Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5957
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5957, 312 aa
1>>>pF1KE5957 312 - 312 aa - 312 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9057+/-0.000595; mu= 18.2767+/- 0.037
mean_var=82.7118+/-18.624, 0's: 0 Z-trim(106.0): 250 B-trim: 803 in 1/50
Lambda= 0.141023
statistics sampled from 13796 (14121) to 13796 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.495), E-opt: 0.2 (0.166), width: 16
Scan time: 5.890
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 864 186.3 6.8e-47
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NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 835 180.4 4.1e-45
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 835 180.4 4.1e-45
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 832 179.8 6.3e-45
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 830 179.4 8.2e-45
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 828 179.0 1.1e-44
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 827 178.8 1.2e-44
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 806 174.5 2.4e-43
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 802 173.7 4.2e-43
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 799 173.1 6.4e-43
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 793 171.9 1.5e-42
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 778 168.8 1.2e-41
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 775 168.2 1.9e-41
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 775 168.2 1.9e-41
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 775 168.2 1.9e-41
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 766 166.4 6.8e-41
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 745 162.1 1.3e-39
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 703 153.6 4.9e-37
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 484 109.0 1.3e-23
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 470 106.2 9.2e-23
NP_001699 (OMIM: 190900,613522) short-wave-sensiti ( 348) 235 58.4 2.4e-08
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 213 54.0 6.2e-07
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 207 52.7 1.3e-06
NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471) 189 49.2 2e-05
NP_000904 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 179 47.0 6.8e-05
XP_016883343 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 370) 179 47.0 6.8e-05
NP_001186948 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 370) 179 47.0 6.8e-05
NP_872588 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 179 47.0 6.8e-05
NP_003848 (OMIM: 603691) galanin receptor type 2 [ ( 387) 179 47.1 7e-05
XP_016883341 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 179 47.1 7e-05
XP_011527130 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 179 47.1 7e-05
XP_016883342 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 179 47.1 7e-05
NP_001305782 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 399) 179 47.1 7.2e-05
NP_006574 (OMIM: 605224) visual pigment-like recep ( 337) 176 46.4 9.7e-05
XP_016867841 (OMIM: 605188) PREDICTED: probable G- ( 370) 176 46.4 0.0001
NP_001139739 (OMIM: 605188) probable G-protein cou ( 370) 176 46.4 0.0001
XP_005250508 (OMIM: 605188) PREDICTED: probable G- ( 370) 176 46.4 0.0001
NP_001139738 (OMIM: 605188) probable G-protein cou ( 370) 176 46.4 0.0001
NP_061843 (OMIM: 605188) probable G-protein couple ( 370) 176 46.4 0.0001
NP_001139737 (OMIM: 605188) probable G-protein cou ( 370) 176 46.4 0.0001
NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 176 46.5 0.00012
XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 176 46.6 0.00013
NP_000504 (OMIM: 300821,303700,303800) medium-wave ( 364) 174 46.0 0.00014
NP_064445 (OMIM: 300822,303700,303900) long-wave-s ( 364) 173 45.8 0.00016
NP_005949 (OMIM: 600665) melatonin receptor type 1 ( 350) 170 45.2 0.00023
NP_062874 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 432) 170 45.3 0.00027
NP_000863 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 445) 170 45.3 0.00027
NP_062873 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 479) 170 45.3 0.00029
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 864; 42.2% identity (75.6% similar) in 308 aa overlap (2-304:4-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MKNRTSVTDFILLGLTDNPQLQVVIFSFLFLTYVLSVTGNLTIISLTLLDSHLKTPMY
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NP_003 AFSTCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKE
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300 310
pF1KE5 VKQAFKDVLRKISHKKKKH
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NP_003 VKKALANVISRKRTSSFL
300 310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 838; 43.8% identity (73.4% similar) in 304 aa overlap (2-303:6-308)
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pF1KE5 MSYDCYVAICKPLHYTTIMSDRICYQLIISSWLAGFLVIFPPLAMGLQLDFCDSNVIDHF
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pF1KE5 FSTCSSHVIVVSISYGSCIFMYVKTSAKEGVALTKGVAILNTSVAPMLNPFIYTLRNQQV
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NP_006 FSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDV
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300 310
pF1KE5 KQAFKDVLRKISHKKKKH
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NP_006 KDAAEKVLRSKVDSS
300 310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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pF1KE5 MKNRTSVTDFILLGLTDNPQLQVVIFSFLFLTYVLSVTGNLTIISLTLLDSHLKTPMY
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300 310
pF1KE5 FKDVLRKISHKKKKH
.. .: :.:
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 812 init1: 606 opt: 835 Z-score: 931.0 bits: 180.4 E(85289): 4.1e-45
Smith-Waterman score: 835; 42.6% identity (73.4% similar) in 305 aa overlap (3-306:5-309)
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pF1KE5 MKNRTSVTDFILLGLTDNPQLQVVIFSFLFLTYVLSVTGNLTIISLTLLDSHLKTPMY
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pF1KE5 FFLRNFSL-EISFTSVCNPRFLISILTGDKSISYNACAAQLFFFIFLGSTEFFLLASMSY
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NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KE5 DCYVAICKPLHYTTIMSDRICYQLIISSWLAGFLVIFPPLAMGLQLDFCDSNVIDHFTCD
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NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
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pF1KE5 FKDVLRKISHKKKKH
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NP_036 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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Smith-Waterman score: 835; 42.6% identity (73.4% similar) in 305 aa overlap (3-306:5-309)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MKNRTSVTDFILLGLTDNPQLQVVIFSFLFLTYVLSVTGNLTIISLTLLDSHLKTPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KE5 FFLRNFSL-EISFTSVCNPRFLISILTGDKSISYNACAAQLFFFIFLGSTEFFLLASMSY
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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pF1KE5 SAPLLQISCTDTSTLELMSFILALFTLISTLILVILSYTYIIRTILRIPSAQQRKKAFST
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
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pF1KE5 FKDVLRKISHKKKKH
.. .: :.:
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo (327 aa)
initn: 806 init1: 661 opt: 832 Z-score: 927.5 bits: 179.8 E(85289): 6.3e-45
Smith-Waterman score: 832; 44.8% identity (71.8% similar) in 308 aa overlap (7-308:10-316)
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pF1KE5 MKNRTSVTDFILLGLTDNPQLQVVIFSFLFLTYVLSVTGNLTIISLTLLDSHLKTPM
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NP_003 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLHKPM
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pF1KE5 YFFLRNFS-LEISFTSVCNPRFLISILTGDKS-----ISYNACAAQLFFFIFLGSTEFFL
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NP_003 YFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFV-GSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVL
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120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LASMSYDCYVAICKPLHYTTIMSDRICYQLIISSWLAGFLVIFPPLAMGLQLDFCDSNVI
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NP_003 LAVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPNII
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DHFTCDSAPLLQISCTDTSTLELMSFILALFTLISTLILVILSYTYIIRTILRIPSAQQR
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NP_003 NHFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAGR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 KKAFSTCSSHVIVVSISYGSCIFMYVKTSAKEGVALTKGVAILNTSVAPMLNPFIYTLRN
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NP_003 YKAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLRN
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 QQVKQAFKDVLRKISHKKKKH
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NP_003 QEVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
300 310 320
>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
initn: 820 init1: 626 opt: 830 Z-score: 925.5 bits: 179.4 E(85289): 8.2e-45
Smith-Waterman score: 830; 43.4% identity (74.0% similar) in 304 aa overlap (3-302:5-305)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MKNRTSVTDFILLGLTDNPQLQVVIFSFLFLTYVLSVTGNLTIISLTLLDSHLKTPMY
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NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY
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pF1KE5 FFLRNFS-LEISFTSVCNPRFLISILTGDKSISYNACAAQLFFFIFLGSTEFFLLASMSY
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NP_001 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMAY
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pF1KE5 DCYVAICKPLHYTTIMSDRICYQLIISSWLAGFLVIFPPLAMG---LQLDFCDSNVIDHF
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NP_001 DRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCG---VANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHF
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pF1KE5 TCDSAPLLQISCTDTSTLELMSFILALFTLISTLILVILSYTYIIRTILRIPSAQQRKKA
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NP_001 LREMPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKA
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pF1KE5 FSTCSSHVIVVSISYGSCIFMYVKTSAKEGVALTKGVAILNTSVAPMLNPFIYTLRNQQV
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NP_001 FGTCGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREV
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 KQAFKDVLRKISHKKKKH
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NP_001 KGALGRLLLGKRELGKE
300 310
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 818 init1: 673 opt: 828 Z-score: 923.3 bits: 179.0 E(85289): 1.1e-44
Smith-Waterman score: 828; 41.6% identity (75.4% similar) in 305 aa overlap (3-305:5-309)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MKNRTSVTDFILLGLTDNP-QLQVVIFSFLFLTYVLSVTGNLTIISLTLLDSHLKTPM
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NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
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pF1KE5 YFFLRNFS-LEISFTSVCNPRFLISILTGDKSISYNACAAQLFFFIFLGSTEFFLLASMS
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NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
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pF1KE5 YDCYVAICKPLHYTTIMSDRICYQLIISSWLAGFLVIFPPLAMGLQLDFCDSNVIDHFTC
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NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
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pF1KE5 DSAPLLQISCTDTSTLELMSFILALFTLISTLILVILSYTYIIRTILRIPSAQQRKKAFS
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NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
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pF1KE5 TCSSHVIVVSISYGSCIFMYVKTSAKEGVALTKGVAILNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQ
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NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
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300 310
pF1KE5 AFKDVLRKISHKKKKH
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NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP
310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 793 init1: 538 opt: 827 Z-score: 922.3 bits: 178.8 E(85289): 1.2e-44
Smith-Waterman score: 827; 40.3% identity (74.9% similar) in 303 aa overlap (3-304:6-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MKNRTSVTDFILLGLTDNPQLQVVIFSFLFLTYVLSVTGNLTIISLTLLDSHLKTPM
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NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 YFFLRNFS-LEISFTSVCNPRFLISILTGDKSISYNACAAQLFFFIFLGSTEFFLLASMS
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NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
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NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
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pF1KE5 DSAPLLQISCTDTSTLELMSFILALFTLISTLILVILSYTYIIRTILRIPSAQQRKKAFS
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NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
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pF1KE5 TCSSHVIVVSISYGSCIFMYVKTSAKEGVALTKGVAILNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQ
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NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD
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300 310
pF1KE5 AFKDVLRKISHKKKKH
:.: . ..
NP_001 ALKRLQKRKCC
310
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
initn: 603 init1: 329 opt: 806 Z-score: 899.2 bits: 174.5 E(85289): 2.4e-43
Smith-Waterman score: 806; 41.9% identity (69.7% similar) in 310 aa overlap (1-309:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MKNRTSVTDFILLGLTDNPQLQVVIFSFLFLTYVLSVTGNLTIISLTLLDSHLKTPMYFF
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NP_001 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLS
10 20 30 40 50 60
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NP_001 LAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDH
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pF1KE5 YVAICKPLHYTTIMSDRICYQLIISSWLAGFLVIFPPLAMGLQLDFCDSNVIDHFTCDSA
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]