Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5945
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5945, 312 aa
1>>>pF1KE5945 312 - 312 aa - 312 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5065+/-0.00151; mu= 14.6438+/- 0.089
mean_var=149.6438+/-51.719, 0's: 0 Z-trim(99.3): 391 B-trim: 706 in 2/43
Lambda= 0.104844
statistics sampled from 5223 (5691) to 5223 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.493), E-opt: 0.2 (0.175), width: 16
Scan time: 2.140
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 1999 315.3 3.9e-86
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 1861 294.4 7.5e-80
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 1804 285.8 2.9e-77
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 1193 193.4 1.9e-49
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 1148 186.6 2.2e-47
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1108 180.5 1.4e-45
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1107 180.4 1.6e-45
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 1082 176.6 2.3e-44
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1080 176.3 2.7e-44
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 1072 175.1 6.3e-44
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 1070 174.8 7.8e-44
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 1070 174.8 7.8e-44
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 1050 171.7 6.4e-43
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 1044 170.8 1.2e-42
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 1044 170.8 1.2e-42
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 1044 170.8 1.2e-42
CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 ( 309) 1037 169.8 2.5e-42
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 1037 169.8 2.5e-42
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 1037 169.9 2.7e-42
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 1033 169.2 3.8e-42
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 1032 169.0 4.3e-42
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 1031 168.9 4.6e-42
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 1030 168.7 5.1e-42
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 1030 168.7 5.3e-42
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 1025 168.0 9.1e-42
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 1018 166.9 1.8e-41
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 1015 166.5 2.5e-41
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 1010 165.7 4.2e-41
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 1010 165.7 4.2e-41
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 1010 165.7 4.2e-41
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 1009 165.5 4.7e-41
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 1008 165.5 5.5e-41
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 1007 165.2 5.7e-41
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 1007 165.2 5.8e-41
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 1006 165.1 6.4e-41
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 1006 165.1 6.5e-41
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 1005 164.9 7.1e-41
CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 1002 164.5 9.7e-41
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 999 164.0 1.3e-40
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 994 163.3 2.3e-40
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 982 161.5 7.9e-40
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 978 160.8 1.2e-39
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 977 160.7 1.3e-39
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 975 160.5 1.8e-39
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 972 159.9 2.2e-39
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 971 159.8 2.5e-39
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 968 159.3 3.4e-39
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 968 159.3 3.4e-39
CCDS31538.1 OR5AK2 gene_id:390181|Hs108|chr11 ( 309) 967 159.2 3.8e-39
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 963 158.6 5.7e-39
>>CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1999 init1: 1999 opt: 1999 Z-score: 1659.9 bits: 315.3 E(32554): 3.9e-86
Smith-Waterman score: 1999; 99.4% identity (99.4% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMGRRNDTNVADFILMGLSDSEEVQMALFMLFLLIYLITMLGNVGMLLIIRLDLQLHTPM
::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MMGRRNDTNVADFILTGLSDSEEVQMALFMLFLLIYLITMLGNVGMLLIIRLDLQLHTPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YFFLTHLSFIDLSYSTVVTPKTLANLLTSNYISFTGCFAQMFCFVFLGTAECYLLSSMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YFFLTHLSFIDLSYSTVVTPKTLANLLTSNYISFTGCFAQMFCFVFLGTAECYLLSSMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYAAICSPLHYTVIMSKRLCLALITGPYVIGFMDSFVNVVSMSRLHFCDSNIIHHFFCD
:::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DRYAAICSPLHYTVIMPKRLCLALITGPYVIGFMDSFVNVVSMSRLHFCDSNIIHHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TSPILALSCTDTDNTEMLIFIIAGSTLMVSLITISASYVSILSTILKINSTSGKQKAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TSPILALSCTDTDNTEMLIFIIAGSTLMVSLITISASYVSILSTILKINSTSGKQKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CVSHLLGVTIFYGTMIFTYLKPRKSYSLGRDQVAPVFYTIVIPMLNPLIYSLRNREVKNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CVSHLLGVTIFYGTMIFTYLKPRKSYSLGRDQVAPVFYTIVIPMLNPLIYSLRNREVKNA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LIRVMQRRQDSR
::::::::::::
CCDS31 LIRVMQRRQDSR
310
>>CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1861 init1: 1861 opt: 1861 Z-score: 1547.1 bits: 294.4 E(32554): 7.5e-80
Smith-Waterman score: 1861; 92.6% identity (97.8% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMGRRNDTNVADFILMGLSDSEEVQMALFMLFLLIYLITMLGNVGMLLIIRLDLQLHTPM
::::::.:::::::::::. :::.::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS31 MMGRRNNTNVADFILMGLTLSEEIQMALFMLFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YFFLTHLSFIDLSYSTVVTPKTLANLLTSNYISFTGCFAQMFCFVFLGTAECYLLSSMAY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :.::::::::::::::.
CCDS31 YFFLTHLSFIDLSYSTVVTPKTLANLLTSNYISFTGCFAQMFFFAFLGTAECYLLSSMAH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYAAICSPLHYTVIMSKRLCLALITGPYVIGFMDSFVNVVSMSRLHFCDSNIIHHFFCD
:::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::: :::.:::::::
CCDS31 DRYAAICSPLHYTVIMSKRLCLALITGPYVIGFIDSFVNVVSMSRLHFYDSNVIHHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TSPILALSCTDTDNTEMLIFIIAGSTLMVSLITISASYVSILSTILKINSTSGKQKAFST
:::::::::::: :::.:::::.::::::::.::::::: :: :::::::::::::::::
CCDS31 TSPILALSCTDTYNTEILIFIIVGSTLMVSLFTISASYVFILFTILKINSTSGKQKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CVSHLLGVTIFYGTMIFTYLKPRKSYSLGRDQVAPVFYTIVIPMLNPLIYSLRNREVKNA
::::::::::::.:.::::::::::::::::::: ::::::::.::::::::::.:::::
CCDS31 CVSHLLGVTIFYSTLIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPVLNPLIYSLRNKEVKNA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LIRVMQRRQDSR
.:::::::::::
CCDS31 VIRVMQRRQDSR
310
>>CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1804 init1: 1804 opt: 1804 Z-score: 1500.5 bits: 285.8 E(32554): 2.9e-77
Smith-Waterman score: 1804; 89.1% identity (96.1% similar) in 311 aa overlap (2-312:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMGRRNDTNVADFILMGLSDSEEVQMALFMLFLLIYLITMLGNVGMLLIIRLDLQLHTPM
:::::.::: :::: :::::::::::::.::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS31 MGRRNNTNVPDFILTGLSDSEEVQMALFILFLLIYLITMLGNVGMILIIRLDLQLHTPM
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70 80 90 100 110 120
pF1KE5 YFFLTHLSFIDLSYSTVVTPKTLANLLTSNYISFTGCFAQMFCFVFLGTAECYLLSSMAY
:::::::::::::::::.:::::::::::::::: ::::::: :::::.:::.:::::::
CCDS31 YFFLTHLSFIDLSYSTVITPKTLANLLTSNYISFMGCFAQMFFFVFLGAAECFLLSSMAY
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130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYAAICSPLHYTVIMSKRLCLALITGPYVIGFMDSFVNVVSMSRLHFCDSNIIHHFFCD
:::.::::::.: :::::::: ::.::::::.:..:::::: ::::::::::...:::::
CCDS31 DRYVAICSPLRYPVIMSKRLCCALVTGPYVISFINSFVNVVWMSRLHFCDSNVVRHFFCD
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190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TSPILALSCTDTDNTEMLIFIIAGSTLMVSLITISASYVSILSTILKINSTSGKQKAFST
::::::::: :: . :..: :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS31 TSPILALSCMDTYDIEIMIHILAGSTLMVSLITISASYVSILSTILKINSTSGKQKALST
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250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CVSHLLGVTIFYGTMIFTYLKPRKSYSLGRDQVAPVFYTIVIPMLNPLIYSLRNREVKNA
:.:::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::.:::::
CCDS31 CASHLLGVTIFYGTMIFTYLKPRKSYSLGRDQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKEVKNA
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 LIRVMQRRQDSR
::::::::::::
CCDS31 LIRVMQRRQDSR
300 310
>>CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 (310 aa)
initn: 1099 init1: 788 opt: 1193 Z-score: 1001.0 bits: 193.4 E(32554): 1.9e-49
Smith-Waterman score: 1193; 58.1% identity (85.7% similar) in 308 aa overlap (2-308:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMGRRNDTNVADFILMGLSDSEEVQMALFMLFLLIYLITMLGNVGMLLIIRLDLQLHTPM
:. : :.:. ::: :... :.:..::..::.:::.:.:::.:.. .::.: ::::::
CCDS31 MAGNNFTEVTVFILSGFANHPELQVSLFLMFLFIYLFTVLGNLGLITLIRMDSQLHTPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE5 YFFLTHLSFIDLSYSTVVTPKTLANLLTSNY-ISFTGCFAQMFCFVFLGTAECYLLSSMA
::::..:.:::. ::..::::.:.:. .. :::.:::.::. :: : ::.::.:::
CCDS31 YFFLSNLAFIDIFYSSTVTPKALVNFQSNRRSISFVGCFVQMYFFVGLVCCECFLLGSMA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YDRYAAICSPLHYTVIMSKRLCLALITGPYVIGFMDSFVNVVSMSRLHFCDSNIIHHFFC
:.:: :::.:: :.:.::... : . :::::: .:...: .: : ::::.: .::::
CCDS31 YNRYIAICNPLLYSVVMSQKVSNWLGVMPYVIGFTSSLISVWVISSLAFCDSSI-NHFFC
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DTSPILALSCTDTDNTEMLIFIIAGSTLMVSLITISASYVSILSTILKINSTSGKQKAFS
::. .:::::.:: .:::. :..:: ::. ::. :...:. :.:.::.:.:..:.:::::
CCDS31 DTTALLALSCVDTFGTEMVSFVLAGFTLLSSLLIITVTYIIIISAILRIQSAAGRQKAFS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCVSHLLGVTIFYGTMIFTYLKPRKSYSLGRDQVAPVFYTIVIPMLNPLIYSLRNREVKN
::.:::..::::::..:::::.: .. :: . ::: :::::::::::::::::::..:::
CCDS31 TCASHLMAVTIFYGSLIFTYLQPDNTSSLTQAQVASVFYTIVIPMLNPLIYSLRNKDVKN
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 ALIRVMQRRQDSR
::.::..:.
CCDS31 ALLRVIHRKLFP
300 310
>>CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1169 init1: 803 opt: 1148 Z-score: 964.2 bits: 186.6 E(32554): 2.2e-47
Smith-Waterman score: 1148; 53.1% identity (83.0% similar) in 311 aa overlap (2-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMGRRNDTNVADFILMGLSDSEEVQMALFMLFLLIYLITMLGNVGMLLIIRLDLQLHTPM
: :.: :....:.:.::.:. :.:. ::..::.:: .:.:::.::.:.::.: ::::::
CCDS31 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE5 YFFLTHLSFIDLSYSTVVTPKTLANLLT-SNYISFTGCFAQMFCFVFLGTAECYLLSSMA
::::..:::.:. ::..::: ::.::. .. :::.::: ::. :. :.:.:: :.. ::
CCDS31 YFFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YDRYAAICSPLHYTVIMSKRLCLALITGPYVIGFMDSFVNVVSMSRLHFCDSNIIHHFFC
:::::::: :: :..:::. . : . .: .. :... .::. .: : :::::.::::::
CCDS31 YDRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFC
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DTSPILALSCTDTDNTEMLIFIIAGSTLMVSLITISASYVSILSTILKINSTSGKQKAFS
:. :.. :::.:: : . :.:: ... .:..: .:: .: .:....: :...:::
CCDS31 DSPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCVSHLLGVTIFYGTMIFTYLKPRKSYSLGRDQVAPVFYTIVIPMLNPLIYSLRNREVKN
::.::: .. .::.: :.:::.: .::::..:.:: ::::.:::::::::::::..:::.
CCDS31 TCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKK
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 ALIRVMQRRQDSR
:: :..:.. :
CCDS31 ALANVISRKRTSSFL
300 310
>>CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1000 init1: 596 opt: 1108 Z-score: 931.6 bits: 180.5 E(32554): 1.4e-45
Smith-Waterman score: 1108; 53.5% identity (82.8% similar) in 303 aa overlap (6-307:3-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMGRRNDTNVADFILMGLSDSEEVQMALFMLFLLIYLITMLGNVGMLLIIRLDLQLHTPM
:.:.:..:::.::.:. ..:. :.. ::.:::::.::: ::..::. : .:::::
CCDS31 MENSTEVTEFILLGLTDDPNLQIPLLLAFLFIYLITLLGNGGMMVIIHSDSHLHTPM
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70 80 90 100 110
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