FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5951, 312 aa
1>>>pF1KE5951 312 - 312 aa - 312 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.6820+/-0.000457; mu= 18.9948+/- 0.029
mean_var=97.1289+/-26.557, 0's: 0 Z-trim(109.8): 283 B-trim: 1042 in 1/47
Lambda= 0.130137
statistics sampled from 17635 (18041) to 17635 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.562), E-opt: 0.2 (0.212), width: 16
Scan time: 5.730
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 805 162.2 1.3e-39
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 805 162.2 1.3e-39
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 805 162.2 1.3e-39
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 796 160.5 4.1e-39
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 792 159.7 6.9e-39
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 786 158.6 1.5e-38
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 772 156.0 9.3e-38
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 768 155.2 1.6e-37
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 768 155.2 1.6e-37
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 768 155.2 1.6e-37
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 766 154.8 2e-37
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XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 727 147.5 3.2e-35
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 727 147.5 3.2e-35
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 723 146.8 5.4e-35
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 710 144.4 3e-34
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 700 142.4 1.1e-33
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 696 141.7 1.8e-33
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 696 141.7 1.8e-33
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 689 140.4 4.6e-33
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 522 109.0 1.3e-23
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 521 108.9 1.4e-23
NP_006574 (OMIM: 605224) visual pigment-like recep ( 337) 205 49.6 1.1e-05
NP_003848 (OMIM: 603691) galanin receptor type 2 [ ( 387) 205 49.6 1.2e-05
XP_011542714 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 308) 194 47.4 4.3e-05
XP_016868585 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 317) 194 47.5 4.4e-05
XP_011542713 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 324) 194 47.5 4.4e-05
NP_001309433 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 342) 194 47.5 4.6e-05
NP_001309432 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 370) 194 47.5 4.8e-05
NP_001309431 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 372) 194 47.6 4.8e-05
NP_150645 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 429) 194 47.6 5.2e-05
XP_006716356 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 429) 194 47.6 5.2e-05
NP_150647 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 455) 194 47.7 5.4e-05
NP_000671 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 466) 194 47.7 5.5e-05
XP_016868584 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 475) 194 47.7 5.6e-05
XP_006716355 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 475) 194 47.7 5.6e-05
NP_150646 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 475) 194 47.7 5.6e-05
XP_016868583 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 475) 194 47.7 5.6e-05
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 191 47.0 7.2e-05
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 191 47.0 7.5e-05
NP_000673 (OMIM: 104260,607876) alpha-2B adrenergi ( 450) 188 46.5 0.00012
NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337) 179 44.7 0.00032
NP_001091670 (OMIM: 602042) N-arachidonyl glycine ( 331) 175 43.9 0.00053
NP_005283 (OMIM: 602042) N-arachidonyl glycine rec ( 331) 175 43.9 0.00053
XP_006720009 (OMIM: 602042) PREDICTED: N-arachidon ( 331) 175 43.9 0.00053
NP_071640 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor iso ( 359) 175 44.0 0.00056
XP_006714928 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 362) 175 44.0 0.00056
NP_001124527 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor ( 397) 175 44.0 0.00059
XP_006714927 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 175 44.1 0.00061
XP_011532851 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 175 44.1 0.00061
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 813 init1: 791 opt: 805 Z-score: 832.4 bits: 162.2 E(85289): 1.3e-39
Smith-Waterman score: 805; 41.4% identity (69.4% similar) in 307 aa overlap (3-309:5-311)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MPNSTTVMEFLLMRFSDVWTLQILHSASFFMLYLVTLMGNILIVTVTTCDSSLHMPMY
:...: ::::. .: : : . :. .::.:..::.::. .. :: :: :::
NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLRNLSILDACYISVTVPTSCVNSLLDSTTISKAGCVAQVFLVVFFVYVELLFLTIMAH
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NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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pF1KE5 DRYVAVCQPLHYPVIVNSRICIQMTLASLLSGLVYAGMHTGSTFQLPFCRSNVIHQFFCD
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NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CIPHILVVSVFLSSCSSVYLRPPAIPAATQDLILSGFYSIMPPLFNPIIYSLRNKQIKVA
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NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 IKKIMKRIFYSENV
.::.. :. .:
NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 813 init1: 791 opt: 805 Z-score: 832.4 bits: 162.2 E(85289): 1.3e-39
Smith-Waterman score: 805; 41.4% identity (69.4% similar) in 307 aa overlap (3-309:5-311)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MPNSTTVMEFLLMRFSDVWTLQILHSASFFMLYLVTLMGNILIVTVTTCDSSLHMPMY
:...: ::::. .: : : . :. .::.:..::.::. .. :: :: :::
XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLRNLSILDACYISVTVPTSCVNSLLDSTTISKAGCVAQVFLVVFFVYVELLFLTIMAH
::: :::..: :. .::: .: .:.. ::: ::..:...: .:: .. ..:..::.
XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVAVCQPLHYPVIVNSRICIQMTLASLLSGLVYAGMHTGSTFQLPFCRSNVIHQFFCD
:..::::.:::: . .. ..: .. . . . . . .:: : :: .:.: .::::
XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE5 IPSLLKLSCSDTFSNEVMIVVSALGVGGGCFIFIIRSYIHIFSTVLGFPRGADRTKAFST
. ::::::::: :::.:. . : :. :. ::.:: ::: : : :::::
XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CIPHILVVSVFLSSCSSVYLRPPAIPAATQDLILSGFYSIMPPLFNPIIYSLRNKQIKVA
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XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 IKKIMKRIFYSENV
.::.. :. .:
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
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Smith-Waterman score: 805; 41.4% identity (69.4% similar) in 307 aa overlap (3-309:15-321)
10 20 30 40
pF1KE5 MPNSTTVMEFLLMRFSDVWTLQILHSASFFMLYLVTLMGNILIVTVTT
:...: ::::. .: : : . :. .::.:..::.::. ..
XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
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pF1KE5 CDSSLHMPMYFFLRNLSILDACYISVTVPTSCVNSLLDSTTISKAGCVAQVFLVVFFVYV
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XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
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pF1KE5 SNVIHQFFCDIPSLLKLSCSDTFSNEVMIVVSALGVGGGCFIFIIRSYIHIFSTVLGFPR
.:.: .::::. ::::::::: :::.:. . : :. :. ::.:: ::: :
XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
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pF1KE5 GADRTKAFSTCIPHILVVSVFLSSCSSVYLRPPAIPAATQDLILSGFYSIMPPLFNPIIY
: :::::: :. :: .: :. .::. : . .: .: . . .:... :..::.::
XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
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290 300 310
pF1KE5 SLRNKQIKVAIKKIMKRIFYSENV
::::. .: :.::.. :. .:
XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
310 320
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 801 init1: 739 opt: 796 Z-score: 823.2 bits: 160.5 E(85289): 4.1e-39
Smith-Waterman score: 796; 42.8% identity (69.5% similar) in 311 aa overlap (3-311:5-314)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MPNSTTVMEFLLMRFSDVWT-LQILHSASFFMLYLVTLMGNILIVTVTTCDSSLHMPM
: : . ::.:: ::.. : .: : .:. .::::: :: ::. :: : :: ::
NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
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pF1KE5 YFFLRNLSILDACYISVTVPTSCVNSLLDSTTISKAGCVAQVFLVVFFVYVELLFLTIMA
::::::::.:. . : :: . : ..:::: ::..:... :: .: ..:. ::
NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
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pF1KE5 HDRYVAVCQPLHYPVIVNSRICIQMTLASLLSGLVYAGMHTGSTFQLPFCRSNVIHQFFC
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NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
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pF1KE5 DIPSLLKLSCSDTFSNEVMIVV-SALGVGGGCFIFIIRSYIHIFSTVLGFPRGADRTKAF
: : .::: :.:: :.. .: . : : :.. :. :: .: ...: .: . . :::
NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLL-ILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAF
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pF1KE5 STCIPHILVVSVFLSSCSSVYLRPPAIPAATQDLILSGFYSIMPPLFNPIIYSLRNKQIK
::: :.::::.: : : .:. : . . . .:: :... :..:::::::::...:
NP_835 STCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVK
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300 310
pF1KE5 VAIKKIMKRIFYSENV
:... ..... .:
NP_835 NALSRTFHKVLALRNCIP
300 310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 808 init1: 779 opt: 792 Z-score: 819.1 bits: 159.7 E(85289): 6.9e-39
Smith-Waterman score: 792; 41.7% identity (68.2% similar) in 302 aa overlap (3-304:7-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MPNSTTVMEFLLMRFSDVWTLQILHSASFFMLYLVTLMGNILIVTVTTCDSSLHMP
: : : ::.:. : :::. :. :: . :.::: .. . : :. :
NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
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pF1KE5 MYFFLRNLSILDACYISVTVPTSCVNSLLDSTTISKAGCVAQVFLVVFFVYVELLFLTIM
::::: :::..: ::.: :: :: : .. .:: ::. : .. :. .: ..:. :
NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
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pF1KE5 AHDRYVAVCQPLHYPVIVNSRICIQMTLASLLSGLVYAGMHTGSTFQLPFCRSNVIHQFF
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NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
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pF1KE5 CDIPSLLKLSCSDTFSNEVMIVVSALGVGGGCFIFIIRSYIHIFSTVLGFPRGADRTKAF
::.: ::::::.:: :: .. . . .: :::.:: ::. :. .:: . . : :.:
NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
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pF1KE5 STCIPHILVVSVFLSSCSSVYLRPPAIPAATQDLILSGFYSIMPPLFNPIIYSLRNKQIK
::: :. :... .. .: :: . . . : :.: ::.:. :..::.:::::::..:
NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 VAIKKIMKRIFYSENV
: .:...
NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 784 init1: 784 opt: 786 Z-score: 813.1 bits: 158.6 E(85289): 1.5e-38
Smith-Waterman score: 786; 40.1% identity (69.7% similar) in 304 aa overlap (3-305:6-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MPNSTTVMEFLLMRFSDV-WTLQILHSASFFMLYLVTLMGNILIVTVTTCDSSLHMP
: : . :.:. ::: ...: . :...:...: :. .... :: :: :
NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTI-FLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTP
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pF1KE5 MYFFLRNLSILDACYISVTVPTSCVNSLLDSTTISKAGCVAQVFLVVFFVYVELLFLTIM
::::: :::..:.:::: ::: : : .. ::. .::. : :. . : ..: :
NP_001 MYFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAM
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 AHDRYVAVCQPLHYPVIVNSRICIQMTLASLLSGLVYAGMHTGSTFQLPFCRSNVIHQFF
:.:::.:.:.:: : :.. .:. :.:.. ..::. . .. :. .:: :: ::::..::
NP_001 AYDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 CDIPSLLKLSCSDTFSNEVMIVVSALGVGGGCFIFIIRSYIHIFSTVLGFPRGADRTKAF
::.:.:: :::.::: .:: .. .. : . . :. :: .: ... . . :.:::
NP_001 CDMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 STCIPHILVVSVFLSSCSSVYLRPPAIPAATQDLILSGFYSIMPPLFNPIIYSLRNKQIK
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NP_001 NTCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIK
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 VAIKKIMKRIFYSENV
:.:...::
NP_001 DALKRLQKRKCC
300 310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE5 MPNSTTVMEFLLMRFSDVWTLQILHSASFFMLYLVTLMGNILIVTVTTCDSSLHMPMY
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NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
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60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLRNLSILDACYISVTVPTSCVNSLLDSTTISKAGCVAQVFLVVFFVYVELLFLTIMAH
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NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
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pF1KE5 DRYVAVCQPLHYPVIVNSRICIQMTLASLLSGLVYAGMHTGSTFQLPFCRSNVIHQFFCD
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NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
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pF1KE5 IPSLLKLSCSDTFSNEVMIVVSALGVGG-GCFIFIIRSYIHIFSTVLGFPRGADRTKAFS
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NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILA-GVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFS
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pF1KE5 TCIPHILVVSVFLSSCSSVYLRPPAIPAATQDLILSGFYSIMPPLFNPIIYSLRNKQIKV
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NP_003 TCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKK
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300 310
pF1KE5 AIKKIMKRIFYSENV
:. ....:
NP_003 ALANVISRKRTSSFL
300 310
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10 20 30 40 50
pF1KE5 MPNSTTVMEFLLMRFSDVWTLQILHSASFFMLYLVTLMGNILIVTVTTCDSSLHMPMY
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pF1KE5 FFLRNLSILDACYISVTVPTSCVNSLLDSTTISKAGCVAQVFLVVFFVYVELLFLTIMAH
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pF1KE5 DRYVAVCQPLHYPVIVNSRICIQMTLASLLSGLVYAGMHTGSTFQLPFCRSNVIHQFFCD
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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pF1KE5 IPSLLKLSCSDTFSNEVMIVVSALGVGGGCFIFIIRSYIHIFSTVLGFPRGADRTKAFST
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CIPHILVVSVFLSSCSSVYLRPPAIPAATQDLILSGFYSIMPPLFNPIIYSLRNKQIKVA
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
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300 310
pF1KE5 IKKIMKRIFYSENV
.:..
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
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Smith-Waterman score: 768; 38.9% identity (72.8% similar) in 301 aa overlap (3-303:5-305)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MPNSTTVMEFLLMRFSDVWTLQILHSASFFMLYLVTLMGNILIVTVTTCDSSLHMPMY
:.: : ::.:. .:. : .. . :...:.::..:: ::: . :: :: :::
NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KE5 FFLRNLSILDACYISVTVPTSCVNSLLDSTTISKAGCVAQVFLVVFFVYVELLFLTIMAH
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NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KE5 DRYVAVCQPLHYPVIVNSRICIQMTLASLLSGLVYAGMHTGSTFQLPFCRSNVIHQFFCD
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NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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pF1KE5 IPSLLKLSCSDTFSNEVMIVVSALGVGGGCFIFIIRSYIHIFSTVLGFPRGADRTKAFST
. ....:.: :: :::: :.::.. . : ... :::.:.::.: . : ::: :
NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CIPHILVVSVFLSSCSSVYLRPPAIPAATQDLILSGFYSIMPPLFNPIIYSLRNKQIKVA
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NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 IKKIMKRIFYSENV
.:..
NP_036 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 782 init1: 756 opt: 768 Z-score: 794.7 bits: 155.2 E(85289): 1.6e-37
Smith-Waterman score: 768; 38.9% identity (72.8% similar) in 301 aa overlap (3-303:5-305)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MPNSTTVMEFLLMRFSDVWTLQILHSASFFMLYLVTLMGNILIVTVTTCDSSLHMPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLRNLSILDACYISVTVPTSCVNSLLDSTTISKAGCVAQVFLVVFFVYVELLFLTIMAH
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVAVCQPLHYPVIVNSRICIQMTLASLLSGLVYAGMHTGSTFQLPFCRSNVIHQFFCD
:::::::. :.: .:... .: .....: .::.. . ..:. :::::.::.. : .. :.
XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 IPSLLKLSCSDTFSNEVMIVVSALGVGGGCFIFIIRSYIHIFSTVLGFPRGADRTKAFST
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CIPHILVVSVFLSSCSSVYLRPPAIPAATQDLILSGFYSIMPPLFNPIIYSLRNKQIKVA
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 IKKIMKRIFYSENV
.:..
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
312 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]