Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5948
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5948, 312 aa
1>>>pF1KE5948 312 - 312 aa - 312 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5960+/-0.00126; mu= 14.4930+/- 0.074
mean_var=172.0666+/-60.151, 0's: 0 Z-trim(102.0): 378 B-trim: 400 in 1/46
Lambda= 0.097775
statistics sampled from 6287 (6740) to 6287 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.532), E-opt: 0.2 (0.207), width: 16
Scan time: 1.300
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS30896.1 OR10K2 gene_id:391107|Hs108|chr1 ( 312) 2033 299.9 1.7e-81
CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 ( 313) 1724 256.3 2.3e-68
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 1112 170.0 2.3e-42
CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 ( 314) 1073 164.5 9.9e-41
CCDS30910.1 OR10J5 gene_id:127385|Hs108|chr1 ( 309) 1056 162.0 5.2e-40
CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 ( 320) 1025 157.7 1.1e-38
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 1016 156.4 2.6e-38
CCDS12335.1 OR10H1 gene_id:26539|Hs108|chr19 ( 318) 1004 154.7 8.5e-38
CCDS32940.1 OR10H5 gene_id:284433|Hs108|chr19 ( 315) 1001 154.3 1.1e-37
CCDS12333.1 OR10H2 gene_id:26538|Hs108|chr19 ( 315) 990 152.8 3.3e-37
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 987 152.3 4.5e-37
CCDS32941.1 OR10H4 gene_id:126541|Hs108|chr19 ( 316) 976 150.8 1.3e-36
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 957 148.1 8.4e-36
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 953 147.6 1.3e-35
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 952 147.4 1.4e-35
CCDS31565.1 OR10V1 gene_id:390201|Hs108|chr11 ( 309) 951 147.2 1.5e-35
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 949 147.0 1.8e-35
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 948 146.8 2e-35
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 936 145.1 6.6e-35
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 932 144.6 9.8e-35
CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 ( 303) 929 144.1 1.3e-34
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 929 144.1 1.3e-34
CCDS12334.1 OR10H3 gene_id:26532|Hs108|chr19 ( 316) 929 144.1 1.3e-34
CCDS31547.1 OR10Q1 gene_id:219960|Hs108|chr11 ( 319) 921 143.0 2.9e-34
CCDS30909.1 OR10J3 gene_id:441911|Hs108|chr1 ( 329) 919 142.8 3.5e-34
CCDS42837.1 OR6B3 gene_id:150681|Hs108|chr2 ( 331) 914 142.1 5.8e-34
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 910 141.5 8.3e-34
CCDS46559.1 OR6B2 gene_id:389090|Hs108|chr2 ( 312) 901 140.2 2e-33
CCDS31828.1 OR10P1 gene_id:121130|Hs108|chr12 ( 313) 898 139.8 2.7e-33
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 894 139.2 3.9e-33
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 890 138.7 6e-33
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 888 138.4 7.1e-33
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 883 137.7 1.2e-32
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 882 137.5 1.3e-32
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 881 137.4 1.4e-32
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 878 136.9 1.9e-32
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 872 136.1 3.4e-32
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 871 136.0 3.7e-32
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 870 135.8 4.1e-32
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 869 135.7 4.5e-32
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 869 135.7 4.5e-32
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 868 135.5 5e-32
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 868 135.5 5e-32
CCDS43671.1 OR2A2 gene_id:442361|Hs108|chr7 ( 318) 867 135.4 5.6e-32
CCDS35124.1 OR1L8 gene_id:138881|Hs108|chr9 ( 309) 866 135.2 6.1e-32
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 866 135.3 6.2e-32
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 865 135.1 6.7e-32
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 861 134.5 9.9e-32
CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 ( 324) 859 134.3 1.2e-31
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 858 134.1 1.3e-31
>>CCDS30896.1 OR10K2 gene_id:391107|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 2033 init1: 2033 opt: 2033 Z-score: 1576.6 bits: 299.9 E(32554): 1.7e-81
Smith-Waterman score: 2033; 100.0% identity (100.0% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MERVNETVVREVIFLGFSSLARLQQLLFVIFLLLYLFTLGTNAIIISTIVLDRALHIPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MERVNETVVREVIFLGFSSLARLQQLLFVIFLLLYLFTLGTNAIIISTIVLDRALHIPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLAILSCSEICYTFIIVPKMLVDLLSQKKTISFLGCAIQMFSFLFLGCSHSFLLAVMGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 FFLAILSCSEICYTFIIVPKMLVDLLSQKKTISFLGCAIQMFSFLFLGCSHSFLLAVMGY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYIAICNPLRYSVLMGHGVCMGLVAAACACGFTVAQIITSLVFHLPFYSSNQLHHFFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DRYIAICNPLRYSVLMGHGVCMGLVAAACACGFTVAQIITSLVFHLPFYSSNQLHHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 IAPVLKLASHHNHFSQIVIFMLCTLVLAIPLLLILVSYVHILSAILQFPSTLGRCKAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 IAPVLKLASHHNHFSQIVIFMLCTLVLAIPLLLILVSYVHILSAILQFPSTLGRCKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CVSHLIIVTVHYGCASFIYLRPQSNYSSSQDALISVSYTIITPLFNPMIYSLRNKEFKSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 CVSHLIIVTVHYGCASFIYLRPQSNYSSSQDALISVSYTIITPLFNPMIYSLRNKEFKSA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LCKIVRRTISLL
::::::::::::
CCDS30 LCKIVRRTISLL
310
>>CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 (313 aa)
initn: 1768 init1: 1723 opt: 1724 Z-score: 1341.0 bits: 256.3 E(32554): 2.3e-68
Smith-Waterman score: 1724; 84.5% identity (95.8% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MERVNETVVREVIFLGFSSLARLQQLLFVIFLLLYLFTLGTNAIIISTIVLDRALHIPMY
::.::.::::: . :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS30 MEQVNKTVVREFVVLGFSSLARLQQLLFVIFLLLYLFTLGTNAIIISTIVLDRALHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLAILSCSEICYTFIIVPKMLVDLLSQKKTISFLGCAIQMFSFLFLGCSHSFLLAVMGY
:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.: :::::::.:::
CCDS30 FFLAILSCSEICYTFVIVPKMLVDLLSQKKTISFLGCAIQMFSFLFFGSSHSFLLAAMGY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYIAICNPLRYSVLMGHGVCMGLVAAACACGFTVAQIITSLVFHLPFYSSNQLHHFFCD
:::.::::::::::::::::::::.::::::::::. . :::::::::.:::::::::::
CCDS30 DRYMAICNPLRYSVLMGHGVCMGLMAAACACGFTVSLVTTSLVFHLPFHSSNQLHHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 IAPVLKLASHHNHFSQIVIFMLCTLVLAIPLLLILVSYVHILSAILQFPSTLGRCKAFST
:.:::::::.:. :::.::::: ...:.::::::::::..:.::::..::..:: :.:::
CCDS30 ISPVLKLASQHSGFSQLVIFMLGVFALVIPLLLILVSYIRIISAILKIPSSVGRYKTFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CVSHLIIVTVHYGCASFIYLRPQSNYSSSQDALISVSYTIITPLFNPMIYSLRNKEFKSA
:.::::.:::::.:::::::::..::.::::.::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS30 CASHLIVVTVHYSCASFIYLRPKTNYTSSQDTLISVSYTILTPLFNPMIYSLRNKEFKSA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LCKIVRRTISLL
: ::::
CCDS30 L----RRTIGQTFYPLS
310
>>CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 (335 aa)
initn: 1103 init1: 1103 opt: 1112 Z-score: 874.2 bits: 170.0 E(32554): 2.3e-42
Smith-Waterman score: 1112; 56.2% identity (80.8% similar) in 308 aa overlap (5-311:25-331)
10 20 30 40
pF1KE5 MERVNETVVREVIFLGFSSLARLQQLLFVIFLLLYLFTLG
: :.: : ..::::::...: :::.::.::: :.
CCDS30 MPQILIFTYLNMFYFFPPLQILAENLTMVTEFLLLGFSSLGEIQLALFVVFLFLYLVILS
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 TNAIIISTIVLDRALHIPMYFFLAILSCSEICYTFIIVPKMLVDLLSQKKTISFLGCAIQ
:. :::.: ::..:: ::::::.::: :: :::.:.::::..::: .:::: ::.:
CCDS30 GNVTIISVIHLDKSLHTPMYFFLGILSTSETFYTFVILPKMLINLLSVARTISFNCCALQ
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150
pF1KE5 MFSFLFLGCSHSFLLAVMGYDRYIAICNPLRYSVLMGHGVCMGLVAAACACG-FTVAQII
:: :: .. .. .::.::::::: :::.::.: .::. :: : .::::: : : .. .
CCDS30 MFFFLGFAITNCLLLGVMGYDRYAAICHPLHYPTLMSWQVC-GKLAAACAIGGFLASLTV
130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 TSLVFHLPFYSSNQLHHFFCDIAPVLKLASHHNHFSQIVIFMLCTLVLAIPLLLILVSYV
..::: ::: :.:...:.::::. :. :: .. ...:::. .:::..:.:.: :::.
CCDS30 VNLVFSLPFCSANKVNHYFCDISAVILLACTNTDVNEFVIFICGVLVLVVPFLFICVSYL
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 HILSAILQFPSTLGRCKAFSTCVSHLIIVTVHYGCASFIYLRPQSNYSSSQDALISVSYT
:: .::..::. :: ::::::.::: .: ::::::::::::: .:: :..: :..:.::
CCDS30 CILRTILKIPSAEGRRKAFSTCASHLSVVIVHYGCASFIYLRPTANYVSNKDRLVTVTYT
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310
pF1KE5 IITPLFNPMIYSLRNKEFKSALCKIVRRTISLL
:.:::.:::.::::::. . :. :.. . ::
CCDS30 IVTPLLNPMVYSLRNKDVQLAIRKVLGKKGSLKLYN
300 310 320 330
>>CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 (314 aa)
initn: 1099 init1: 766 opt: 1073 Z-score: 844.7 bits: 164.5 E(32554): 9.9e-41
Smith-Waterman score: 1073; 52.5% identity (82.3% similar) in 299 aa overlap (7-305:8-305)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MERVNETVVREVIFLGFSSLARLQQLLFVIFLLLYLFTLGTNAIIISTIVLDRALHIPM
::: . :..:::::..:: ::::::::::: : .:. :...: .. .:: ::
CCDS30 MRGFNKTTVVTQFILVGFSSLGELQLLLFVIFLLLYLTILVANVTIMAVIRFSWTLHTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFFLAILSCSEICYTFIIVPKMLVDLLSQKKTISFLGCAIQMFSFLFLGCSHSFLLAVMG
: :: ::: :: ::::.:.:..:: :::. :::::..:: :.: :: ..:.. .:.::::
CCDS30 YGFLFILSFSESCYTFVIIPQLLVHLLSDTKTISFMACATQLFFFLGFACTNCLLIAVMG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YDRYIAICNPLRYSVLMGHGVCMGLVAAACACGFTVAQIITSLVFHLPFYSSNQLHHFFC
::::.:::.::::...... . . :.. . : :: .: . :.:. . : . :...:.::
CCDS30 YDRYVAICHPLRYTLIINKRLGLELISLSGATGFFIALVATNLICDMRFCGPNRVNHYFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DIAPVLKLASHHNHFSQIVIFMLCTLVLAIPLLLILVSYVHILSAILQFPSTLGRCKAFS
:.:::.::: .: .....: : ::. .:.::::.:: :...::..::. :. :::
CCDS30 DMAPVIKLACTDTHVKELALFSLSILVIMVPFLLILISYGFIVNTILKIPSAEGK-KAFV
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCVSHLIIVTVHYGCASFIYLRPQSNYSSSQDALISVSYTIITPLFNPMIYSLRNKEFKS
::.::: .: :::::::.:::::.:. .:..: :..:.::..:::.::..::::::: :.
CCDS30 TCASHLTVVFVHYGCASIIYLRPKSKSASDKDQLVAVTYTVVTPLLNPLVYSLRNKEVKT
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 ALCKIVRRTISLL
:: ...
CCDS30 ALKRVLGMPVATKMS
300 310
>>CCDS30910.1 OR10J5 gene_id:127385|Hs108|chr1 (309 aa)
initn: 1058 init1: 573 opt: 1056 Z-score: 831.8 bits: 162.0 E(32554): 5.2e-40
Smith-Waterman score: 1056; 50.6% identity (80.0% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MERVNETVVREVIFLGFSSLARLQQLLFVIFLLLYLFTLGTNAIIISTIVLDRALHIPMY
:.: : : : : :::::::... : :::.:: .:..:: .: ::.. : .:. :: :::
CCDS30 MKRKNFTEVSEFIFLGFSSFGKHQITLFVVFLTVYILTLVANIIIVTIICIDHHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLAILSCSEICYTFIIVPKMLVDLLSQKKTISFLGCAIQMFSFLFLGCSHSFLLAVMGY
:::..:. :: ::..:::.::..:. ... ::. ::: ::: :..:. .. :::..:::
CCDS30 FFLSMLASSETVYTLVIVPRMLLSLIFHNQPISLAGCATQMFFFVILATNNCFLLTAMGY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYIAICNPLRYSVLMGHGVCMGLVAAACACGFTVAQIITSLVFHLPFYSSNQLHHFFCD
:::.::: ::::.:.:..:.: :: .. . :.:.: . .. .:.::: .. . :::::
CCDS30 DRYVAICRPLRYTVIMSKGLCAQLVCGSFGIGLTMAVLHVTAMFNLPF-CGTVVDHFFCD
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 IAPVLKLASHHNHFSQIVIFMLCTLVLAIPLLLILVSYVHILSAILQFPSTLGRCKAFST
: ::.::. . ...:. . . ..:. .:. ::..::: ..:.:::. :. :: :.:.:
CCDS30 IYPVMKLSCIDTTINEIINYGVSSFVIFVPIGLIFISYVLVISSILQIASAEGRKKTFAT
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CVSHLIIVTVHYGCASFIYLRPQSNYSSSQDALISVSYTIITPLFNPMIYSLRNKEFKSA
::::: .: :: ::::. ::.:.:. : .: ..::.:::::::.::..::::::: :.:
CCDS30 CVSHLTVVIVHCGCASIAYLKPKSESSIEKDLVLSVTYTIITPLLNPVVYSLRNKEVKDA
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 LCKIVRRTISLL
::..: :.::
CCDS30 LCRVVGRNIS
300
>>CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 (320 aa)
initn: 1023 init1: 548 opt: 1025 Z-score: 808.0 bits: 157.7 E(32554): 1.1e-38
Smith-Waterman score: 1025; 49.8% identity (78.4% similar) in 305 aa overlap (1-305:12-315)
10 20 30 40
pF1KE5 MERVNETVVREVIFLGFSSLARLQQLLFVIFLLLYLFTLGTNAIIISTI
:.: : :.. . .: ::::. . : :: .:: ::..::. : ::.. :
CCDS11 MLLCFRFGNQSMKRENFTLITDFVFQGFSSFHEQQITLFGVFLALYILTLAGNIIIVTII
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
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110 120 130 140 150 160
pF1KE5 SHSFLLAVMGYDRYIAICNPLRYSVLMGHGVCMGLVAAACACGFTVAQIITSLVFHLPFY
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CCDS11 TNCFLLTAMGYDRYVAICNPLRYMVIMNKRLRIQLVLGACSIGLIVAITQVTSVFRLPF-
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 SSNQLHHFFCDIAPVLKLASHHNHFSQIVIFMLCTLVLAIPLLLILVSYVHILSAILQFP
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CCDS11 CARKVPHFFCDIRPVMKLSCIDTTVNEILTLIISVLVLVVPMGLVFISYVLIISTILKIA
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230 240 250 260 270 280
pF1KE5 STLGRCKAFSTCVSHLIIVTVHYGCASFIYLRPQSNYSSSQDALISVSYTIITPLFNPMI
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CCDS11 SVEGRKKAFATCASHLTVVIVHYSCASIAYLKPKSENTREHDQLISVTYTVITPLLNPVV
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CCDS11 YTLRNKEVKDALCRAVGGKFS
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CCDS30 CASHLTVVIIHYGCASFVYLRPKASYSLERDQLIAMTYTVVTPLLNPIVYSLRNRAIQTA
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310
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: . :
CCDS30 LRNAFRGRLLGKG
310
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CCDS12 LKVAMKKTFFSKLYPEKNVMM
300 310
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.: :. :
CCDS32 LKVAMKKTCFTKLFPQNC
300 310
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]