Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5942
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5942, 312 aa
1>>>pF1KE5942 312 - 312 aa - 312 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6493+/-0.00131; mu= 13.8004+/- 0.076
mean_var=142.0327+/-45.045, 0's: 0 Z-trim(102.2): 393 B-trim: 823 in 2/45
Lambda= 0.107617
statistics sampled from 6364 (6857) to 6364 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.553), E-opt: 0.2 (0.211), width: 16
Scan time: 1.810
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32899.1 OR7G3 gene_id:390883|Hs108|chr19 ( 312) 2012 324.9 5.1e-89
CCDS32897.1 OR7G2 gene_id:390882|Hs108|chr19 ( 345) 1421 233.1 2.3e-61
CCDS32898.2 OR7G1 gene_id:125962|Hs108|chr19 ( 311) 1366 224.6 8e-59
CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19 ( 312) 1354 222.7 2.9e-58
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 1337 220.0 1.8e-57
CCDS32900.1 OR7D2 gene_id:162998|Hs108|chr19 ( 312) 1335 219.7 2.3e-57
CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 ( 320) 1329 218.8 4.4e-57
CCDS12319.1 OR7A17 gene_id:26333|Hs108|chr19 ( 309) 1297 213.8 1.3e-55
CCDS12320.1 OR7C2 gene_id:26658|Hs108|chr19 ( 319) 1289 212.6 3.2e-55
CCDS12318.1 OR7A5 gene_id:26659|Hs108|chr19 ( 319) 1281 211.4 7.6e-55
CCDS45955.1 OR7E24 gene_id:26648|Hs108|chr19 ( 339) 1270 209.7 2.6e-54
CCDS11020.1 OR1G1 gene_id:8390|Hs108|chr17 ( 313) 1110 184.8 7.4e-47
CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 1103 183.8 1.6e-46
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 1096 182.6 3.3e-46
CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 ( 313) 1093 182.2 4.6e-46
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 1091 181.9 5.7e-46
CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 ( 311) 1060 177.0 1.6e-44
CCDS11019.1 OR1D2 gene_id:4991|Hs108|chr17 ( 312) 1059 176.9 1.8e-44
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 1048 175.2 5.8e-44
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 1039 173.8 1.5e-43
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 1029 172.2 4.5e-43
CCDS31545.1 OR1S2 gene_id:219958|Hs108|chr11 ( 325) 1024 171.5 7.9e-43
CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 ( 322) 1022 171.2 9.8e-43
CCDS32937.1 OR1I1 gene_id:126370|Hs108|chr19 ( 355) 1019 170.8 1.4e-42
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 1018 170.5 1.5e-42
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 1017 170.4 1.6e-42
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 997 167.3 1.4e-41
CCDS58499.1 OR1D5 gene_id:8386|Hs108|chr17 ( 312) 988 165.9 3.7e-41
CCDS11022.1 OR1A1 gene_id:8383|Hs108|chr17 ( 309) 971 163.2 2.3e-40
CCDS35124.1 OR1L8 gene_id:138881|Hs108|chr9 ( 309) 964 162.1 4.9e-40
CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 ( 324) 963 162.0 5.6e-40
CCDS35125.1 OR1Q1 gene_id:158131|Hs108|chr9 ( 314) 939 158.3 7.3e-39
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 917 154.8 7.7e-38
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 903 152.7 3.5e-37
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 901 152.4 4.4e-37
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 898 151.9 5.8e-37
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 898 151.9 6e-37
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 897 151.7 6.6e-37
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 896 151.6 7.6e-37
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 892 151.0 1.1e-36
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 891 150.8 1.3e-36
CCDS35132.1 OR1K1 gene_id:392392|Hs108|chr9 ( 316) 891 150.8 1.3e-36
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 891 150.9 1.4e-36
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 890 150.7 1.4e-36
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 889 150.5 1.6e-36
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 887 150.2 2e-36
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 886 150.0 2.2e-36
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 886 150.1 2.3e-36
CCDS11021.1 OR1A2 gene_id:26189|Hs108|chr17 ( 309) 884 149.7 2.7e-36
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 883 149.6 3.3e-36
>>CCDS32899.1 OR7G3 gene_id:390883|Hs108|chr19 (312 aa)
initn: 2012 init1: 2012 opt: 2012 Z-score: 1711.6 bits: 324.9 E(32554): 5.1e-89
Smith-Waterman score: 2012; 100.0% identity (100.0% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MKAGNFSDTPEFFLLGLSGDPELQPILFMLFLSMYLATMLGNLLIILAVNSDSHLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MKAGNFSDTPEFFLLGLSGDPELQPILFMLFLSMYLATMLGNLLIILAVNSDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLSILSLVDICFTSTTMPKMLVNIQAQAQSINYTGCLTQICFVLVFVGLENGILVMMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FLLSILSLVDICFTSTTMPKMLVNIQAQAQSINYTGCLTQICFVLVFVGLENGILVMMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRFVAICHPLRYNVIMNPKLCGLLLLLSFIVSVLDALLHTLMVLQLTFCIDLEIPHFFCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DRFVAICHPLRYNVIMNPKLCGLLLLLSFIVSVLDALLHTLMVLQLTFCIDLEIPHFFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LAHILKLACSDVLINNILVYLVTSLLGVVPLSGIIFSYTRIVSSVMKIPSAGGKYKAFSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LAHILKLACSDVLINNILVYLVTSLLGVVPLSGIIFSYTRIVSSVMKIPSAGGKYKAFSI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CGSHLIVVSLFYGTGFGVYLSSGATHSSRKGAIASVMYTVVTPMLNPLIYSLRNKDMLKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CGSHLIVVSLFYGTGFGVYLSSGATHSSRKGAIASVMYTVVTPMLNPLIYSLRNKDMLKA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LRKLISRIPSFH
::::::::::::
CCDS32 LRKLISRIPSFH
310
>>CCDS32897.1 OR7G2 gene_id:390882|Hs108|chr19 (345 aa)
initn: 1400 init1: 1400 opt: 1421 Z-score: 1215.2 bits: 233.1 E(32554): 2.3e-61
Smith-Waterman score: 1421; 68.2% identity (89.4% similar) in 311 aa overlap (1-311:22-332)
10 20 30
pF1KE5 MKAGNFSDTPEFFLLGLSGDPELQPILFMLFLSMYLATM
:.: : . .:.:::: ::::::.:: :::::::.:.
CCDS32 MPMQLLLTDFIIFSIRFIINSMEARNQTAISKFLLLGLIEDPELQPVLFSLFLSMYLVTI
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 LGNLLIILAVNSDSHLHTPMYFLLSILSLVDICFTSTTMPKMLVNIQAQAQSINYTGCLT
::::::.::: :::::::::::.:: ::..:::...::.:::::::::: .::.:.::::
CCDS32 LGNLLILLAVISDSHLHTPMYFFLSNLSFLDICLSTTTIPKMLVNIQAQNRSITYSGCLT
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 QICFVLVFVGLENGILVMMAYDRFVAICHPLRYNVIMNPKLCGLLLLLSFIVSVLDALLH
:::::: :.:::: .:. :::::.:::::::::.:::::.:::::.:::...::..:::
CCDS32 QICFVLFFAGLENCLLAAMAYDRYVAICHPLRYTVIMNPRLCGLLILLSLLTSVVNALLL
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 TLMVLQLTFCIDLEIPHFFCELAHILKLACSDVLINNILVYLVTSLLGVVPLSGIIFSYT
.::::.:.:: ::::: ::::::....:.:::.::::::.:... ..: :::::::.:::
CCDS32 SLMVLRLSFCTDLEIPLFFCELAQVIQLTCSDTLINNILIYFAACIFGGVPLSGIILSYT
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 RIVSSVMKIPSAGGKYKAFSICGSHLIVVSLFYGTGFGVYLSSGATHSSRKGAIASVMYT
.:.: :...:::.::.:: : ::::: .: ::::.:.:::.:: .: : :: :.:::::.
CCDS32 QITSCVLRMPSASGKHKAVSTCGSHLSIVLLFYGAGLGVYISSVVTDSPRKTAVASVMYS
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310
pF1KE5 VVTPMLNPLIYSLRNKDMLKALRKLISRIPSFH
: :.::.::::::::: .:::.:.::::.
CCDS32 VFPQMVNPFIYSLRNKDMKGTLRKFIGRIPSLLWCAICFGFRFLE
310 320 330 340
>>CCDS32898.2 OR7G1 gene_id:125962|Hs108|chr19 (311 aa)
initn: 1411 init1: 1360 opt: 1366 Z-score: 1169.5 bits: 224.6 E(32554): 8e-59
Smith-Waterman score: 1366; 66.6% identity (89.7% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MKAGNFSDTPEFFLLGLSGDPELQPILFMLFLSMYLATMLGNLLIILAVNSDSHLHTPMY
: : . . ::.:. .. ::::. : : :::::::.:.::::::.::: ::::::::::
CCDS32 MGPRNQTAVSEFLLMKVTEDPELKLIPFSLFLSMYLVTILGNLLILLAVISDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLSILSLVDICFTSTTMPKMLVNIQAQAQSINYTGCLTQICFVLVFVGLENGILVMMAY
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CCDS32 FLLFNLSFTDICLTTTTVPKILVNIQAQNQSITYTGCLTQICLVLVFAGLESCFLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRFVAICHPLRYNVIMNPKLCGLLLLLSFIVSVLDALLHTLMVLQLTFCIDLEIPHFFCE
::.:::::::::.:.:: .. :::.:::...:..:::...::::::.:: ..::: ::::
CCDS32 DRYVAICHPLRYTVLMNVHFWGLLILLSMFMSTMDALVQSLMVLQLSFCKNVEIPLFFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LAHILKLACSDVLINNILVYLVTSLLGVVPLSGIIFSYTRIVSSVMKIPSAGGKYKAFSI
.....::::::.::::::.:...:..:..:::::::::..::.::...::: :::::::
CCDS32 VVQVIKLACSDTLINNILIYFASSVFGAIPLSGIIFSYSQIVTSVLRMPSARGKYKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CGSHLIVVSLFYGTGFGVYLSSGATHSSRKGAIASVMYTVVTPMLNPLIYSLRNKDMLKA
:: :: : ::::::.::::.::....::: :.:::::::: :.::.:::::::.: ::
CCDS32 CGCHLSVFSLFYGTAFGVYISSAVAESSRITAVASVMYTVVPQMMNPFIYSLRNKEMKKA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LRKLISRIPSFH
:::::.:. :
CCDS32 LRKLIGRLFPF
310
>>CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19 (312 aa)
initn: 1324 init1: 1324 opt: 1354 Z-score: 1159.5 bits: 222.7 E(32554): 2.9e-58
Smith-Waterman score: 1354; 65.2% identity (89.0% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MKAGNFSDTPEFFLLGLSGDPELQPILFMLFLSMYLATMLGNLLIILAVNSDSHLHTPMY
:.: :... .:.::::: ::::::.:: :::::::.:.::::::::::.::::::::::
CCDS32 MEAENLTELSKFLLLGLSDDPELQPVLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAVSSDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLSILSLVDICFTSTTMPKMLVNIQAQAQSINYTGCLTQICFVLVFVGLENGILVMMAY
:.:: ::.::::: :::.:::::.:::....:.: :::::. :...:.:... .:..:::
CCDS32 FFLSNLSFVDICFISTTVPKMLVSIQARSKDISYMGCLTQVYFLMMFAGMDTFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRFVAICHPLRYNVIMNPKLCGLLLLLSFIVSVLDALLHTLMVLQLTFCIDLEIPHFFCE
::::::::::.:.::::: :::::.: :... .:.: :.. .::: ::::::::
CCDS32 DRFVAICHPLHYTVIMNPCLCGLLVLASWFIIFWFSLVHILLMKRLTFSTGTEIPHFFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LAHILKLACSDVLINNILVYLVTSLLGVVPLSGIIFSYTRIVSSVMKIPSAGGKYKAFSI
:..::.:::..:.:::..:..:.:::: :..::.:::..::::.: . :. :::::::
CCDS32 PAQVLKVACSNTLLNNIVLYVATALLGVFPVAGILFSYSQIVSSLMGMSSTKGKYKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CGSHLIVVSLFYGTGFGVYLSSGATHSSRKGAIASVMYTVVTPMLNPLIYSLRNKDMLKA
::::: :::::::::.::::::..::::.... :::::..:::::::.::::::::. :
CCDS32 CGSHLCVVSLFYGTGLGVYLSSAVTHSSQSSSTASVMYAMVTPMLNPFIYSLRNKDVKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LRKLISRIPSFH
:..:.:: :
CCDS32 LERLLSRADSCP
310
>>CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 (309 aa)
initn: 1331 init1: 1331 opt: 1337 Z-score: 1145.2 bits: 220.0 E(32554): 1.8e-57
Smith-Waterman score: 1337; 66.6% identity (88.4% similar) in 302 aa overlap (1-302:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MKAGNFSDTPEFFLLGLSGDPELQPILFMLFLSMYLATMLGNLLIILAVNSDSHLHTPMY
::. : . ::.:::.: .:::: .:: :::::::.:.:::::::::. ::::::::::
CCDS32 MKSWNNTIILEFLLLGISEEPELQAFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLSILSLVDICFTSTTMPKMLVNIQAQAQSINYTGCLTQICFVLVFVGLENGILVMMAY
:.:: ::.:::::.:::.::::::::.. . :.:.::.::.:: :.::::.: .:..:::
CCDS32 FFLSNLSFVDICFVSTTVPKMLVNIQTHNKVITYAGCITQMCFFLLFVGLDNFLLTVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRFVAICHPLRYNVIMNPKLCGLLLLLSFIVSVLDALLHTLMVLQLTFCIDLEIPHFFCE
::::::::::.: :::::.:::::.: :.:.:::...:..:::: : :: .::::::::
CCDS32 DRFVAICHPLHYMVIMNPQLCGLLVLASWIMSVLNSMLQSLMVLPLPFCTHMEIPHFFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LAHILKLACSDVLINNILVYLVTSLLGVVPLSGIIFSYTRIVSSVMKIPSAGGKYKAFSI
. ....:::::...:.:..:....::: ::.::..::..::::. : :: :::::::
CCDS32 INQVVHLACSDTFLNDIVMYFAVALLGGGPLTGILYSYSKIVSSIRAISSAQGKYKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CGSHLIVVSLFYGTGFGVYLSSGATHSSRKGAIASVMYTVVTPMLNPLIYSLRNKDMLKA
:.::: :::::::: .::::::.:::.:. :: ::::::::::::::.::::::: . :
CCDS32 CASHLSVVSLFYGTCLGVYLSSAATHNSHTGAAASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKHIKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LRKLISRIPSFH
..
CCDS32 MKTFFRGKQ
>>CCDS32900.1 OR7D2 gene_id:162998|Hs108|chr19 (312 aa)
initn: 1389 init1: 1327 opt: 1335 Z-score: 1143.5 bits: 219.7 E(32554): 2.3e-57
Smith-Waterman score: 1335; 63.2% identity (87.4% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MKAGNFSDTPEFFLLGLSGDPELQPILFMLFLSMYLATMLGNLLIILAVNSDSHLHTPMY
:.::: . ::.::::: ::::::..: :::::::.:.:::::::::..::::::::::
CCDS32 MEAGNQTGFLEFILLGLSEDPELQPFIFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAISSDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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310
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]