Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5953
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5953, 312 aa
1>>>pF1KE5953 312 - 312 aa - 312 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6660+/-0.000504; mu= 13.4753+/- 0.031
mean_var=102.3339+/-27.697, 0's: 0 Z-trim(107.9): 295 B-trim: 2011 in 2/51
Lambda= 0.126784
statistics sampled from 15509 (15972) to 15509 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.525), E-opt: 0.2 (0.187), width: 16
Scan time: 6.910
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 913 178.4 1.7e-44
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 913 178.4 1.7e-44
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 913 178.4 1.7e-44
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 903 176.6 5.8e-44
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 902 176.4 6.6e-44
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 898 175.7 1.1e-43
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 891 174.4 2.7e-43
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 875 171.4 2e-42
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 873 171.1 2.6e-42
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 839 164.9 1.9e-40
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 837 164.5 2.5e-40
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 834 164.0 3.7e-40
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 813 160.1 5.3e-39
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 811 159.7 6.8e-39
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 811 159.7 6.8e-39
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 811 159.8 6.9e-39
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 808 159.2 1e-38
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 805 158.7 1.5e-38
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 777 153.5 5e-37
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 730 144.9 1.9e-34
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 570 115.7 1.3e-25
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 501 103.1 8.1e-22
NP_001718 (OMIM: 300107) bombesin receptor subtype ( 399) 221 51.9 2.5e-06
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 213 50.4 6.1e-06
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 209 49.7 1.1e-05
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 209 49.7 1.2e-05
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 203 48.5 2e-05
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 203 48.6 2.2e-05
NP_003941 (OMIM: 602779) proteinase-activated rece ( 385) 203 48.6 2.4e-05
NP_004239 (OMIM: 600895) prolactin-releasing pepti ( 370) 202 48.4 2.6e-05
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 197 47.5 4.5e-05
NP_005305 (OMIM: 305670) gastrin-releasing peptide ( 384) 193 46.8 8.4e-05
NP_001138757 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 389) 192 46.6 9.6e-05
NP_001008504 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 392) 192 46.6 9.7e-05
NP_001138755 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 397) 192 46.6 9.8e-05
NP_000905 (OMIM: 600018) mu-type opioid receptor i ( 400) 192 46.6 9.8e-05
NP_001138756 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 403) 192 46.6 9.9e-05
NP_001138754 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 406) 192 46.6 9.9e-05
NP_001272452 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 414) 192 46.6 0.0001
NP_001008503 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 418) 192 46.6 0.0001
NP_001138758 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 420) 192 46.6 0.0001
NP_001008505 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 446) 192 46.7 0.00011
NP_001272453 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 493) 192 46.7 0.00011
NP_001138751 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 493) 192 46.7 0.00011
NP_057624 (OMIM: 605569) probable G-protein couple ( 423) 187 45.7 0.00019
XP_011542714 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 308) 184 45.1 0.00022
XP_016868585 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 317) 184 45.1 0.00023
XP_011542713 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 324) 184 45.1 0.00023
NP_001309433 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 342) 184 45.1 0.00024
NP_001309432 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 370) 184 45.1 0.00026
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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Smith-Waterman score: 913; 45.0% identity (77.7% similar) in 309 aa overlap (2-310:4-312)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MENGSYTSYFILLGLFNHTRAHQVLFMMVLSIVLTSLFSNSLMILLIHRDHRLHTPMY
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300 310
pF1KE5 LTRCMGRCVALSRE
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XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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Smith-Waterman score: 913; 45.0% identity (77.7% similar) in 309 aa overlap (2-310:4-312)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MENGSYTSYFILLGLFNHTRAHQVLFMMVLSIVLTSLFSNSLMILLIHRDHRLHTPMY
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pF1KE5 FLLSQLSLMDVMLVSTTVPKMAADYLTGSKAISRAGCGVQIFFLLTLGGGECFLLAAMAY
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pF1KE5 APVLVRLACADTSVFENARYICCVLMLLVPFSLILSSYGLILSAVLHMRSTEARKKAFAT
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pF1KE5 CSSHVAVVGLFYGAAIFTYMRPKSHRSTNHDKVVSAFYTMFTPLLNPLIYSVKNSEVKGA
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
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300 310
pF1KE5 LTRCMGRCVALSRE
. . . .:.
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
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Smith-Waterman score: 913; 45.0% identity (77.7% similar) in 309 aa overlap (2-310:4-312)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MENGSYTSYFILLGLFNHTRAHQVLFMMVLSIVLTSLFSNSLMILLIHRDHRLHTPMY
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NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KE5 FLLSQLSLMDVMLVSTTVPKMAADYLTGSKAISRAGCGVQIFFLLTLGGGECFLLAAMAY
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pF1KE5 DRYAAVCHPLRYPTLMSWQLCLRMTMSCWLLGAADGLLQAVATLSFPYCGAHEIDHFFCE
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pF1KE5 APVLVRLACADTSVFENARYICCVLMLLVPFSLILSSYGLILSAVLHMRSTEARKKAFAT
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NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
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pF1KE5 LTRCMGRCVALSRE
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NP_036 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
initn: 901 init1: 880 opt: 903 Z-score: 910.2 bits: 176.6 E(85289): 5.8e-44
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pF1KE5 MENGSYTSYFILLGLFNHTRAHQVLFMMVLSIVLTSLFSNSLMILLIHRDHRLHTPMYFL
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pF1KE5 RCMGRCVALSRE
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NP_009 RLLGKEMGLTQS
310
>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
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Smith-Waterman score: 902; 43.5% identity (77.1% similar) in 301 aa overlap (3-303:5-305)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MENGSYTSYFILLGLFNHTRAHQVLFMMVLSIVLTSLFSNSLMILLIHRDHRLHTPMY
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pF1KE5 FLLSQLSLMDVMLVSTTVPKMAADYLTGSKAISRAGCGVQIFFLLTLGGGECFLLAAMAY
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pF1KE5 DRYAAVCHPLRYPTLMSWQLCLRMTMSCWLLGAADGLLQAVATLSFPYCGAHEIDHFFCE
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pF1KE5 APVLVRLACADTSVFENARYICCVLMLLVPFSLILSSYGLILSAVLHMRSTEARKKAFAT
:.:.:.::..: ..:.. .. : ..: :. .:: ::. :. :::..::. .:.:::.:
NP_001 MPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKAFGT
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pF1KE5 CSSHVAVVGLFYGAAIFTYMRPKSHRSTNHDKVVSAFYTMFTPLLNPLIYSVKNSEVKGA
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NP_001 CGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREVKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 LTRCMGRCVALSRE
: : .
NP_001 LGRLLLGKRELGKE
310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 911 init1: 758 opt: 898 Z-score: 905.3 bits: 175.7 E(85289): 1.1e-43
Smith-Waterman score: 898; 44.6% identity (77.6% similar) in 303 aa overlap (3-305:5-305)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MENGSYTSYFILLGLFNHTRAHQVLFMMVLSIVLTSLFSNSLMILLIHRDHRLHTPMY
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NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
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pF1KE5 FLLSQLSLMDVMLVSTTVPKMAADYLTGSKAISRAGCGVQIFFLLTLGGGECFLLAAMAY
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NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYAAVCHPLRYPTLMSWQLCLRMTMSCWLLGAADGLLQAVATLSFPYCGAHEIDHFFCE
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NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 APVLVRLACADTSVFENARYICCVLMLLVPFSLILSSYGLILSAVLHMRSTEARKKAFAT
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NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CSSHVAVVGLFYGAAIFTYMRPKSHRSTNHDKVVSAFYTMFTPLLNPLIYSVKNSEVKGA
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NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKS--SKQQEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA
250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 LTRCMGRCVALSRE
: . :
NP_003 LRKVATRNFP
300
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 891 init1: 891 opt: 891 Z-score: 898.4 bits: 174.4 E(85289): 2.7e-43
Smith-Waterman score: 891; 43.0% identity (76.5% similar) in 302 aa overlap (3-304:8-309)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MENGSYTSYFILLGLFNHTRAHQVLFMMVLSIVLTSLFSNSLMILLIHRDHRLHT
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 PMYFLLSQLSLMDVMLVSTTVPKMAADYLTGSKAISRAGCGVQIFFLLTLGGGECFLLAA
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 MAYDRYAAVCHPLRYPTLMSWQLCLRMTMSCWLLGAADGLLQAVATLSFPYCGAHEIDHF
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NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 FCEAPVLVRLACADTSVFENARYICCVLMLLVPFSLILSSYGLILSAVLHMRSTEARKKA
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NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FATCSSHVAVVGLFYGAAIFTYMRPKSHRSTNHDKVVSAFYTMFTPLLNPLIYSVKNSEV
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NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 KGALTRCMGRCVALSRE
.::. : ::
NP_001 RGAVKRLMGWE
310
>>XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory recep (300 aa)
initn: 873 init1: 852 opt: 875 Z-score: 882.8 bits: 171.4 E(85289): 2e-42
Smith-Waterman score: 875; 44.6% identity (76.7% similar) in 296 aa overlap (1-296:1-296)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MENGSYTSYFILLGLFNHTRAHQVLFMMVLSIVLTSLFSNSLMILLIHRDHRLHTPMYFL
: : : : :.:::. .: ...::..::. : .: .:.:.::: : .::.::::.
XP_011 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LSQLSLMDVMLVSTTVPKMAADYLTGSKAISRAGCGVQIFFLLTLGGGECFLLAAMAYDR
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XP_011 LSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAFDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YAAVCHPLRYPTLMSWQLCLRMTMSCWLLGAADGLLQAVATLSFPYCGAHEIDHFFCEAP
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XP_011 YVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCEVP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VLVRLACADTSVFENARYICCVLMLLVPFSLILSSYGLILSAVLHMRSTEARKKAFATCS
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XP_011 ALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGTCS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SHVAVVGLFYGAAIFTYMRPKSHRSTNHDKVVSAFYTMFTPLLNPLIYSVKNSEVKGALT
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XP_011 SHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEQKRRGS
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 RCMGRCVALSRE
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 859 init1: 859 opt: 873 Z-score: 880.5 bits: 171.1 E(85289): 2.6e-42
Smith-Waterman score: 873; 42.3% identity (76.3% similar) in 312 aa overlap (1-309:1-312)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MENGSYT--SYFILLGLFN-HTRAHQVLFMMVLSIVLTSLFSNSLMILLIHRDHRLHTPM
: :..: : :::... . :. ...::. :.: :..: .:::.::. : ::.::
NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFLLSQLSLMDVMLVSTTVPKMAADYLTGSKAISRAGCGVQIFFLLTLGGGECFLLAAMA
::.: .::.... . . :::: . :. . .:: ::..:..:.. .: .::::::.::
NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YDRYAAVCHPLRYPTLMSWQLCLRMTMSCWLLGAADGLLQAVATLSFPYCGAHEIDHFFC
::::.:.: ::.::..:. . ... . :. : . .:.. .:::.::.....::::
NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 EAPVLVRLACADTSVFENARYICCVLMLLVPFSLILSSYGLILSAVLHMRSTEARKKAFA
..: ...:.::::..:: . .:....: ::: :: : .:.:.. :.....:::.
NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCSSHVAVVGLFYGAAIFTYMRPKSHRSTNHDKVVSAFYTMFTPLLNPLIYSVKNSEVKG
:::::. ::.::: .. .::. :::. : . :..: ::. ::.:::.:::..:::::.
NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 ALTRCMGRCVALSRE
::.: . . .::
NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP
310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 865 init1: 834 opt: 839 Z-score: 847.0 bits: 164.9 E(85289): 1.9e-40
Smith-Waterman score: 839; 43.0% identity (73.1% similar) in 305 aa overlap (3-306:6-310)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MENGSYTSYFILLGLFNHTRAHQVLFMMVLSIVLTSLFSNSLMILLIHRDHRLHTPM
: . .::::::. . : .::: . : : .::: : .:.::. : .:::::
NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFLLSQLSLMDVMLVSTTVPKMAADYLTGSKAISRAGCGVQIFFLLTLGGGECFLLAAMA
::.::.::..:: .:.::::: .. : ...:. .:: .: :.. :.: .: :..:::
NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YDRYAAVCHPLRYPTLMSWQLCLRMTMSCWLLGAADGLLQAVATLSFPYCGAHEIDHFFC
::::::.:.:: : ..:: ::. :... .. : . .:.: : :.. .::.. : ::::
NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 EAPVLVRLACADTSVFENARYICCVLMLLVPFSLILSSYGLILSAVLHMRSTEARKKAFA
. : :. :.:.:: . : ... .. .:. ::: : ..... :...:.:::
NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
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250 260 270 280 290 300
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NP_001 ALKRLQKRKCC
310
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]