Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5939
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5939, 311 aa
1>>>pF1KE5939 311 - 311 aa - 311 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4988+/-0.00142; mu= 9.0391+/- 0.082
mean_var=167.1753+/-57.248, 0's: 0 Z-trim(101.4): 398 B-trim: 759 in 2/47
Lambda= 0.099195
statistics sampled from 5969 (6484) to 5969 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.533), E-opt: 0.2 (0.199), width: 16
Scan time: 2.360
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32898.2 OR7G1 gene_id:125962|Hs108|chr19 ( 311) 2001 299.4 2.3e-81
CCDS32897.1 OR7G2 gene_id:390882|Hs108|chr19 ( 345) 1517 230.2 1.7e-60
CCDS32899.1 OR7G3 gene_id:390883|Hs108|chr19 ( 312) 1366 208.6 5.1e-54
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 1276 195.7 3.9e-50
CCDS12319.1 OR7A17 gene_id:26333|Hs108|chr19 ( 309) 1250 192.0 5.1e-49
CCDS12318.1 OR7A5 gene_id:26659|Hs108|chr19 ( 319) 1246 191.4 7.7e-49
CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19 ( 312) 1236 190.0 2.1e-48
CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 ( 320) 1231 189.3 3.4e-48
CCDS12320.1 OR7C2 gene_id:26658|Hs108|chr19 ( 319) 1229 189.0 4.2e-48
CCDS45955.1 OR7E24 gene_id:26648|Hs108|chr19 ( 339) 1190 183.4 2.1e-46
CCDS32900.1 OR7D2 gene_id:162998|Hs108|chr19 ( 312) 1189 183.2 2.2e-46
CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 ( 313) 1028 160.2 1.9e-39
CCDS32937.1 OR1I1 gene_id:126370|Hs108|chr19 ( 355) 1014 158.3 8.2e-39
CCDS11020.1 OR1G1 gene_id:8390|Hs108|chr17 ( 313) 1009 157.5 1.2e-38
CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 1001 156.4 2.8e-38
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 998 155.9 3.7e-38
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 978 153.1 2.7e-37
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 978 153.1 2.7e-37
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 976 152.8 3.3e-37
CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 ( 311) 969 151.8 6.5e-37
CCDS31545.1 OR1S2 gene_id:219958|Hs108|chr11 ( 325) 961 150.6 1.5e-36
CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 ( 322) 955 149.8 2.7e-36
CCDS11019.1 OR1D2 gene_id:4991|Hs108|chr17 ( 312) 953 149.5 3.2e-36
CCDS58499.1 OR1D5 gene_id:8386|Hs108|chr17 ( 312) 917 144.3 1.1e-34
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 915 144.0 1.4e-34
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 913 143.7 1.7e-34
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 899 141.7 6.7e-34
CCDS35124.1 OR1L8 gene_id:138881|Hs108|chr9 ( 309) 889 140.3 1.8e-33
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 873 138.0 8.9e-33
CCDS11022.1 OR1A1 gene_id:8383|Hs108|chr17 ( 309) 863 136.6 2.4e-32
CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 ( 324) 857 135.8 4.5e-32
CCDS35125.1 OR1Q1 gene_id:158131|Hs108|chr9 ( 314) 854 135.3 5.9e-32
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 851 134.9 8e-32
CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 ( 347) 849 134.6 1e-31
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 848 134.5 1.1e-31
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 848 134.5 1.2e-31
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 845 134.0 1.5e-31
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 839 133.2 2.8e-31
CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9 ( 320) 832 132.2 5.3e-31
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 831 132.0 5.8e-31
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 827 131.5 8.8e-31
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 825 131.2 1e-30
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 825 131.2 1.1e-30
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 824 131.0 1.2e-30
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 824 131.0 1.2e-30
CCDS11021.1 OR1A2 gene_id:26189|Hs108|chr17 ( 309) 822 130.7 1.4e-30
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 821 130.6 1.5e-30
CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 ( 347) 821 130.6 1.7e-30
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 818 130.1 2.1e-30
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 816 129.9 2.6e-30
>>CCDS32898.2 OR7G1 gene_id:125962|Hs108|chr19 (311 aa)
initn: 2001 init1: 2001 opt: 2001 Z-score: 1574.3 bits: 299.4 E(32554): 2.3e-81
Smith-Waterman score: 2001; 100.0% identity (100.0% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGPRNQTAVSEFLLMKVTEDPELKLIPFSLFLSMYLVTILGNLLILLAVISDSHLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MGPRNQTAVSEFLLMKVTEDPELKLIPFSLFLSMYLVTILGNLLILLAVISDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLFNLSFTDICLTTTTVPKILVNIQAQNQSITYTGCLTQICLVLVFAGLESCFLAVMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FLLFNLSFTDICLTTTTVPKILVNIQAQNQSITYTGCLTQICLVLVFAGLESCFLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICHPLRYTVLMNVHFWGLLILLSMFMSTMDALVQSLMVLQLSFCKNVEIPLFFCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DRYVAICHPLRYTVLMNVHFWGLLILLSMFMSTMDALVQSLMVLQLSFCKNVEIPLFFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VVQVIKLACSDTLINNILIYFASSVFGAIPLSGIIFSYSQIVTSVLRMPSARGKYKAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VVQVIKLACSDTLINNILIYFASSVFGAIPLSGIIFSYSQIVTSVLRMPSARGKYKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CGCHLSVFSLFYGTAFGVYISSAVAESSRITAVASVMYTVVPQMMNPFIYSLRNKEMKKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CGCHLSVFSLFYGTAFGVYISSAVAESSRITAVASVMYTVVPQMMNPFIYSLRNKEMKKA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LRKLIGRLFPF
:::::::::::
CCDS32 LRKLIGRLFPF
310
>>CCDS32897.1 OR7G2 gene_id:390882|Hs108|chr19 (345 aa)
initn: 1540 init1: 1514 opt: 1517 Z-score: 1199.5 bits: 230.2 E(32554): 1.7e-60
Smith-Waterman score: 1517; 74.4% identity (91.9% similar) in 308 aa overlap (1-308:22-329)
10 20 30
pF1KE5 MGPRNQTAVSEFLLMKVTEDPELKLIPFSLFLSMYLVTI
: :::::.:.:::. . :::::. . ::::::::::::
CCDS32 MPMQLLLTDFIIFSIRFIINSMEARNQTAISKFLLLGLIEDPELQPVLFSLFLSMYLVTI
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 LGNLLILLAVISDSHLHTPMYFLLFNLSFTDICLTTTTVPKILVNIQAQNQSITYTGCLT
::::::::::::::::::::::.: :::: ::::.:::.::.::::::::.::::.::::
CCDS32 LGNLLILLAVISDSHLHTPMYFFLSNLSFLDICLSTTTIPKMLVNIQAQNRSITYSGCLT
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 QICLVLVFAGLESCFLAVMAYDRYVAICHPLRYTVLMNVHFWGLLILLSMFMSTMDALVQ
:::.:: :::::.:.::.:::::::::::::::::.:: .. :::::::.. :...::.
CCDS32 QICFVLFFAGLENCLLAAMAYDRYVAICHPLRYTVIMNPRLCGLLILLSLLTSVVNALLL
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 SLMVLQLSFCKNVEIPLFFCEVVQVIKLACSDTLINNILIYFASSVFGAIPLSGIIFSYS
:::::.:::: ..::::::::..:::.:.::::::::::::::. .::..::::::.::.
CCDS32 SLMVLRLSFCTDLEIPLFFCELAQVIQLTCSDTLINNILIYFAACIFGGVPLSGIILSYT
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 QIVTSVLRMPSARGKYKAFSTCGCHLSVFSLFYGTAFGVYISSAVAESSRITAVASVMYT
::.. ::::::: ::.:: :::: :::. ::::...::::::.:..: : ::::::::.
CCDS32 QITSCVLRMPSASGKHKAVSTCGSHLSIVLLFYGAGLGVYISSVVTDSPRKTAVASVMYS
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310
pF1KE5 VVPQMMNPFIYSLRNKEMKKALRKLIGRLFPF
: :::.::::::::::.:: .:::.:::.
CCDS32 VFPQMVNPFIYSLRNKDMKGTLRKFIGRIPSLLWCAICFGFRFLE
310 320 330 340
>>CCDS32899.1 OR7G3 gene_id:390883|Hs108|chr19 (312 aa)
initn: 1411 init1: 1360 opt: 1366 Z-score: 1083.2 bits: 208.6 E(32554): 5.1e-54
Smith-Waterman score: 1366; 66.6% identity (89.7% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGPRNQTAVSEFLLMKVTEDPELKLIPFSLFLSMYLVTILGNLLILLAVISDSHLHTPMY
: : . . ::.:. .. ::::. : : :::::::.:.::::::.::: ::::::::::
CCDS32 MKAGNFSDTPEFFLLGLSGDPELQPILFMLFLSMYLATMLGNLLIILAVNSDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLFNLSFTDICLTTTTVPKILVNIQAQNQSITYTGCLTQICLVLVFAGLESCFLAVMAY
::: ::..:::.:.::.::.::::::: :::.:::::::::.::::.:::. .:..:::
CCDS32 FLLSILSLVDICFTSTTMPKMLVNIQAQAQSINYTGCLTQICFVLVFVGLENGILVMMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICHPLRYTVLMNVHFWGLLILLSMFMSTMDALVQSLMVLQLSFCKNVEIPLFFCE
::.:::::::::.:.:: .. :::.:::...:..:::...::::::.:: ..::: ::::
CCDS32 DRFVAICHPLRYNVIMNPKLCGLLLLLSFIVSVLDALLHTLMVLQLTFCIDLEIPHFFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VVQVIKLACSDTLINNILIYFASSVFGAIPLSGIIFSYSQIVTSVLRMPSARGKYKAFST
.....::::::.::::::.:...:..:..:::::::::..::.::...::: :::::::
CCDS32 LAHILKLACSDVLINNILVYLVTSLLGVVPLSGIIFSYTRIVSSVMKIPSAGGKYKAFSI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CGCHLSVFSLFYGTAFGVYISSAVAESSRITAVASVMYTVVPQMMNPFIYSLRNKEMKKA
:: :: : ::::::.::::.::....::: :.:::::::: :.::.:::::::.: ::
CCDS32 CGSHLIVVSLFYGTGFGVYLSSGATHSSRKGAIASVMYTVVTPMLNPLIYSLRNKDMLKA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LRKLIGRLFPF
:::::.:. :
CCDS32 LRKLISRIPSFH
310
>>CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 (309 aa)
initn: 1283 init1: 1263 opt: 1276 Z-score: 1013.7 bits: 195.7 E(32554): 3.9e-50
Smith-Waterman score: 1276; 61.9% identity (88.4% similar) in 302 aa overlap (1-302:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGPRNQTAVSEFLLMKVTEDPELKLIPFSLFLSMYLVTILGNLLILLAVISDSHLHTPMY
: :.: . ::::. ..:.:::. . :.:::::::::.::::::.::.:::::::::::
CCDS32 MKSWNNTIILEFLLLGISEEPELQAFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLFNLSFTDICLTTTTVPKILVNIQAQNQSITYTGCLTQICLVLVFAGLESCFLAVMAY
:.: ::::.:::...:::::.:::::..:. :::.::.::.:. :.:.::.. .:.::::
CCDS32 FFLSNLSFVDICFVSTTVPKMLVNIQTHNKVITYAGCITQMCFFLLFVGLDNFLLTVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICHPLRYTVLMNVHFWGLLILLSMFMSTMDALVQSLMVLQLSFCKNVEIPLFFCE
::.:::::::.: :.:: .. :::.: : .::......:::::: : :: ..::: ::::
CCDS32 DRFVAICHPLHYMVIMNPQLCGLLVLASWIMSVLNSMLQSLMVLPLPFCTHMEIPHFFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VVQVIKLACSDTLINNILIYFASSVFGAIPLSGIIFSYSQIVTSVLRMPSARGKYKAFST
. ::..::::::..:.:..::: ...:. ::.::..:::.::.:. . ::.::::::::
CCDS32 INQVVHLACSDTFLNDIVMYFAVALLGGGPLTGILYSYSKIVSSIRAISSAQGKYKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CGCHLSVFSLFYGTAFGVYISSAVAESSRITAVASVMYTVVPQMMNPFIYSLRNKEMKKA
:. :::: :::::: .:::.:::....:. :.:::::::: :.::::::::::..: :
CCDS32 CASHLSVVSLFYGTCLGVYLSSAATHNSHTGAAASVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKHIKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LRKLIGRLFPF
..
CCDS32 MKTFFRGKQ
>>CCDS12319.1 OR7A17 gene_id:26333|Hs108|chr19 (309 aa)
initn: 1220 init1: 1220 opt: 1250 Z-score: 993.5 bits: 192.0 E(32554): 5.1e-49
Smith-Waterman score: 1250; 60.9% identity (89.4% similar) in 302 aa overlap (1-302:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGPRNQTAVSEFLLMKVTEDPELKLIPFSLFLSMYLVTILGNLLILLAVISDSHLHTPMY
: :.:.:..:::.:. ..:.:::. . :.:::::::::.::::::.::.:::::::::::
CCDS12 MEPENDTGISEFVLLGLSEEPELQPFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLFNLSFTDICLTTTTVPKILVNIQAQNQSITYTGCLTQICLVLVFAGLESCFLAVMAY
:.: ::::.:::. .::.::.:.:::.:.. :::.::.::.:. ..:.::.: .::::::
CCDS12 FFLSNLSFADICFISTTIPKMLINIQTQSRVITYAGCITQMCFFVLFGGLDSLLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICHPLRYTVLMNVHFWGLLILLSMFMSTMDALVQSLMVLQLSFCKNVEIPLFFCE
::.:::::::.:::.:: .. :::.: : .......: :::::: :::: ..::: ::::
CCDS12 DRFVAICHPLHYTVIMNPRLCGLLVLASWMIAALNSLSQSLMVLWLSFCTDLEIPHFFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VVQVIKLACSDTLINNILIYFASSVFGAIPLSGIIFSYSQIVTSVLRMPSARGKYKAFST
. :::.::::::..:.. .:::...... :: ::. :::.::.:. . ::.::::::::
CCDS12 LNQVIHLACSDTFLNDMGMYFAAGLLAGGPLVGILCSYSKIVSSIRAISSAQGKYKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CGCHLSVFSLFYGTAFGVYISSAVAESSRITAVASVMYTVVPQMMNPFIYSLRNKEMKKA
:. :::: ::: :..:::..::....:. .:.:::::::. :.::::::::::..:.:
CCDS12 CASHLSVVSLFCCTGLGVYLTSAATHNSHTSATASVMYTVATPMLNPFIYSLRNKDIKRA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE5 LRKLIGRLFPF
:.
CCDS12 LKMSFRGKQ
>>CCDS12318.1 OR7A5 gene_id:26659|Hs108|chr19 (319 aa)
initn: 1246 init1: 1246 opt: 1246 Z-score: 990.3 bits: 191.4 E(32554): 7.7e-49
Smith-Waterman score: 1246; 61.1% identity (87.4% similar) in 301 aa overlap (1-301:1-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGPRNQTAVSEFLLMKVTEDPELKLIPFSLFLSMYLVTILGNLLILLAVISDSHLHTPMY
: : :.: .:::::. ...: :. . :.:::::::::.::::::.::.:::::::::::
CCDS12 MEPGNDTQISEFLLLGFSQEPGLQPFLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILATISDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLFNLSFTDICLTTTTVPKILVNIQAQNQSITYTGCLTQICLVLVFAGLESCFLAVMAY
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310
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:
CCDS12 LGIHLLWGTMKGQFFKKCP
310
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310
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CCDS32 LERLLSRADSCP
310
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310
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: .:..:
CCDS12 LGRLLSRATFFNGDITAGLS
310 320
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CCDS12 MERGNQTEVGNFLLLGFAEDSDMQLLLHGLFLSMYLVTIIGNLLIILTISSDSHLHTPMY
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CCDS12 FFLSNLSFADICFTSTTVPKMLVNIQTQSKMITFAGCLTQIFFFIAFGCLDNLLLTMTAY
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pF1KE5 LRKLIGRLFPF
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CCDS12 LGRLLLRATSLKEGTIAKLS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]