Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5937
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5937, 311 aa
1>>>pF1KE5937 311 - 311 aa - 311 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1206+/-0.000432; mu= 16.6985+/- 0.027
mean_var=111.1397+/-32.051, 0's: 0 Z-trim(110.2): 355 B-trim: 1033 in 1/48
Lambda= 0.121658
statistics sampled from 17972 (18502) to 17972 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.567), E-opt: 0.2 (0.217), width: 16
Scan time: 6.820
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 890 167.7 2.7e-41
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 890 167.7 2.7e-41
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 890 167.7 2.7e-41
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 888 167.4 3.4e-41
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 879 165.8 1.1e-40
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NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 858 162.1 1.3e-39
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 855 161.6 1.9e-39
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 851 160.9 3.1e-39
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 845 159.8 6.4e-39
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 836 158.3 1.9e-38
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 824 156.1 8.2e-38
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 824 156.1 8.2e-38
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 824 156.2 8.4e-38
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 790 150.2 5.2e-36
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 788 149.8 6.5e-36
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 783 148.9 1.2e-35
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 779 148.2 2e-35
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 776 147.7 2.8e-35
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 760 144.9 2e-34
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 569 111.4 2.5e-24
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 549 107.9 2.8e-23
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 207 47.9 3.3e-05
NP_001041695 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 ( 326) 198 46.3 0.0001
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NP_001265427 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 199 46.6 0.0001
NP_001265428 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 199 46.6 0.0001
NP_001265426 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 199 46.6 0.0001
NP_001265429 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 199 46.6 0.0001
XP_011542714 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 308) 196 45.9 0.00012
XP_016868585 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 317) 196 45.9 0.00013
XP_011542713 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 324) 196 45.9 0.00013
NP_001309433 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 342) 196 46.0 0.00013
NP_001309432 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 370) 196 46.0 0.00014
NP_001309431 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 372) 196 46.0 0.00014
NP_150645 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 429) 196 46.1 0.00015
XP_006716356 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 429) 196 46.1 0.00015
NP_150647 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 455) 196 46.1 0.00016
NP_000671 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 466) 196 46.1 0.00016
XP_016868584 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 475) 196 46.1 0.00016
NP_150646 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 475) 196 46.1 0.00016
XP_016868583 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 475) 196 46.1 0.00016
XP_006716355 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 475) 196 46.1 0.00016
NP_005949 (OMIM: 600665) melatonin receptor type 1 ( 350) 193 45.4 0.00019
NP_000520 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotropi ( 297) 192 45.2 0.0002
XP_016881270 (OMIM: 202200,607397) PREDICTED: adre ( 297) 192 45.2 0.0002
NP_001278840 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotr ( 297) 192 45.2 0.0002
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 192 45.2 0.00021
XP_016883343 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 370) 190 45.0 0.00029
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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pF1KE5 KALLKLKDKVAHSQSK
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XP_011 GAWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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pF1KE5 MSNASLLTAFILMGLPHAPALDAPLFGVFLVVYVLTVLGNLLILLVIRVDSHLHTTMY
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pF1KE5 CDRYLAISYPLRYTSMMTGRSCTLLATSTWLSGSLHSAVQAILTFHLPYCGPNWIQHYLC
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pF1KE5 DAPPILKLACADTSAIETVIFVTVGIVASGCFVLIVLSYVSIVCSILRIRTSEGKHRAFQ
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pF1KE5 TCASH-CIVVLCFFGPGLFIYLRPGSRKAV--DGVVAVFYTVLTPLLNPVVYTLRNKEVK
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XP_011 TCASHLTVVALCY-GVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVK
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300 310
pF1KE5 KALLKLKDKVAHSQSK
: :: : . ::
XP_011 GAWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
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Smith-Waterman score: 890; 45.8% identity (73.4% similar) in 312 aa overlap (3-311:5-314)
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pF1KE5 MSNASLLTAFILMGLPHAPALDAPLFGVFLVVYVLTVLGNLLILLVIRVDSHLHTTMY
: . .. :::.:: . :: .:::.::.::::: ::.:.::.::.::: ::
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pF1KE5 CDRYLAISYPLRYTSMMTGRSCTLLATSTWLSGSLHSAVQAILTFHLPYCGPNWIQHYLC
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pF1KE5 DAPPILKLACADTSAIETVIFVTVGIVASGCFVLIVLSYVSIVCSILRIRTSEGKHRAFQ
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NP_036 TCASHLTVVALCY-GVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVK
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pF1KE5 KALLKLKDKVAHSQSK
: :: : . ::
NP_036 GAWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
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Smith-Waterman score: 888; 42.5% identity (75.7% similar) in 301 aa overlap (1-301:1-299)
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: : . .: :.:.:: . : .. .: ::.:.:..::.: .::...: .. : . ::
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pF1KE5 LKDKVAHSQSK
:
NP_001 LCSRKDISGDK
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>>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo (327 aa)
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pF1KE5 MSNASLLTAFILMGLPHAPA-LDAPLFGVFLVVYVLTVLGNLLILLVIRVDSHLHTT
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pF1KE5 MYYFLTNLSFIDMWFSTVTVPKLLMTLVFPS---GRAISFHSCMAQLYFFHFLGGTECFL
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pF1KE5 YRVMSCDRYLAISYPLRYTSMMTGRSCTLLATSTWLSGSLHSAVQAILTFHLPYCGPNWI
::. :::.:: :::.: ...:: :. .:...: .: : :...: : ::::: :
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pF1KE5 QHYLCDAPPILKLACADTSAIETVIFVTVGIVASGCFVLIVLSYVSIVCSILRIRTSEGK
.:..::. :.:.:.:.: :. : . :. . .. : . . :::.:. ....: .. :.
NP_003 NHFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAGR
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NP_003 YKAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLRN
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pF1KE5 KEVKKALLKLKDKVAHSQSK
.:::.::
NP_003 QEVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
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>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
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Smith-Waterman score: 876; 44.2% identity (74.4% similar) in 301 aa overlap (3-301:8-307)
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pF1KE5 MSNASLLTAFILMGLPHAPALDAPLFGVFLVVYVLTVLGNLLILLVIRVDSHLHT
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
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60 70 80 90 100 110
pF1KE5 TMYYFLTNLSFIDMWFSTVTVPKLLMTLVFPSGRAISFHSCMAQLYFFHFLGGTECFLYR
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPE-KTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLV
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 VMSCDRYLAISYPLRYTSMMTGRSCTLLATSTWLSGSLHSAVQAILTFHLPYCGPNWIQH
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NP_001 VMSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDH
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 YLCDAPPILKLACADTSAIETVIFVTVGIVASGCFVLIVLSYVSIVCSILRIRTSEGKHR
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NP_001 FFCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 AFQTCASHCIVVLCFFGPGLFIYLRPGSRKAVDG--VVAVFYTVLTPLLNPVVYTLRNKE
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NP_001 VFGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKV
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 VKKALLKLKDKVAHSQSK
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NP_001 VRGAVKRLMGWE
300 310
>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
initn: 875 init1: 478 opt: 858 Z-score: 832.0 bits: 162.1 E(85289): 1.3e-39
Smith-Waterman score: 858; 44.6% identity (74.9% similar) in 303 aa overlap (2-301:4-304)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSNASLLTAFILMGLPHAPALDAPLFGVFLVVYVLTVLGNLLILLVIRVDSHLHTTMY
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NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFLTNLSFIDMWFSTVTVPKLLMTLVFPSGRAISFHSCMAQLYFFHFLGGTECFLYRVMS
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NP_001 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLN-GCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMA
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pF1KE5 CDRYLAISYPLRYTSMMTGRSCTLLATSTWLSGSLHSAVQAILTFHLPYCGPNWIQHYLC
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NP_001 YDRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DAPPILKLACADTSAIETVIFV-TVGIVASGCFVLIVLSYVSIVCSILRIRTSEGKHRAF
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NP_001 EMPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSP-LVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKAF
180 190 200 210 220 230
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pF1KE5 QTCASHCIVVLCFFGPGLFIYLRPGSRKAVD-GV-VAVFYTVLTPLLNPVVYTLRNKEVK
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NP_001 GTCGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREVK
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 KALLKLKDKVAHSQSK
:: .:
NP_001 GALGRLLLGKRELGKE
300 310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 848 init1: 584 opt: 855 Z-score: 829.3 bits: 161.6 E(85289): 1.9e-39
Smith-Waterman score: 855; 44.9% identity (72.9% similar) in 303 aa overlap (3-304:5-305)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSNASLLTAFILMGLPHAPALDAPLFGVFLVVYVLTVLGNLLILLVIRVDSHLHTTMY
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NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFLTNLSFIDMWFSTVTVPKLLMTLVFPSGRAISFHSCMAQLYFFHFLGGTECFLYRVMS
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NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLL-SRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMS
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120 130 140 150 160 170
pF1KE5 CDRYLAISYPLRYTSMMTGRSCTLLATSTWLSGSLHSAVQAILTFHLPYCGPNWIQHYLC
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NP_003 YDRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFC
120 130 140 150 160 170
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pF1KE5 DAPPILKLACADTSAIETVIFVTVGIVASGCFVLIVL-SYVSIVCSILRIRTSEGKHRAF
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NP_003 EAPALLILASTDTHASEMAIFL-MGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAF
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pF1KE5 QTCASHCIVVLCFFGPGLFIYLRPGSRKAVDGVVAVFYTVLTPLLNPVVYTLRNKEVKKA
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NP_003 STCGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQQEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE5 LLKLKDKVAHSQSK
: :. .
NP_003 LRKVATRNFP
300
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 579 init1: 473 opt: 851 Z-score: 825.4 bits: 160.9 E(85289): 3.1e-39
Smith-Waterman score: 851; 42.6% identity (72.6% similar) in 310 aa overlap (3-308:7-314)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSNASLLTAFILMGLPHAPALDAPLFGVFLVVYVLTVLGNLLILLVIRVDSHLHTT
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NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
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pF1KE5 MYYFLTNLSFIDM-WFSTVTVPKLLMTLVFPSGRAISFHSCMAQLYFFHFLGGTECFLYR
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NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDI-VPKMLVNFL-SENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILA
70 80 90 100 110
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pF1KE5 VMSCDRYLAISYPLRYTSMMTGRSCTLLATSTWLSGSLHSAVQAILTFHLPYCGPNWIQH
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NP_006 AMAYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINH
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 YLCDAPPILKLACADTSAIETVIFVTVGIVASGCFVLIVLSYVSIVCSILRIRTSEGKHR
..:: ::.:::.:.::. : .. . . : ::..:..:: :. :.:.::. :...
NP_006 FFCDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 AFQTCASHCIVVLCFFGPGLFIYLRPGS--RKAVDGVVAVFYTVLTPLLNPVVYTLRNKE
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NP_006 TFSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKD
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300 310
pF1KE5 VKKALLK-LKDKVAHSQSK
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NP_006 VKDAAEKVLRSKVDSS
300 310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 856 init1: 468 opt: 845 Z-score: 819.7 bits: 159.8 E(85289): 6.4e-39
Smith-Waterman score: 845; 44.5% identity (74.2% similar) in 299 aa overlap (3-298:5-301)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MSNASLLTAFILMGLPHAPALDAPLFGVFLVVYVLTVLGNLLILLVIRVDSHLHTTMY
: . :: :.:.:: . :. :: :::.:.::::::: ..:.::.::.::: ::
NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFLTNLSFIDMWFSTVTVPKLLMTLVFPSGRAISFHSCMAQLYFFHFLGGTECFLYRVMS
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NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLL-SEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMA
70 80 90 100 110
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pF1KE5 CDRYLAISYPLRYTSMMTGRSCTL-LATSTWLSGSLHSAVQAILTFHLPYCGPNWIQHYL
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NP_003 YDRYAAICRPLLYSLIMS-RTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 CDAPPILKLACADTSAIETVIFVTVGIVASGCFVLIVLSYVSIVCSILRIRTSEGKHRAF
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NP_003 CDSPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAF
180 190 200 210 220 230
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]