FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5940, 312 aa
1>>>pF1KE5940 312 - 312 aa - 312 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5573+/-0.00122; mu= 13.8486+/- 0.072
mean_var=150.5646+/-54.901, 0's: 0 Z-trim(102.1): 390 B-trim: 785 in 2/47
Lambda= 0.104523
statistics sampled from 6303 (6811) to 6303 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.547), E-opt: 0.2 (0.209), width: 16
Scan time: 1.980
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 ( 312) 2037 319.9 1.6e-87
CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 ( 312) 1478 235.6 3.7e-62
CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 ( 310) 1310 210.3 1.6e-54
CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 ( 314) 1185 191.5 7.4e-49
CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 ( 321) 1185 191.5 7.5e-49
CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 ( 315) 1146 185.6 4.4e-47
CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 ( 326) 1060 172.6 3.6e-43
CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 ( 320) 1024 167.2 1.5e-41
CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 ( 312) 1021 166.7 2.1e-41
CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 ( 314) 1020 166.6 2.3e-41
CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 ( 342) 1016 166.0 3.7e-41
CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 ( 314) 1008 164.8 8e-41
CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 ( 313) 1002 163.9 1.5e-40
CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 ( 314) 989 161.9 5.8e-40
CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 ( 317) 987 161.6 7.2e-40
CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 ( 312) 981 160.7 1.3e-39
CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 974 159.6 2.8e-39
CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 ( 318) 955 156.8 2.1e-38
CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 ( 329) 942 154.8 8.2e-38
CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 ( 317) 934 153.6 1.8e-37
CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 ( 324) 933 153.5 2.1e-37
CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 ( 325) 930 153.0 2.8e-37
CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 930 153.1 3e-37
CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 ( 323) 917 151.1 1.1e-36
CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 ( 311) 906 149.4 3.4e-36
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CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 ( 312) 886 146.4 2.8e-35
CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 ( 318) 879 145.3 5.8e-35
CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 ( 321) 874 144.6 9.8e-35
CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 862 142.8 3.4e-34
CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 860 142.5 4.4e-34
CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 ( 320) 849 140.8 1.3e-33
CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 ( 324) 836 138.8 5.3e-33
CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 ( 312) 824 137.0 1.8e-32
CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 795 132.7 3.8e-31
CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 793 132.3 4.6e-31
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 791 132.1 5.8e-31
CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 710 119.8 2.8e-27
CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 703 118.9 6.1e-27
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 701 118.5 6.9e-27
CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 692 117.1 1.8e-26
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 690 116.8 2.2e-26
CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 ( 350) 671 114.0 1.7e-25
CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 ( 324) 663 112.8 3.7e-25
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 639 109.1 4.5e-24
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 627 107.3 1.6e-23
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 619 106.1 3.6e-23
CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 ( 322) 614 105.4 6.3e-23
>>CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 2037 init1: 2037 opt: 2037 Z-score: 1685.0 bits: 319.9 E(32554): 1.6e-87
Smith-Waterman score: 2037; 99.4% identity (99.4% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSSSGSSHPFLLTGFPGLEEAHHWISVFFLFMYISILFGNGTLLLLIKEDHNLHEPMYFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MSSSGSSHPFLLTGFPGLEEAHHWISVFFLFMYISILFGNGTLLLLIKEDHNLHEPMYFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LAMLAATDLGLALTTMPTVLGVLWLDHREIGSAACFSQAYFTHSLSFLESGILLAMAYDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::
CCDS31 LAMLAATDLGLALTTMPTVLGVLWLDHREIGSAACFSQAYFIHSLSFLESGILLAMAYDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 FIAICNPLRYTSVLTNTRVVKIGLGVLMRGFVSVVPPIRLLYFFLYCHSHVLSHAFCLHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
CCDS31 FIAICNPLRYTSVLTNTRVVKIGLGVLMRGFVSVVPPIRPLYFFLYCHSHVLSHAFCLHQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 DVIKLACADTTFNRLYPAVLVVFIFVLDYLIIFISYVLILKTVLSIASREERAKALITCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DVIKLACADTTFNRLYPAVLVVFIFVLDYLIIFISYVLILKTVLSIASREERAKALITCV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SHICCVLVFYVTVIGLSLIHRFGKQVPHIVHLIMSYAYFLFPPLMNPITYSVKTKQIQNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SHICCVLVFYVTVIGLSLIHRFGKQVPHIVHLIMSYAYFLFPPLMNPITYSVKTKQIQNA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 ILHLFTTHRIGT
::::::::::::
CCDS31 ILHLFTTHRIGT
310
>>CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1465 init1: 1465 opt: 1478 Z-score: 1229.4 bits: 235.6 E(32554): 3.7e-62
Smith-Waterman score: 1478; 70.6% identity (89.5% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSSSGSSHPFLLTGFPGLEEAHHWISVFFLFMYISILFGNGTLLLLIKEDHNLHEPMYFF
:. . :. : ::::::.:.::::: . .: :::::.::::::.::..:::::::::.:
CCDS31 MGLNKSASTFQLTGFPGMEKAHHWIFIPLLAAYISILLGNGTLLFLIRNDHNLHEPMYYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LAMLAATDLGLALTTMPTVLGVLWLDHREIGSAACFSQAYFTHSLSFLESGILLAMAYDR
::::::::::..::::::::::::::::::: .:::::::: :.:: .:::.:::::::
CCDS31 LAMLAATDLGVTLTTMPTVLGVLWLDHREIGHGACFSQAYFIHTLSVMESGVLLAMAYDC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 FIAICNPLRYTSVLTNTRVVKIGLGVLMRGFVSVVPPIRLLYFFLYCHSHVLSHAFCLHQ
::.: .::::::.::::.:.:::. :: :. .:..: . :..: ::.::::::::::::
CCDS31 FITIRSPLRYTSILTNTQVMKIGVRVLTRAGLSIMPIVVRLHWFPYCRSHVLSHAFCLHQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 DVIKLACADTTFNRLYPAVLVVFIFVLDYLIIFISYVLILKTVLSIASREERAKALITCV
::::::::: :::::::.:.. . .::.::::.::.::::::..:.: :::::: :::
CCDS31 DVIKLACADITFNRLYPVVVLFAMVLLDFLIIFFSYILILKTVMGIGSGGERAKALNTCV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SHICCVLVFYVTVIGLSLIHRFGKQVPHIVHLIMSYAYFLFPPLMNPITYSVKTKQIQNA
:::::.:::::::. :..::::::.:::.::. ::: .:::::.:::. ::.::::::..
CCDS31 SHICCILVFYVTVVCLTFIHRFGKHVPHVVHITMSYIHFLFPPFMNPFIYSIKTKQIQSG
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 ILHLFTTHRIGT
::.::.
CCDS31 ILRLFSLPHSRA
310
>>CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 (310 aa)
initn: 1304 init1: 889 opt: 1310 Z-score: 1092.5 bits: 210.3 E(32554): 1.6e-54
Smith-Waterman score: 1310; 64.4% identity (86.9% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSSSGSSHPFLLTGFPGLEEAHHWISVFFLFMYISILFGNGTLLLLIKEDHNLHEPMYFF
: ..:. ::::::: : : .:. ::. :. .:.:.::::::::.:: .::.::::::.:
CCDS77 MWYNNSAGPFLLTGFLGSEAVHYRISMSFFVIYFSVLFGNGTLLVLIWNDHSLHEPMYYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LAMLAATDLGLALTTMPTVLGVLWLDHREIGSAACFSQAYFTHSLSFLESGILLAMAYDR
::::: ::::...:::::::::: ::.:::. ::::.:. : :::...::::::..:::
CCDS77 LAMLADTDLGMTFTTMPTVLGVLLLDQREIAHAACFTQS-FIHSLAIVESGILLVLAYDC
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 FIAICNPLRYTSVLTNTRVVKIGLGVLMRGFVSVVPPIRLLYFFLYCHSHVLSHAFCLHQ
:::: .::::. .:::.::..::::::::::.:..: : :: . :: :..: :.:::::
CCDS77 FIAIRTPLRYNCILTNSRVMNIGLGVLMRGFMSILPIILSLYCYPYCGSRALLHTFCLHQ
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 DVIKLACADTTFNRLYPAVLVVFIFVLDYLIIFISYVLILKTVLSIASREERAKALITCV
::::::::: :::..:: . . . :: :::..::.::::::..::: .:.::.: :::
CCDS77 DVIKLACADITFNHIYPIIQTSLTVFLDALIIIFSYILILKTVMGIASGQEEAKSLNTCV
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SHICCVLVFYVTVIGLSLIHRFGKQVPHIVHLIMSYAYFLFPPLMNPITYSVKTKQIQNA
::: :::::..::.:::.::::::..::.: . :::..:::::..::: ::.:::::: .
CCDS77 SHISCVLVFHITVMGLSFIHRFGKHAPHVVPITMSYVHFLFPPFVNPIIYSIKTKQIQRS
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE5 ILHLFTTHRIGT
:..::.
CCDS77 IIRLFSGQSRA
300 310
>>CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1211 init1: 1185 opt: 1185 Z-score: 990.6 bits: 191.5 E(32554): 7.4e-49
Smith-Waterman score: 1185; 57.6% identity (80.6% similar) in 304 aa overlap (2-305:9-312)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSSSGSSHPFLLTGFPGLEEAHHWISVFFLFMYISILFGNGTLLLLIKEDHNL
:::. : :::.:.::::. : :::. . :::. . :: :.:..:: ...:
CCDS31 MTLGSLGNSSSSVSATFLLSGIPGLERMHIWISIPLCFMYLVSIPGNCTILFIIKTERSL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 HEPMYFFLAMLAATDLGLALTTMPTVLGVLWLDHREIGSAACFSQAYFTHSLSFLESGIL
:::::.::.::: ::::.: :.:::::..:. :::. :::.: .: : .:::::..:
CCDS31 HEPMYLFLSMLALIDLGLSLCTLPTVLGIFWVGAREISHDACFAQLFFIHCFSFLESSVL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LAMAYDRFIAICNPLRYTSVLTNTRVVKIGLGVLMRGFVSVVPPIRLLYFFLYCHSHVLS
:.::.:::.:::.::.:.:.:::: . .::: : :. . . : .: : :: : :::
CCDS31 LSMAFDRFVAICHPLHYVSILTNTVIGRIGLVSLGRSVALIFPLPFMLKRFPYCGSPVLS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 HAFCLHQDVIKLACADTTFNRLYPAVLVVFIFVLDYLIIFISYVLILKTVLSIASREERA
:..::::.:.:::::: : .: ..: .: :.:..::.:::.:::::::: ::
CCDS31 HSYCLHQEVMKLACADMKANSIYGMFVIVSTVGIDSLLILFSYALILRTVLSIASRAERF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 KALITCVSHICCVLVFYVTVIGLSLIHRFGKQVPHIVHLIMSYAYFLFPPLMNPITYSVK
::: ::::::: ::.::. .::::.:::::::.::.:...:.. :.::::.::::.::::
CCDS31 KALNTCVSHICAVLLFYTPMIGLSVIHRFGKQAPHLVQVVMGFMYLLFPPVMNPIVYSVK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE5 TKQIQNAILHLFTTHRIGT
::::.. . : :
CCDS31 TKQIRDRVTHAFCY
310
>>CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 (321 aa)
initn: 1200 init1: 1177 opt: 1185 Z-score: 990.5 bits: 191.5 E(32554): 7.5e-49
Smith-Waterman score: 1185; 53.1% identity (82.4% similar) in 307 aa overlap (3-309:14-320)
10 20 30 40
pF1KE5 MSSSGSSHPFLLTGFPGLEEAHHWISVFFLFMYISILFGNGTLLLLIKE
:.... :::::: :.:. . :.:. : .: .:.:: .: .:
CCDS31 MFLSSRMITSVSPSTSTNSSFLLTGFSGMEQQYPWLSIPFSSIYAMVLLGNCMVLHVIWT
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 DHNLHEPMYFFLAMLAATDLGLALTTMPTVLGVLWLDHREIGSAACFSQAYFTHSLSFLE
. .::.::..::.::: ::: ..:.:. ::::.:: :::. .:..:.:: :.:::.:
CCDS31 EPSLHQPMFYFLSMLALTDLCMGLSTVYTVLGILWGIIREISLDSCIAQSYFIHGLSFME
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 SGILLAMAYDRFIAICNPLRYTSVLTNTRVVKIGLGVLMRGFVSVVPPIRLLYFFLYCHS
:..::.::.::.:::::::::.:.:::.:..:::: .. :.: ..::: : :: :::
CCDS31 SSVLLTMAFDRYIAICNPLRYSSILTNSRIIKIGLTIIGRSFFFITPPIICLKFFNYCHF
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 HVLSHAFCLHQDVIKLACADTTFNRLYPAVLVVFIFVLDYLIIFISYVLILKTVLSIASR
:.:::.::::::...:::.: :: : .::. :..:: ..:..::.::::.::..::.
CCDS31 HILSHSFCLHQDLLRLACSDIRFNSYYALMLVICILLLDAILILFSYILILKSVLAVASQ
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 EERAKALITCVSHICCVLVFYVTVIGLSLIHRFGKQVPHIVHLIMSYAYFLFPPLMNPIT
::: : . ::.:::: :::::. .:.:...:::::.. ..:.... :.:::::::::
CCDS31 EERHKLFQTCISHICAVLVFYIPIISLTMVHRFGKHLSPVAHVLIGNIYILFPPLMNPII
250 260 270 280 290 300
290 300 310
pF1KE5 YSVKTKQIQNAILHLFTTHRIGT
:::::.::.. .:.::. .:
CCDS31 YSVKTQQIHTRMLRLFSLKRY
310 320
>>CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 1129 init1: 1129 opt: 1146 Z-score: 958.8 bits: 185.6 E(32554): 4.4e-47
Smith-Waterman score: 1146; 52.4% identity (82.8% similar) in 309 aa overlap (2-309:5-313)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSSSGSSHP-FLLTGFPGLEEAHHWISVFFLFMYISILFGNGTLLLLIKEDHNLHEP
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CCDS31 MGDWNNSDAVEPIFILRGFPGLEYVHSWLSILFCLAYLVAFMGNVTILSVIWIESSLHQP
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pF1KE5 MYFFLAMLAATDLGLALTTMPTVLGVLWLDHREIGSAACFSQAYFTHSLSFLESGILLAM
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CCDS31 MYYFISILAVNDLGMSLSTLPTMLAVLWLDAPEIQASACYAQLFFIHTFTFLESSVLLAM
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pF1KE5 AYDRFIAICNPLRYTSVLTNTRVVKIGLGVLMRGFVSVVPPIRLLYFFLYCHSHVLSHAF
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CCDS31 AFDRFVAICHPLHYPTILTNSVIGKIGLACLLRSLGVVLPTPLLLRHYHYCHGNALSHAF
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180 190 200 210 220 230
pF1KE5 CLHQDVIKLACADTTFNRLYPAVLVVFIFVLDYLIIFISYVLILKTVLSIASREERAKAL
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CCDS31 CLHQDVLRLSCTDARTNSIYGLCVVIATLGVDSIFILLSYVLILNTVLDIASREEQLKAL
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CCDS31 NTCVSHICVVLIFFVPVIGVSMVHRFGKHLSPIVHILMADIYLLLPPVLNPIVYSVRTKQ
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300 310
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CCDS31 IRLGILHKFVLRRRF
310
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10 20 30 40
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CCDS53 MSVQYSLSPQFMLLSNITQFSPIFYLTSFPGLEGIKHWIFIPFFFMYMVAISGNCFILII
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CCDS53 IKTNPRLHTPMYYLLSLLALTDLGLCVSTLPTTMGIFWFNSHSIYFGACQIQMFCIHSFS
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CCDS53 FMESSVLLMMSFDRLVAICHPLRYSVIITGQQVVRAGLIVIFRGPVATIPIVLLLKAFPY
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CCDS53 CGSVVLSHSFCLHQEVIQLACTDITFNNLYGLMVVVFTVMLDLVLIALSYGLILHTVAGL
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CCDS53 ASQEEQRRAFQTCTAPLCAVLVFFVPMMGLSLVHRFGKHAPPAIHLLMANVYLFVPPMLN
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290 300 310
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CCDS53 PIIYSIKTKEIHRAIIKFLGLKKASK
310 320
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CCDS77 FLCMLAAIDLALSTSTMPKILALFWFDSREISFEACLTQMFFIHALSAIESTILLAMAFD
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CCDS77 RYVAICHPLRHAAVLNNTVTAQIGIVAVVRGSLFFFPLPLLIKRLAFCHSNVLSHSYCVH
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CCDS77 QDVMKLAYADTLPNVVYGLTAILLVMGVDVMFISLSYFLIIRTVLQLPSKSERAKAFGTC
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CCDS77 VSHIGVVLAFYVPLIGLSVVHRFGNSLHPIVRVVMGDIYLLLPPVINPIIYGAKTKQIRT
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pF1KE5 AILHLFTTHRIGT
.: .:
CCDS77 RVLAMFKISCDKDLQAVGGK
310 320
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CCDS31 YFLSMLSFSDVAISMATLPTVLRTFCLNARNITFDACLIQMFLIHFFSMMESGILLAMSF
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CCDS31 DRYVAICDPLRYATVLTTEVIAAMGLGAAARSFITLFPLPFLIKRLPICRSNVLSHSYCL
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CCDS31 HPDMMRLACADISINSIYGLFVLVSTFGMDLFFIFLSYVLILRSVMATASREERLKALNT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]