FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5951, 312 aa
1>>>pF1KE5951 312 - 312 aa - 312 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3327+/-0.00113; mu= 15.0186+/- 0.067
mean_var=130.3710+/-40.183, 0's: 0 Z-trim(103.5): 387 B-trim: 843 in 2/46
Lambda= 0.112327
statistics sampled from 6971 (7458) to 6971 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.591), E-opt: 0.2 (0.229), width: 16
Scan time: 2.370
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31112.1 OR14C36 gene_id:127066|Hs108|chr1 ( 312) 2048 344.0 8.7e-95
CCDS31125.1 OR14I1 gene_id:401994|Hs108|chr1 ( 311) 1025 178.2 7e-45
CCDS31097.1 OR14A16 gene_id:284532|Hs108|chr1 ( 309) 1020 177.4 1.2e-44
CCDS34362.1 OR14J1 gene_id:442191|Hs108|chr6 ( 321) 992 172.9 2.9e-43
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 869 153.0 2.9e-37
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 861 151.7 7.1e-37
CCDS11020.1 OR1G1 gene_id:8390|Hs108|chr17 ( 313) 836 147.6 1.2e-35
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 836 147.6 1.2e-35
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 832 147.0 1.8e-35
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 823 145.5 5e-35
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 820 145.0 7e-35
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 817 144.5 9.9e-35
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 816 144.4 1.1e-34
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 810 143.4 2.2e-34
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 810 143.4 2.2e-34
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 805 142.6 3.8e-34
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 803 142.3 4.8e-34
CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 800 141.8 6.7e-34
CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 ( 314) 799 141.6 7.5e-34
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 797 141.3 9.5e-34
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 796 141.1 1.1e-33
CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 ( 303) 794 140.8 1.3e-33
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 793 140.7 1.6e-33
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 792 140.5 1.6e-33
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 792 140.5 1.6e-33
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 791 140.3 1.8e-33
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 791 140.3 1.9e-33
CCDS31824.1 OR6C2 gene_id:341416|Hs108|chr12 ( 312) 790 140.2 2e-33
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 787 139.7 2.9e-33
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 786 139.5 3.2e-33
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 785 139.3 3.6e-33
CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 ( 320) 785 139.4 3.6e-33
CCDS32029.1 OR4L1 gene_id:122742|Hs108|chr14 ( 312) 783 139.0 4.5e-33
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 782 138.8 4.9e-33
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 782 138.9 5e-33
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 782 138.9 5.3e-33
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 781 138.7 5.6e-33
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 781 138.7 5.6e-33
CCDS30896.1 OR10K2 gene_id:391107|Hs108|chr1 ( 312) 781 138.7 5.6e-33
CCDS12320.1 OR7C2 gene_id:26658|Hs108|chr19 ( 319) 779 138.4 7.1e-33
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 778 138.2 7.9e-33
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 777 138.0 8.8e-33
CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 ( 323) 777 138.1 9e-33
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 774 137.6 1.2e-32
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 774 137.6 1.2e-32
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 774 137.6 1.3e-32
CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 772 137.2 1.5e-32
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 772 137.2 1.5e-32
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 772 137.2 1.5e-32
CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 ( 314) 772 137.2 1.5e-32
>>CCDS31112.1 OR14C36 gene_id:127066|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 2048 init1: 2048 opt: 2048 Z-score: 1815.2 bits: 344.0 E(32554): 8.7e-95
Smith-Waterman score: 2048; 100.0% identity (100.0% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MPNSTTVMEFLLMRFSDVWTLQILHSASFFMLYLVTLMGNILIVTVTTCDSSLHMPMYFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MPNSTTVMEFLLMRFSDVWTLQILHSASFFMLYLVTLMGNILIVTVTTCDSSLHMPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LRNLSILDACYISVTVPTSCVNSLLDSTTISKAGCVAQVFLVVFFVYVELLFLTIMAHDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LRNLSILDACYISVTVPTSCVNSLLDSTTISKAGCVAQVFLVVFFVYVELLFLTIMAHDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YVAVCQPLHYPVIVNSRICIQMTLASLLSGLVYAGMHTGSTFQLPFCRSNVIHQFFCDIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YVAVCQPLHYPVIVNSRICIQMTLASLLSGLVYAGMHTGSTFQLPFCRSNVIHQFFCDIP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 SLLKLSCSDTFSNEVMIVVSALGVGGGCFIFIIRSYIHIFSTVLGFPRGADRTKAFSTCI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SLLKLSCSDTFSNEVMIVVSALGVGGGCFIFIIRSYIHIFSTVLGFPRGADRTKAFSTCI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 PHILVVSVFLSSCSSVYLRPPAIPAATQDLILSGFYSIMPPLFNPIIYSLRNKQIKVAIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PHILVVSVFLSSCSSVYLRPPAIPAATQDLILSGFYSIMPPLFNPIIYSLRNKQIKVAIK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 KIMKRIFYSENV
::::::::::::
CCDS31 KIMKRIFYSENV
310
>>CCDS31125.1 OR14I1 gene_id:401994|Hs108|chr1 (311 aa)
initn: 1064 init1: 1006 opt: 1025 Z-score: 919.2 bits: 178.2 E(32554): 7e-45
Smith-Waterman score: 1025; 50.2% identity (77.3% similar) in 309 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MPNSTTVMEFLLMRFSDVWTLQILHSASFFMLYLVTLMGNILIVTVTTCDSSLHMPMYFF
: : : : :::::.:: .: ::.::.. :...::..:.::.::..: : :. :: :::::
CCDS31 MDNLTKVTEFLLMEFSGIWELQVLHAGLFLLIYLAVLVGNLLIIAVITLDQHLHTPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LRNLSILDACYISVTVPTSCVNSLLDSTTISKAGCVAQVFLVVFFVYVELLFLTIMAHDR
:.:::.:: :::::::: : ::: ..:: ::::::.. :. .:: :::.:..::
CCDS31 LKNLSVLDLCYISVTVPKSIRNSLTRRSSISYLGCVAQVYFFSAFASAELAFLTVMSYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YVAVCQPLHYPVIVNSRICIQMTLASLLSGLVYAGMHTGSTFQLPFCRSNVIHQFFCDIP
:::.:.::.: ....: : ::.... :: . ::..:::. :. :::.:::::: :::
CCDS31 YVAICHPLQYRAVMTSGGCYQMAVTTWLSCFSYAAVHTGNMFREHVCRSSVIHQFFRDIP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE5 SLLKL-SCSDTFSNEVMIVVSALGVGGGCFIFIIRSYIHIFSTVLGFPRGADRTKAFSTC
.: : :: : . . ...:. : : :::... ::..:::::: .: : .:.::::::
CCDS31 HVLALVSCEVFFVEFLTLALSSCLVLG-CFILMMISYFQIFSTVLRIPSGQSRAKAFSTC
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 IPHILVVSVFLSSCSSVYLRPPAIPAATQDLILSGFYSIMPPLFNPIIYSLRNKQIKVAI
:...:. .::.. . : : : . :::... :...::..::::::::::.::.:.
CCDS31 SPQLIVIMLFLTTGLFAALGPIAKALSIQDLVIALTYTVLPPFLNPIIYSLRNKEIKTAM
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 KKIMKRIFYSENV
... .:..
CCDS31 WRLFVKIYFLQK
300 310
>>CCDS31097.1 OR14A16 gene_id:284532|Hs108|chr1 (309 aa)
initn: 1039 init1: 846 opt: 1020 Z-score: 914.9 bits: 177.4 E(32554): 1.2e-44
Smith-Waterman score: 1020; 50.0% identity (75.0% similar) in 304 aa overlap (1-304:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MPNSTTVMEFLLMRFSDVWTLQILHSASFFMLYLVTLMGNILIVTVTTCDSSLHMPMYFF
: : : : ::.:: :: .. :::: :...:: .::::.::. .:: : :: :.:::
CCDS31 MANLTIVTEFILMGFSTNKNMCILHSILFLLIYLCALMGNVLIIMITTLDHHLHTPVYFF
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pF1KE5 LRNLSILDACYISVTVPTSCVNSLLDSTTISKAGCVAQVFLVVFFVYVELLFLTIMAHDR
:.:::.:: : ::::.: : .:::. ...:: :::.::::.. . .:::.::.:. ::
CCDS31 LKNLSFLDLCLISVTAPKSIANSLIHNNSISFLGCVSQVFLLLSSASAELLLLTVMSFDR
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 YVAVCQPLHYPVIVNSRICIQMTLASLLSGLVYAGMHTGSTFQLPFCRSNVIHQFFCDIP
:.:.:.:::: ::.. :.: . .: : : . : :::..::.: .: ::..::::::::
CCDS31 YTAICHPLHYDVIMDRSTCVQRATVSWLYGGLIAVMHTAGTFSLSYCGSNMVHQFFCDIP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 SLLKLSCSDTFSNEVMIVVSALGVGGGCFIFIIRSYIHIFSTVLGFPRGADRTKAFSTCI
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CCDS31 QLLAISCSENLIREIALILINVVLDFCCFIVIIITYVHVFSTVKKIPSTEGQSKAYSICL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 PHILVVSVFLSSCSSVYLRPPAIPAATQDLILSGFYSIMPPLFNPIIYSLRNKQIKVAIK
::.::: .:::. .::.: . . : ..: ::...:: ::::::::::: ::::.
CCDS31 PHLLVV-LFLSTGFIAYLKPASESPSILDAVISVFYTMLPPTFNPIIYSLRNKAIKVALG
250 260 270 280 290
310
pF1KE5 KIMKRIFYSENV
..:
CCDS31 MLIKGKLTKK
300
>>CCDS34362.1 OR14J1 gene_id:442191|Hs108|chr6 (321 aa)
initn: 1002 init1: 981 opt: 992 Z-score: 890.2 bits: 172.9 E(32554): 2.9e-43
Smith-Waterman score: 992; 46.9% identity (77.4% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MPNSTTVMEFLLMRFSDVWTLQILHSASFFMLYLVTLMGNILIVTVTTCDSSLHMPMYFF
: : :.. :::: ::: :::::. :.. ::..: ::.::.:. : : :: :::.:
CCDS34 MVNLTSMSGFLLMGFSDERKLQILHALVFLVTYLLALTGNLLIITIITVDRRLHSPMYYF
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70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LRNLSILDACYISVTVPTSCVNSLLDSTTISKAGCVAQVFLVVFFVYVELLFLTIMAHDR
:..::.:: :.:::::: : .:::. . :: . :. :::. . .. :. .::.:..::
CCDS34 LKHLSLLDLCFISVTVPQSIANSLMGNGYISLVQCILQVFFFIALASSEVAILTVMSYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YVAVCQPLHYPVIVNSRICIQMTLASLLSGLVYAGMHTGSTFQLPFCRSNVIHQFFCDIP
:.:.:::::: .:.. : : . ..: ..: . . ::.. .:..:.: . ::::::::.:
CCDS34 YAAICQPLHYETIMDPRACRHAVIAVWIAGGLSGLMHAAINFSIPLCGKRVIHQFFCDVP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 SLLKLSCSDTFSNEVMIVVSALGVGGGCFIFIIRSYIHIFSTVLGFPRGADRTKAFSTCI
..:::.:: : ::. ... . ... :.: :. :::.:::::: .: . :::.::::.
CCDS34 QMLKLACSYEFINEIALAAFTTSAAFICLISIVLSYIRIFSTVLRIPSAEGRTKVFSTCL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 PHILVVSVFLSSCSSVYLRPPAIPAATQDLILSGFYSIMPPLFNPIIYSLRNKQIKVAIK
::..:.. :::. . .:: :. ..: ::..: ::...:: .::.:::::: ..:.:..
CCDS34 PHLFVATFFLSAAGFEFLRLPSDSSSTVDLVFSVFYTVIPPTLNPVIYSLRNDSMKAALR
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 KIMKRIFYSENV
:....
CCDS34 KMLSKEELPQRKMCLKAMFKL
310 320
>>CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 (313 aa)
initn: 845 init1: 644 opt: 869 Z-score: 782.6 bits: 153.0 E(32554): 2.9e-37
Smith-Waterman score: 869; 41.0% identity (74.5% similar) in 310 aa overlap (3-311:5-311)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MPNSTTVMEFLLMRFSDVWTLQILHSASFFMLYLVTLMGNILIVTVTTCDSSLHMPMY
:.: : ::... ..: .:..: .: .:..:: :::::. .:. ::: :::
CCDS41 MDSLNQTRVTEFVFLGLTDNRVLEMLFFMAFSAIYMLTLSGNILIIIATVFTPSLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLRNLSILDACYISVTVPTSCVNSLLDSTTISKAGCVAQVFLVVFFVYVELLFLTIMAH
::: :::..: :. ::::: . ::. ::: .:..:.:.. .:. .:...: :::.
CCDS41 FFLSNLSFIDICHSSVTVPKMLEGLLLERKTISFDNCITQLFFLHLFACAEIFLLIIMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYVAVCQPLHYPVIVNSRICIQMTLASLLSGLVYAGMHTGSTFQLPFCRSNVIHQFFCD
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CCDS41 DRYVAICTPLHYPNVMNMRVCIQLVFALWLGGTVHSLGQTFLTIRLPYCGPNIIDSYFCD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 IPSLLKLSCSDTFSNEVMIVVSALGVGGGCFIFIIRSYIHIFSTVLGFPRGADRTKAFST
.: ..::.:.::. . ..::... .. .::. .. ::. :. . : . : ::.::
CCDS41 VPLVIKLACTDTYLTGILIVTNSGTISLSCFLAVVTSYMVILVS-LRKHSAEGRRKALST
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CIPHILVVSVFLSSCSSVYLRPPAIPAATQDLILSGFYSIMPPLFNPIIYSLRNKQIKVA
: :..::..:.. : .: :: . . . : ..: ::... ::.::.::.:::...: :
CCDS41 CSAHFMVVALFFGPCIFIYTRPDT--SFSIDKVVSVFYTVVTPLLNPFIYTLRNEEVKSA
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 IKKIMKR-IFYSENV
.:.. .: .:....
CCDS41 MKQLRQRQVFFTKSYT
300 310
>>CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 (321 aa)
initn: 875 init1: 846 opt: 861 Z-score: 775.5 bits: 151.7 E(32554): 7.1e-37
Smith-Waterman score: 861; 44.3% identity (71.7% similar) in 300 aa overlap (3-302:5-304)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MPNSTTVMEFLLMRFSDVWTLQILHSASFFMLYLVTLMGNILIVTVTTCDSSLHMPMY
:.:.. ::... ::.. ::.: . ::. :. :: :::::. .:. : :: :::
CCDS46 MERKNQTAITEFIILGFSNLNELQFLLFTIFFLTYFCTLGGNILIILTTVTDPHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FFLRNLSILDACYISVTVPTSCVNSLLDSTTISKAGCVAQVFLVVFFVYVELLFLTIMAH
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CCDS11 FFLANLSLADACFVSTTVPKMLANIQIQSQAISYSGCLLQLYFFMLFVMLEAFLLAVMAY
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CCDS11 INPLLSLSCTDPFTNELVIFITGGLTGLICVLCLIISYTNVFSTILKIPSAQGKRKAFST
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CCDS11 CSSHLSVVSLFFGTSFCVDFSSPSTHSAQKDTVASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNQEIKSS
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pF1KE5 IKKIMKRIFYSENV
..:..
CCDS11 LRKLIWVRKIHSP
310
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CCDS31 LHTPMYFFLSSLSFVDASYSSSVTPKMLVNLMAENKAISFHGCAAQFYFFGSFLGTECFL
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CCDS31 NHFYCDTPPLLKLSCSDTHFNGIVIMAFSSFIVISCVMIVLISYLCIFIAVLKMPSLEGR
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CCDS31 HKAFSTCASYLMAVTIFFGTILFMYLRPTSSYSMEQDKVVSVFYTVIIPVLNPLIYSLKN
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