHPGRLCLLIF
.::.: .::.:::.: : .::. ::..::
CCDS31 TWMASHTGWSDFILMGLFRQSKHPMANITWMANHTGWSDFILLGLFRQSKHPALLCVVIF
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 SIFLMAVSWNITLILLIHIDSSLHTPMYFFINQLSLIDLTYISVTVPKMLVNQLAKDKTI
.::::.: : .:::::: :. :::::::::.::::.:..::::::::::..:. . :
CCDS31 VVFLMALSGNAVLILLIHCDAHLHTPMYFFISQLSLMDMAYISVTVPKMLLDQVMGVNKI
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 SVLGCGTQMYFYLQLGGAECCLLAAMAYDRYVAICHPLRYSVLMSHRVCLLLASGCWFVG
:. :: ::.::. :.:.: :::.::::::::::::::: :::.:::::.:.:::::.:
CCDS31 SAPECGMQMFFYVTLAGSEFFLLATMAYDRYVAICHPLRYPVLMNHRVCLFLSSGCWFLG
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 SVDGFMLTPIAMSFPFCRSHEIQHFFCEVPAVLKLSCSDTSLYKIFMYLCCVIMLLIPVT
::::: .:::.:.::: :.::.::::::::::.:::::::::.::::::::.::::::.
CCDS31 SVDGFTFTPITMTFPFRGSREIHHFFCEVPAVLNLSCSDTSLYEIFMYLCCVLMLLIPVV
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 VISVSYYYIILTIHKMNSVEGRKKAFTTCSSHITVVSLFYGAAIYNYMLPSSYQTPEKDM
.:: :: :.:::: :::.:::::::.:::::.::: ::::::::.:::::::.::::::
CCDS31 IISSSYLLILLTIHGMNSAEGRKKAFATCSSHLTVVILFYGAAIYTYMLPSSYHTPEKDM
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310
pF1KE5 MSSFFYTILTPVLNPIIYSFRNKDVTRALKKMLSVQKPPY
: : ::::::::.::.:::.::::: ::::::.:. : .
CCDS31 MVSVFYTILTPVVNPLIYSLRNKDVMGALKKMLTVE-PAFQKAME
310 320 330 340
>>CCDS31118.1 OR2T5 gene_id:401993|Hs108|chr1 (315 aa)
initn: 1527 init1: 1484 opt: 1494 Z-score: 1297.4 bits: 248.2 E(32554): 6.1e-66
Smith-Waterman score: 1494; 71.3% identity (88.3% similar) in 307 aa overlap (2-308:6-312)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MRLANQTLGGDFFLLGIFSQISHPGRLCLLIFSIFLMAVSWNITLILLIHIDSSLH
:.::.: ::.:.:.: . .::. : ..:: .:: :.: : .:::::: :. ::
CCDS31 MANITRMANHTGKLDFILMGLFRRSKHPALLSVVIFVVFLKALSGNAVLILLIHCDAHLH
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 TPMYFFINQLSLIDLTYISVTVPKMLVNQLAKDKTISVLGCGTQMYFYLQLGGAECCLLA
.::::::.::::.:..::::::::::..:. . .:. :: ::..:: :.:.: :::
CCDS31 SPMYFFISQLSLMDMAYISVTVPKMLLDQVMGVNKVSAPECGMQMFLYLTLAGSEFFLLA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 AMAYDRYVAICHPLRYSVLMSHRVCLLLASGCWFVGSVDGFMLTPIAMSFPFCRSHEIQH
.::::::::::::::: :::.:::::.:::::::.:::::::::::.:::::::: ::.:
CCDS31 TMAYDRYVAICHPLRYPVLMNHRVCLFLASGCWFLGSVDGFMLTPITMSFPFCRSWEIHH
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 FFCEVPAVLKLSCSDTSLYKIFMYLCCVIMLLIPVTVISVSYYYIILTIHKMNSVEGRKK
:::::::: :::::::::. .::::::.:::::::.:: :: :.::.:.:::.:::::
CCDS31 FFCEVPAVTILSCSDTSLYETLMYLCCVLMLLIPVTIISSSYLLILLTVHRMNSAEGRKK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 AFTTCSSHITVVSLFYGAAIYNYMLPSSYQTPEKDMMSSFFYTILTPVLNPIIYSFRNKD
::.:::::.::: ::::::.:.:::::::.::::::: : :::::::::::.:::.::::
CCDS31 AFATCSSHLTVVILFYGAAVYTYMLPSSYHTPEKDMMVSVFYTILTPVLNPLIYSLRNKD
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 VTRALKKMLSVQKPPY
: ::::::.:.
CCDS31 VMGALKKMLTVRFVL
310
>>CCDS31116.1 OR2T2 gene_id:401992|Hs108|chr1 (324 aa)
initn: 1388 init1: 1320 opt: 1343 Z-score: 1168.3 bits: 224.4 E(32554): 9.3e-59
Smith-Waterman score: 1343; 64.4% identity (88.1% similar) in 295 aa overlap (11-305:12-306)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MRLANQTLGGDFFLLGIFSQISHPGRLCLLIFSIFLMAVSWNITLILLIHIDSSLHTPM
.: : :.... . :: : ..::::..:.. :...:::::.:: :::::
CCDS31 MGMEGLLQNSTNFVLTGLITHPAFPGLLFAIVFSIFVVAITANLVMILLIHMDSRLHTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFFINQLSLIDLTYISVTVPKMLVNQLAKDKTISVLGCGTQMYFYLQLGGAECCLLAAMA
::...:::..: :: .:::::: . :.:::::: :::..:...:: : :.: ::. ::
CCDS31 YFLLSQLSIMDTIYICITVPKMLQDLLSKDKTISFLGCAVQIFLYLTLIGGEFFLLGLMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YDRYVAICHPLRYSVLMSHRVCLLLASGCWFVGSVDGFMLTPIAMSFPFCRSHEIQHFFC
::::::.:.:::: .::..::::... : : ::.:::::::..::::::::.::.::::
CCDS31 YDRYVAVCNPLRYPLLMNRRVCLFMVVGSWVGGSLDGFMLTPVTMSFPFCRSREINHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 EVPAVLKLSCSDTSLYKIFMYLCCVIMLLIPVTVISVSYYYIILTIHKMNSVEGRKKAFT
:.::::::::.:::::. .:: :::.:::::..:::::: .:.::.:.:::.:::.:::.
CCDS31 EIPAVLKLSCTDTSLYETLMYACCVLMLLIPLSVISVSYTHILLTVHRMNSAEGRRKAFA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCSSHITVVSLFYGAAIYNYMLPSSYQTPEKDMMSSFFYTILTPVLNPIIYSFRNKDVTR
:::::: :::.:::::.:. .:: ::.::::: . : :::::::.:::.:::.:::::.
CCDS31 TCSSHIMVVSVFYGAAFYTNVLPHSYHTPEKDKVVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKDVAA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 ALKKMLSVQKPPY
::.:.:
CCDS31 ALRKVLGRCGSSQSIRVATVIRKG
310 320
>>CCDS31123.1 OR2T35 gene_id:403244|Hs108|chr1 (323 aa)
initn: 1353 init1: 999 opt: 1333 Z-score: 1159.8 bits: 222.8 E(32554): 2.8e-58
Smith-Waterman score: 1333; 64.7% identity (87.8% similar) in 295 aa overlap (11-305:12-305)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MRLANQTLGGDFFLLGIFSQISHPGRLCLLIFSIFLMAVSWNITLILLIHIDSSLHTPM
.: : :.... . :: : ..::::..:.. :...:::::.:: :::::
CCDS31 MGMEGLLQNSTNFVLTGLITHPAFPGLLFAVVFSIFVVAITANLVMILLIHMDSRLHTPM
10 20 30 40 50 60
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310
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CCDS31 MCSGNQTSQNQTASTDFTLTGLFAESKHAALLYTVTFLLFLMALTGNALLILLIHSEPRL
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CCDS31 KALATCSSHMIIVLLLFGASFYTYMLRSSYHTAEQDMMVSAFYTIFTPVLNPLIYSLRNK
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CCDS31 DVTRALRSMMQSRMNQEK
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310
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]