Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5944
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5944, 312 aa
1>>>pF1KE5944 312 - 312 aa - 312 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.6145+/-0.000594; mu= 19.9526+/- 0.037
mean_var=115.9823+/-32.872, 0's: 0 Z-trim(105.0): 379 B-trim: 760 in 1/50
Lambda= 0.119091
statistics sampled from 12735 (13226) to 12735 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.467), E-opt: 0.2 (0.155), width: 16
Scan time: 5.770
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 998 183.6 4.5e-46
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 981 180.7 3.4e-45
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 903 167.3 3.7e-41
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 903 167.3 3.7e-41
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 903 167.3 3.8e-41
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 874 162.3 1.2e-39
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 872 161.9 1.5e-39
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 839 156.3 7.6e-38
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 839 156.3 7.6e-38
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 830 154.7 2.2e-37
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 830 154.7 2.2e-37
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 830 154.7 2.2e-37
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 817 152.5 1e-36
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 817 152.5 1.1e-36
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 811 151.4 2.1e-36
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 807 150.8 3.4e-36
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 777 145.6 1.2e-34
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 739 139.1 1.1e-32
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 738 138.9 1.3e-32
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 718 135.4 1.3e-31
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 528 102.8 9.3e-22
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 506 99.1 1.3e-20
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 196 45.8 0.00014
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 196 45.9 0.00015
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 196 46.0 0.00016
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 195 45.8 0.00018
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 189 44.6 0.00031
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 189 44.7 0.00034
NP_001035262 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 360) 186 44.2 0.00049
XP_016881270 (OMIM: 202200,607397) PREDICTED: adre ( 297) 185 43.9 0.00049
NP_001278840 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotr ( 297) 185 43.9 0.00049
NP_000520 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotropi ( 297) 185 43.9 0.00049
NP_955525 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine recep ( 378) 186 44.2 0.0005
NP_001035259 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 387) 186 44.2 0.00051
NP_000861 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine recep ( 388) 186 44.2 0.00051
NP_001273339 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 411) 186 44.2 0.00052
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 185 43.9 0.00052
NP_001035263 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 428) 186 44.3 0.00054
XP_016884926 (OMIM: 300086) PREDICTED: lysophospha ( 370) 185 44.0 0.00056
XP_006724702 (OMIM: 300086) PREDICTED: lysophospha ( 370) 185 44.0 0.00056
NP_005287 (OMIM: 300086) lysophosphatidic acid rec ( 370) 185 44.0 0.00056
XP_005262183 (OMIM: 300086) PREDICTED: lysophospha ( 370) 185 44.0 0.00056
XP_016884927 (OMIM: 300086) PREDICTED: lysophospha ( 370) 185 44.0 0.00056
NP_001264929 (OMIM: 300086) lysophosphatidic acid ( 370) 185 44.0 0.00056
NP_001154889 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cyst ( 339) 184 43.8 0.0006
NP_001154888 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cyst ( 339) 184 43.8 0.0006
NP_005282 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cystein ( 367) 184 43.8 0.00062
NP_001154887 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cyst ( 367) 184 43.8 0.00062
XP_016859322 (OMIM: 603071) PREDICTED: uracil nucl ( 367) 184 43.8 0.00062
NP_002502 (OMIM: 162341) neuromedin-B receptor iso ( 390) 184 43.9 0.00065
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 998; 50.8% identity (76.9% similar) in 299 aa overlap (5-302:7-305)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEQHNLTTVNEFILTGITDIAELQAPLFALFLMIYVISVMGNLGMIVLTKLDSRLQTP
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pF1KE5 SYDRYVAICNPLLYTVIMSRRVCQVLVAIPYLYCTFISLLVTIKIFTLSFCGYNVISHFY
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NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
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300 310
pF1KE5 YALRRTWNNLCNIFV
: ..
NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 981; 49.2% identity (79.1% similar) in 301 aa overlap (1-300:1-301)
10 20 30 40 50 60
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NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
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300 310
pF1KE5 LRRTWNNLCNIFV
:
NP_003 LANVISRKRTSSFL
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
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pF1KE5 MEQHNLTTVNEFILTGITDIAELQAPLFALFLMIYVISVMGNLGMIVLTKLDSRLQTPMY
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pF1KE5 FFLRHLAFMDLGYSTTVGPKMLVNFVVDKNIISYYFCATQLAFFLVFIGSELFILSAMSY
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pF1KE5 CGAHLTVVIVFYGTLLFMYVQPKSSHSFDTDKVASIFYTLVIPMLNPLIYSLRNKDVKYA
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pF1KE5 LRRTWNNLCNIFV
:..
NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
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Smith-Waterman score: 903; 45.2% identity (76.2% similar) in 303 aa overlap (1-302:1-303)
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pF1KE5 MEQHNLTTVNEFILTGITDIAELQAPLFALFLMIYVISVMGNLGMIVLTKLDSRLQTPMY
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XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KE5 FFLRHLAFMDLGYSTTVGPKMLVNFVVDKNIISYYFCATQLAFFLVFIGSELFILSAMSY
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XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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pF1KE5 DRYVAICNPLLYTVIMSRRVCQVLVAIPYLYCTFISLLVTIKIFTLSFCGYNVISHFYCD
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XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE5 LRRTWNNLCNIFV
:..
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 932 init1: 610 opt: 903 Z-score: 859.7 bits: 167.3 E(85289): 3.8e-41
Smith-Waterman score: 903; 45.2% identity (76.2% similar) in 303 aa overlap (1-302:11-313)
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pF1KE5 MEQHNLTTVNEFILTGITDIAELQAPLFALFLMIYVISVMGNLGMIVLTK
: : ..:.::.: :.. . : ::..:: .:. .:.::: .:. ..
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pF1KE5 LDSRLQTPMYFFLRHLAFMDLGYSTTVGPKMLVNFVVDKNIISYYFCATQLAFFLVFIGS
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pF1KE5 ELFILSAMSYDRYVAICNPLLYTVIMSRRVCQVLVAIPYLYCTFISLLVTIKIFTLSFCG
. :.:..:.::..::.:.:: ::. :....: .::: .. .. :: :. . ::::.
XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
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pF1KE5 YNVISHFYCDSLPLLPLLCSNTHEIELIILIFAAIDLISSLLIVLLSYLLILVAILRMNS
:.:.::.:: ::: : ::.:: :.::: .:. .:. .: .: ::. : ..:.. :
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pF1KE5 A-GRQKAFSTCGAHLTVVIVFYGTLLFMYVQPKSSHSFDTDKVASIFYTLVIPMLNPLIY
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pF1KE5 SLRNKDVKYALRRTWNNLCNIFV
::::. .: ::..
XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
310 320
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 702 init1: 570 opt: 874 Z-score: 833.0 bits: 162.3 E(85289): 1.2e-39
Smith-Waterman score: 874; 45.2% identity (76.2% similar) in 303 aa overlap (1-302:1-301)
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pF1KE5 MEQHNLTTVNEFILTGITDIAELQAPLFALFLMIYVISVMGNLGMIVLTKLDSRLQTPMY
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NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
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pF1KE5 FFLRHLAFMDLGYSTTVGPKMLVNFVVDKNIISYYFCATQLAFFLVFIGSELFILSAMSY
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NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICNPLLYTVIMSRRVCQVLVAIPYLYCTFISLLVTIKIFTLSFCGYNVISHFYCD
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NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE5 SLPLLPLLCSNTHEIELIILIFAAIDLISSLLIVLLSYLLILVAILRMNSA-GRQKAFST
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NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 CGAHLTVVIVFYGTLLFMYVQPKSSHSFDTDKVASIFYTLVIPMLNPLIYSLRNKDVKYA
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NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQ--QEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA
250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 LRRTWNNLCNIFV
::.
NP_003 LRKVATRNFP
300
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 863 init1: 594 opt: 872 Z-score: 831.1 bits: 161.9 E(85289): 1.5e-39
Smith-Waterman score: 872; 44.3% identity (73.8% similar) in 305 aa overlap (5-308:6-310)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEQHNLTTVNEFILTGITDIAELQAPLFALFLMIYVISVMGNLGMIVLTKLDSRLQTPM
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NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
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pF1KE5 YFFLRHLAFMDLGYSTTVGPKMLVNFVVDKNIISYYFCATQLAFFLVFIGSELFILSAMS
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NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
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pF1KE5 YDRYVAICNPLLYTVIMSRRVCQVLVAIPYLYCTFISLLVTIKIFTLSFCGYNVISHFYC
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NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
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pF1KE5 DSLPLLPLLCSNTHEIELIILIFAAIDLISSLLIVLLSYLLILVAILRMNSA-GRQKAFS
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NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
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pF1KE5 TCGAHLTVVIVFYGTLLFMYVQPKSSHSFDTDKVASIFYTLVIPMLNPLIYSLRNKDVKY
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NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD
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300 310
pF1KE5 ALRRTWNNLCNIFV
::.: . :
NP_001 ALKRLQKRKCC
310
>>NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 [Ho (312 aa)
initn: 812 init1: 560 opt: 839 Z-score: 800.4 bits: 156.3 E(85289): 7.6e-38
Smith-Waterman score: 839; 43.9% identity (74.9% similar) in 303 aa overlap (1-302:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MEQHNLTTVNEFILTGITDIAELQAPLFALFLMIYVISVMGNLGMIVLTKLDSRLQTPMY
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NP_001 MEAENLTELSKFLLLGLSDDPELQPVLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAVSSDSHLHTPMY
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pF1KE5 FFLRHLAFMDLGYSTTVGPKMLVNFVVDKNIISYYFCATQLAFFLVFIGSELFILSAMSY
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NP_001 FFLSNLSFVDICFISTTVPKMLVSIQARSKDISYMGCLTQVYFLMMFAGMDTFLLAVMAY
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pF1KE5 DRYVAICNPLLYTVIMSRRVCQVLVAIPYLYCTFISLLVTIKIFTLSFCGYNVISHFYCD
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NP_001 DRFVAICHPLHYTVIMNPCLCGLLVLASWFIIFWFSLVHILLMKRLTFSTGTEIPHFFCE
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pF1KE5 SLPLLPLLCSNTHEIELIILIFAAIDLISSLLIVLLSYLLILVAILRMNSA-GRQKAFST
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NP_001 PAQVLKVACSNTLLNNIVLYVATALLGVFPVAGILFSYSQIVSSLMGMSSTKGKYKAFST
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pF1KE5 CGAHLTVVIVFYGTLLFMYVQPKSSHSFDTDKVASIFYTLVIPMLNPLIYSLRNKDVKYA
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NP_001 CGSHLCVVSLFYGTGLGVYLSSAVTHSSQSSSTASVMYAMVTPMLNPFIYSLRNKDVKGA
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300 310
pF1KE5 LRRTWNNLCNIFV
:.:
NP_001 LERLLSRADSCP
310
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 808 init1: 563 opt: 839 Z-score: 800.4 bits: 156.3 E(85289): 7.6e-38
Smith-Waterman score: 839; 42.7% identity (73.8% similar) in 309 aa overlap (1-307:1-309)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MEQHNLTTVNEFILTGITDI-AELQAPLFALFLMIYVISVMGNLGMIVLTKLDSRLQTPM
: : : ..:::: ..... .:.:. :: :: ::.... :: .:..: : :..::
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pF1KE5 YFFLRHLAFMDLGYSTTVGPKMLVNFVVDKNIISYYFCATQLAFFLVFIGSELFILSAMS
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NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
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pF1KE5 YDRYVAICNPLLYTVIMSRRVCQVLVAIPYLYCTFISLLVTIKIFTLSFCGYNVISHFYC
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NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
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pF1KE5 DSLPLLPLLCSNTHEIELIILIFAAIDLISSLLIVLLSYLLILVAILRMNSA-GRQKAFS
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NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TCGAHLTVVIVFYGTLLFMYVQPKSSHSFDTDKVASIFYTLVIPMLNPLIYSLRNKDVKY
::..:: :: .:: . . : :::..: .. :. :. ::.: :::::.::::::..::
NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
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300 310
pF1KE5 ALRRTWNNLCNIFV
:: ::....
NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP
310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 806 init1: 544 opt: 830 Z-score: 792.0 bits: 154.7 E(85289): 2.2e-37
Smith-Waterman score: 830; 43.6% identity (73.0% similar) in 307 aa overlap (1-304:1-306)
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pF1KE5 MEQHNLTTVNEFILTGITDIAELQAPLFALFLMIYVISVMGNLGMIVLTKLDSRLQTPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFLRHLAFMDLGYSTTVGPKMLVNFVVDKNIISYYFCATQLAFFLVFIGSELFILSAMSY
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRYVAICNPLLYTVIMSRRVCQVLVAIPYLYCTFISLLVTIKI-FTLSFCGYNVISHFYC
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARL-AITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISC
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pF1KE5 DSLPLLPLLCSNTHEIELIILIFAAIDLISSLLIVLLSYLLILVAILRMNS-AGRQKAFS
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XP_011 ELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH
180 190 200 210 220 230
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300 310
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]