Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5939
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5939, 311 aa
1>>>pF1KE5939 311 - 311 aa - 311 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0108+/-0.000535; mu= 17.8286+/- 0.033
mean_var=107.1844+/-32.602, 0's: 0 Z-trim(106.7): 346 B-trim: 1842 in 2/47
Lambda= 0.123882
statistics sampled from 14278 (14810) to 14278 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.503), E-opt: 0.2 (0.174), width: 16
Scan time: 5.340
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 1236 232.5 8.5e-61
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 978 186.4 6.5e-47
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 978 186.4 6.5e-47
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 978 186.4 6.6e-47
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 953 181.9 1.4e-45
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 816 157.4 3.4e-38
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 816 157.4 3.4e-38
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 816 157.4 3.4e-38
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 814 157.1 4.3e-38
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 812 156.7 5.5e-38
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 794 153.5 5.1e-37
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 793 153.3 5.7e-37
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 780 151.0 2.9e-36
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 778 150.6 3.7e-36
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 774 149.9 6.1e-36
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 765 148.3 1.8e-35
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 750 145.6 1.2e-34
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 734 142.8 8.7e-34
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 659 129.4 9.3e-30
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 654 128.5 1.8e-29
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 529 106.2 9.4e-23
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 519 104.4 3.2e-22
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 229 52.5 1.3e-06
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 215 50.0 7.4e-06
NP_005949 (OMIM: 600665) melatonin receptor type 1 ( 350) 215 50.1 7.8e-06
NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 207 48.6 2e-05
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 207 48.6 2.1e-05
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 204 48.1 2.9e-05
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 202 47.8 3.9e-05
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 201 47.5 4.1e-05
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 199 47.3 5.9e-05
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 199 47.3 6.2e-05
XP_016867841 (OMIM: 605188) PREDICTED: probable G- ( 370) 195 46.5 9.6e-05
NP_001139738 (OMIM: 605188) probable G-protein cou ( 370) 195 46.5 9.6e-05
XP_005250508 (OMIM: 605188) PREDICTED: probable G- ( 370) 195 46.5 9.6e-05
NP_001139737 (OMIM: 605188) probable G-protein cou ( 370) 195 46.5 9.6e-05
NP_001139739 (OMIM: 605188) probable G-protein cou ( 370) 195 46.5 9.6e-05
NP_061843 (OMIM: 605188) probable G-protein couple ( 370) 195 46.5 9.6e-05
NP_000015 (OMIM: 109690,600807,601665) beta-2 adre ( 413) 195 46.6 0.0001
NP_778237 (OMIM: 608923) trace amine-associated re ( 345) 192 46.0 0.00013
NP_057624 (OMIM: 605569) probable G-protein couple ( 423) 192 46.1 0.00015
XP_011515565 (OMIM: 188545) PREDICTED: thyrotropin ( 398) 191 45.9 0.00016
NP_003292 (OMIM: 188545) thyrotropin-releasing hor ( 398) 191 45.9 0.00016
NP_778227 (OMIM: 608282) trace amine-associated re ( 348) 190 45.6 0.00017
NP_000904 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 190 45.6 0.00018
NP_001186948 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 370) 190 45.6 0.00018
XP_016883343 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 370) 190 45.6 0.00018
NP_872588 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 190 45.6 0.00018
XP_016883341 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 190 45.7 0.00018
XP_011527130 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 190 45.7 0.00018
>>NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 [Ho (312 aa)
initn: 1242 init1: 1217 opt: 1236 Z-score: 1212.5 bits: 232.5 E(85289): 8.5e-61
Smith-Waterman score: 1236; 59.9% identity (87.6% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGPRNQTAVSEFLLMKVTEDPELKLIPFSLFLSMYLVTILGNLLILLAVISDSHLHTPMY
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NP_001 MEAENLTELSKFLLLGLSDDPELQPVLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAVSSDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 FLLFNLSFTDICLTTTTVPKILVNIQAQNQSITYTGCLTQICLVLVFAGLESCFLAVMAY
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NP_001 FFLSNLSFVDICFISTTVPKMLVSIQARSKDISYMGCLTQVYFLMMFAGMDTFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRYVAICHPLRYTVLMNVHFWGLLILLSMFMSTMDALVQSLMVLQLSFCKNVEIPLFFCE
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NP_001 DRFVAICHPLHYTVIMNPCLCGLLVLASWFIIFWFSLVHILLMKRLTFSTGTEIPHFFCE
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190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VVQVIKLACSDTLINNILIYFASSVFGAIPLSGIIFSYSQIVTSVLRMPSARGKYKAFST
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NP_001 PAQVLKVACSNTLLNNIVLYVATALLGVFPVAGILFSYSQIVSSLMGMSSTKGKYKAFST
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250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CGCHLSVFSLFYGTAFGVYISSAVAESSRITAVASVMYTVVPQMMNPFIYSLRNKEMKKA
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NP_001 CGSHLCVVSLFYGTGLGVYLSSAVTHSSQSSSTASVMYAMVTPMLNPFIYSLRNKDVKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LRKLIGRLFPF
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NP_001 LERLLSRADSCP
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 1013 init1: 974 opt: 978 Z-score: 963.3 bits: 186.4 E(85289): 6.5e-47
Smith-Waterman score: 978; 47.1% identity (80.2% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGPRNQTAVSEFLLMKVTEDPELKLIPFSLFLSMYLVTILGNLLILLAVISDSHLHTPMY
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KE5 FLLFNLSFTDICLTTTTVPKILVNIQAQNQSITYTGCLTQICLVLVFAGLESCFLAVMAY
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pF1KE5 DRYVAICHPLRYTVLMNVHFWGLLILLSMFMSTMDALVQSLMVLQLSFCKNVEIPLFFCE
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NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VVQVIKLACSDTLINNILIYFASSVFGAIPLSGIIFSYSQIVTSVLRMPSARGKYKAFST
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NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CGCHLSVFSLFYGTAFGVYISSAVAESSRITAVASVMYTVVPQMMNPFIYSLRNKEMKKA
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NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LRKLIGRLFPF
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NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 1013 init1: 974 opt: 978 Z-score: 963.3 bits: 186.4 E(85289): 6.5e-47
Smith-Waterman score: 978; 47.1% identity (80.2% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGPRNQTAVSEFLLMKVTEDPELKLIPFSLFLSMYLVTILGNLLILLAVISDSHLHTPMY
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XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KE5 FLLFNLSFTDICLTTTTVPKILVNIQAQNQSITYTGCLTQICLVLVFAGLESCFLAVMAY
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pF1KE5 DRYVAICHPLRYTVLMNVHFWGLLILLSMFMSTMDALVQSLMVLQLSFCKNVEIPLFFCE
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XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KE5 VVQVIKLACSDTLINNILIYFASSVFGAIPLSGIIFSYSQIVTSVLRMPSARGKYKAFST
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XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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pF1KE5 CGCHLSVFSLFYGTAFGVYISSAVAESSRITAVASVMYTVVPQMMNPFIYSLRNKEMKKA
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XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LRKLIGRLFPF
:.:..::.
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 1013 init1: 974 opt: 978 Z-score: 963.1 bits: 186.4 E(85289): 6.6e-47
Smith-Waterman score: 978; 47.1% identity (80.2% similar) in 308 aa overlap (1-308:11-318)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGPRNQTAVSEFLLMKVTEDPELKLIPFSLFLSMYLVTILGNLLILLAVI
:. ::..::::::. ....:. . . : .::::::.:.::::::.:.:
XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
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pF1KE5 SDSHLHTPMYFLLFNLSFTDICLTTTTVPKILVNIQAQNQSITYTGCLTQICLVLVFAGL
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XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
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pF1KE5 ESCFLAVMAYDRYVAICHPLRYTVLMNVHFWGLLILLSMFMSTMDALVQSLMVLQLSFCK
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XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
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pF1KE5 NVEIPLFFCEVVQVIKLACSDTLINNILIYFASSVFGAIPLSGIIFSYSQIVTSVLRMPS
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XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
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pF1KE5 ARGKYKAFSTCGCHLSVFSLFYGTAFGVYISSAVAESSRITAVASVMYTVVPQMMNPFIY
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XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
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300 310
pF1KE5 SLRNKEMKKALRKLIGRLFPF
::::. .: ::.:..::.
XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
310 320
>>NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [Homo (312 aa)
initn: 951 init1: 812 opt: 953 Z-score: 939.1 bits: 181.9 E(85289): 1.4e-45
Smith-Waterman score: 953; 48.7% identity (78.7% similar) in 310 aa overlap (1-309:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGPRNQTAVSEFLLMKVTEDPELKLIPFSLFLSMYLVTILGNLLILLAVISDSHLHTPMY
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NP_002 MDGGNQSEGSEFLLLGMSESPEQQRILFWMFLSMYLVTVVGNVLIILAISSDSRLHTPVY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLFNLSFTDICLTTTTVPKILVNIQAQNQSITYTGCLTQICLVLVFAGLESCFLAVMAY
:.: ::::::. ..:.:.::.:::.:..:..:.:.:::::. ... ...:.. .::::::
NP_002 FFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNLQSHNKAISYAGCLTQLYFLVSLVALDNLILAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRYVAICHPLRYTVLMNVHFWGLLILLSMFMSTMDALVQSLMVLQLSFCKNVEIPLFFCE
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NP_002 DRYVAICCPLHYTTAMSPKLCILLLSLCWVLSVLYGLIHTLLMTRVTFCGSRKIHYIFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE5 VVQVIKLACSDTLINN-ILIYFASSVFGAIPLSGIIFSYSQIVTSVLRMPSARGKYKAFS
. ....:::. ::. .:: . .: ::.. .:.:: :. ..::.::. ::::::
NP_002 MYVLLRMACSNIQINHTVLIATGCFIF-LIPFGFVIISYVLIIRAILRIPSVSKKYKAFS
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::. ::.. :::::: ::.. . : . .::.:::.:: ::::::::::::.:.
NP_002 TCASHLGAVSLFYGTLCMVYLKPLHTYSVK-DSVATVMYAVVTPMMNPFIYSLRNKDMHG
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pF1KE5 ALRKLIGRLFPF
:: .:. . :
NP_002 ALGRLLDKHFKRLT
300 310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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Smith-Waterman score: 816; 41.6% identity (73.4% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGPRNQTAVSEFLLMKVTEDPELKLIPFSLFLSMYLVTILGNLLILLAVISDSHLHTPMY
:: ::: ::::.:. .. : . .. : ::: ::.::.::: ::.: . ::.::::::
XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KE5 FLLFNLSFTDICLTTTTVPKILVNIQAQNQSITYTGCLTQICLVLVFAGLESCFLAVMAY
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICHPLRYTVLMNVHFWGLLILLSMFMSTMDALVQSLMVLQLSFCKNVEIPLFFCE
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VVQVIKLACSDTLINNILIYFASSVFGAIPLSGIIFSYSQIVTSVLRMPSARGKYKAFST
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CGCHLSVFSLFYGTAFGVYISSAVAESSRITAVASVMYTVVPQMMNPFIYSLRNKEMKKA
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LRKLIGRLFPF
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XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 842 init1: 816 opt: 816 Z-score: 806.7 bits: 157.4 E(85289): 3.4e-38
Smith-Waterman score: 816; 41.6% identity (73.4% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGPRNQTAVSEFLLMKVTEDPELKLIPFSLFLSMYLVTILGNLLILLAVISDSHLHTPMY
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10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLFNLSFTDICLTTTTVPKILVNIQAQNQSITYTGCLTQICLVLVFAGLESCFLAVMAY
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NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 DRYVAICHPLRYTVLMNVHFWGLLILLSMFMSTMDALVQSLMVLQLSFCKNVEIPLFFCE
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NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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pF1KE5 VVQVIKLACSDTLINNILIYFASSVFGAIPLSGIIFSYSQIVTSVLRMPSARGKYKAFST
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NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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pF1KE5 CGCHLSVFSLFYGTAFGVYISSAVAESSRITAVASVMYTVVPQMMNPFIYSLRNKEMKKA
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NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
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310
pF1KE5 LRKLIGRLFPF
.::. ..
NP_036 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 842 init1: 816 opt: 816 Z-score: 806.7 bits: 157.4 E(85289): 3.4e-38
Smith-Waterman score: 816; 41.6% identity (73.4% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGPRNQTAVSEFLLMKVTEDPELKLIPFSLFLSMYLVTILGNLLILLAVISDSHLHTPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLFNLSFTDICLTTTTVPKILVNIQAQNQSITYTGCLTQICLVLVFAGLESCFLAVMAY
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICHPLRYTVLMNVHFWGLLILLSMFMSTMDALVQSLMVLQLSFCKNVEIPLFFCE
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VVQVIKLACSDTLINNILIYFASSVFGAIPLSGIIFSYSQIVTSVLRMPSARGKYKAFST
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CGCHLSVFSLFYGTAFGVYISSAVAESSRITAVASVMYTVVPQMMNPFIYSLRNKEMKKA
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LRKLIGRLFPF
.::. ..
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 812 init1: 759 opt: 814 Z-score: 804.9 bits: 157.1 E(85289): 4.3e-38
Smith-Waterman score: 814; 41.6% identity (71.3% similar) in 310 aa overlap (2-307:3-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGPRNQTAVSEFLLMKVTEDPELKLIPFSLFLSMYLVTILGNLLILLAVISDSHLHTPM
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NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
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pF1KE5 YFLLFNLSFTDICLTTTTVPKILVNIQAQNQSITYTGCLTQICLVLVFAGL-ESCFLAVM
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NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQY-FIFSTMGLSESCLMTAM
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pF1KE5 AYDRYVAICHPLRYTVLMN--VHFWGLLILLSMFMSTMDA-LVQSLMVLQLSFCKNVEIP
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NP_001 AYDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVW---MVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIR
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pF1KE5 LFFCEVVQVIKLACSDTLINNILIYFASSVFGAIPLSGIIFSYSQIVTSVLRMPSARGKY
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NP_001 HFFCDMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRS
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pF1KE5 KAFSTCGCHLSVFSLFYGTAFGVYISSAVAESSRITAVASVMYTVVPQMMNPFIYSLRNK
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NP_001 KAFNTCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNK
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pF1KE5 EMKKALRKLIGRLFPF
:.: ::..: :
NP_001 EIKDALKRLQKRKCC
300 310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 768 init1: 768 opt: 812 Z-score: 803.0 bits: 156.7 E(85289): 5.5e-38
Smith-Waterman score: 812; 40.0% identity (73.4% similar) in 305 aa overlap (2-306:5-309)
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pF1KE5 MGPRNQTAVSEFLLMKVTEDPELKLIPFSLFLSMYLVTILGNLLILLAVISDSHLHT
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
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NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]